MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994038 draft genome

Total Repeats: 26019

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021026	TAA	2	6	34	39	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021026	AAT	2	6	43	48	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021026	TTC	2	6	49	54	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_021026	ATT	2	6	96	101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021026	AGG	2	6	172	177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021026	TCA	2	6	280	285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480533969
7	NC_021026	AAC	2	6	349	354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480533969
8	NC_021026	ATT	2	6	363	368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480533969
9	NC_021026	GTA	2	6	369	374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533969
10	NC_021026	GAA	2	6	456	461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533969
11	NC_021026	GGA	2	6	648	653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480533969
12	NC_021026	TTA	2	6	675	680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480533969
13	NC_021026	TTA	2	6	751	756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480533969
14	NC_021026	GAT	2	6	837	842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533969
15	NC_021026	GAA	2	6	879	884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533969
16	NC_021026	GAG	2	6	972	977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480533969
17	NC_021026	TGC	2	6	1214	1219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480533969
18	NC_021026	ATA	2	6	1402	1407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480533969
19	NC_021026	AAT	2	6	1543	1548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480533969
20	NC_021026	TAT	2	6	1657	1662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021026	TAT	2	6	1666	1671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021026	TAA	2	6	1723	1728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480533970
23	NC_021026	TAC	2	6	1753	1758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480533970
24	NC_021026	CTT	2	6	1914	1919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480533970
25	NC_021026	CTT	2	6	1931	1936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480533970
26	NC_021026	CTT	2	6	1941	1946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480533970
27	NC_021026	GTA	2	6	1958	1963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533970
28	NC_021026	ATT	2	6	2138	2143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480533970
29	NC_021026	TGC	2	6	2158	2163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480533970
30	NC_021026	TGA	2	6	2293	2298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533970
31	NC_021026	GAT	2	6	2354	2359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533970
32	NC_021026	ACT	2	6	2489	2494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480533970
33	NC_021026	GTT	2	6	2597	2602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480533970
34	NC_021026	GAA	2	6	2642	2647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533970
35	NC_021026	CAG	2	6	2787	2792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480533970
36	NC_021026	AGT	2	6	2901	2906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021026	TTG	2	6	2926	2931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480533971
38	NC_021026	TGT	2	6	3044	3049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480533971
39	NC_021026	ATG	2	6	3051	3056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533971
40	NC_021026	ATT	2	6	3090	3095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480533971
41	NC_021026	CAG	2	6	3195	3200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480533972
42	NC_021026	GCA	2	6	3269	3274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480533972
43	NC_021026	TGG	2	6	3312	3317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480533972
44	NC_021026	TGA	3	9	3505	3513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533972
45	NC_021026	TTC	2	6	3690	3695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480533972
46	NC_021026	AGA	2	6	3715	3720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533972
47	NC_021026	GAC	2	6	3790	3795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480533972
48	NC_021026	AGT	2	6	3904	3909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533972
49	NC_021026	GAA	2	6	3932	3937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533972
50	NC_021026	GAT	2	6	3950	3955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533972
51	NC_021026	AAG	2	6	4071	4076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533972
52	NC_021026	CTC	2	6	4110	4115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480533972
53	NC_021026	AGC	2	6	4117	4122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480533972
54	NC_021026	TAT	2	6	4126	4131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480533972
55	NC_021026	AAG	2	6	4218	4223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533972
56	NC_021026	GAA	2	6	4238	4243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533972
57	NC_021026	TAA	2	6	4305	4310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021026	GAA	2	6	4463	4468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533973
59	NC_021026	TTA	2	6	4599	4604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480533973
60	NC_021026	GAT	2	6	4647	4652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533973
61	NC_021026	CAG	2	6	4696	4701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480533973
62	NC_021026	TAT	2	6	4724	4729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480533973
63	NC_021026	GTT	2	6	4800	4805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480533973
64	NC_021026	CAT	2	6	4806	4811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480533973
65	NC_021026	GAT	2	6	4833	4838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533973
66	NC_021026	ACT	2	6	4885	4890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480533973
67	NC_021026	TTA	2	6	4950	4955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480533974
68	NC_021026	CTA	2	6	5044	5049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480533974
69	NC_021026	AGA	2	6	5081	5086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533974
70	NC_021026	GAT	2	6	5187	5192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533974
71	NC_021026	TGG	2	6	5200	5205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480533974
