MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994038 draft genome

Total Repeats: 1524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021026	AAAAG	2	10	530	539	80 %	0 %	20 %	0 %	480533969
2	NC_021026	GAAAT	2	10	691	700	60 %	20 %	20 %	0 %	480533969
3	NC_021026	AAAAT	2	10	1473	1482	80 %	20 %	0 %	0 %	480533969
4	NC_021026	GTAAA	2	10	2631	2640	60 %	20 %	20 %	0 %	480533970
5	NC_021026	AAAAT	2	10	3018	3027	80 %	20 %	0 %	0 %	480533971
6	NC_021026	TGAAA	2	10	3159	3168	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021026	AAACA	2	10	4420	4429	80 %	0 %	0 %	20 %	480533973
8	NC_021026	TCAAT	2	10	6047	6056	40 %	40 %	0 %	20 %	480533974
9	NC_021026	TTTTC	2	10	6087	6096	0 %	80 %	0 %	20 %	480533974
10	NC_021026	TAAAT	2	10	6605	6614	60 %	40 %	0 %	0 %	480533974
11	NC_021026	ACTCT	2	10	6686	6695	20 %	40 %	0 %	40 %	480533974
12	NC_021026	AAACG	2	10	7929	7938	60 %	0 %	20 %	20 %	480533974
13	NC_021026	TTGGT	2	10	8158	8167	0 %	60 %	40 %	0 %	480533974
14	NC_021026	CAATT	2	10	8227	8236	40 %	40 %	0 %	20 %	480533974
15	NC_021026	AGGAA	2	10	9243	9252	60 %	0 %	40 %	0 %	480533977
16	NC_021026	ATTGA	2	10	10661	10670	40 %	40 %	20 %	0 %	480533979
17	NC_021026	ATTCT	2	10	12794	12803	20 %	60 %	0 %	20 %	480533981
18	NC_021026	TCGTG	2	10	16410	16419	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_021026	GTTAA	2	10	17131	17140	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021026	GGGAG	2	10	17649	17658	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021026	AGGGA	2	10	19860	19869	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021026	TTGAA	2	10	20064	20073	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021026	ATGGT	2	10	22450	22459	20 %	40 %	40 %	0 %	480533984
24	NC_021026	CTTTT	2	10	23618	23627	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_021026	TAGAT	2	10	30898	30907	40 %	40 %	20 %	0 %	480533999
26	NC_021026	CTTAT	2	10	31406	31415	20 %	60 %	0 %	20 %	480534001
27	NC_021026	GAAGA	2	10	33279	33288	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021026	CAGAA	2	10	34286	34295	60 %	0 %	20 %	20 %	480534007
29	NC_021026	TTTTG	2	10	34536	34545	0 %	80 %	20 %	0 %	480534008
30	NC_021026	GAATG	2	10	34625	34634	40 %	20 %	40 %	0 %	480534008
31	NC_021026	GAAAC	2	10	38320	38329	60 %	0 %	20 %	20 %	480534013
32	NC_021026	TCTAA	2	10	38663	38672	40 %	40 %	0 %	20 %	480534013
33	NC_021026	CTCTT	2	10	39284	39293	0 %	60 %	0 %	40 %	480534013
34	NC_021026	AGTTG	2	10	40108	40117	20 %	40 %	40 %	0 %	480534015
35	NC_021026	ACAAG	2	10	40486	40495	60 %	0 %	20 %	20 %	480534015
36	NC_021026	GGGTG	2	10	41696	41705	0 %	20 %	80 %	0 %	480534017
37	NC_021026	CCTAT	2	10	42017	42026	20 %	40 %	0 %	40 %	480534018
38	NC_021026	ATGAC	2	10	42743	42752	40 %	20 %	20 %	20 %	480534021
39	NC_021026	AGCTG	2	10	45831	45840	20 %	20 %	40 %	20 %	480534023
40	NC_021026	GGTCA	2	10	47640	47649	20 %	20 %	40 %	20 %	480534024
41	NC_021026	ATTTT	2	10	57712	57721	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021026	AATCA	2	10	64699	64708	60 %	20 %	0 %	20 %	480534041
43	NC_021026	AGCAG	2	10	65370	65379	40 %	0 %	40 %	20 %	480534042
44	NC_021026	TTGAT	2	10	72854	72863	20 %	60 %	20 %	0 %	480534048
45	NC_021026	CAGAT	2	10	75049	75058	40 %	20 %	20 %	20 %	480534050
46	NC_021026	TTTAC	2	10	75751	75760	20 %	60 %	0 %	20 %	480534050
47	NC_021026	AGAGG	2	10	76613	76622	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021026	GTGAC	2	10	79382	79391	20 %	20 %	40 %	20 %	480534053
