MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Butyrate-producing bacterium SSC/2

Total Repeats: 2799

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021016	ACAGA	2	10	222	231	60 %	0 %	20 %	20 %	479158860
2	NC_021016	TAAAT	2	10	688	697	60 %	40 %	0 %	0 %	479158861
3	NC_021016	TATAA	2	10	1527	1536	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021016	AGAAA	2	10	2835	2844	80 %	0 %	20 %	0 %	479158867
5	NC_021016	ACATA	2	10	4359	4368	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_021016	ATTAG	2	10	5992	6001	40 %	40 %	20 %	0 %	479158872
7	NC_021016	AAAAG	2	10	6505	6514	80 %	0 %	20 %	0 %	479158874
8	NC_021016	TTTTC	2	10	6969	6978	0 %	80 %	0 %	20 %	479158874
9	NC_021016	CAGAA	2	10	8171	8180	60 %	0 %	20 %	20 %	479158876
10	NC_021016	GAATT	2	10	10705	10714	40 %	40 %	20 %	0 %	479158882
11	NC_021016	AATTA	2	10	10719	10728	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021016	AGAAA	2	10	11101	11110	80 %	0 %	20 %	0 %	479158883
13	NC_021016	GTTTT	2	10	12722	12731	0 %	80 %	20 %	0 %	479158885
14	NC_021016	TGATC	2	10	12935	12944	20 %	40 %	20 %	20 %	479158885
15	NC_021016	AGTTT	2	10	13923	13932	20 %	60 %	20 %	0 %	479158885
16	NC_021016	AAGAG	2	10	14010	14019	60 %	0 %	40 %	0 %	479158885
17	NC_021016	TGGGG	2	10	16458	16467	0 %	20 %	80 %	0 %	479158886
18	NC_021016	TTATC	2	10	17442	17451	20 %	60 %	0 %	20 %	479158886
19	NC_021016	AAAAG	2	10	20591	20600	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021016	ATATA	2	10	21077	21086	60 %	40 %	0 %	0 %	479158889
21	NC_021016	AAAAC	2	10	21486	21495	80 %	0 %	0 %	20 %	479158889
22	NC_021016	GAAAG	2	10	21707	21716	60 %	0 %	40 %	0 %	479158889
23	NC_021016	CCAAG	2	10	23068	23077	40 %	0 %	20 %	40 %	479158889
24	NC_021016	GGAAA	2	10	32840	32849	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021016	ATGAA	2	10	34097	34106	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021016	GGTAT	2	10	35161	35170	20 %	40 %	40 %	0 %	479158899
27	NC_021016	AATGA	2	10	36262	36271	60 %	20 %	20 %	0 %	479158900
28	NC_021016	ATGAT	2	10	38881	38890	40 %	40 %	20 %	0 %	479158902
29	NC_021016	GACAG	2	10	39776	39785	40 %	0 %	40 %	20 %	479158903
30	NC_021016	AGCAG	2	10	40022	40031	40 %	0 %	40 %	20 %	479158903
31	NC_021016	CATTT	2	10	41104	41113	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_021016	AAAGA	2	10	42073	42082	80 %	0 %	20 %	0 %	479158907
33	NC_021016	TAAAA	2	10	42397	42406	80 %	20 %	0 %	0 %	479158907
34	NC_021016	TCATA	2	10	43930	43939	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_021016	TCGTG	2	10	45249	45258	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_021016	GGGAG	2	10	46926	46935	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021016	GGAAT	2	10	47867	47876	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021016	AAGAT	2	10	49168	49177	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021016	GACAA	2	10	49918	49927	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_021016	AAGCG	2	10	52993	53002	40 %	0 %	40 %	20 %	479158913
41	NC_021016	ATGGA	2	10	53326	53335	40 %	20 %	40 %	0 %	479158914
42	NC_021016	GATGG	2	10	53461	53470	20 %	20 %	60 %	0 %	479158914
43	NC_021016	TGAAA	2	10	53814	53823	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021016	ACTTC	2	10	54659	54668	20 %	40 %	0 %	40 %	479158915
45	NC_021016	CAGAA	2	10	54716	54725	60 %	0 %	20 %	20 %	479158915
46	NC_021016	TCAGA	2	10	55282	55291	40 %	20 %	20 %	20 %	479158916
47	NC_021016	AGATC	2	10	55779	55788	40 %	20 %	20 %	20 %	479158917
48	NC_021016	CGGAT	2	10	58830	58839	20 %	20 %	40 %	20 %	479158921
49	NC_021016	AGAAA	2	10	59070	59079	80 %	0 %	20 %	0 %	479158922
50	NC_021016	TATCA	2	10	60784	60793	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_021016	TCATT	2	10	60797	60806	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_021016	ATCTG	2	10	62493	62502	20 %	40 %	20 %	20 %	479158924
53	NC_021016	TTCTC	2	10	65470	65479	0 %	60 %	0 %	40 %	479158926
