MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Bacteroides xylanisolvens XB1A draft genome

Total Repeats: 1718

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021017	GCCGAA	2	12	2094	2105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479162169
2	NC_021017	GAATTT	2	12	3504	3515	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	479162169
3	NC_021017	AAAGAA	2	12	6055	6066	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	479162171
4	NC_021017	GGATTG	2	12	7228	7239	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	479162171
5	NC_021017	AAACGT	2	12	9122	9133	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	479162173
6	NC_021017	CTTTAC	2	12	13168	13179	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	479162175
7	NC_021017	CTGAAA	2	12	14390	14401	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	479162176
8	NC_021017	GCAGAA	2	12	18450	18461	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	479162178
9	NC_021017	GCCATA	2	12	19226	19237	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	479162179
10	NC_021017	TTATTT	2	12	21744	21755	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	479162181
11	NC_021017	TAACCA	2	12	25987	25998	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	479162185
12	NC_021017	ATTTCC	2	12	27496	27507	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	479162186
13	NC_021017	CAATAC	2	12	28880	28891	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	479162187
14	NC_021017	TGCTTT	2	12	33071	33082	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	479162191
15	NC_021017	GCTTCT	3	18	33207	33224	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	479162191
16	NC_021017	ACGGGT	2	12	35451	35462	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	479162193
17	NC_021017	CATAAT	2	12	37660	37671	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	479162194
18	NC_021017	GAATAT	2	12	38137	38148	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	479162195
19	NC_021017	TTATGA	2	12	41818	41829	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	479162201
20	NC_021017	TTTCTT	2	12	43377	43388	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	479162203
21	NC_021017	CTTTAT	2	12	45475	45486	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	479162205
22	NC_021017	ATCGGT	2	12	50127	50138	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	479162208
23	NC_021017	AAAGAT	2	12	51276	51287	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	479162209
24	NC_021017	TGGCGA	2	12	54701	54712	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	479162211
25	NC_021017	GACGGA	2	12	57711	57722	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	479162213
26	NC_021017	TTGGTG	2	12	59492	59503	0 %	50 %	50 %	0 %	479162214
27	NC_021017	CACCGC	2	12	60954	60965	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	479162216
28	NC_021017	AGGAAG	2	12	64476	64487	50 %	0 %	50 %	0 %	479162219
29	NC_021017	GAAGCA	2	12	69536	69547	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	479162222
30	NC_021017	CTTCTC	2	12	74088	74099	0 %	50 %	0 %	50 %	479162225
31	NC_021017	TTCAAT	2	12	74776	74787	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	479162225
32	NC_021017	TGCCAT	2	12	79535	79546	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	479162230
33	NC_021017	CACGTG	2	12	80362	80373	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	479162230
34	NC_021017	AGTTCG	2	12	80661	80672	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	479162230
35	NC_021017	TGCTAT	2	12	89666	89677	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	479162237
36	NC_021017	TAATTG	2	12	90760	90771	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	479162238
37	NC_021017	GAAGTT	2	12	90900	90911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479162238
38	NC_021017	CATTTT	2	12	97374	97385	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	479162245
39	NC_021017	CCTTCT	2	12	99841	99852	0 %	50 %	0 %	50 %	479162248
40	NC_021017	GGTTCA	2	12	119501	119512	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	479162259
41	NC_021017	CCGTTT	2	12	126520	126531	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	479162261
42	NC_021017	TGCGAT	2	12	127875	127886	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	479162262
43	NC_021017	ATTGAA	2	12	128862	128873	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	479162262
44	NC_021017	GCCGAA	2	12	129935	129946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479162263
45	NC_021017	GGGCAT	2	12	129955	129966	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	479162263
46	NC_021017	GATTAT	2	12	131933	131944	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	479162264
47	NC_021017	TACGGA	2	12	132343	132354	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	479162264
48	NC_021017	TTCTCT	2	12	133041	133052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479162265
49	NC_021017	TAGAAG	2	12	139429	139440	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	479162268
50	NC_021017	GTCATA	2	12	144900	144911	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	479162273
51	NC_021017	ACAGGC	2	12	144966	144977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479162273
52	NC_021017	CTTGCT	2	12	145715	145726	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	479162274
53	NC_021017	ATACGG	2	12	151495	151506	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	479162277
54	NC_021017	TTTATC	2	12	157371	157382	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	479162282
55	NC_021017	CATATA	2	12	158312	158323	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	479162283
56	NC_021017	GAAAAT	2	12	162328	162339	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	479162285
57	NC_021017	TACCGT	2	12	170800	170811	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	479162292
58	NC_021017	TTCCTG	2	12	171685	171696	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	479162293
59	NC_021017	CATGAC	2	12	172391	172402	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	479162293
60	NC_021017	GGAATG	2	12	173308	173319	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	479162294
61	NC_021017	GAAATA	2	12	173819	173830	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	479162294
62	NC_021017	GAAGTT	2	12	174359	174370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479162294
63	NC_021017	TTATCG	2	12	176681	176692	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	479162295
64	NC_021017	TAATGA	2	12	177481	177492	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	479162295
65	NC_021017	TAAAAT	2	12	190622	190633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479162304
66	NC_021017	TTTGGT	2	12	192901	192912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479162306
