MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Eubacterium cylindroides T2-87 draft genome

Total Repeats: 898

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021019	TTGTT	2	10	618	627	0 %	80 %	20 %	0 %	479169110
2	NC_021019	TTTTC	2	10	685	694	0 %	80 %	0 %	20 %	479169111
3	NC_021019	ATTTT	2	10	1311	1320	20 %	80 %	0 %	0 %	479169111
4	NC_021019	ATAAA	2	10	1364	1373	80 %	20 %	0 %	0 %	479169111
5	NC_021019	ATCAA	2	10	4739	4748	60 %	20 %	0 %	20 %	479169114
6	NC_021019	TCCAA	2	10	4775	4784	40 %	20 %	0 %	40 %	479169114
7	NC_021019	CGATA	2	10	7748	7757	40 %	20 %	20 %	20 %	479169116
8	NC_021019	TCCTA	2	10	9019	9028	20 %	40 %	0 %	40 %	479169117
9	NC_021019	TTTCT	2	10	11829	11838	0 %	80 %	0 %	20 %	479169119
10	NC_021019	AATCC	2	10	12559	12568	40 %	20 %	0 %	40 %	479169119
11	NC_021019	ATAAC	2	10	23491	23500	60 %	20 %	0 %	20 %	479169126
12	NC_021019	AATTC	2	10	24797	24806	40 %	40 %	0 %	20 %	479169127
13	NC_021019	TTTGA	2	10	25722	25731	20 %	60 %	20 %	0 %	479169127
14	NC_021019	CAAAC	2	10	27881	27890	60 %	0 %	0 %	40 %	479169130
15	NC_021019	TCTAT	2	10	30759	30768	20 %	60 %	0 %	20 %	479169135
16	NC_021019	TGAAG	2	10	30950	30959	40 %	20 %	40 %	0 %	479169135
17	NC_021019	TTGTT	2	10	34469	34478	0 %	80 %	20 %	0 %	479169136
18	NC_021019	AGAAC	2	10	43423	43432	60 %	0 %	20 %	20 %	479169140
19	NC_021019	ATCAA	2	10	45003	45012	60 %	20 %	0 %	20 %	479169141
20	NC_021019	TAAAT	2	10	48082	48091	60 %	40 %	0 %	0 %	479169144
21	NC_021019	TAAAA	2	10	53255	53264	80 %	20 %	0 %	0 %	479169148
22	NC_021019	CCAGA	2	10	55968	55977	40 %	0 %	20 %	40 %	479169151
23	NC_021019	CTTTT	2	10	56114	56123	0 %	80 %	0 %	20 %	479169152
24	NC_021019	AAAAG	2	10	59513	59522	80 %	0 %	20 %	0 %	479169154
25	NC_021019	AATGT	2	10	60719	60728	40 %	40 %	20 %	0 %	479169155
26	NC_021019	AATTA	2	10	60881	60890	60 %	40 %	0 %	0 %	479169155
27	NC_021019	TGTAT	2	10	61790	61799	20 %	60 %	20 %	0 %	479169157
28	NC_021019	AAACA	2	10	62000	62009	80 %	0 %	0 %	20 %	479169157
29	NC_021019	TATTG	2	10	62729	62738	20 %	60 %	20 %	0 %	479169159
30	NC_021019	ATGGC	2	10	63839	63848	20 %	20 %	40 %	20 %	479169160
31	NC_021019	AATCA	2	10	66381	66390	60 %	20 %	0 %	20 %	479169164
32	NC_021019	ACAAA	2	10	69069	69078	80 %	0 %	0 %	20 %	479169166
33	NC_021019	AAACA	2	10	69219	69228	80 %	0 %	0 %	20 %	479169166
34	NC_021019	TGGAT	2	10	70161	70170	20 %	40 %	40 %	0 %	479169167
35	NC_021019	TATTT	2	10	71117	71126	20 %	80 %	0 %	0 %	479169170
36	NC_021019	ATGAC	2	10	73409	73418	40 %	20 %	20 %	20 %	479169171
37	NC_021019	CTGTT	2	10	75535	75544	0 %	60 %	20 %	20 %	479169174
38	NC_021019	TTCGC	2	10	76138	76147	0 %	40 %	20 %	40 %	479169174
39	NC_021019	TGGCA	2	10	79892	79901	20 %	20 %	40 %	20 %	479169178
40	NC_021019	TTTTA	2	10	81201	81210	20 %	80 %	0 %	0 %	479169179
41	NC_021019	TTGGT	2	10	81600	81609	0 %	60 %	40 %	0 %	479169179
42	NC_021019	TTTTC	2	10	84293	84302	0 %	80 %	0 %	20 %	479169182
43	NC_021019	AAGTA	2	10	84314	84323	60 %	20 %	20 %	0 %	479169182
44	NC_021019	TTGAA	2	10	88465	88474	40 %	40 %	20 %	0 %	479169187
45	NC_021019	ATCGA	2	10	89531	89540	40 %	20 %	20 %	20 %	479169188
