MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mycoplasma mycoides subsp. mycoides SC str. Gladysdale MU clone SC5

Total Repeats: 1516

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021025	AAAAT	2	10	609	618	80 %	20 %	0 %	0 %	479184589
2	NC_021025	GAATT	2	10	1907	1916	40 %	40 %	20 %	0 %	479183818
3	NC_021025	TAATT	2	10	2235	2244	40 %	60 %	0 %	0 %	479183818
4	NC_021025	GATTT	2	10	2339	2348	20 %	60 %	20 %	0 %	479183818
5	NC_021025	AATAG	2	10	3097	3106	60 %	20 %	20 %	0 %	479184663
6	NC_021025	CAAAA	2	10	3297	3306	80 %	0 %	0 %	20 %	479183934
7	NC_021025	CAAAA	2	10	3894	3903	80 %	0 %	0 %	20 %	479183934
8	NC_021025	ATAAA	2	10	4305	4314	80 %	20 %	0 %	0 %	479184798
9	NC_021025	CTAAA	2	10	4326	4335	60 %	20 %	0 %	20 %	479184798
10	NC_021025	GTATT	2	10	5228	5237	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021025	ATTAT	2	10	5470	5479	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021025	AGTTT	2	10	5797	5806	20 %	60 %	20 %	0 %	479183841
13	NC_021025	ATAAA	2	10	6227	6236	80 %	20 %	0 %	0 %	479183841
14	NC_021025	GATTA	2	10	9861	9870	40 %	40 %	20 %	0 %	479184653
15	NC_021025	TGATT	2	10	10682	10691	20 %	60 %	20 %	0 %	479184186
16	NC_021025	TAAAT	2	10	11054	11063	60 %	40 %	0 %	0 %	479184867
17	NC_021025	AATTT	2	10	11343	11352	40 %	60 %	0 %	0 %	479184867
18	NC_021025	GTAAA	2	10	12498	12507	60 %	20 %	20 %	0 %	479184867
19	NC_021025	TTTAA	2	10	12837	12846	40 %	60 %	0 %	0 %	479184867
20	NC_021025	TAGTT	2	10	13469	13478	20 %	60 %	20 %	0 %	479184867
21	NC_021025	CATAC	2	10	14079	14088	40 %	20 %	0 %	40 %	479183852
22	NC_021025	CATAT	2	10	14121	14130	40 %	40 %	0 %	20 %	479183852
23	NC_021025	ATTTC	2	10	14431	14440	20 %	60 %	0 %	20 %	479183852
24	NC_021025	CTAAT	2	10	14480	14489	40 %	40 %	0 %	20 %	479183852
25	NC_021025	TAATA	2	10	14823	14832	60 %	40 %	0 %	0 %	479183852
26	NC_021025	AAATA	2	10	14976	14985	80 %	20 %	0 %	0 %	479183852
27	NC_021025	TTTTG	2	10	16473	16482	0 %	80 %	20 %	0 %	479184724
28	NC_021025	TATCA	2	10	17115	17124	40 %	40 %	0 %	20 %	479184192
29	NC_021025	ATTTA	2	10	18270	18279	40 %	60 %	0 %	0 %	479184192
30	NC_021025	ATTTT	2	10	21038	21047	20 %	80 %	0 %	0 %	479184711
31	NC_021025	TCCAT	2	10	21798	21807	20 %	40 %	0 %	40 %	479184711
32	NC_021025	TCAAT	2	10	21997	22006	40 %	40 %	0 %	20 %	479184711
33	NC_021025	TGTTA	2	10	22295	22304	20 %	60 %	20 %	0 %	479184583
34	NC_021025	TGAAT	2	10	22446	22455	40 %	40 %	20 %	0 %	479184583
35	NC_021025	TTCTA	2	10	23320	23329	20 %	60 %	0 %	20 %	479184139
36	NC_021025	ATTTA	2	10	23458	23467	40 %	60 %	0 %	0 %	479184139
37	NC_021025	ATATT	2	10	23774	23783	40 %	60 %	0 %	0 %	479184752
38	NC_021025	TAAGT	2	10	23978	23987	40 %	40 %	20 %	0 %	479184752
39	NC_021025	TAAGT	2	10	25144	25153	40 %	40 %	20 %	0 %	479184276
40	NC_021025	TGAAT	2	10	25738	25747	40 %	40 %	20 %	0 %	479184280
41	NC_021025	ACATT	2	10	25791	25800	40 %	40 %	0 %	20 %	479184280
42	NC_021025	TTGAT	2	10	26930	26939	20 %	60 %	20 %	0 %	479184414
43	NC_021025	TTGGT	2	10	27710	27719	0 %	60 %	40 %	0 %	479184414
44	NC_021025	ATCAA	2	10	27926	27935	60 %	20 %	0 %	20 %	479184414
45	NC_021025	TATAT	2	10	28244	28253	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021025	TGTTT	2	10	28392	28401	0 %	80 %	20 %	0 %	479183973