54	NC_021016	GCCTT	2	10	65869	65878	0 %	40 %	20 %	40 %	479158926
55	NC_021016	AAAAT	2	10	67996	68005	80 %	20 %	0 %	0 %	479158927
56	NC_021016	CTTAT	2	10	68951	68960	20 %	60 %	0 %	20 %	479158929
57	NC_021016	AAATA	2	10	69010	69019	80 %	20 %	0 %	0 %	479158929
58	NC_021016	TTAAT	2	10	69552	69561	40 %	60 %	0 %	0 %	479158929
59	NC_021016	ATTTA	2	10	70321	70330	40 %	60 %	0 %	0 %	479158930
60	NC_021016	TTGAA	2	10	70726	70735	40 %	40 %	20 %	0 %	479158930
61	NC_021016	TCAGA	2	10	71073	71082	40 %	20 %	20 %	20 %	479158930
62	NC_021016	AAAGA	2	10	71737	71746	80 %	0 %	20 %	0 %	479158931
63	NC_021016	CTTTT	2	10	71868	71877	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_021016	GATAT	2	10	72130	72139	40 %	40 %	20 %	0 %	479158932
65	NC_021016	AAGGA	2	10	72461	72470	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021016	AAATC	2	10	73750	73759	60 %	20 %	0 %	20 %	479158934
67	NC_021016	TAAAG	2	10	74139	74148	60 %	20 %	20 %	0 %	479158934
68	NC_021016	TATAT	2	10	74336	74345	40 %	60 %	0 %	0 %	479158935
69	NC_021016	TGTAT	2	10	74545	74554	20 %	60 %	20 %	0 %	479158935
70	NC_021016	AAGAT	2	10	76570	76579	60 %	20 %	20 %	0 %	479158936
71	NC_021016	AGATG	2	10	77150	77159	40 %	20 %	40 %	0 %	479158936
72	NC_021016	CAAAA	2	10	77998	78007	80 %	0 %	0 %	20 %	479158937
73	NC_021016	AAAAG	2	10	79942	79951	80 %	0 %	20 %	0 %	479158939
74	NC_021016	ATATG	2	10	79999	80008	40 %	40 %	20 %	0 %	479158939
75	NC_021016	GAGAA	2	10	81311	81320	60 %	0 %	40 %	0 %	479158940
76	NC_021016	ATTGA	2	10	81607	81616	40 %	40 %	20 %	0 %	479158940
77	NC_021016	GATCA	2	10	82790	82799	40 %	20 %	20 %	20 %	479158941
78	NC_021016	TAAAT	2	10	83006	83015	60 %	40 %	0 %	0 %	479158942
79	NC_021016	AGAAA	2	10	84114	84123	80 %	0 %	20 %	0 %	479158943
80	NC_021016	ATACA	2	10	85030	85039	60 %	20 %	0 %	20 %	479158944
81	NC_021016	ATGAG	2	10	85185	85194	40 %	20 %	40 %	0 %	479158944
82	NC_021016	TATGA	2	10	85381	85390	40 %	40 %	20 %	0 %	479158944
83	NC_021016	GCAAT	2	10	86087	86096	40 %	20 %	20 %	20 %	479158945
84	NC_021016	GAATT	2	10	86645	86654	40 %	40 %	20 %	0 %	479158946
85	NC_021016	TAGTA	2	10	87670	87679	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021016	AGACA	2	10	87768	87777	60 %	0 %	20 %	20 %	479158948
87	NC_021016	AATGG	2	10	88014	88023	40 %	20 %	40 %	0 %	479158949
88	NC_021016	CAAAC	2	10	92155	92164	60 %	0 %	0 %	40 %	479158951
89	NC_021016	AAAGA	2	10	94733	94742	80 %	0 %	20 %	0 %	479158955
90	NC_021016	AGATC	2	10	95153	95162	40 %	20 %	20 %	20 %	479158955
91	NC_021016	CAAAG	2	10	96420	96429	60 %	0 %	20 %	20 %	479158956
92	NC_021016	AGCAA	2	10	96509	96518	60 %	0 %	20 %	20 %	479158956
93	NC_021016	TAGAA	2	10	96728	96737	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021016	ATCAA	2	10	98604	98613	60 %	20 %	0 %	20 %	479158958
95	NC_021016	GAAAT	2	10	100779	100788	60 %	20 %	20 %	0 %	479158960
96	NC_021016	TGGCG	2	10	101147	101156	0 %	20 %	60 %	20 %	479158961
97	NC_021016	GATCA	2	10	101706	101715	40 %	20 %	20 %	20 %	479158961
98	NC_021016	ACAAG	2	10	103912	103921	60 %	0 %	20 %	20 %	479158962
99	NC_021016	TAATG	2	10	104068	104077	40 %	40 %	20 %	0 %	479158962
100	NC_021016	TACTT	2	10	105873	105882	20 %	60 %	0 %	20 %	479158963
101	NC_021016	AAAAG	2	10	106705	106714	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021016	GGTAA	2	10	106872	106881	40 %	20 %	40 %	0 %	479158965
103	NC_021016	GATAT	2	10	108792	108801	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021016	TTCTT	2	10	110085	110094	0 %	80 %	0 %	20 %	479158968
105	NC_021016	GAACA	2	10	111551	111560	60 %	0 %	20 %	20 %	479158970
106	NC_021016	AAAAG	2	10	112682	112691	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021016	TCTGG	2	10	113086	113095	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
108	NC_021016	ATAAA	2	10	113147	113156	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021016	GGTGC	2	10	113566	113575	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
