MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Faecalibacterium prausnitzii SL3/3 draft genome

Total Repeats: 299

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021020	GACCAA	2	12	12895	12906	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_021020	GCCGGA	2	12	29100	29111	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021020	TCCGCT	2	12	44971	44982	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
4	NC_021020	GACATA	2	12	82256	82267	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_021020	ATTCGC	2	12	82316	82327	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_021020	CGAGGC	2	12	88956	88967	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_021020	GACGAG	2	12	148320	148331	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_021020	GCATTT	2	12	148848	148859	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_021020	CACGGA	2	12	149057	149068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_021020	TGAAGC	2	12	150311	150322	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_021020	GATGTG	2	12	159015	159026	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021020	CCGTAG	2	12	170197	170208	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_021020	GATGGT	2	12	173547	173558	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021020	GGTGCT	2	12	173703	173714	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_021020	GCCAGC	2	12	174343	174354	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
16	NC_021020	GACCAA	2	12	185766	185777	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_021020	AAGGAA	2	12	201656	201667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021020	GCCGAG	2	12	206959	206970	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_021020	GCACAG	2	12	206986	206997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_021020	CTGACC	2	12	208729	208740	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
21	NC_021020	AAAGCA	2	12	209377	209388	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_021020	TGTAGG	2	12	214426	214437	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021020	CGTTGA	2	12	214684	214695	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_021020	TGTGTT	2	12	257512	257523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021020	AGGACA	2	12	264811	264822	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_021020	ACGGAA	2	12	265416	265427	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_021020	AGGGGC	2	12	269704	269715	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_021020	CAGCGC	2	12	269798	269809	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
29	NC_021020	GGCGGT	2	12	269834	269845	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_021020	AAATGC	2	12	283400	283411	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_021020	CTTTTT	2	12	314801	314812	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_021020	ATGTTC	2	12	332920	332931	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_021020	AGATCG	2	12	333380	333391	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_021020	ATAAAG	2	12	335264	335275	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021020	AGCGCC	2	12	348860	348871	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
36	NC_021020	CCTGCG	2	12	349935	349946	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
37	NC_021020	GTCTGC	2	12	350254	350265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_021020	TGTGCC	2	12	350336	350347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_021020	CTGTGC	2	12	350834	350845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_021020	TCAAGG	2	12	351609	351620	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_021020	GCTGCG	2	12	367935	367946	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_021020	AGCCCC	2	12	391533	391544	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_021020	CTCTTT	2	12	407033	407044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_021020	GAACTG	2	12	407799	407810	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_021020	GAATAA	2	12	416704	416715	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021020	CGTAAA	2	12	442566	442577	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_021020	AATTCA	2	12	444505	444516	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_021020	TGCTCC	2	12	451620	451631	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
49	NC_021020	GGGCAA	2	12	454081	454092	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_021020	GCTTTC	2	12	455510	455521	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_021020	GTCAAG	2	12	466010	466021	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_021020	CTTTCC	2	12	483195	483206	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_021020	GTGGCG	2	12	484411	484422	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_021020	GGTTTT	2	12	504979	504990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021020	TGGCGG	2	12	505210	505221	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_021020	TTGCAG	2	12	521772	521783	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_021020	AACAGA	2	12	546666	546677	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_021020	AGAGTC	2	12	563577	563588	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_021020	CTTTTG	2	12	571935	571946	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_021020	TGGAAA	2	12	575520	575531	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021020	TCGCTT	2	12	589110	589121	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_021020	GCCAGC	2	12	597903	597914	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
63	NC_021020	GCAGCG	2	12	598224	598235	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_021020	TGCCCA	2	12	598861	598872	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
65	NC_021020	ATCAGA	2	12	612386	612397	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_021020	TTTACG	2	12	652990	653001	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_021020	CTTCAG	2	12	682358	682369	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_021020	GAAAAT	2	12	697464	697475	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021020	TCAGGC	2	12	752162	752173	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_021020	ATCCTC	2	12	752382	752393	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_021020	TGCAAA	2	12	755175	755186	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_021020	TGAATT	2	12	759708	759719	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021020	ATGAAA	2	12	763021	763032	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021020	GCTGCC	2	12	766704	766715	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
75	NC_021020	CCGCAG	2	12	773880	773891	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
76	NC_021020	GCAGCG	2	12	774226	774237	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_021020	CAGCTG	2	12	774612	774623	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_021020	ACCTAC	2	12	787789	787800	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_021020	CAAAAA	2	12	789270	789281	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_021020	TCTTTT	2	12	797489	797500	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_021020	TTTACG	2	12	811132	811143	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_021020	GAGCTG	2	12	818151	818162	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_021020	AAAGCA	2	12	824112	824123	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_021020	CAAGGA	2	12	834510	834521	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_021020	AGATTG	2	12	838505	838516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021020	CTTTTT	2	12	853097	853108	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_021020	TGCCCT	2	12	854673	854684	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
