MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Butyrate-producing bacterium SSC/2

Total Repeats: 262

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021016	TGCAGG	2	12	24696	24707	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_021016	TTTCAT	2	12	32454	32465	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_021016	AAAATA	2	12	32793	32804	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021016	AATTTA	2	12	34360	34371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021016	GTCAAG	2	12	34587	34598	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_021016	GAAATG	2	12	46258	46269	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021016	TGAAAT	2	12	48404	48415	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021016	TTAAGA	2	12	53537	53548	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021016	AGAAAA	2	12	108336	108347	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021016	AAAACA	2	12	113724	113735	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_021016	ATAAGG	2	12	118872	118883	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021016	TCTTTT	2	12	119202	119213	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_021016	AAAAGG	2	12	126278	126289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021016	TGGTTT	2	12	148235	148246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021016	GAATGC	2	12	158425	158436	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_021016	AGGATG	2	12	164938	164949	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021016	CAGGAC	2	12	176417	176428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_021016	TTATAA	2	12	178330	178341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021016	CGTCCT	2	12	198789	198800	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
20	NC_021016	GAGAAA	2	12	231580	231591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021016	CTGGTT	2	12	252009	252020	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_021016	TTCTGG	2	12	252071	252082	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_021016	TATTTT	2	12	252180	252191	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021016	TCTTTT	2	12	254473	254484	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_021016	GTCCAA	2	12	261300	261311	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_021016	TCGAAA	2	12	265554	265565	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_021016	TTTTTA	2	12	265981	265992	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021016	CATTTT	2	12	275924	275935	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_021016	CTTTCC	2	12	285960	285971	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_021016	TTTTGT	2	12	288572	288583	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021016	TTTTCT	2	12	288692	288703	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_021016	TTTTCT	2	12	289817	289828	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_021016	TGTTTT	2	12	290021	290032	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021016	TTGACA	2	12	309127	309138	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_021016	TGCAAA	2	12	310229	310240	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_021016	TATTTT	2	12	323920	323931	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021016	TTAAAT	2	12	324176	324187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021016	TATGTT	2	12	375466	375477	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021016	AAAGGC	2	12	391914	391925	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_021016	CATATT	2	12	402885	402896	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_021016	ATACTT	2	12	406824	406835	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_021016	AAATAA	2	12	484140	484151	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021016	AAAGAT	2	12	484895	484906	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021016	CTTGTA	2	12	490846	490857	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_021016	TGAAAA	2	12	520152	520163	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021016	ACAAAA	2	12	520881	520892	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_021016	TTATGA	2	12	520995	521006	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021016	GCATTA	2	12	537611	537622	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_021016	TAAATA	2	12	545300	545311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021016	AACAGG	2	12	558970	558981	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_021016	GCGTCT	2	12	560798	560809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_021016	TTTGAC	2	12	561092	561103	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_021016	CCCATC	2	12	561713	561724	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_021016	GATAAT	2	12	574089	574100	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021016	GAAAAA	2	12	576881	576892	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021016	AGCAAA	2	12	583591	583602	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_021016	AATTAA	2	12	584311	584322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021016	TAAAGA	2	12	584353	584364	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021016	GATTGC	2	12	622120	622131	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_021016	CGTCCT	2	12	625664	625675	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
61	NC_021016	ATATAA	2	12	631092	631103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021016	ATCCAC	2	12	643489	643500	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_021016	ATAAAA	2	12	672951	672962	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021016	GACATT	2	12	687925	687936	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_021016	TTTATC	2	12	689862	689873	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_021016	TAATTT	2	12	692368	692379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021016	TATCAA	2	12	732024	732035	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_021016	TTCCTG	2	12	732042	732053	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_021016	CTTTTT	2	12	746508	746519	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_021016	AAGATA	2	12	748860	748871	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021016	GTATTT	2	12	768462	768473	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021016	GAAAAA	2	12	778031	778042	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021016	TATTGG	2	12	793812	793823	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021016	ATTATC	2	12	817645	817656	