110	NC_021016	TGGAA	2	10	115648	115657	40 %	20 %	40 %	0 %	479158972
111	NC_021016	GAAGT	2	10	115683	115692	40 %	20 %	40 %	0 %	479158972
112	NC_021016	ATATT	2	10	115913	115922	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021016	CAGAT	2	10	116472	116481	40 %	20 %	20 %	20 %	479158973
114	NC_021016	TTTCT	2	10	116643	116652	0 %	80 %	0 %	20 %	479158974
115	NC_021016	GATAT	2	10	117594	117603	40 %	40 %	20 %	0 %	479158975
116	NC_021016	TTGTT	2	10	117614	117623	0 %	80 %	20 %	0 %	479158975
117	NC_021016	AATAA	2	10	119585	119594	80 %	20 %	0 %	0 %	479158976
118	NC_021016	ATTCA	2	10	119882	119891	40 %	40 %	0 %	20 %	479158976
119	NC_021016	CAAGA	2	10	120101	120110	60 %	0 %	20 %	20 %	479158976
120	NC_021016	ATCAG	2	10	121501	121510	40 %	20 %	20 %	20 %	479158977
121	NC_021016	TTTTG	2	10	124125	124134	0 %	80 %	20 %	0 %	479158980
122	NC_021016	CATAT	2	10	124476	124485	40 %	40 %	0 %	20 %	479158980
123	NC_021016	CATTT	2	10	125239	125248	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_021016	AGAGA	2	10	129275	129284	60 %	0 %	40 %	0 %	479158983
125	NC_021016	TATTT	2	10	129918	129927	20 %	80 %	0 %	0 %	479158984
126	NC_021016	AGATG	2	10	130812	130821	40 %	20 %	40 %	0 %	479158984
127	NC_021016	AGAAA	2	10	132218	132227	80 %	0 %	20 %	0 %	479158986
128	NC_021016	CAGGA	2	10	133216	133225	40 %	0 %	40 %	20 %	479158987
129	NC_021016	GCAGA	2	10	133509	133518	40 %	0 %	40 %	20 %	479158987
130	NC_021016	ATTAT	2	10	134417	134426	40 %	60 %	0 %	0 %	479158988
131	NC_021016	CAATG	2	10	135708	135717	40 %	20 %	20 %	20 %	479158990
132	NC_021016	ATAGA	2	10	136223	136232	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021016	TCATA	2	10	137774	137783	40 %	40 %	0 %	20 %	479158993
134	NC_021016	ATTGG	2	10	140085	140094	20 %	40 %	40 %	0 %	479158997
135	NC_021016	AGCCA	2	10	141343	141352	40 %	0 %	20 %	40 %	479158998
136	NC_021016	ATTCC	2	10	142439	142448	20 %	40 %	0 %	40 %	479158999
137	NC_021016	AAACA	2	10	143736	143745	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_021016	TTCTT	2	10	145689	145698	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_021016	TGAAA	2	10	146203	146212	60 %	20 %	20 %	0 %	479159004
140	NC_021016	GATAT	2	10	147424	147433	40 %	40 %	20 %	0 %	479159005
141	NC_021016	GTTCT	2	10	147988	147997	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
142	NC_021016	TAAAA	2	10	148342	148351	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021016	TTTTA	2	10	148393	148402	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021016	GATCA	2	10	149815	149824	40 %	20 %	20 %	20 %	479159007
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146	NC_021016	ATTTT	2	10	152734	152743	20 %	80 %	0 %	0 %	479159010
147	NC_021016	TATGG	2	10	153159	153168	20 %	40 %	40 %	0 %	479159010
148	NC_021016	AAAAG	2	10	153497	153506	80 %	0 %	20 %	0 %	479159010
149	NC_021016	CACAG	2	10	153913	153922	40 %	0 %	20 %	40 %	479159010
150	NC_021016	GATCA	2	10	154354	154363	40 %	20 %	20 %	20 %	479159010
151	NC_021016	AAATG	2	10	155976	155985	60 %	20 %	20 %	0 %	479159012
152	NC_021016	GCATC	2	10	157510	157519	20 %	20 %	20 %	40 %	479159014
153	NC_021016	GGCAG	2	10	160370	160379	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
154	NC_021016	TTTTA	2	10	163592	163601	20 %	80 %	0 %	0 %	479159019
155	NC_021016	TTTTA	2	10	165258	165267	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_021016	CTTAT	2	10	165544	165553	20 %	60 %	0 %	20 %	479159020
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161	NC_021016	CCAGA	2	10	172683	172692	40 %	0 %	20 %	40 %	479159028
162	NC_021016	TTATG	2	10	175477	175486	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
163	NC_021016	TATTT	2	10	179880	179889	20 %	80 %	0 %	0 %	479159036
164	NC_021016	ATTAT	2	10	180816	180825	40 %	60 %	0 %	0 %	479159036
165	NC_021016	TACTT	2	10	182511	182520	20 %	60 %	0 %	20 %	479159038
