MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Eubacterium cylindroides T2-87 draft genome

Total Repeats: 1437

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021019	TTGTT	2	10	618	627	0 %	80 %	20 %	0 %	479169110
2	NC_021019	TTTTC	2	10	685	694	0 %	80 %	0 %	20 %	479169111
3	NC_021019	ATTTT	2	10	1311	1320	20 %	80 %	0 %	0 %	479169111
4	NC_021019	ATAAA	2	10	1364	1373	80 %	20 %	0 %	0 %	479169111
5	NC_021019	TTCAT	2	10	3605	3614	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_021019	ATCAA	2	10	4739	4748	60 %	20 %	0 %	20 %	479169114
7	NC_021019	TCCAA	2	10	4775	4784	40 %	20 %	0 %	40 %	479169114
8	NC_021019	CGATA	2	10	7748	7757	40 %	20 %	20 %	20 %	479169116
9	NC_021019	TCCTA	2	10	9019	9028	20 %	40 %	0 %	40 %	479169117
10	NC_021019	TTTCT	2	10	11829	11838	0 %	80 %	0 %	20 %	479169119
11	NC_021019	AATCC	2	10	12559	12568	40 %	20 %	0 %	40 %	479169119
12	NC_021019	TATTC	2	10	12751	12760	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_021019	TATAT	2	10	14465	14474	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021019	GAAAA	2	10	20017	20026	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021019	ATAAC	2	10	23491	23500	60 %	20 %	0 %	20 %	479169126
16	NC_021019	AATTC	2	10	24797	24806	40 %	40 %	0 %	20 %	479169127
17	NC_021019	TTTGA	2	10	25722	25731	20 %	60 %	20 %	0 %	479169127
18	NC_021019	CAAAC	2	10	27881	27890	60 %	0 %	0 %	40 %	479169130
19	NC_021019	TTAAT	2	10	29004	29013	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021019	TTTGT	2	10	30236	30245	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021019	TCTAT	2	10	30759	30768	20 %	60 %	0 %	20 %	479169135
22	NC_021019	TGAAG	2	10	30950	30959	40 %	20 %	40 %	0 %	479169135
23	NC_021019	GAGAA	2	10	31849	31858	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021019	GCCAT	2	10	33721	33730	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
25	NC_021019	TTGTT	2	10	34469	34478	0 %	80 %	20 %	0 %	479169136
26	NC_021019	AATTG	2	10	38270	38279	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021019	GTTTT	2	10	38755	38764	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021019	AAAAG	2	10	41496	41505	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021019	AACTT	2	10	42072	42081	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_021019	AGAAC	2	10	43423	43432	60 %	0 %	20 %	20 %	479169140
31	NC_021019	ATCAA	2	10	45003	45012	60 %	20 %	0 %	20 %	479169141
32	NC_021019	TCTTT	2	10	47749	47758	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_021019	TAAAT	2	10	48082	48091	60 %	40 %	0 %	0 %	479169144
34	NC_021019	TAAAA	2	10	53255	53264	80 %	20 %	0 %	0 %	479169148
35	NC_021019	GATTA	2	10	55125	55134	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021019	CCAGA	2	10	55968	55977	40 %	0 %	20 %	40 %	479169151
37	NC_021019	CTTTT	2	10	56114	56123	0 %	80 %	0 %	20 %	479169152
38	NC_021019	AAAAG	2	10	59513	59522	80 %	0 %	20 %	0 %	479169154
39	NC_021019	AATGT	2	10	60719	60728	40 %	40 %	20 %	0 %	479169155
40	NC_021019	AATTA	2	10	60881	60890	60 %	40 %	0 %	0 %	479169155
41	NC_021019	TGTAT	2	10	61790	61799	20 %	60 %	20 %	0 %	479169157
42	NC_021019	AAACA	2	10	62000	62009	80 %	0 %	0 %	20 %	479169157
43	NC_021019	TATTG	2	10	62729	62738	20 %	60 %	20 %	0 %	479169159
44	NC_021019	ATGGC	2	10	63839	63848	20 %	20 %	40 %	20 %	479169160
45	NC_021019	TAAAA	2	10	64675	64684	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021019	AATCA	2	10	66381	66390	60 %	20 %	0 %	20 %	479169164
47	NC_021019	TTGGA	2	10	66922	66931	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021019	ACAAA	2	10	69069	69078	80 %	0 %	0 %	20 %	479169166
49	NC_021019	AAACA	2	10	69219	69228	80 %	0 %	0 %	20 %	479169166
50	NC_021019	TGGAT	2	10	70161	70170	20 %	40 %	40 %	0 %	479169167
51	NC_021019	TATTT	2	10	71117	71126	20 %	80 %	0 %	0 %	479169170
52	NC_021019	ATATT	2	10	71902	71911	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021019	CGGAT	2	10	73079	73088	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_021019	ATGAC	2	10	73409	73418	40 %	20 %	20 %	20 %	479169171