67	NC_021017	TCATTT	2	12	193923	193934	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	479162307
68	NC_021017	TCCGCT	2	12	201752	201763	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	479162311
69	NC_021017	GCAAAG	2	12	209593	209604	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	479162320
70	NC_021017	CTACCA	2	12	209859	209870	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	479162321
71	NC_021017	GGTATG	2	12	211464	211475	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	479162323
72	NC_021017	AAAAAG	2	12	213531	213542	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	479162326
73	NC_021017	ATCGCT	2	12	219508	219519	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	479162330
74	NC_021017	GCATTG	2	12	221562	221573	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	479162332
75	NC_021017	CGTAAA	2	12	225711	225722	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	479162334
76	NC_021017	TTGCTG	2	12	228202	228213	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	479162336
77	NC_021017	GGTGCA	2	12	237805	237816	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	479162343
78	NC_021017	TGATCT	2	12	240935	240946	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	479162346
79	NC_021017	CCGAAA	2	12	242891	242902	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	479162347
80	NC_021017	CATATA	2	12	246897	246908	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	479162349
81	NC_021017	TAATCC	2	12	247129	247140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479162350
82	NC_021017	GTAATA	2	12	249847	249858	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	479162353
83	NC_021017	CCATTG	2	12	258348	258359	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	479162358
84	NC_021017	CGGTGG	2	12	260149	260160	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	479162359
85	NC_021017	GGCACA	2	12	263341	263352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479162362
86	NC_021017	ATTTTG	2	12	263430	263441	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	479162362
87	NC_021017	ATCCAT	2	12	263623	263634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479162362
88	NC_021017	GCCGAA	2	12	264933	264944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479162364
89	NC_021017	ATTGGT	2	12	270254	270265	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	479162367
90	NC_021017	AGGCCG	2	12	274224	274235	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	479162369
91	NC_021017	GTGATG	2	12	277348	277359	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	479162371
92	NC_021017	TTCATA	2	12	281919	281930	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	479162375
93	NC_021017	ATACAT	2	12	282683	282694	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	479162376
94	NC_021017	GCACAC	2	12	286652	286663	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	479162378
95	NC_021017	AAGATA	2	12	286856	286867	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	479162378
96	NC_021017	CGAAGC	2	12	288979	288990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479162380
97	NC_021017	GGTTTA	2	12	290218	290229	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	479162381
98	NC_021017	TACGAT	2	12	296302	296313	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	479162385
99	NC_021017	AATTCA	2	12	299430	299441	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	479162390
100	NC_021017	GAAAAA	2	12	303344	303355	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	479162393
101	NC_021017	GCAAGA	2	12	303444	303455	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	479162394
102	NC_021017	CCGGAA	2	12	311020	311031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479162401
103	NC_021017	GGGGAA	2	12	311897	311908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479162401
104	NC_021017	GGAGAA	2	12	313265	313276	50 %	0 %	50 %	0 %	479162401
105	NC_021017	ACGGGG	2	12	315289	315300	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	479162404
106	NC_021017	GCCTTT	2	12	317008	317019	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	479162405
107	NC_021017	AGGATC	2	12	318909	318920	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	479162406
108	NC_021017	AGGTAC	2	12	321544	321555	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	479162409
109	NC_021017	TCGGCG	2	12	332500	332511	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	479162420
110	NC_021017	TGGTAA	2	12	346192	346203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479162433
111	NC_021017	ATAAAT	2	12	346716	346727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479162433
112	NC_021017	GCTGAT	2	12	353651	353662	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	479162438
113	NC_021017	TAGTAA	2	12	354899	354910	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	479162439
114	NC_021017	AGATGA	2	12	357172	357183	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	479162441
115	NC_021017	GATGAA	2	12	358048	358059	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	479162441
116	NC_021017	TACGGT	2	12	359195	359206	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	479162441
117	NC_021017	TATGGA	2	12	359207	359218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479162441
118	NC_021017	TCAACA	2	12	366505	366516	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	479162448
119	NC_021017	GGAAAA	2	12	367401	367412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479162449
120	NC_021017	TTATCG	2	12	370999	371010	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	479162451
121	NC_021017	CGAATA	2	12	373842	373853	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	479162451
122	NC_021017	AAAAGC	2	12	379524	379535	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	479162454
123	NC_021017	GAAAAT	2	12	379594	379605	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	479162454
124	NC_021017	CGGTAT	2	12	380397	380408	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	479162455
125	NC_021017	GAATAA	2	12	402962	402973	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	479162470
126	NC_021017	ACTTAT	2	12	403455	403466	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	479162470
127	NC_021017	TGCGAA	2	12	403583	403594	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	479162470
128	NC_021017	AAGTGA	2	12	404197	404208	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	479162470
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130	NC_021017	ACAACG	2	12	409204	409215	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	479162473
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132	NC_021017	CTATGT	2	12	417677	417688	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	479162479