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_021016	TAAAAA	2	12	817676	817687	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021016	TAAAAA	2	12	874374	874385	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021016	AAATTT	2	12	886333	886344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021016	ACAGGT	2	12	888388	888399	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_021016	TTTTTA	2	12	891801	891812	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021016	AAAAGA	2	12	940078	940089	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021016	TTTTCT	2	12	950858	950869	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_021016	AAAACA	2	12	965750	965761	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_021016	TTTCAG	2	12	981189	981200	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_021016	CTTTAT	2	12	982974	982985	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_021016	GGAGCA	2	12	983036	983047	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_021016	ATGTCA	2	12	983679	983690	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_021016	GAAATA	2	12	996427	996438	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021016	TTTTCT	2	12	998716	998727	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_021016	AATTGC	2	12	1004288	1004299	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_021016	GGAGCT	2	12	1015190	1015201	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_021016	CTTTTC	2	12	1017821	1017832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_021016	GAAAAG	2	12	1052849	1052860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021016	GATAAC	2	12	1067894	1067905	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_021016	AAATTT	2	12	1111447	1111458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021016	GGAATT	2	12	1126644	1126655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021016	AGAAAG	2	12	1129398	1129409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021016	AGAATC	2	12	1137833	1137844	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_021016	TGTAAA	2	12	1148561	1148572	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021016	TAAAAA	2	12	1154652	1154663	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021016	AAGCAG	2	12	1167132	1167143	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_021016	CAAAGA	2	12	1167325	1167336	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_021016	ATTGTA	2	12	1197019	1197030	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021016	GGGAAT	2	12	1198449	1198460	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021016	TAAGAA	2	12	1199655	1199666	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021016	ATTTTA	2	12	1202060	1202071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021016	AGATGA	2	12	1206455	1206466	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021016	ATGCAA	2	12	1225290	1225301	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_021016	CATTTT	2	12	1237870	1237881	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_021016	AATTTA	2	12	1246743	1246754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021016	TGATTT	2	12	1253694	1253705	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021016	TGGAAA	2	12	1256489	1256500	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021016	GAAGTA	2	12	1274070	1274081	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021016	CTTATT	2	12	1281157	1281168	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_021016	GGAAAC	2	12	1282299	1282310	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_021016	TGTGAT	2	12	1287372	1287383	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021016	TTTAGC	2	12	1288267	1288278	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_021016	TCATAA	2	12	1297601	1297612	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_021016	TACATT	2	12	1304678	1304689	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_021016	AAATAG	2	12	1343987	1343998	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021016	TTTTTA	2	12	1349246	1349257	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021016	AAAATG	2	12	1353242	1353253	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021016	ATAAGA	2	12	1386533	1386544	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021016	GAAGAT	2	12	1393253	1393264	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021016	GGATTT	2	12	1394678	1394689	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021016	ACAAAA	2	12	1402473	1402484	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_021016	ACAATG	2	12	1406233	1406244	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_021016	TAGAAA	2	12	1406987	1406998	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021016	GTTTAT	2	12	1410080	1410091	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021016	AGATTT	2	12	1454010	1454021	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021016	CAGAAC	2	12	1455886	1455897	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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132	NC_021016	TCCATC	2	12	1456766	1456777	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
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249	NC_021016	GGAATC	2	12	2987601	2987612	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
250	NC_021016	TTTCTT	2	12	2991644	2991655	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
251	NC_021016	GAAGCA	2	12	3035545	3035556	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
252	NC_021016	AATTTG	2	12	3045470	3045481	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
253	NC_021016	TTGACT	2	12	3056263	3056274	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
254	NC_021016	AAAGAA	2	12	3075366	3075377	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
255	NC_021016	GAGATC	2	12	3079272	3079283	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
256	NC_021016	ATATTG	2	12	3081471	3081482	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
257	NC_021016	AGAAAA	2	12	3086255	3086266	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
258	NC_021016	TTGGAA	2	12	3086818	3086829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
259	NC_021016	GTTTTC	2	12	3095417	3095428	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
260	NC_021016	TATAAA	2	12	3102799	3102810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
261	NC_021016	ATCTTT	2	12	3108588	3108599	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
262	NC_021016	TTCCTG	2	12	3112090	3112101	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.