MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Ruminococcus torques L2-14 draft genome

Total Repeats: 2808

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021015	TTGAT	2	10	227	236	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021015	TCGTG	2	10	1210	1219	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_021015	GGGAG	2	10	3427	3436	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021015	CCGTA	2	10	4525	4534	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_021015	ATCAC	2	10	6482	6491	40 %	20 %	0 %	40 %	479155736
6	NC_021015	TTCCC	2	10	6928	6937	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
7	NC_021015	TTAAC	2	10	7655	7664	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_021015	CAGCC	2	10	8760	8769	20 %	0 %	20 %	60 %	479155739
9	NC_021015	CGGGC	2	10	9035	9044	0 %	0 %	60 %	40 %	479155739
10	NC_021015	TTTTC	2	10	12246	12255	0 %	80 %	0 %	20 %	479155741
11	NC_021015	TATGA	2	10	13880	13889	40 %	40 %	20 %	0 %	479155743
12	NC_021015	GAGAA	2	10	16194	16203	60 %	0 %	40 %	0 %	479155746
13	NC_021015	CAGAA	2	10	16846	16855	60 %	0 %	20 %	20 %	479155746
14	NC_021015	GACAG	2	10	17831	17840	40 %	0 %	40 %	20 %	479155747
15	NC_021015	AAGGT	2	10	21229	21238	40 %	20 %	40 %	0 %	479155749
16	NC_021015	TTCTT	2	10	22947	22956	0 %	80 %	0 %	20 %	479155751
17	NC_021015	CAAAT	2	10	25136	25145	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_021015	TCCTT	2	10	27924	27933	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_021015	ATTTA	2	10	28041	28050	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021015	GACAG	2	10	29929	29938	40 %	0 %	40 %	20 %	479155756
21	NC_021015	CGAAT	2	10	30672	30681	40 %	20 %	20 %	20 %	479155757
22	NC_021015	GTATT	2	10	31757	31766	20 %	60 %	20 %	0 %	479155758
23	NC_021015	AGAAA	2	10	32415	32424	80 %	0 %	20 %	0 %	479155759
24	NC_021015	CAGTA	2	10	35679	35688	40 %	20 %	20 %	20 %	479155765
25	NC_021015	CAATG	2	10	36772	36781	40 %	20 %	20 %	20 %	479155765
26	NC_021015	TTATT	2	10	37514	37523	20 %	80 %	0 %	0 %	479155766
27	NC_021015	GAAAA	2	10	39561	39570	80 %	0 %	20 %	0 %	479155768
28	NC_021015	GTCAG	2	10	39748	39757	20 %	20 %	40 %	20 %	479155768
29	NC_021015	CGATA	2	10	42022	42031	40 %	20 %	20 %	20 %	479155770
30	NC_021015	AAAAG	2	10	42079	42088	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021015	GTCAG	2	10	42708	42717	20 %	20 %	40 %	20 %	479155771
32	NC_021015	GAGAA	2	10	45620	45629	60 %	0 %	40 %	0 %	479155773
33	NC_021015	GAAAA	2	10	47041	47050	80 %	0 %	20 %	0 %	479155774
34	NC_021015	TGCGT	2	10	47241	47250	0 %	40 %	40 %	20 %	479155774
35	NC_021015	TCTGT	2	10	48185	48194	0 %	60 %	20 %	20 %	479155774
36	NC_021015	GATCA	2	10	48259	48268	40 %	20 %	20 %	20 %	479155774
37	NC_021015	TCAGA	2	10	48616	48625	40 %	20 %	20 %	20 %	479155775
38	NC_021015	GAAAA	2	10	52797	52806	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021015	GAAAA	2	10	52983	52992	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021015	GTGAA	2	10	53974	53983	40 %	20 %	40 %	0 %	479155779
41	NC_021015	ATTCC	2	10	54425	54434	20 %	40 %	0 %	40 %	479155779
42	NC_021015	CACTT	2	10	54814	54823	20 %	40 %	0 %	40 %	479155779
43	NC_021015	CGCTG	2	10	54991	55000	0 %	20 %	40 %	40 %	479155780
44	NC_021015	AGCAC	2	10	55383	55392	40 %	0 %	20 %	40 %	479155780
45	NC_021015	AAGGC	2	10	57755	57764	40 %	0 %	40 %	20 %	479155784
46	NC_021015	TGCTG	2	10	58999	59008	0 %	40 %	40 %	20 %	479155786
47	NC_021015	CTTTT	2	10	59272	59281	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_021015	AAAAG	2	10	62962	62971	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021015	AGCCC	2	10	66477	66486	20 %	0 %	20 %	60 %	479155790