46	NC_021019	AAGAA	2	10	89541	89550	80 %	0 %	20 %	0 %	479169188
47	NC_021019	GATCG	2	10	93061	93070	20 %	20 %	40 %	20 %	479169192
48	NC_021019	ATTTT	2	10	98860	98869	20 %	80 %	0 %	0 %	479169197
49	NC_021019	ATCAA	2	10	100561	100570	60 %	20 %	0 %	20 %	479169198
50	NC_021019	TTCTT	2	10	101084	101093	0 %	80 %	0 %	20 %	479169198
51	NC_021019	CAAGA	2	10	101687	101696	60 %	0 %	20 %	20 %	479169200
52	NC_021019	TAACA	2	10	103360	103369	60 %	20 %	0 %	20 %	479169203
53	NC_021019	GCCCT	2	10	105557	105566	0 %	20 %	20 %	60 %	479169205
54	NC_021019	TTTGA	2	10	105789	105798	20 %	60 %	20 %	0 %	479169206
55	NC_021019	TTGTT	2	10	107681	107690	0 %	80 %	20 %	0 %	479169208
56	NC_021019	ATAGA	2	10	108836	108845	60 %	20 %	20 %	0 %	479169209
57	NC_021019	AGATA	2	10	109808	109817	60 %	20 %	20 %	0 %	479169210
58	NC_021019	TTTAA	2	10	114219	114228	40 %	60 %	0 %	0 %	479169214
59	NC_021019	GTACC	2	10	119381	119390	20 %	20 %	20 %	40 %	479169219
60	NC_021019	CAAGT	2	10	121862	121871	40 %	20 %	20 %	20 %	479169220
61	NC_021019	TTGAT	2	10	124652	124661	20 %	60 %	20 %	0 %	479169223
62	NC_021019	AAATG	2	10	133338	133347	60 %	20 %	20 %	0 %	479169226
63	NC_021019	TTCAT	2	10	142830	142839	20 %	60 %	0 %	20 %	479169229
64	NC_021019	CACTG	2	10	147813	147822	20 %	20 %	20 %	40 %	479169231
65	NC_021019	ATGGC	2	10	148163	148172	20 %	20 %	40 %	20 %	479169232
66	NC_021019	ATTTG	2	10	149180	149189	20 %	60 %	20 %	0 %	479169233
67	NC_021019	TTCCA	2	10	161922	161931	20 %	40 %	0 %	40 %	479169235
68	NC_021019	AATGA	2	10	179202	179211	60 %	20 %	20 %	0 %	479169241
69	NC_021019	TCATT	2	10	179816	179825	20 %	60 %	0 %	20 %	479169243
70	NC_021019	GATTC	2	10	180336	180345	20 %	40 %	20 %	20 %	479169244
71	NC_021019	GTATT	2	10	182472	182481	20 %	60 %	20 %	0 %	479169245
72	NC_021019	GAAAA	2	10	183953	183962	80 %	0 %	20 %	0 %	479169247
73	NC_021019	AAAAT	2	10	185376	185385	80 %	20 %	0 %	0 %	479169249
74	NC_021019	TTGTC	2	10	185986	185995	0 %	60 %	20 %	20 %	479169249
75	NC_021019	TTATT	2	10	187300	187309	20 %	80 %	0 %	0 %	479169250
76	NC_021019	ACTTA	2	10	187829	187838	40 %	40 %	0 %	20 %	479169250
77	NC_021019	ATTAT	2	10	196596	196605	40 %	60 %	0 %	0 %	479169255
78	NC_021019	AATTT	2	10	201073	201082	40 %	60 %	0 %	0 %	479169259
79	NC_021019	GATCT	2	10	202228	202237	20 %	40 %	20 %	20 %	479169260
80	NC_021019	ACACC	2	10	202778	202787	40 %	0 %	0 %	60 %	479169260
81	NC_021019	ATAAA	2	10	208521	208530	80 %	20 %	0 %	0 %	479169266
82	NC_021019	GATGT	2	10	209619	209628	20 %	40 %	40 %	0 %	479169267
83	NC_021019	TGCAA	2	10	209641	209650	40 %	20 %	20 %	20 %	479169267
84	NC_021019	AGACA	2	10	210001	210010	60 %	0 %	20 %	20 %	479169267
85	NC_021019	AATCC	2	10	213290	213299	40 %	20 %	0 %	40 %	479169268
86	NC_021019	TTCAT	2	10	213919	213928	20 %	60 %	0 %	20 %	479169268
87	NC_021019	ACAAT	2	10	217296	217305	60 %	20 %	0 %	20 %	479169271
88	NC_021019	TTTTC	2	10	219440	219449	0 %	80 %	0 %	20 %	479169272
89	NC_021019	AATAA	2	10	221683	221692	80 %	20 %	0 %	0 %	479169273
90	NC_021019	TCTTT	2	10	222711	222720	0 %	80 %	0 %	20 %	479169274
91	NC_021019	ATTTA	2	10	222747	222756	40 %	60 %	0 %	0 %	479169274