55	NC_021019	CTGTT	2	10	75535	75544	0 %	60 %	20 %	20 %	479169174
56	NC_021019	TTCGC	2	10	76138	76147	0 %	40 %	20 %	40 %	479169174
57	NC_021019	TGCTG	2	10	78264	78273	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_021019	TGGCA	2	10	79892	79901	20 %	20 %	40 %	20 %	479169178
59	NC_021019	TTTTA	2	10	81201	81210	20 %	80 %	0 %	0 %	479169179
60	NC_021019	TTGGT	2	10	81600	81609	0 %	60 %	40 %	0 %	479169179
61	NC_021019	TTTTC	2	10	84293	84302	0 %	80 %	0 %	20 %	479169182
62	NC_021019	AAGTA	2	10	84314	84323	60 %	20 %	20 %	0 %	479169182
63	NC_021019	TTGAA	2	10	88465	88474	40 %	40 %	20 %	0 %	479169187
64	NC_021019	TTTTC	2	10	89150	89159	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_021019	TTTTG	2	10	89176	89185	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021019	ATCGA	2	10	89531	89540	40 %	20 %	20 %	20 %	479169188
67	NC_021019	AAGAA	2	10	89541	89550	80 %	0 %	20 %	0 %	479169188
68	NC_021019	GATCG	2	10	93061	93070	20 %	20 %	40 %	20 %	479169192
69	NC_021019	ATTTT	2	10	98860	98869	20 %	80 %	0 %	0 %	479169197
70	NC_021019	TCTTT	2	10	100449	100458	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_021019	ATCAA	2	10	100561	100570	60 %	20 %	0 %	20 %	479169198
72	NC_021019	TTCTT	2	10	101084	101093	0 %	80 %	0 %	20 %	479169198
73	NC_021019	CAAGA	2	10	101687	101696	60 %	0 %	20 %	20 %	479169200
74	NC_021019	TAACA	2	10	103360	103369	60 %	20 %	0 %	20 %	479169203
75	NC_021019	GCCCT	2	10	105557	105566	0 %	20 %	20 %	60 %	479169205
76	NC_021019	TTTGA	2	10	105789	105798	20 %	60 %	20 %	0 %	479169206
77	NC_021019	TTGTT	2	10	107681	107690	0 %	80 %	20 %	0 %	479169208
78	NC_021019	ATAGA	2	10	108836	108845	60 %	20 %	20 %	0 %	479169209
79	NC_021019	AGATA	2	10	109808	109817	60 %	20 %	20 %	0 %	479169210
80	NC_021019	TTTAA	2	10	114219	114228	40 %	60 %	0 %	0 %	479169214
81	NC_021019	ACGTT	2	10	117853	117862	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_021019	GTACC	2	10	119381	119390	20 %	20 %	20 %	40 %	479169219
83	NC_021019	AAGTA	2	10	120102	120111	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021019	TGCTT	2	10	120176	120185	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_021019	ATGAA	2	10	120831	120840	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021019	TTGAT	2	10	121060	121069	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021019	CAAGT	2	10	121862	121871	40 %	20 %	20 %	20 %	479169220
88	NC_021019	AAAAG	2	10	122439	122448	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021019	TTGAT	2	10	124652	124661	20 %	60 %	20 %	0 %	479169223
90	NC_021019	ATACG	2	10	125450	125459	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_021019	ACAAA	2	10	127736	127745	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_021019	CTTCA	2	10	128141	128150	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
93	NC_021019	ATTTT	2	10	131052	131061	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021019	TCAAT	2	10	132431	132440	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_021019	CTTTT	2	10	133140	133149	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_021019	AAATG	2	10	133338	133347	60 %	20 %	20 %	0 %	479169226
97	NC_021019	TCGTG	2	10	135574	135583	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
98	NC_021019	AAAAG	2	10	136164	136173	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021019	AGGGA	2	10	139007	139016	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021019	TTATA	2	10	140039	140048	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021019	TTCAT	2	10	142830	142839	20 %	60 %	0 %	20 %	479169229
102	NC_021019	CACTG	2	10	147813	147822	20 %	20 %	20 %	40 %	479169231
103	NC_021019	ATGGC	2	10	148163	148172	20 %	20 %	40 %	20 %	479169232
104	NC_021019	ATTTG	2	10	149180	149189	20 %	60 %	20 %	0 %	479169233
