MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Faecalibacterium prausnitzii SL3/3 draft genome

Total Repeats: 709

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021020	GCAGA	2	10	2193276	2193285	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
502	NC_021020	GCGCC	2	10	2193453	2193462	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
503	NC_021020	GCTTG	2	10	2194921	2194930	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
504	NC_021020	TGAAC	2	10	2195333	2195342	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
505	NC_021020	GCGGT	2	10	2195892	2195901	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
506	NC_021020	AGACA	2	10	2201819	2201828	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
507	NC_021020	TTTGC	2	10	2204334	2204343	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
508	NC_021020	AAACG	2	10	2207350	2207359	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
509	NC_021020	TAGAA	2	10	2215139	2215148	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
510	NC_021020	ATACT	2	10	2215246	2215255	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
511	NC_021020	GAGCA	2	10	2224796	2224805	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
512	NC_021020	CCACC	2	10	2227222	2227231	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
513	NC_021020	GTTGT	2	10	2254827	2254836	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
514	NC_021020	TTTTC	2	10	2268501	2268510	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
515	NC_021020	AGGGA	2	10	2268916	2268925	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
516	NC_021020	ACCCA	2	10	2271181	2271190	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
517	NC_021020	TTTAA	2	10	2277145	2277154	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_021020	TTATA	2	10	2278081	2278090	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_021020	TATTT	2	10	2279028	2279037	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_021020	CAAAA	2	10	2282258	2282267	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
521	NC_021020	ATAAA	2	10	2286139	2286148	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_021020	GTATC	2	10	2290447	2290456	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
523	NC_021020	TCTGC	2	10	2294850	2294859	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
524	NC_021020	ATGTA	2	10	2295582	2295591	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
525	NC_021020	GTTCT	2	10	2300931	2300940	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
526	NC_021020	TATTT	2	10	2303052	2303061	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_021020	AAAAT	2	10	2305624	2305633	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_021020	TGTAT	2	10	2309306	2309315	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
529	NC_021020	TGTAT	2	10	2312976	2312985	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
530	NC_021020	GGGAT	2	10	2313623	2313632	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
531	NC_021020	TGATA	2	10	2313943	2313952	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
532	NC_021020	TAAAG	2	10	2314026	2314035	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
533	NC_021020	ATACA	2	10	2314352	2314361	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
534	NC_021020	TGGAA	2	10	2320471	2320480	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
535	NC_021020	ATTCT	2	10	2320769	2320778	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
536	NC_021020	AAAAG	2	10	2349335	2349344	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
537	NC_021020	TTCTC	2	10	2357158	2357167	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
538	NC_021020	GGTGA	2	10	2357230	2357239	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
539	NC_021020	GGTAT	2	10	2358590	2358599	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
540	NC_021020	TGATT	2	10	2358846	2358855	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
541	NC_021020	GGCTG	2	10	2361910	2361919	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
542	NC_021020	GTACC	2	10	2362005	2362014	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
543	NC_021020	TTCTT	2	10	2372841	2372850	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
544	NC_021020	TACAA	2	10	2383781	2383790	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
545	NC_021020	GCACC	2	10	2396211	2396220	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
546	NC_021020	CTCGA	2	10	2396517	2396526	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
547	NC_021020	GAAAA	2	10	2399281	2399290	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
548	NC_021020	TACCT	2	10	2412034	2412043	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
549	NC_021020	TCAAT	2	10	2417583	2417592	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
550	NC_021020	GGAGG	2	10	2431100	2431109	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
551	NC_021020	GAAAA	2	10	2445099	2445108	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
552	NC_021020	CTTTA	2	10	2445150	2445159	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
553	NC_021020	AGGAA	2	10	2449214	2449223	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
554	NC_021020	CACGG	2	10	2461683	2461692	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
555	NC_021020	TCAGA	2	10	2462700	2462709	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
556	NC_021020	TTTTC	2	10	2468117	2468126	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
557	NC_021020	CAAAG	2	10	2468990	2468999	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
558	NC_021020	AAAAT	2	10	2474698	2474707	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_021020	TATAC	2	10	2474744	2474753	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
560	NC_021020	ATAGG	2	10	2480447	2480456	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
561	NC_021020	GGACG	2	10	2481099	2481108	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
562	NC_021020	GGCAG	2	10	2487211	2487220	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
563	NC_021020	CAAAA	2	10	2499778	2499787	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
564	NC_021020	AGCGG	2	10	2504229	2504238	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
565	NC_021020	GAAGT	2	10	2506285	2506294	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
566	NC_021020	CGCAG	2	10	2506734	2506743	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
567	NC_021020	AAACA	2	10	2507115	2507124	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
568	NC_021020	CTTTT	2	10	2510515	2510524	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
569	NC_021020	CGGGG	2	10	2521595	2521604	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
570	NC_021020	GCACT	2	10	2522365	2522374	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
571	NC_021020	GGAAA	2	10	2527787	2527796	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
572	NC_021020	CTTCA	2	10	2529076	2529085	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
573	NC_021020	AAGTG	2	10	2531194	2531203	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
574	NC_021020	TCAGG	2	10	2536107	2536116	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