50	NC_021015	GCCCC	2	10	67971	67980	0 %	0 %	20 %	80 %	479155792
51	NC_021015	CAAGG	2	10	69243	69252	40 %	0 %	40 %	20 %	479155792
52	NC_021015	TTGCT	2	10	70082	70091	0 %	60 %	20 %	20 %	479155792
53	NC_021015	GAAAA	2	10	70572	70581	80 %	0 %	20 %	0 %	479155792
54	NC_021015	ACTTT	2	10	70676	70685	20 %	60 %	0 %	20 %	479155793
55	NC_021015	GCAAC	2	10	71007	71016	40 %	0 %	20 %	40 %	479155794
56	NC_021015	ATCCA	2	10	72123	72132	40 %	20 %	0 %	40 %	479155794
57	NC_021015	GCTGT	2	10	74466	74475	0 %	40 %	40 %	20 %	479155794
58	NC_021015	TTTTC	2	10	80039	80048	0 %	80 %	0 %	20 %	479155796
59	NC_021015	TGTTA	2	10	80630	80639	20 %	60 %	20 %	0 %	479155796
60	NC_021015	CTTTG	2	10	80899	80908	0 %	60 %	20 %	20 %	479155797
61	NC_021015	ATTCA	2	10	83157	83166	40 %	40 %	0 %	20 %	479155800
62	NC_021015	GAACT	2	10	84086	84095	40 %	20 %	20 %	20 %	479155801
63	NC_021015	TTCCT	2	10	84122	84131	0 %	60 %	0 %	40 %	479155801
64	NC_021015	TCTCT	2	10	84172	84181	0 %	60 %	0 %	40 %	479155801
65	NC_021015	ACTTT	2	10	85364	85373	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_021015	ATTTA	2	10	85749	85758	40 %	60 %	0 %	0 %	479155802
67	NC_021015	CACAC	2	10	86381	86390	40 %	0 %	0 %	60 %	479155802
68	NC_021015	ATGCC	2	10	86729	86738	20 %	20 %	20 %	40 %	479155802
69	NC_021015	CTTTT	2	10	87694	87703	0 %	80 %	0 %	20 %	479155802
70	NC_021015	GCTCT	2	10	87772	87781	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
71	NC_021015	GGTCA	2	10	89829	89838	20 %	20 %	40 %	20 %	479155806
72	NC_021015	CCTAT	2	10	95742	95751	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
73	NC_021015	CATAT	2	10	97828	97837	40 %	40 %	0 %	20 %	479155813
74	NC_021015	ATCAG	2	10	99440	99449	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_021015	ACTGA	2	10	100511	100520	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_021015	GTGCC	2	10	101578	101587	0 %	20 %	40 %	40 %	479155816
77	NC_021015	GTTCA	2	10	106493	106502	20 %	40 %	20 %	20 %	479155824
78	NC_021015	ATCTG	2	10	107252	107261	20 %	40 %	20 %	20 %	479155825
79	NC_021015	TTCAG	2	10	108816	108825	20 %	40 %	20 %	20 %	479155826
80	NC_021015	CCTGT	2	10	109355	109364	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
81	NC_021015	TGACT	2	10	109788	109797	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_021015	ACATT	2	10	112730	112739	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_021015	TTAAG	2	10	112919	112928	40 %	40 %	20 %	0 %	479155829
84	NC_021015	TCCTT	2	10	113371	113380	0 %	60 %	0 %	40 %	479155830
85	NC_021015	ACAAA	2	10	114173	114182	80 %	0 %	0 %	20 %	479155833
86	NC_021015	TGCAT	2	10	114637	114646	20 %	40 %	20 %	20 %	479155834
87	NC_021015	CTTGC	2	10	116368	116377	0 %	40 %	20 %	40 %	479155834
88	NC_021015	TGCAT	2	10	118356	118365	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_021015	CCCTT	2	10	118604	118613	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
90	NC_021015	ATCTG	2	10	119057	119066	20 %	40 %	20 %	20 %	479155836
91	NC_021015	TACAA	2	10	121374	121383	60 %	20 %	0 %	20 %	479155840
92	NC_021015	ACCAA	2	10	123247	123256	60 %	0 %	0 %	40 %	479155843
93	NC_021015	ATCAG	2	10	126135	126144	40 %	20 %	20 %	20 %	479155846
94	NC_021015	TTTCC	2	10	128799	128808	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
95	NC_021015	GAAGG	2	10	130134	130143	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021015	ATCAA	2	10	131106	131115	60 %	20 %	0 %	20 %	479155853
97	NC_021015	GAATT	2	10	132492	132501	40 %	40 %	20 %	0 %	479155855
98	NC_021015	TCTTT	2	10	132688	132697	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_021015	ATAAG	2	10	134721	134730	60 %	20 %	20 %	0 %	479155859
100	NC_021015	GCTTC	2	10	135416	135425	0 %	40 %	20 %	40 %	479155859