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140	NC_021017	CATTGC	2	12	446574	446585	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	479162494
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143	NC_021017	ATCTGA	2	12	457775	457786	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	479162497
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147	NC_021017	TCTTCC	2	12	477619	477630	0 %	50 %	0 %	50 %	479162508
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219	NC_021017	CGAAGT	2	12	781832	781843	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	479162719
220	NC_021017	TGCTAC	2	12	791041	791052	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	479162721
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222	NC_021017	TGTATA	2	12	793924	793935	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	479162723
223	NC_021017	CAAGAA	2	12	797522	797533	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	479162726
224	NC_021017	GTAATG	2	12	813720	813731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479162735
225	NC_021017	GTTCCG	2	12	815198	815209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479162736
226	NC_021017	CATTAA	2	12	820987	820998	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	479162739
227	NC_021017	TTTCAC	2	12	822178	822189	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	479162739
228	NC_021017	AAATGG	2	12	829799	829810	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	479162746
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230	NC_021017	TCATCG	2	12	834111	834122	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	479162750
231	NC_021017	ATGAAA	2	12	835472	835483	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	479162752
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233	NC_021017	ATCGGT	2	12	837594	837605	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	479162754
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342	NC_021017	AAGTAA	2	12	1245283	1245294	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	479163074
343	NC_021017	CAATAG	2	12	1247696	1247707	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	479163079
344	NC_021017	TTTGTC	2	12	1270548	1270559	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	479163097
345	NC_021017	TATAAT	2	12	1270671	1270682	50 %	50 %	0 %	0 %	479163097
346	NC_021017	TGCCAT	2	12	1271474	1271485	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	479163098
347	NC_021017	TAAGTG	2	12	1282056	1282067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479163109
348	NC_021017	TCCATA	2	12	1282340	1282351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479163109
349	NC_021017	GTTGTC	2	12	1286001	1286012	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	479163111
350	NC_021017	CGGATG	2	12	1286308	1286319	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	479163112
351	NC_021017	TGCCTG	2	12	1289967	1289978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479163114
352	NC_021017	GCGCTT	2	12	1291934	1291945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479163115
353	NC_021017	GGTATC	2	12	1292265	1292276	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	479163115
354	NC_021017	CTATTA	2	12	1295583	1295594	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	479163122
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356	NC_021017	ATGGAT	2	12	1298561	1298572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479163123
357	NC_021017	TTTCAG	2	12	1308527	1308538	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	479163133
358	NC_021017	CCAAAT	2	12	1316813	1316824	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	479163136
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360	NC_021017	GTATCT	2	12	1319393	1319404	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	479163138
361	NC_021017	CTACGG	2	12	1320823	1320834	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	479163139
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363	NC_021017	CCACCG	2	12	1325595	1325606	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	479163146
364	NC_021017	GCTACT	2	12	1325630	1325641	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	479163146
365	NC_021017	TTCGTC	2	12	1327656	1327667	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	479163147
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367	NC_021017	ACGGTA	2	12	1333258	1333269	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	479163151
368	NC_021017	TATACG	2	12	1335532	1335543	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	479163151
369	NC_021017	TTTTCT	2	12	1336156	1336167	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	479163152
370	NC_021017	GCCTAT	2	12	1337034	1337045	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	479163153
371	NC_021017	CATTTC	2	12	1345852	1345863	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	479163161
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378	NC_021017	TATTGA	2	12	1397406	1397417	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	479163194
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380	NC_021017	GGAAAT	2	12	1405821	1405832	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	479163198
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449	NC_021017	GAAAAG	2	12	1614109	1614120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479163363
450	NC_021017	ACTATC	2	12	1617312	1617323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479163366
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452	NC_021017	GGTACC	2	12	1618679	1618690	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	479163366
453	NC_021017	GGATAT	2	12	1622821	1622832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479163367
454	NC_021017	TGAGTT	2	12	1623805	1623816	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	479163368
455	NC_021017	TATGAT	2	12	1625878	1625889	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	479163369
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459	NC_021017	GCTGAT	2	12	1635058	1635069	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	479163373
460	NC_021017	TCGGTA	2	12	1635377	1635388	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	479163373
461	NC_021017	AAGGAG	2	12	1637993	1638004	50 %	0 %	50 %	0 %	479163374
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464	NC_021017	ACTGCT	2	12	1642184	1642195	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	479163378
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467	NC_021017	TCAGCA	2	12	1685965	1685976	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	479163412
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