MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Eubacterium cylindroides T2-87 draft genome

Total Repeats: 705

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021019	AATCAA	2	12	5040	5051	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	479169114
2	NC_021019	ATTTCT	2	12	5863	5874	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	479169115
3	NC_021019	TCACTG	2	12	11049	11060	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	479169118
4	NC_021019	GTTAAC	2	12	19125	19136	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_021019	TCAAAA	2	12	21557	21568	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	479169124
6	NC_021019	ACATAT	2	12	27911	27922	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_021019	TGATAA	2	12	35295	35306	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	479169137
8	NC_021019	GAAGTC	2	12	37818	37829	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_021019	GACGAT	2	12	41137	41148	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_021019	TAAAAT	2	12	50656	50667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479169146
11	NC_021019	TGGATA	2	12	52584	52595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479169147
12	NC_021019	AAAGAA	2	12	54138	54149	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	479169148
13	NC_021019	AAGTAA	2	12	61004	61015	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	479169155
14	NC_021019	ATAAAG	2	12	61574	61585	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	479169157
15	NC_021019	TGGAGC	2	12	64469	64480	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_021019	GGTTTG	2	12	65230	65241	0 %	50 %	50 %	0 %	479169163
17	NC_021019	CAAAAT	2	12	70259	70270	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	479169168
18	NC_021019	TTCCTT	2	12	71666	71677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479169170
19	NC_021019	TACGAA	2	12	73747	73758	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	479169171
20	NC_021019	TTTTCT	2	12	75248	75259	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	479169174
21	NC_021019	TACCTT	2	12	81020	81031	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_021019	TTAATA	2	12	81052	81063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021019	TTCTGG	2	12	86855	86866	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	479169185
24	NC_021019	AAAGGC	2	12	88847	88858	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	479169187
25	NC_021019	ATGTGC	2	12	91896	91907	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	479169191
26	NC_021019	ATCGAG	2	12	93934	93945	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	479169192
27	NC_021019	TTGATG	2	12	97399	97410	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	479169195
28	NC_021019	AACAAA	2	12	98360	98371	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	479169196
29	NC_021019	ACGATC	2	12	98898	98909	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	479169197
30	NC_021019	TTTCTT	2	12	98948	98959	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	479169197
31	NC_021019	CATTGG	2	12	100928	100939	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	479169198
32	NC_021019	CTTTAG	2	12	102044	102055	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	479169201
33	NC_021019	TGGTTT	2	12	102577	102588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479169202
34	NC_021019	TTATCT	2	12	108005	108016	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	479169208
35	NC_021019	TTGGTT	2	12	111952	111963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479169212
36	NC_021019	TTTACA	2	12	114889	114900	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	479169215
37	NC_021019	ATTTAA	2	12	118153	118164	50 %	50 %	0 %	0 %	479169218
38	NC_021019	TAGGAT	2	12	126029	126040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021019	TCCAGT	2	12	134237	134248	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	479169227
40	NC_021019	TACATA	2	12	142985	142996	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	479169229
41	NC_021019	TTACGT	2	12	143137	143148	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	479169229
42	NC_021019	TTATGT	2	12	148257	148268	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	479169232
43	NC_021019	TAGAAT	2	12	148398	148409	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021019	CTTTAT	2	12	148740	148751	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	479169233
45	NC_021019	ATTCGT	2	12	154256	154267	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_021019	ACTTTA	2	12	156282	156293	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_021019	TTTTTC	2	12	160666	160677	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_021019	TTTTTC	2	12	160783	160794	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_021019	CATCCT	2	12	161882	161893	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	479169235
50	NC_021019	GCTACA	2	12	166207	166218	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_021019	ATCATT	2	12	183309	183320	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	479169246
52	NC_021019	TACTAT	2	12	183658	183669	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	479169247
53	NC_021019	ACCAAA	2	12	187844	187855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479169250
54	NC_021019	ATGGGT	2	12	192857	192868	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	479169251
55	NC_021019	GCTACC	2	12	196859	196870	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	479169255
56	NC_021019	CCTAAA	2	12	197792	197803	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	479169256
57	NC_021019	ATTTAC	2	12	200758	200769	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	479169258
58	NC_021019	TCTTTT	2	12	205573	205584	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	479169263
59	NC_021019	AAATCA	2	12	206758	206769	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	479169264
60	NC_021019	AACATC	2	12	208231	208242	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	479169265
61	NC_021019	TTTTCA	2	12	214854	214865	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	479169269
62	NC_021019	ACAAGA	2	12	217904	217915	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_021019	CTATTT	2	12	220373	220384	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_021019	CTATTT	2	12	223990	224001	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	479169275
65	NC_021019	ATAGCA	2	12	224509	224520	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	479169276
66	NC_021019	GGATCT	2	12	228631	228642	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_021019	CATGTG	2	12	228818	228829	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_021019	CATTTT	2	12	229857	229868	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	479169279
69	NC_021019	AATCTA	2	12	236992	237003	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_021019	ATCCAA	2	12	253009	253020	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	479169293
71	NC_021019	CTTCAA	2	12	254598	254609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_021019	TATCTT	2	12	255620	255631	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	479169296
73	NC_021019	AAGTTC	2	12	263387	263398	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_021019	TCATCT	2	12	264699	264710	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	479169301
75	NC_021019	TAACCA	2	12	265132	265143	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	479169301
76	NC_021019	ATATGT	2	12	274422	274433	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	479169311
77	NC_021019	CTGAAT	2	12	275627	275638	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	479169311
78	NC_021019	AGCTGG	2	12	277549	277560	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	479169314
79	NC_021019	AACAAT	2	12	280705	280716	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	479169316
80	NC_021019	TGCCGC	2	12	287389	287400	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	479169324