92	NC_021019	ATCCA	2	10	224715	224724	40 %	20 %	0 %	40 %	479169276
93	NC_021019	ATAAA	2	10	224776	224785	80 %	20 %	0 %	0 %	479169276
94	NC_021019	TTTAT	2	10	225151	225160	20 %	80 %	0 %	0 %	479169276
95	NC_021019	AATGT	2	10	238358	238367	40 %	40 %	20 %	0 %	479169284
96	NC_021019	TCAAT	2	10	239075	239084	40 %	40 %	0 %	20 %	479169284
97	NC_021019	CATCT	2	10	240213	240222	20 %	40 %	0 %	40 %	479169286
98	NC_021019	TCTTT	2	10	241597	241606	0 %	80 %	0 %	20 %	479169287
99	NC_021019	ATCGC	2	10	241710	241719	20 %	20 %	20 %	40 %	479169287
100	NC_021019	GTCCA	2	10	247988	247997	20 %	20 %	20 %	40 %	479169290
101	NC_021019	TTTGA	2	10	252834	252843	20 %	60 %	20 %	0 %	479169293
102	NC_021019	TTTTC	2	10	255995	256004	0 %	80 %	0 %	20 %	479169297
103	NC_021019	ATCAT	2	10	256014	256023	40 %	40 %	0 %	20 %	479169297
104	NC_021019	AATAT	2	10	260701	260710	60 %	40 %	0 %	0 %	479169299
105	NC_021019	TTTAC	2	10	266274	266283	20 %	60 %	0 %	20 %	479169303
106	NC_021019	TTGAT	2	10	266744	266753	20 %	60 %	20 %	0 %	479169303
107	NC_021019	ACATT	2	10	266787	266796	40 %	40 %	0 %	20 %	479169303
108	NC_021019	ACTTT	2	10	267129	267138	20 %	60 %	0 %	20 %	479169303
109	NC_021019	AGTTG	2	10	268550	268559	20 %	40 %	40 %	0 %	479169305
110	NC_021019	ATGGA	2	10	269487	269496	40 %	20 %	40 %	0 %	479169306
111	NC_021019	TGAGG	2	10	271426	271435	20 %	20 %	60 %	0 %	479169308
112	NC_021019	AACGA	2	10	271854	271863	60 %	0 %	20 %	20 %	479169308
113	NC_021019	ATCTT	2	10	279021	279030	20 %	60 %	0 %	20 %	479169315
114	NC_021019	TTTTG	2	10	279237	279246	0 %	80 %	20 %	0 %	479169315
115	NC_021019	ACCAT	2	10	280681	280690	40 %	20 %	0 %	40 %	479169316
116	NC_021019	CATCT	2	10	285729	285738	20 %	40 %	0 %	40 %	479169322
117	NC_021019	ACTTG	2	10	285868	285877	20 %	40 %	20 %	20 %	479169322
118	NC_021019	AATCA	2	10	285930	285939	60 %	20 %	0 %	20 %	479169322
119	NC_021019	TTTCT	2	10	286821	286830	0 %	80 %	0 %	20 %	479169323
120	NC_021019	ATTTT	2	10	286882	286891	20 %	80 %	0 %	0 %	479169323
121	NC_021019	TTGTC	2	10	287235	287244	0 %	60 %	20 %	20 %	479169324
122	NC_021019	GATCT	2	10	288267	288276	20 %	40 %	20 %	20 %	479169324
123	NC_021019	ATCTT	2	10	288515	288524	20 %	60 %	0 %	20 %	479169324
124	NC_021019	GATAA	2	10	288878	288887	60 %	20 %	20 %	0 %	479169324
125	NC_021019	AAAGT	2	10	301552	301561	60 %	20 %	20 %	0 %	479169329
126	NC_021019	CAAGA	2	10	301564	301573	60 %	0 %	20 %	20 %	479169329
127	NC_021019	ACCTT	2	10	309399	309408	20 %	40 %	0 %	40 %	479169331
128	NC_021019	AATTG	2	10	309723	309732	40 %	40 %	20 %	0 %	479169331
129	NC_021019	ATTCT	2	10	312232	312241	20 %	60 %	0 %	20 %	479169334
130	NC_021019	TAACT	2	10	313307	313316	40 %	40 %	0 %	20 %	479169335
131	NC_021019	GCTAA	2	10	322927	322936	40 %	20 %	20 %	20 %	479169340
132	NC_021019	AATCA	2	10	335599	335608	60 %	20 %	0 %	20 %	479169345
133	NC_021019	ATGGA	2	10	344387	344396	40 %	20 %	40 %	0 %	479169348
134	NC_021019	TTGAT	2	10	345715	345724	20 %	60 %	20 %	0 %	479169350
135	NC_021019	ATAAG	2	10	348350	348359	60 %	20 %	20 %	0 %	479169352
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