88	NC_021020	AAGCAA	2	12	856987	856998	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_021020	CGAAAA	2	12	861658	861669	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_021020	CCCGCC	2	12	872557	872568	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
91	NC_021020	AAAATA	2	12	872726	872737	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021020	TTATTT	2	12	889371	889382	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021020	GAAAAA	2	12	894630	894641	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021020	TGCCCT	2	12	906378	906389	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
95	NC_021020	AAAGCC	2	12	920020	920031	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_021020	TTTGCC	2	12	934955	934966	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_021020	ATCCTC	2	12	971167	971178	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_021020	GAAAAA	2	12	1011017	1011028	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021020	ATTTTG	2	12	1011325	1011336	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021020	TTTTTC	2	12	1056826	1056837	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_021020	CATTGT	2	12	1098426	1098437	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_021020	CGTGGG	2	12	1101941	1101952	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_021020	GGCGTG	2	12	1101957	1101968	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_021020	CATCTT	2	12	1102292	1102303	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_021020	GATGCA	2	12	1106106	1106117	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_021020	GACATG	2	12	1116849	1116860	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_021020	GGGCTG	2	12	1146341	1146352	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_021020	TGGCGC	2	12	1148308	1148319	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_021020	GGCCGA	2	12	1163003	1163014	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_021020	TGGGCG	2	12	1167568	1167579	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_021020	ATTTTG	2	12	1196399	1196410	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021020	GAAAAA	2	12	1200862	1200873	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021020	CCTGCC	2	12	1215138	1215149	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_021020	TACTTT	2	12	1222765	1222776	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_021020	TCATCC	2	12	1227962	1227973	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_021020	CGCGGG	2	12	1228996	1229007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_021020	CAAAAT	2	12	1231866	1231877	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_021020	TTTTTA	2	12	1247576	1247587	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021020	AAAATC	2	12	1263173	1263184	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_021020	GAGCAG	2	12	1294976	1294987	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_021020	CGGCAT	2	12	1295554	1295565	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_021020	CTGATC	2	12	1306431	1306442	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_021020	CACTGC	2	12	1311335	1311346	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
124	NC_021020	GACTGG	2	12	1339887	1339898	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_021020	ATAAAA	2	12	1342721	1342732	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021020	CAAGGA	2	12	1343598	1343609	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_021020	TGTGTT	2	12	1362179	1362190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021020	AGCCCC	2	12	1363574	1363585	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_021020	TGCTTT	2	12	1368069	1368080	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_021020	TTTTGC	2	12	1368123	1368134	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_021020	CCCCGA	2	12	1370546	1370557	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_021020	CCCAGA	2	12	1370867	1370878	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
133	NC_021020	GCATCG	2	12	1371515	1371526	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_021020	GGATGC	2	12	1399483	1399494	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_021020	AAACCC	2	12	1426862	1426873	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_021020	AAAATA	2	12	1428643	1428654	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_021020	CCTCTC	2	12	1630185	1630196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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243	NC_021020	TTTATA	2	12	2586239	2586250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
244	NC_021020	GACAAG	2	12	2597100	2597111	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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247	NC_021020	AAAAAG	2	12	2635692	2635703	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
248	NC_021020	CAGCTA	2	12	2658175	2658186	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
249	NC_021020	CTTGGC	2	12	2661203	2661214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
250	NC_021020	GTCATC	2	12	2690713	2690724	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
251	NC_021020	GCAGAA	2	12	2690905	2690916	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
252	NC_021020	GAAACG	2	12	2693188	2693199	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
253	NC_021020	CTTTTT	2	12	2693403	2693414	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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258	NC_021020	ATAAAA	2	12	2765969	2765980	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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260	NC_021020	CAGCTC	2	12	2833217	2833228	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
261	NC_021020	TGGGCG	2	12	2833323	2833334	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
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263	NC_021020	CTGCCG	2	12	2833902	2833913	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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273	NC_021020	AAGCTG	2	12	2931908	2931919	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
274	NC_021020	AAATAA	2	12	2965942	2965953	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
275	NC_021020	TGCCGC	2	12	2973228	2973239	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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278	NC_021020	GCTGGA	2	12	2999529	2999540	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
279	NC_021020	TGAGAG	2	12	3022067	3022078	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_021020	CCGCAG	2	12	3025495	3025506	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
282	NC_021020	CATCGG	2	12	3026508	3026519	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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287	NC_021020	AGCAGG	2	12	3072838	3072849	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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296	NC_021020	CGCACT	2	12	3173056	3173067	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
297	NC_021020	CGGTGG	2	12	3188774	3188785	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
298	NC_021020	TGGTGC	2	12	3202644	3202655	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
299	NC_021020	GGCAGC	2	12	3202876	3202887	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.