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167	NC_021016	TTTTC	2	10	183574	183583	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
168	NC_021016	AAATC	2	10	186262	186271	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
169	NC_021016	TAATA	2	10	186320	186329	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_021016	ACGTT	2	10	190279	190288	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
173	NC_021016	TAGAT	2	10	191278	191287	40 %	40 %	20 %	0 %	479159046
174	NC_021016	TTTTC	2	10	192569	192578	0 %	80 %	0 %	20 %	479159046
175	NC_021016	AATTA	2	10	193956	193965	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_021016	AGGGT	2	10	195849	195858	20 %	20 %	60 %	0 %	479159051
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186	NC_021016	GTAGA	2	10	214748	214757	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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189	NC_021016	AAAAT	2	10	218474	218483	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_021016	TAAAT	2	10	219128	219137	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_021016	AGATT	2	10	220456	220465	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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195	NC_021016	AAACA	2	10	226762	226771	80 %	0 %	0 %	20 %	479159072
196	NC_021016	GACAG	2	10	227041	227050	40 %	0 %	40 %	20 %	479159072
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198	NC_021016	GGCAA	2	10	231427	231436	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
199	NC_021016	GGATA	2	10	231775	231784	40 %	20 %	40 %	0 %	479159078
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203	NC_021016	TGTGA	2	10	236395	236404	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
204	NC_021016	TGATA	2	10	236519	236528	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
205	NC_021016	ACACA	2	10	237816	237825	60 %	0 %	0 %	40 %	479159082
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232	NC_021016	AAGAA	2	10	265523	265532	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
233	NC_021016	GTTTT	2	10	265954	265963	0 %	80 %	20 %	0 %	479159109
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241	NC_021016	TATCA	2	10	277283	277292	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
242	NC_021016	TGCAA	2	10	278167	278176	40 %	20 %	20 %	20 %	479159119
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252	NC_021016	ATCAC	2	10	288155	288164	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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254	NC_021016	AGATC	2	10	288366	288375	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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256	NC_021016	TCTTT	2	10	288996	289005	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
257	NC_021016	TTCTT	2	10	289387	289396	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
258	NC_021016	TGCGA	2	10	290460	290469	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
259	NC_021016	TTTCA	2	10	292897	292906	20 %	60 %	0 %	20 %	479159129
260	NC_021016	ATCGT	2	10	292950	292959	20 %	40 %	20 %	20 %	479159129
261	NC_021016	TTGCA	2	10	293046	293055	20 %	40 %	20 %	20 %	479159129
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267	NC_021016	TTCCT	2	10	297415	297424	0 %	60 %	0 %	40 %	479159134
268	NC_021016	TCCAA	2	10	297674	297683	40 %	20 %	0 %	40 %	479159134
269	NC_021016	TTCTT	2	10	298327	298336	0 %	80 %	0 %	20 %	479159134
270	NC_021016	TCATC	2	10	299816	299825	20 %	40 %	0 %	40 %	479159135
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272	NC_021016	TTGTT	2	10	304663	304672	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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402	NC_021016	CTTTT	2	10	437171	437180	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
403	NC_021016	CAGAT	2	10	439266	439275	40 %	20 %	20 %	20 %	479159265
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