72	NC_021026	GCA	2	6	5304	5309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480533974
73	NC_021026	GAA	2	6	5373	5378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533974
74	NC_021026	GAG	2	6	5467	5472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480533974
75	NC_021026	TGA	2	6	5531	5536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533974
76	NC_021026	AGA	2	6	5714	5719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533974
77	NC_021026	TGA	2	6	5840	5845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533974
78	NC_021026	TGA	2	6	5857	5862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533974
79	NC_021026	AGA	2	6	5906	5911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533974
80	NC_021026	AGA	2	6	6101	6106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533974
81	NC_021026	ATT	2	6	6138	6143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480533974
82	NC_021026	GGA	2	6	6179	6184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480533974
83	NC_021026	CGT	2	6	6348	6353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480533974
84	NC_021026	ACA	2	6	6362	6367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480533974
85	NC_021026	TGT	2	6	6422	6427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480533974
86	NC_021026	CAT	2	6	6429	6434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480533974
87	NC_021026	TGA	2	6	6671	6676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533974
88	NC_021026	TGA	4	12	6731	6742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533974
89	NC_021026	TGA	2	6	6755	6760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533974
90	NC_021026	GAT	2	6	6783	6788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533974
91	NC_021026	GTA	2	6	6796	6801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533974
92	NC_021026	CGA	2	6	6946	6951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480533974
93	NC_021026	TGT	2	6	7127	7132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480533974
94	NC_021026	TGA	2	6	7150	7155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533974
95	NC_021026	TGA	2	6	7160	7165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533974
96	NC_021026	GAA	2	6	7211	7216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533974
97	NC_021026	CCG	2	6	7311	7316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	480533974
98	NC_021026	ACA	2	6	7423	7428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480533974
99	NC_021026	GAC	2	6	7574	7579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480533974
100	NC_021026	TAT	2	6	7583	7588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480533974
101	NC_021026	TTA	2	6	7908	7913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480533974
102	NC_021026	GTA	2	6	8136	8141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533974
103	NC_021026	ATA	2	6	8215	8220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480533974
104	NC_021026	ATT	2	6	8272	8277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480533974
105	NC_021026	TTA	2	6	8409	8414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480533974
106	NC_021026	GAA	2	6	8433	8438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533974
107	NC_021026	TCT	2	6	8457	8462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_021026	AAT	2	6	8485	8490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021026	TAA	2	6	8500	8505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021026	CGT	2	6	8550	8555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480533975
111	NC_021026	TGC	2	6	8671	8676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480533975
112	NC_021026	GCA	2	6	8721	8726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480533975
113	NC_021026	AGA	2	6	8759	8764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533975
114	NC_021026	AAT	2	6	8791	8796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480533976
115	NC_021026	CGT	2	6	8821	8826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480533976
116	NC_021026	TGA	2	6	8834	8839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533976
117	NC_021026	TAT	2	6	8894	8899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480533976
118	NC_021026	TGA	2	6	8997	9002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533976
119	NC_021026	TGC	2	6	9051	9056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480533976
120	NC_021026	TAT	2	6	9079	9084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480533976
121	NC_021026	TTA	2	6	9149	9154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480533977
122	NC_021026	GAA	2	6	9197	9202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533977
123	NC_021026	ATT	2	6	9220	9225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480533977
124	NC_021026	AAG	2	6	9234	9239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533977
125	NC_021026	ATT	2	6	9270	9275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480533978
126	NC_021026	TTG	2	6	9276	9281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480533978
127	NC_021026	AGT	2	6	9329	9334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533978
128	NC_021026	TTA	2	6	9353	9358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480533978
129	NC_021026	TAG	2	6	9451	9456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533978
130	NC_021026	ATC	2	6	9547	9552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480533978
131	NC_021026	CAA	2	6	9604	9609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480533978
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260	NC_021026	GGT	2	6	19527	19532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
261	NC_021026	TCG	2	6	19642	19647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
262	NC_021026	CGT	2	6	19722	19727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
263	NC_021026	AGT	2	6	20180	20185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
264	NC_021026	GTA	2	6	20247	20252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
265	NC_021026	ATG	2	6	20270	20275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
266	NC_021026	TAA	3	9	20341	20349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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268	NC_021026	TAT	2	6	20467	20472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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279	NC_021026	TGA	2	6	21418	21423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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