MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Eubacterium cylindroides T2-87 draft genome

Total Repeats: 243

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021019	GTTAAC	2	12	19125	19136	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_021019	ACATAT	2	12	27911	27922	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_021019	GAAGTC	2	12	37818	37829	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_021019	GACGAT	2	12	41137	41148	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_021019	TGGAGC	2	12	64469	64480	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_021019	TACCTT	2	12	81020	81031	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_021019	TTAATA	2	12	81052	81063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021019	TAGGAT	2	12	126029	126040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021019	TAGAAT	2	12	148398	148409	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021019	ATTCGT	2	12	154256	154267	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_021019	ACTTTA	2	12	156282	156293	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_021019	TTTTTC	2	12	160666	160677	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_021019	TTTTTC	2	12	160783	160794	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_021019	GCTACA	2	12	166207	166218	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_021019	ACAAGA	2	12	217904	217915	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_021019	CTATTT	2	12	220373	220384	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_021019	GGATCT	2	12	228631	228642	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_021019	CATGTG	2	12	228818	228829	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_021019	AATCTA	2	12	236992	237003	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_021019	CTTCAA	2	12	254598	254609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_021019	AAGTTC	2	12	263387	263398	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_021019	GTTGAT	2	12	295535	295546	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021019	AGTGGC	2	12	298968	298979	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_021019	AAATTG	2	12	299032	299043	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021019	AGTTTC	2	12	305202	305213	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_021019	TGTAGT	2	12	307113	307124	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021019	CAAAAA	2	12	308213	308224	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_021019	TAAAAT	2	12	325058	325069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021019	TGATCT	2	12	326807	326818	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_021019	CTTGAT	2	12	336701	336712	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_021019	ATCGCG	2	12	338410	338421	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_021019	CAACAC	2	12	338721	338732	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_021019	AAGGAA	2	12	340980	340991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021019	TTTCGC	2	12	350125	350136	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_021019	AAAAAG	2	12	364468	364479	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021019	TGCCAT	2	12	369992	370003	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_021019	TAACAA	2	12	370607	370618	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_021019	CATTTG	2	12	370755	370766	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_021019	AAATTG	2	12	385996	386007	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021019	TAGAAA	2	12	386203	386214	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021019	ATCTTG	2	12	390865	390876	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_021019	TAAAAG	2	12	398216	398227	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021019	TATTTA	2	12	408613	408624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021019	GATGTG	2	12	417353	417364	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021019	AGAAAA	2	12	423787	423798	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021019	CAAAGC	2	12	424225	424236	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_021019	GAAGGA	2	12	426006	426017	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021019	GAACGG	2	12	426763	426774	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_021019	AGGAAA	2	12	426804	426815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021019	GGAATC	2	12	445985	445996	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_021019	GATAAA	2	12	490943	490954	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021019	TAAGTA	2	12	497672	497683	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021019	GTGTGG	2	12	501658	501669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021019	ACTGTA	2	12	504813	504824	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_021019	ATTAAA	2	12	505868	505879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021019	TTGTTT	2	12	510310	510321	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021019	AGCCAA	2	12	510337	510348	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_021019	ATCGCA	2	12	512434	512445	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_021019	CATAGC	2	12	525562	525573	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_021019	CAAATC	2	12	529632	529643	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_021019	TCTTCA	2	12	540881	540892	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_021019	TTCTAA	2	12	542602	542613	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_021019	TCAATG	2	12	543998	544009	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_021019	TGGCGA	2	12	554799	554810	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_021019	CAATAG	2	12	559254	559265	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_021019	GGCTTT	2	12	609809	609820	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_021019	ATTTTC	2	12	609976	609987	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_021019	AGCTTT	2	12	670212	670223	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_021019	ACTTTA	2	12	670411	670422	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_021019	ATCAAA	2	12	741792	741803	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_021019	TTTCAA	2	12	750468	750479	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_021019	ATTCCG	2	12	760527	760538	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_021019	AAAAAG	2	12	761087	761098	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021019	ATGAAA	2	12	784436	784447	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021019	CATTCA	2	12	786305	786316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_021019	ATCTTT	2	12	797103	797114	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_021019	CATATC	2	12	801733	801744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_021019	AATCCT	2	12	801890	801901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_021019	ATTGCT	2	12	802970	