47	NC_021025	AAATA	2	10	32669	32678	80 %	20 %	0 %	0 %	479184319
48	NC_021025	AAAAC	2	10	32886	32895	80 %	0 %	0 %	20 %	479184319
49	NC_021025	TAATT	2	10	33525	33534	40 %	60 %	0 %	0 %	479184803
50	NC_021025	TTTGA	2	10	33933	33942	20 %	60 %	20 %	0 %	479184803
51	NC_021025	TCTTT	2	10	34212	34221	0 %	80 %	0 %	20 %	479184803
52	NC_021025	GTTTT	2	10	34899	34908	0 %	80 %	20 %	0 %	479184172
53	NC_021025	TGGTT	2	10	35425	35434	0 %	60 %	40 %	0 %	479184172
54	NC_021025	TATCT	2	10	35807	35816	20 %	60 %	0 %	20 %	479184172
55	NC_021025	AAAAT	2	10	36558	36567	80 %	20 %	0 %	0 %	479184172
56	NC_021025	ATTAT	3	15	37819	37833	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021025	TTTAA	2	10	38215	38224	40 %	60 %	0 %	0 %	479184379
58	NC_021025	ACAAA	2	10	38673	38682	80 %	0 %	0 %	20 %	479184379
59	NC_021025	ATCAA	2	10	40671	40680	60 %	20 %	0 %	20 %	479184379
60	NC_021025	AATTT	2	10	41071	41080	40 %	60 %	0 %	0 %	479184379
61	NC_021025	TAAGT	2	10	41271	41280	40 %	40 %	20 %	0 %	479184379
62	NC_021025	TAGTT	2	10	42102	42111	20 %	60 %	20 %	0 %	479184379
63	NC_021025	TATTT	2	10	42238	42247	20 %	80 %	0 %	0 %	479184379
64	NC_021025	TACAA	2	10	42700	42709	60 %	20 %	0 %	20 %	479184379
65	NC_021025	TTATG	2	10	42920	42929	20 %	60 %	20 %	0 %	479184379
66	NC_021025	TTTTA	2	10	43467	43476	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021025	TTTAG	2	10	44055	44064	20 %	60 %	20 %	0 %	479184048
68	NC_021025	TAAAA	2	10	45855	45864	80 %	20 %	0 %	0 %	479184532
69	NC_021025	CTTAT	2	10	46723	46732	20 %	60 %	0 %	20 %	479184468
70	NC_021025	AAAGA	2	10	47444	47453	80 %	0 %	20 %	0 %	479183888
71	NC_021025	TTTCA	2	10	49130	49139	20 %	60 %	0 %	20 %	479184460
72	NC_021025	ACATT	2	10	49374	49383	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_021025	AGAAA	2	10	50751	50760	80 %	0 %	20 %	0 %	479184042
74	NC_021025	ATTTT	2	10	52540	52549	20 %	80 %	0 %	0 %	479183896
75	NC_021025	TAGTA	2	10	54031	54040	40 %	40 %	20 %	0 %	479184204
76	NC_021025	ATATT	2	10	54768	54777	40 %	60 %	0 %	0 %	479183894
77	NC_021025	AATGT	2	10	56921	56930	40 %	40 %	20 %	0 %	479184159
78	NC_021025	TTGTT	2	10	57120	57129	0 %	80 %	20 %	0 %	479184159
79	NC_021025	GATTT	2	10	57709	57718	20 %	60 %	20 %	0 %	479183969
80	NC_021025	ATTTT	2	10	57813	57822	20 %	80 %	0 %	0 %	479183969
81	NC_021025	TTTGT	2	10	58092	58101	0 %	80 %	20 %	0 %	479183969
82	NC_021025	TAAAA	2	10	58750	58759	80 %	20 %	0 %	0 %	479183969
83	NC_021025	TTGTT	2	10	58810	58819	0 %	80 %	20 %	0 %	479183969
84	NC_021025	AATTA	2	10	59371	59380	60 %	40 %	0 %	0 %	479183905
85	NC_021025	ATTAT	2	10	59843	59852	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021025	TTCTT	2	10	60777	60786	0 %	80 %	0 %	20 %	479184381
87	NC_021025	GTAAA	2	10	62421	62430	60 %	20 %	20 %	0 %	479184500
88	NC_021025	TTTTA	2	10	63703	63712	20 %	80 %	0 %	0 %	479184500
89	NC_021025	GTTAA	2	10	64682	64691	40 %	40 %	20 %	0 %	479184128
90	NC_021025	TATTT	2	10	65287	65296	20 %	80 %	0 %	0 %	479184356
91	NC_021025	ATTTT	2	10	66436	66445	20 %	80 %	0 %	0 %	479184356
92	NC_021025	AATTA	2	10	66673	66682	60 %	40 %	0 %	0 %	479184356
93	NC_021025	TGTTA	2	10	67075	67084	20 %	60 %	20 %	0 %	479184387
94	NC_021025	TGAAT	2	10	67226	67235	40 %	40 %	20 %	0 %	479184387