49	NC_021026	GTGAT	2	10	80372	80381	20 %	40 %	40 %	0 %	480534053
50	NC_021026	TGGCT	2	10	83192	83201	0 %	40 %	40 %	20 %	480534054
51	NC_021026	AAATG	2	10	83798	83807	60 %	20 %	20 %	0 %	480534054
52	NC_021026	AGCTA	2	10	84692	84701	40 %	20 %	20 %	20 %	480534055
53	NC_021026	CCTTG	2	10	87582	87591	0 %	40 %	20 %	40 %	480534058
54	NC_021026	TCAAA	2	10	87776	87785	60 %	20 %	0 %	20 %	480534058
55	NC_021026	GCAAG	2	10	89445	89454	40 %	0 %	40 %	20 %	480534059
56	NC_021026	AGTGG	2	10	90143	90152	20 %	20 %	60 %	0 %	480534060
57	NC_021026	GGGTG	2	10	90181	90190	0 %	20 %	80 %	0 %	480534060
58	NC_021026	CTATT	2	10	91157	91166	20 %	60 %	0 %	20 %	480534061
59	NC_021026	GAAGC	2	10	91347	91356	40 %	0 %	40 %	20 %	480534061
60	NC_021026	GCTTG	2	10	91802	91811	0 %	40 %	40 %	20 %	480534063
61	NC_021026	GCTTT	2	10	93231	93240	0 %	60 %	20 %	20 %	480534064
62	NC_021026	TCTGG	2	10	93825	93834	0 %	40 %	40 %	20 %	480534064
63	NC_021026	AGCAT	2	10	94779	94788	40 %	20 %	20 %	20 %	480534064
64	NC_021026	TACCA	2	10	95477	95486	40 %	20 %	0 %	40 %	480534064
65	NC_021026	TTCCT	2	10	96494	96503	0 %	60 %	0 %	40 %	480534064
66	NC_021026	TTATT	2	10	97075	97084	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021026	TTGGT	2	10	100450	100459	0 %	60 %	40 %	0 %	480534067
68	NC_021026	CTTCA	2	10	101505	101514	20 %	40 %	0 %	40 %	480534068
69	NC_021026	AATCA	2	10	101617	101626	60 %	20 %	0 %	20 %	480534069
70	NC_021026	ATTCA	2	10	102991	103000	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_021026	AGCTC	2	10	103835	103844	20 %	20 %	20 %	40 %	480534071
72	NC_021026	TTAAA	2	10	105438	105447	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021026	TTATC	2	10	105512	105521	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_021026	GCTCC	2	10	108070	108079	0 %	20 %	20 %	60 %	480534076
75	NC_021026	GCTGT	2	10	108388	108397	0 %	40 %	40 %	20 %	480534076
76	NC_021026	TATCA	2	10	108712	108721	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_021026	TCTAT	2	10	109546	109555	20 %	60 %	0 %	20 %	480534077
78	NC_021026	AGAAA	2	10	110471	110480	80 %	0 %	20 %	0 %	480534077
79	NC_021026	GAAAG	2	10	110523	110532	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021026	TGACT	2	10	113517	113526	20 %	40 %	20 %	20 %	480534079
81	NC_021026	AGGGC	2	10	116952	116961	20 %	0 %	60 %	20 %	480534081
82	NC_021026	ATAAA	2	10	119248	119257	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021026	TAACC	2	10	119346	119355	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
84	NC_021026	ATTCT	2	10	119521	119530	20 %	60 %	0 %	20 %	480534083
85	NC_021026	TTACT	2	10	123164	123173	20 %	60 %	0 %	20 %	480534086
86	NC_021026	TGGGA	2	10	123818	123827	20 %	20 %	60 %	0 %	480534086
87	NC_021026	TGCTT	2	10	124691	124700	0 %	60 %	20 %	20 %	480534087
88	NC_021026	TGGCT	2	10	124874	124883	0 %	40 %	40 %	20 %	480534087
89	NC_021026	AGATA	2	10	128946	128955	60 %	20 %	20 %	0 %	480534092
90	NC_021026	GTTTG	2	10	129113	129122	0 %	60 %	40 %	0 %	480534092
91	NC_021026	TATTT	2	10	131062	131071	20 %	80 %	0 %	0 %	480534094
92	NC_021026	AAAGC	2	10	133972	133981	60 %	0 %	20 %	20 %	480534096
93	NC_021026	GGCTT	2	10	135396	135405	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_021026	CACAA	2	10	135735	135744	60 %	0 %	0 %	40 %	480534098
95	NC_021026	ACAGT	2	10	140010	140019	40 %	20 %	20 %	20 %	480534101