105	NC_021019	ATCCA	2	10	150149	150158	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
106	NC_021019	ATCCA	2	10	150332	150341	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
107	NC_021019	ACTTG	2	10	155916	155925	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_021019	ACCTT	2	10	156357	156366	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
109	NC_021019	TGCAT	2	10	158332	158341	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_021019	AATTT	2	10	158597	158606	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021019	CTCTT	2	10	159193	159202	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
112	NC_021019	TTCCA	2	10	161922	161931	20 %	40 %	0 %	40 %	479169235
113	NC_021019	AGTAC	2	10	163806	163815	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_021019	ACATT	2	10	163855	163864	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_021019	TATAA	2	10	173509	173518	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021019	CAATC	2	10	176657	176666	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
117	NC_021019	AGAAA	2	10	177116	177125	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021019	ATTAC	2	10	177330	177339	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_021019	TCAAA	2	10	177520	177529	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_021019	AATGA	2	10	179202	179211	60 %	20 %	20 %	0 %	479169241
121	NC_021019	TCATT	2	10	179816	179825	20 %	60 %	0 %	20 %	479169243
122	NC_021019	GATTC	2	10	180336	180345	20 %	40 %	20 %	20 %	479169244
123	NC_021019	GTATT	2	10	182472	182481	20 %	60 %	20 %	0 %	479169245
124	NC_021019	GAAAA	2	10	183953	183962	80 %	0 %	20 %	0 %	479169247
125	NC_021019	AAAAT	2	10	185376	185385	80 %	20 %	0 %	0 %	479169249
126	NC_021019	TTGTC	2	10	185986	185995	0 %	60 %	20 %	20 %	479169249
127	NC_021019	GAAGG	2	10	186474	186483	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021019	TTATT	2	10	187300	187309	20 %	80 %	0 %	0 %	479169250
129	NC_021019	ACTTA	2	10	187829	187838	40 %	40 %	0 %	20 %	479169250
130	NC_021019	TTTTC	2	10	190095	190104	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_021019	ATTAT	2	10	196596	196605	40 %	60 %	0 %	0 %	479169255
132	NC_021019	CATTT	2	10	199551	199560	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_021019	AATTT	2	10	201073	201082	40 %	60 %	0 %	0 %	479169259
134	NC_021019	GATCT	2	10	202228	202237	20 %	40 %	20 %	20 %	479169260
135	NC_021019	ACACC	2	10	202778	202787	40 %	0 %	0 %	60 %	479169260
136	NC_021019	GTTTT	2	10	203713	203722	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021019	TGAAA	2	10	203802	203811	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021019	ATTTT	2	10	203971	203980	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021019	ATAAA	2	10	208521	208530	80 %	20 %	0 %	0 %	479169266
140	NC_021019	TTTTA	2	10	209483	209492	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021019	GATGT	2	10	209619	209628	20 %	40 %	40 %	0 %	479169267
142	NC_021019	TGCAA	2	10	209641	209650	40 %	20 %	20 %	20 %	479169267
143	NC_021019	AGACA	2	10	210001	210010	60 %	0 %	20 %	20 %	479169267
144	NC_021019	ATTTG	2	10	212502	212511	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021019	TTTGT	2	10	212900	212909	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021019	AATCC	2	10	213290	213299	40 %	20 %	0 %	40 %	479169268
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151	NC_021019	AATAA	2	10	221683	221692	80 %	20 %	0 %	0 %	479169273
152	NC_021019	ATTTT	2	10	222070	222079	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_021019	AATAT	2	10	260701	260710	60 %	40 %	0 %	0 %	479169299
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272	NC_021019	TGAAT	2	10	390496	390505	40 %	40 %	20 %	0 %	479169383
273	NC_021019	GAATT	2	10	390561	390570	40 %	40 %	20 %	0 %	479169383
274	NC_021019	GATCA	2	10	391069	391078	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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