MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Ruminococcus obeum A2-162 draft genome

Total Repeats: 10892

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021022	ACA	2	6	33	38	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_021022	AAT	2	6	85	90	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021022	TAA	2	6	143	148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021022	AGT	2	6	212	217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021022	ATT	2	6	290	295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021022	CCA	2	6	297	302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_021022	TGA	2	6	309	314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021022	CAA	2	6	320	325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_021022	TGT	2	6	643	648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021022	CCT	2	6	2683	2688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_021022	CCG	2	6	2717	2722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_021022	ATC	2	6	3179	3184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_021022	TGT	2	6	3218	3223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021022	TTC	2	6	3302	3307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_021022	ACC	2	6	3555	3560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_021022	ATC	2	6	3616	3621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_021022	AGG	2	6	3712	3717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021022	AAG	2	6	4390	4395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021022	CAG	2	6	4401	4406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_021022	ATT	2	6	8463	8468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021022	AGG	2	6	8510	8515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021022	ATT	2	6	8516	8521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021022	CAG	2	6	13802	13807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_021022	TCC	2	6	13833	13838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_021022	GAT	2	6	13892	13897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021022	AGA	2	6	13933	13938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021022	GGC	2	6	14062	14067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_021022	GGA	2	6	14174	14179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021022	GCG	2	6	14188	14193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_021022	GTA	2	6	14196	14201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021022	CTG	2	6	14223	14228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_021022	GGC	2	6	14384	14389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_021022	ATC	2	6	14445	14450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_021022	GAA	2	6	14522	14527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021022	AAT	2	6	14676	14681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021022	GAA	2	6	14775	14780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021022	AAG	2	6	14797	14802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021022	GCA	2	6	14975	14980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_021022	AAG	2	6	15045	15050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021022	GTT	2	6	15106	15111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021022	ACC	2	6	15193	15198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_021022	GCA	2	6	15201	15206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_021022	TTA	2	6	15250	15255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021022	GGA	2	6	15391	15396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021022	GAA	2	6	15416	15421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021022	TAT	2	6	15437	15442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021022	GAG	2	6	15632	15637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021022	GAA	2	6	15643	15648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021022	AGA	2	6	15654	15659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021022	TGA	2	6	15672	15677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021022	ATT	2	6	15696	15701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021022	TGA	2	6	15760	15765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021022	TAT	2	6	15783	15788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021022	ATG	2	6	15789	15794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021022	ATG	2	6	15917	15922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021022	GCA	2	6	15939	15944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_021022	GAA	2	6	15992	15997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021022	AGA	2	6	16122	16127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021022	TGC	2	6	16140	16145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_021022	GAA	2	6	16151	16156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021022	AGA	2	6	16168	16173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021022	AGC	2	6	16200	16205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_021022	GAT	2	6	16276	16281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021022	TGC	2	6	16321	16326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_021022	GTT	2	6	16408	16413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021022	TAT	2	6	16434	16439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021022	GAA	2	6	16553	16558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021022	TAT	2	6	16565	16570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021022	GCA	2	6	16580	16585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_021022	TAA	2	6	18052	18057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021022	GAT	2	6	18291	18296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021022	AGG	2	6	19194	19199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021022	GAG	2	6	19232	19237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021022	AGC	2	6	19246	19251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_021022	GAT	2	6	19355	19360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021022	GCA	2	6	19445	19450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_021022	TGA	2	6	19456	19461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021022	GGT	2	6	19549	19554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021022	TGA	2	6	19578	19583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021022	TAC	2	6	20297	20302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_021022	TCT	2	6	20367	20372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_021022	GGC	2	6	20376	20381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_021022	AGA	2	6	20451	20456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021022	ATC	2	6	20494	20499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_021022	GAA	2	6	20544	20549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021022	GTT	2	6	20552	20557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021022	CAG	2	6	20697	20702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_021022	GAA	3	9	20965	20973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021022	TCT	2	6	21033	21038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_021022	TCC	2	6	24875	24880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_021022	ATA	2	6	24971	24976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021022	GCC	2	6	25035	25040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_021022	CCT	2	6	28953	28958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_021022	TTC	2	6	28972	28977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_021022	TGC	2	6	28997	29002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_021022	TCA	2	6	29010	29015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_021022	GCA	2	6	29287	29292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_021022	TTA	2	6	29369	29374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021022	ATT	2	6	29421	29426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021022	ATG	2	6	29449	29454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021022	TGA	2	6	29459	29464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021022	TCA	2	6	29555	29560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_021022	TGG	2	6	29627	29632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021022	ATA	2	6	31119	31124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021022	CGC	2	6	31164	31169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_021022	ATA	2	6	31377	31382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021022	AAT	2	6	31391	31396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021022	AAG	2	6	31466	31471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021022	GAT	2	6	31490	31495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021022	TGG	2	6	31503	31508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021022	CTA	2	6	31696	31701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_021022	CAG	2	6	31784	31789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_021022	CTT	2	6	31912	31917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_021022	AAC	2	6	31980	31985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_021022	ACA	2	6	32978	32983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_021022	AAC	2	6	33013	33018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_021022	ACA	2	6	35647	35652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_021022	ATT	2	6	36701	36706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021022	AGG	2	6	40941	40946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021022	GAA	2	6	40950	40955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021022	GTT	2	6	41774	41779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021022	CAT	2	6	44461	44466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_021022	ACA	2	6	44673	44678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_021022	GAA	2	6	46394	46399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021022	TTC	2	6	49832	49837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_021022	CCA	2	6	49866	49871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_021022	AAT	2	6	49946	49951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021022	CAT	2	6	49961	49966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_021022	CTT	2	6	53685	53690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_021022	ATC	2	6	53753	53758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_021022	TGT	2	6	53804	53809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021022	AGC	2	6	53936	53941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_021022	AAT	2	6	54246	54251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021022	ATT	2	6	54298	54303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021022	GAA	2	6	54355	54360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021022	AGG	2	6	54362	54367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021022	ATA	2	6	56890	56895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021022	GCA	2	6	56914	56919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_021022	AAG	2	6	56961	56966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021022	GAA	2	6	57988	57993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021022	TCT	2	6	58021	58026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_021022	GAA	2	6	58063	58068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021022	AGG	2	6	58081	58086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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153	NC_021022	CAG	2	6	61822	61827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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165	NC_021022	AAG	2	6	68292	68297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
166	NC_021022	GGC	2	6	68321	68326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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