96	NC_021026	AATAA	2	10	140754	140763	80 %	20 %	0 %	0 %	480534102
97	NC_021026	GCTTT	2	10	142999	143008	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_021026	TATTG	2	10	143036	143045	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021026	ATTTT	2	10	143134	143143	20 %	80 %	0 %	0 %	480534106
100	NC_021026	CAAAG	2	10	148385	148394	60 %	0 %	20 %	20 %	480534111
101	NC_021026	TAAAA	2	10	148861	148870	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021026	TTCTA	2	10	149446	149455	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_021026	ACTAA	2	10	150389	150398	60 %	20 %	0 %	20 %	480534115
104	NC_021026	ATTAA	2	10	152274	152283	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021026	CGTGG	2	10	153099	153108	0 %	20 %	60 %	20 %	480534116
106	NC_021026	GTGAA	2	10	154101	154110	40 %	20 %	40 %	0 %	480534117
107	NC_021026	AAGCA	2	10	157746	157755	60 %	0 %	20 %	20 %	480534119
108	NC_021026	GTTTG	2	10	159018	159027	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021026	ACATG	2	10	159151	159160	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_021026	GAAAA	2	10	159743	159752	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021026	TTGGA	2	10	160028	160037	20 %	40 %	40 %	0 %	480534123
112	NC_021026	GTCTA	2	10	160159	160168	20 %	40 %	20 %	20 %	480534123
113	NC_021026	ATGTT	2	10	170119	170128	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021026	ACAAA	2	10	170634	170643	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_021026	TTTTC	2	10	172046	172055	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_021026	GAAAT	2	10	172856	172865	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021026	TTAGT	2	10	173727	173736	20 %	60 %	20 %	0 %	480534130
118	NC_021026	CTTGC	2	10	174083	174092	0 %	40 %	20 %	40 %	480534130
119	NC_021026	GGCCT	2	10	175037	175046	0 %	20 %	40 %	40 %	480534131
120	NC_021026	CTGTT	2	10	175605	175614	0 %	60 %	20 %	20 %	480534131
121	NC_021026	AGAAA	2	10	177141	177150	80 %	0 %	20 %	0 %	480534134
122	NC_021026	TATAC	2	10	179102	179111	40 %	40 %	0 %	20 %	480534135
123	NC_021026	AGATC	2	10	179407	179416	40 %	20 %	20 %	20 %	480534136
124	NC_021026	TGGTC	2	10	180495	180504	0 %	40 %	40 %	20 %	480534137
125	NC_021026	TTTGT	2	10	181416	181425	0 %	80 %	20 %	0 %	480534138
126	NC_021026	ACTAT	2	10	185422	185431	40 %	40 %	0 %	20 %	480534141
127	NC_021026	TGAAA	2	10	186823	186832	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021026	TTGAG	2	10	188002	188011	20 %	40 %	40 %	0 %	480534144
129	NC_021026	ATTTC	2	10	188349	188358	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_021026	GCCTT	2	10	189976	189985	0 %	40 %	20 %	40 %	480534147
131	NC_021026	AAGTA	2	10	192758	192767	60 %	20 %	20 %	0 %	480534149
132	NC_021026	TTGAT	2	10	193917	193926	20 %	60 %	20 %	0 %	480534150
133	NC_021026	TCACT	2	10	194292	194301	20 %	40 %	0 %	40 %	480534151
134	NC_021026	ATTTT	2	10	194615	194624	20 %	80 %	0 %	0 %	480534151
135	NC_021026	TTAAG	2	10	194967	194976	40 %	40 %	20 %	0 %	480534151
136	NC_021026	CCCTG	2	10	195599	195608	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
137	NC_021026	TCAGG	2	10	195882	195891	20 %	20 %	40 %	20 %	480534152
138	NC_021026	GCCTT	2	10	197496	197505	0 %	40 %	20 %	40 %	480534154
139	NC_021026	TTCCC	2	10	198070	198079	0 %	40 %	0 %	60 %	480534155
140	NC_021026	TCTCT	2	10	201617	201626	0 %	60 %	0 %	40 %	480534158
141	NC_021026	GAAAG	2	10	203633	203642	60 %	0 %	40 %	0 %	480534158