802981	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_021019	AAAAAG	2	12	803315	803326	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021019	TTTAAA	2	12	818731	818742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021019	ACGATA	2	12	822716	822727	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_021019	TTCTTT	2	12	830476	830487	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_021019	CATAAT	2	12	834837	834848	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_021019	TGTTCT	2	12	835147	835158	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_021019	TCTTCA	2	12	835366	835377	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_021019	TGCTGG	2	12	853531	853542	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_021019	AATGAC	2	12	859807	859818	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_021019	TTTAGA	2	12	870850	870861	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021019	AAGATG	2	12	871184	871195	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021019	GATTTT	2	12	880262	880273	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021019	TTTCTT	2	12	891726	891737	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_021019	GGAACG	2	12	908044	908055	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_021019	GTCCTC	2	12	908479	908490	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
95	NC_021019	TTGATT	2	12	949069	949080	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021019	AAAAAG	2	12	949398	949409	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021019	TAAATA	2	12	949413	949424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021019	GACCAG	2	12	949744	949755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_021019	GTTCCT	2	12	953449	953460	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_021019	AAAAAG	2	12	953506	953517	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021019	ACATTT	2	12	972786	972797	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_021019	GCCCTC	2	12	973721	973732	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_021019	TGGCAA	2	12	985181	985192	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_021019	ATTGGT	2	12	994447	994458	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021019	GTCATG	2	12	1000010	1000021	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_021019	TTAGTC	2	12	1005413	1005424	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_021019	AAGAAA	2	12	1018378	1018389	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021019	GATATA	2	12	1035939	1035950	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021019	TTTTTC	2	12	1050810	1050821	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_021019	AATTCT	2	12	1053367	1053378	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_021019	ATCTTC	2	12	1061554	1061565	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_021019	ATCTTT	2	12	1084841	1084852	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_021019	TTATAT	2	12	1092443	1092454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021019	ATTTAT	2	12	1093086	1093097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021019	ATTTCT	2	12	1093707	1093718	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_021019	TTTATC	2	12	1096579	1096590	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_021019	AAAAGA	2	12	1101222	1101233	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021019	ATTATG	2	12	1111368	1111379	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021019	AATATA	2	12	1136709	1136720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021019	AGAAAT	2	12	1138803	1138814	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021019	ATCTTT	2	12	1154762	1154773	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_021019	CTTTCA	2	12	1157227	1157238	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_021019	AAATTT	2	12	1158646	1158657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021019	AATTAA	2	12	1163924	1163935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021019	TTCAAC	2	12	1170276	1170287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_021019	ACATTT	2	12	1181116	1181127	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_021019	AATGGA	2	12	1185385	1185396	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021019	TTTGGA	2	12	1203381	1203392	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021019	CCTTTT	2	12	1206872	1206883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_021019	ATGTAG	2	12	1213161	1213172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021019	CATATC	2	12	1214644	1214655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_021019	AATAAC	2	12	1216267	1216278	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_021019	GAAAGA	2	12	1220506	1220517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021019	GAAAGT	2	12	1233629	1233640	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021019	ATCGCA	2	12	1235671	1235682	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_021019	TTGGCT	2	12	1244221	1244232	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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138	NC_021019	AAAGAA	2	12	1260420	1260431	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021019	TTTATT	2	12	1266783	1266794	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021019	ATCCTG	2	12	1270939	1270950	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_021019	TTTTTC	2	12	1274667	1274678	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
142	NC_021019	GGAAAA	2	12	1278260	1278271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021019	AGCTTC	2	12	1280421	1280432	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_021019	CATCGG	2	12	1284575	1284586	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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146	NC_021019	GAAAAA	2	12	1296296	1296307	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021019	GGTGTT	2	12	1297136	1297147	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021019	ATCTTT	2	12	1311950	1311961	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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159	NC_021019	TATTCT	2	12	1411476	1411487	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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234	NC_021019	TTTAAA	2	12	1922818	1922829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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236	NC_021019	TCTTTA	2	12	1940255	1940266	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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240	NC_021019	ATTTAA	2	12	1956530	1956541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
241	NC_021019	TTTACT	2	12	1961708	1961719	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
242	NC_021019	TACACC	2	12	1966427	1966438	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
243	NC_021019	AAATTG	2	12	1966600	1966611	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.