575	NC_021020	GAAAA	2	10	2536647	2536656	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
576	NC_021020	GCAGG	2	10	2538906	2538915	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
577	NC_021020	CAAAA	2	10	2550049	2550058	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
578	NC_021020	TACGC	2	10	2552921	2552930	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
579	NC_021020	CGGGG	2	10	2553483	2553492	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
580	NC_021020	CAGCG	2	10	2553864	2553873	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
581	NC_021020	GCGGG	2	10	2561464	2561473	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
582	NC_021020	GACCA	2	10	2568255	2568264	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
583	NC_021020	ACCGC	2	10	2570800	2570809	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
584	NC_021020	CAGCG	2	10	2570909	2570918	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
585	NC_021020	GATGG	2	10	2572218	2572227	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
586	NC_021020	CAGAA	2	10	2572651	2572660	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
587	NC_021020	TCTTT	2	10	2629380	2629389	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
588	NC_021020	GAAAA	2	10	2633693	2633702	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
589	NC_021020	CGCTG	2	10	2639323	2639332	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
590	NC_021020	GAGAG	2	10	2647336	2647345	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
591	NC_021020	GCAAA	2	10	2657695	2657704	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
592	NC_021020	GAAGA	2	10	2665276	2665285	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
593	NC_021020	AAAAC	2	10	2671186	2671195	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
594	NC_021020	GGCGG	2	10	2685081	2685090	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
595	NC_021020	GCACC	2	10	2689137	2689146	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
596	NC_021020	AAGTA	2	10	2690390	2690399	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
597	NC_021020	GTTCA	2	10	2698155	2698164	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
598	NC_021020	CGGCG	2	10	2700135	2700144	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
599	NC_021020	CAAAA	2	10	2703106	2703115	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
600	NC_021020	CGAAA	2	10	2705746	2705755	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
601	NC_021020	GGCGG	2	10	2708545	2708554	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
602	NC_021020	GGGGC	2	10	2709246	2709255	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
603	NC_021020	TATAT	2	10	2711478	2711487	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_021020	CGGCG	2	10	2711833	2711842	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
605	NC_021020	GTTTT	2	10	2727827	2727836	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
606	NC_021020	GCGGT	2	10	2733161	2733170	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
607	NC_021020	CAGAA	2	10	2736300	2736309	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
608	NC_021020	GAAAG	2	10	2742690	2742699	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
609	NC_021020	CATTT	2	10	2744541	2744550	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
610	NC_021020	TCTGC	2	10	2744962	2744971	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
611	NC_021020	TGCCG	2	10	2750155	2750164	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
612	NC_021020	GTCCA	2	10	2751402	2751411	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
613	NC_021020	AAGGT	2	10	2782376	2782385	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
614	NC_021020	CTGGA	2	10	2799502	2799511	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
615	NC_021020	CGCAG	2	10	2800005	2800014	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
616	NC_021020	ACAGA	2	10	2802812	2802821	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
617	NC_021020	TGCGG	2	10	2811432	2811441	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
618	NC_021020	AACAG	2	10	2816233	2816242	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
619	NC_021020	GGCAG	2	10	2816441	2816450	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
620	NC_021020	GCATG	2	10	2818186	2818195	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
621	NC_021020	TCTTT	2	10	2818454	2818463	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
622	NC_021020	GCGCT	2	10	2829666	2829675	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
623	NC_021020	GCTGC	2	10	2832839	2832848	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
624	NC_021020	AGCAG	2	10	2833204	2833213	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
625	NC_021020	GCGCG	2	10	2833885	2833894	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
626	NC_021020	CAGGG	2	10	2834174	2834183	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
627	NC_021020	TTTTG	2	10	2837901	2837910	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
628	NC_021020	CAGGT	2	10	2838037	2838046	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
629	NC_021020	AACGG	2	10	2841141	2841150	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
630	NC_021020	AAAAC	2	10	2847750	2847759	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
631	NC_021020	TTTTC	2	10	2850802	2850811	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
632	NC_021020	CAGGG	2	10	2850857	2850866	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
633	NC_021020	TGCTA	2	10	2856837	2856846	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
634	NC_021020	CCTGT	2	10	2857337	2857346	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
635	NC_021020	GCACC	2	10	2859057	2859066	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
636	NC_021020	CGGCA	2	10	2859468	2859477	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
637	NC_021020	AAGTG	2	10	2874149	2874158	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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639	NC_021020	TAAAA	2	10	2885490	2885499	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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695	NC_021020	GCATC	2	10	3117325	3117334	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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697	NC_021020	ATTCT	2	10	3123307	3123316	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
698	NC_021020	TCTTG	2	10	3128029	3128038	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
699	NC_021020	TCCTT	2	10	3138108	3138117	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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705	NC_021020	GGGTG	2	10	3181531	3181540	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
706	NC_021020	CTGGA	2	10	3182553	3182562	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
707	NC_021020	GCTTT	2	10	3198675	3198684	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
708	NC_021020	CAGCG	2	10	3202342	3202351	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
709	NC_021020	ACGGC	2	10	3209186	3209195	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.