MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma mycoides subsp. mycoides SC str. Gladysdale MU clone SC5

Total Repeats: 268

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021025	GTATT	2	10	5228	5237	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021025	ATTAT	2	10	5470	5479	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021025	TATAT	2	10	28244	28253	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021025	ATTAT	3	15	37819	37833	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021025	TTTTA	2	10	43467	43476	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021025	ACATT	2	10	49374	49383	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_021025	ATTAT	2	10	59843	59852	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021025	ACATT	2	10	71188	71197	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_021025	CTATT	2	10	72086	72095	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_021025	ATAAA	2	10	73166	73175	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021025	TATAA	2	10	75625	75634	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021025	TAATG	2	10	79934	79943	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021025	TTCAA	2	10	84689	84698	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_021025	ACATT	2	10	90348	90357	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_021025	TAATT	2	10	103050	103059	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021025	TTAAA	2	10	104887	104896	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021025	TATTT	2	10	104920	104929	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021025	ACAAA	2	10	111271	111280	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_021025	AAAAC	2	10	112228	112237	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_021025	CTTAT	2	10	113693	113702	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_021025	ACATT	2	10	116868	116877	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_021025	TAATG	2	10	117569	117578	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021025	ATAAA	2	10	124600	124609	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021025	TAATT	2	10	124756	124765	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021025	TAATG	2	10	128667	128676	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021025	ACTAT	2	10	144993	145002	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_021025	ATAGT	2	10	147160	147169	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021025	TTTAT	2	10	151180	151189	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021025	TAATG	2	10	154125	154134	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021025	AATTT	2	10	158341	158350	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021025	AAAAT	2	10	170863	170872	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021025	TTACC	2	10	173409	173418	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
33	NC_021025	TAATG	2	10	174501	174510	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021025	AAATT	2	10	179494	179503	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021025	AAAAT	2	10	179556	179565	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021025	ATAAA	2	10	189804	189813	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021025	ATTTT	2	10	192073	192082	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021025	AAAAC	2	10	202431	202440	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_021025	TTTAA	2	10	202593	202602	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021025	TAAAA	2	10	202829	202838	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021025	AAATA	2	10	203327	203336	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021025	TAAAA	2	10	203480	203489	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021025	TTAGT	2	10	207275	207284	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021025	ACATT	2	10	209353	209362	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_021025	AAGTT	2	10	210349	210358	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021025	ACATT	2	10	213637	213646	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_021025	AACAA	2	10	221498	221507	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_021025	TAAAA	2	10	239471	239480	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021025	TATAT	2	10	241408	241417	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021025	AATTA	2	10	244341	244350	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021025	AAAAT	2	10	256693	256702	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021025	TTAAA	2	10	257581	257590	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021025	AAAAT	2	10	257679	257688	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021025	TTTAA	2	10	257713	257722	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021025	TAATG	2	10	266334	266343	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021025	TAGAT	2	10	271765	271774	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021025	TTTAT	2	10	277620	277629	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021025	ATATT	2	10	278871	278880	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021025	CATGA	2	10	278993	279002	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_021025	ACATT	2	10	291091	291100	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_021025	AAATT	2	10	293267	293276	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021025	ACATT	2	10	296833	296842	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_021025	TAATA	2	10	299329	299338	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021025	TATTT	2	10	303477	303486	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021025	GTAAA	2	10	309193	309202	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021025	TTAAA	2	10	311258	311267	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021025	TAAAA	2	10	311437	311446	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021025	TTAAA	2	10	326636	326645	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021025	AAACA	2	10	335092	335101	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_021025	CAAAA	2	10	335199	335208	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_021025	TAATT	2	10	335243	335252	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021025	GAAAA	2	10	337009	337018	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021025	AAAAT	2	10	337154	337163	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021025	TTATT	2	10	338062	338071	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021025	ATTTT	2	10	345648	345657	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021025	AATTA	2	10	350589	350598	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021025	TTTTC	2	10	352235	352244	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_021025	TAATT	2	10	352325	352334	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021025	TTTAT	2	10	362661	362670	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021025	ACATT	2	10	376330	376339	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_021025	TAATT	2	10	377240	377249	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021025	ATAAA	2	10	377505	377514	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021025	TTTAT	2	10	383046	383055	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021025	ATTTT	2	10	383206	383215	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021025	TATGA	2	10	383795	383804	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021025	TCCAA	2	10	383856	383865	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
87	NC_021025	TAATT	2	10	384618	384627	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021025	CAATT	2	10	387569	387578	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_021025	TAATG	2	10	391052	391061	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021025	TTAAT	2	10	395845	395854	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021025	ATAAA	2	10	395928	395937	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021025	AAATT	2	10	396403	396412	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021025	TAATG	2	10	398533	398542	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021025	TAAAA	2	10	401845	401854	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021025	ACATT	2	10	403788	403797	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_021025	TAAAA	2	10	407690	407699	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021025	TTTAG	2	10	419366	419375	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021025	TAGTT	2	10	424738	424747	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021025	TAATG	2	10	425716	425725	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021025	TAGTT	2	10	427784	427793	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021025	TTTAA	2	10	427980	427989	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021025	TAGAT	2	10	428093	428102	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021025	TTTAA	2	10	428275	428284	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021025	TATAT	2	10	429239	429248	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021025	AAATT	2	10	431121	431130	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021025	TTTAT	2	10	436801	436810	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021025	AATTA	2	10	439018	439027	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021025	ATTTA	2	10	439060	439069	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021025	TAAAT	2	10	439183	439192	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021025	TAATG	2	10	442036	442045	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021025	ATTAC	2	10	446276	446285	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_021025	TATAA	2	10	446821	446830	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021025	TAAGT	2	10	452844	452853	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021025	TTAAT	2	10	460749	460758	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021025	TTCTT	2	10	461702	461711	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_021025	ATTTA	2	10	463865	463874	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021025	CTAAA	2	10	463920	463929	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_021025	AATTT	2	10	468232	468241	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021025	AATCA	2	10	468858	468867	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_021025	TAATA	2	10	468987	468996	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021025	ACATT	2	10	470812	470821	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_021025	ATATA	3	15	471660	471674	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021025	TAATG	2	10	477524	477533	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021025	ACATT	2	10	481608	481617	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_021025	ATTCA	2	10	482156	482165	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_021025	AAATT	2	10	486392	486401	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021025	ATTTT	2	10	498375	498384	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021025	AAGGA	2	10	510655	510664	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021025	AAAAC	2	10	511266	511275	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_021025	TAAAT	2	10	519738	519747	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021025	TATTT	2	10	533810	533819	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021025	AACAT	2	10	536333	536342	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_021025	ATTTT	2	10	552682	552691	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021025	TATAT	2	10	555693	555702	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021025	ATTAG	2	10	569082	569091	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021025	TAATT	2	10	583144	583153	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021025	ATTTT	2	10	589772	589781	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021025	TTTTA	2	10	594587	594596	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021025	TAATA	2	10	597283	597292	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021025	TAACA	2	10	597499	597508	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_021025	TAATG	2	10	603985	603994	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021025	TAATG	2	10	622316	622325	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021025	TAATG	2	10	637323	637332	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021025	TGAAT	2	10	649988	649997	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021025	ACATT	2	10	652783	652792	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_021025	ATTTA	2	10	652918	652927	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021025	GGTTG	2	10	656164	656173	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021025	AAGAA	2	10	658620	658629	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.