81	NC_021019	TGCTTC	2	12	287473	287484	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	479169324
82	NC_021019	CTTCAT	2	12	288360	288371	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	479169324
83	NC_021019	GTTGAT	2	12	295535	295546	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021019	AGTGGC	2	12	298968	298979	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_021019	AAATTG	2	12	299032	299043	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021019	AGTTTC	2	12	305202	305213	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_021019	TGTAGT	2	12	307113	307124	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021019	CAAAAA	2	12	308213	308224	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_021019	CTAAAG	2	12	311347	311358	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	479169333
90	NC_021019	ATTTTC	2	12	312455	312466	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	479169335
91	NC_021019	TTTTGG	2	12	315414	315425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479169336
92	NC_021019	TTTCAT	2	12	315845	315856	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	479169336
93	NC_021019	ATCTTC	2	12	319271	319282	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	479169338
94	NC_021019	TTGCGA	2	12	322184	322195	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	479169339
95	NC_021019	AATTGT	2	12	322683	322694	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	479169339
96	NC_021019	TCCTGA	2	12	322716	322727	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	479169339
97	NC_021019	TAAAAT	2	12	325058	325069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021019	TGATCT	2	12	326807	326818	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_021019	CTTGAT	2	12	336701	336712	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_021019	ATCGCG	2	12	338410	338421	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_021019	CAACAC	2	12	338721	338732	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_021019	AAGGAA	2	12	340980	340991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021019	GTATCT	2	12	343509	343520	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	479169348
104	NC_021019	TTTCGC	2	12	350125	350136	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_021019	TCTACA	2	12	352819	352830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479169356
106	NC_021019	AAAAAG	2	12	364468	364479	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021019	TGCCAT	2	12	369992	370003	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_021019	TAACAA	2	12	370607	370618	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_021019	CATTTG	2	12	370755	370766	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_021019	ATCTTT	2	12	371221	371232	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	479169369
111	NC_021019	TCAATA	2	12	373600	373611	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	479169370
112	NC_021019	CATATA	2	12	375365	375376	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	479169372
113	NC_021019	CAAATA	2	12	375603	375614	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	479169373
114	NC_021019	AATTGG	3	18	378034	378051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479169375
115	NC_021019	CAGGAA	2	12	380296	380307	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	479169377
116	NC_021019	AGGTTT	2	12	382673	382684	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	479169379
117	NC_021019	AAATTG	2	12	385996	386007	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021019	TAGAAA	2	12	386203	386214	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021019	TTTTGA	2	12	390316	390327	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	479169383
120	NC_021019	ATCTTG	2	12	390865	390876	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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122	NC_021019	TATTTA	2	12	408613	408624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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238	NC_021019	CATTCA	2	12	786305	786316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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352	NC_021019	AAAAGA	2	12	1030626	1030637	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	479169899
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354	NC_021019	AATATT	2	12	1032994	1033005	50 %	50 %	0 %	0 %	479169902
355	NC_021019	GATATA	2	12	1035939	1035950	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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467	NC_021019	GAAAAT	2	12	1353679	1353690	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
468	NC_021019	TCAAAA	2	12	1354107	1354118	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	479170109
469	NC_021019	CAAAAC	2	12	1355993	1356004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479170110
470	NC_021019	AAATCA	2	12	1357997	1358008	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	479170111
471	NC_021019	ACTAAA	2	12	1365728	1365739	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
472	NC_021019	TATGAA	2	12	1366126	1366137	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	479170113
473	NC_021019	ATTAAA	2	12	1369573	1369584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479170117
474	NC_021019	CATTTT	2	12	1370975	1370986	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	479170119
475	NC_021019	TCACCA	2	12	1371240	1371251	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	479170120
476	NC_021019	CAATTC	2	12	1374476	1374487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479170121
477	NC_021019	CTAAAG	2	12	1375067	1375078	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	479170122
478	NC_021019	TATCGA	2	12	1376175	1376186	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	479170123
479	NC_021019	GATATA	2	12	1378212	1378223	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	479170125
480	NC_021019	AAGCCA	2	12	1381908	1381919	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	479170129
481	NC_021019	TTCTTT	2	12	1383002	1383013	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	479170130
482	NC_021019	ACGTGT	2	12	1386826	1386837	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	479170133
483	NC_021019	TTATAT	2	12	1388837	1388848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
484	NC_021019	ATCCAT	2	12	1389864	1389875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479170138
485	NC_021019	TACAAA	2	12	1390746	1390757	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	479170138
486	NC_021019	CTTTGA	2	12	1393945	1393956	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	479170141
487	NC_021019	GCCACC	2	12	1394108	1394119	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	479170141
488	NC_021019	GCATGT	2	12	1398431	1398442	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	479170144
489	NC_021019	TTACTT	2	12	1398842	1398853	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	479170145
490	NC_021019	TACATA	2	12	1403071	1403082	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	479170147
491	NC_021019	GTCATT	2	12	1403700	1403711	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	479170147
492	NC_021019	TGAAAA	2	12	1407862	1407873	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	479170151
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494	NC_021019	TATTCT	2	12	1411476	1411487	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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496	NC_021019	TGATCT	2	12	1414317	1414328	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	479170159
497	NC_021019	TTCAAA	2	12	1414940	1414951	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	479170160
498	NC_021019	AAAAGT	2	12	1418339	1418350	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	479170162
499	NC_021019	TATCAT	2	12	1419713	1419724	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	479170163
500	NC_021019	TAATGA	2	12	1421089	1421100	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

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