95	NC_021025	TTTCA	2	10	70944	70953	20 %	60 %	0 %	20 %	479184695
96	NC_021025	ACATT	2	10	71188	71197	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_021025	CTATT	2	10	72086	72095	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_021025	AATTA	2	10	72850	72859	60 %	40 %	0 %	0 %	479184227
99	NC_021025	ATAAA	2	10	73166	73175	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021025	CAAAA	2	10	74796	74805	80 %	0 %	0 %	20 %	479184375
101	NC_021025	TTAGG	2	10	74818	74827	20 %	40 %	40 %	0 %	479184375
102	NC_021025	CAAGT	2	10	74896	74905	40 %	20 %	20 %	20 %	479184375
103	NC_021025	TATAA	2	10	75625	75634	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021025	AAAAC	2	10	76050	76059	80 %	0 %	0 %	20 %	479183979
105	NC_021025	GATTA	2	10	76487	76496	40 %	40 %	20 %	0 %	479183979
106	NC_021025	AACAA	2	10	76690	76699	80 %	0 %	0 %	20 %	479183979
107	NC_021025	AAATT	2	10	76783	76792	60 %	40 %	0 %	0 %	479183979
108	NC_021025	TAAAA	2	10	76924	76933	80 %	20 %	0 %	0 %	479183979
109	NC_021025	TAGTT	2	10	77450	77459	20 %	60 %	20 %	0 %	479184701
110	NC_021025	ATTAG	2	10	77772	77781	40 %	40 %	20 %	0 %	479184701
111	NC_021025	AAAAG	2	10	78251	78260	80 %	0 %	20 %	0 %	479184701
112	NC_021025	AACAA	2	10	78393	78402	80 %	0 %	0 %	20 %	479184719
113	NC_021025	TAATG	2	10	79934	79943	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021025	AATGA	2	10	80177	80186	60 %	20 %	20 %	0 %	479184081
115	NC_021025	CATTT	2	10	83384	83393	20 %	60 %	0 %	20 %	479184486
116	NC_021025	TTCAA	2	10	84689	84698	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_021025	TTTCA	2	10	90104	90113	20 %	60 %	0 %	20 %	479184010
118	NC_021025	ACATT	2	10	90348	90357	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_021025	TAAAC	2	10	91694	91703	60 %	20 %	0 %	20 %	479184077
120	NC_021025	TTTGT	2	10	91888	91897	0 %	80 %	20 %	0 %	479184077
121	NC_021025	AATTT	2	10	93249	93258	40 %	60 %	0 %	0 %	479183927
122	NC_021025	TTTAG	2	10	93312	93321	20 %	60 %	20 %	0 %	479183927
123	NC_021025	TAAAG	2	10	93755	93764	60 %	20 %	20 %	0 %	479183927
124	NC_021025	GAATA	2	10	94460	94469	60 %	20 %	20 %	0 %	479183927
125	NC_021025	AGTTT	2	10	94626	94635	20 %	60 %	20 %	0 %	479183927
126	NC_021025	TAATT	2	10	95525	95534	40 %	60 %	0 %	0 %	479183927
127	NC_021025	TAAAT	2	10	97446	97455	60 %	40 %	0 %	0 %	479183832
128	NC_021025	AGTGT	2	10	97525	97534	20 %	40 %	40 %	0 %	479183832
129	NC_021025	GGAAT	2	10	98254	98263	40 %	20 %	40 %	0 %	479184673
130	NC_021025	ATTTT	2	10	99929	99938	20 %	80 %	0 %	0 %	479184030
131	NC_021025	ATTTT	2	10	100566	100575	20 %	80 %	0 %	0 %	479184527
132	NC_021025	AATTA	2	10	101345	101354	60 %	40 %	0 %	0 %	479184527
133	NC_021025	TAATT	2	10	103050	103059	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021025	TTGTT	2	10	103275	103284	0 %	80 %	20 %	0 %	479184320
135	NC_021025	ATCAA	2	10	103673	103682	60 %	20 %	0 %	20 %	479184320
136	NC_021025	TTAAA	2	10	104887	104896	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021025	TATTT	2	10	104920	104929	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021025	TATAT	2	10	105165	105174	40 %	60 %	0 %	0 %	479184347
139	NC_021025	TATAA	2	10	106266	106275	60 %	40 %	0 %	0 %	479183859
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