142	NC_021026	AGTTA	2	10	204913	204922	40 %	40 %	20 %	0 %	480534160
143	NC_021026	AAATC	2	10	206145	206154	60 %	20 %	0 %	20 %	480534162
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146	NC_021026	ATGAT	2	10	210823	210832	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021026	GTAGA	2	10	210994	211003	40 %	20 %	40 %	0 %	480534168
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149	NC_021026	CTTTT	2	10	211953	211962	0 %	80 %	0 %	20 %	480534168
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152	NC_021026	GGGAG	2	10	215798	215807	20 %	0 %	80 %	0 %	480534172
153	NC_021026	CCTTG	2	10	216400	216409	0 %	40 %	20 %	40 %	480534173
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157	NC_021026	TTCAC	2	10	220905	220914	20 %	40 %	0 %	40 %	480534181
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160	NC_021026	GTTCA	2	10	224699	224708	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
161	NC_021026	TCCAA	2	10	227800	227809	40 %	20 %	0 %	40 %	480534195
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164	NC_021026	ATCGA	2	10	229254	229263	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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169	NC_021026	TGGAT	2	10	233421	233430	20 %	40 %	40 %	0 %	480534203
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174	NC_021026	CTATC	2	10	239870	239879	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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200	NC_021026	GTTTG	2	10	281341	281350	0 %	60 %	40 %	0 %	480534239
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221	NC_021026	TTTAT	2	10	297371	297380	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
222	NC_021026	CTTTA	2	10	299540	299549	20 %	60 %	0 %	20 %	480534258
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250	NC_021026	CTTAT	2	10	325987	325996	20 %	60 %	0 %	20 %	480534282
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253	NC_021026	GCTTC	2	10	330859	330868	0 %	40 %	20 %	40 %	480534286
254	NC_021026	AGCTA	2	10	332505	332514	40 %	20 %	20 %	20 %	480534287
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256	NC_021026	TGCTT	2	10	334199	334208	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
257	NC_021026	ACTTC	2	10	335725	335734	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
258	NC_021026	ATACT	2	10	336474	336483	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
259	NC_021026	TGATG	2	10	338814	338823	20 %	40 %	40 %	0 %	480534289
260	NC_021026	GACAA	2	10	340950	340959	60 %	0 %	20 %	20 %	480534291
261	NC_021026	GTTTT	2	10	341853	341862	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
262	NC_021026	ACAAA	2	10	342985	342994	80 %	0 %	0 %	20 %	480534293
263	NC_021026	TTCTT	2	10	344276	344285	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
264	NC_021026	CCAAT	2	10	347449	347458	40 %	20 %	0 %	40 %	480534295
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266	NC_021026	TAGCC	2	10	351245	351254	20 %	20 %	20 %	40 %	480534295
267	NC_021026	TTTCA	2	10	352908	352917	20 %	60 %	0 %	20 %	480534296
268	NC_021026	TTGGT	2	10	352974	352983	0 %	60 %	40 %	0 %	480534296
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401	NC_021026	TTTTA	2	10	509078	509087	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
402	NC_021026	AATAG	2	10	509939	509948	60 %	20 %	20 %	0 %	480534443
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