101	NC_021015	TGAGA	2	10	136829	136838	40 %	20 %	40 %	0 %	479155862
102	NC_021015	TCTTT	2	10	137098	137107	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_021015	CTTTC	2	10	138799	138808	0 %	60 %	0 %	40 %	479155863
104	NC_021015	TCTGT	2	10	139541	139550	0 %	60 %	20 %	20 %	479155864
105	NC_021015	TTTAT	2	10	139751	139760	20 %	80 %	0 %	0 %	479155864
106	NC_021015	GTCCT	2	10	139872	139881	0 %	40 %	20 %	40 %	479155865
107	NC_021015	TTCTC	2	10	140284	140293	0 %	60 %	0 %	40 %	479155865
108	NC_021015	CAATC	2	10	142184	142193	40 %	20 %	0 %	40 %	479155865
109	NC_021015	ATATA	2	10	144735	144744	60 %	40 %	0 %	0 %	479155866
110	NC_021015	TTTAT	2	10	145521	145530	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021015	TGTTT	2	10	151072	151081	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021015	ATGAT	2	10	151419	151428	40 %	40 %	20 %	0 %	479155870
113	NC_021015	TCCTT	2	10	152415	152424	0 %	60 %	0 %	40 %	479155871
114	NC_021015	TCGTT	2	10	153103	153112	0 %	60 %	20 %	20 %	479155871
115	NC_021015	AAAAT	2	10	155217	155226	80 %	20 %	0 %	0 %	479155874
116	NC_021015	ATCTG	2	10	155959	155968	20 %	40 %	20 %	20 %	479155874
117	NC_021015	AATTG	2	10	156322	156331	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021015	CTCTT	2	10	157097	157106	0 %	60 %	0 %	40 %	479155875
119	NC_021015	TTCTT	2	10	157431	157440	0 %	80 %	0 %	20 %	479155875
120	NC_021015	CAAAT	2	10	159667	159676	60 %	20 %	0 %	20 %	479155878
121	NC_021015	CTTTT	2	10	159984	159993	0 %	80 %	0 %	20 %	479155878
122	NC_021015	AGTTA	2	10	162804	162813	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021015	GTGCT	2	10	165619	165628	0 %	40 %	40 %	20 %	479155883
124	NC_021015	TGTTC	2	10	166106	166115	0 %	60 %	20 %	20 %	479155883
125	NC_021015	CTCCC	2	10	166128	166137	0 %	20 %	0 %	80 %	479155883
126	NC_021015	TTTCT	2	10	166207	166216	0 %	80 %	0 %	20 %	479155883
127	NC_021015	GTTTC	2	10	166403	166412	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
128	NC_021015	TTGTT	2	10	168142	168151	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021015	ATTAT	2	10	168161	168170	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021015	TCTTA	2	10	168776	168785	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_021015	ATAGT	2	10	170914	170923	40 %	40 %	20 %	0 %	479155890
132	NC_021015	CTCTT	2	10	172146	172155	0 %	60 %	0 %	40 %	479155892
133	NC_021015	ATTCC	2	10	173199	173208	20 %	40 %	0 %	40 %	479155893
134	NC_021015	TCCCT	2	10	174072	174081	0 %	40 %	0 %	60 %	479155893
135	NC_021015	CATCG	2	10	174274	174283	20 %	20 %	20 %	40 %	479155893
136	NC_021015	TTCTG	2	10	174941	174950	0 %	60 %	20 %	20 %	479155893
137	NC_021015	CTTTT	2	10	176498	176507	0 %	80 %	0 %	20 %	479155896
138	NC_021015	TTTTC	2	10	177918	177927	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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262	NC_021015	CTAAA	2	10	329504	329513	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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268	NC_021015	CATTA	2	10	344777	344786	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
269	NC_021015	CGCAT	2	10	344947	344956	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
270	NC_021015	AGATC	2	10	346348	346357	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
271	NC_021015	AGAGA	2	10	346723	346732	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
272	NC_021015	GATCT	2	10	346734	346743	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
273	NC_021015	TGATC	2	10	348492	348501	20 %	40 %	20 %	20 %	479156042
274	NC_021015	GGACA	2	10	349078	349087	40 %	0 %	40 %	20 %	479156042
275	NC_021015	TGAAA	2	10	350157	350166	60 %	20 %	20 %	0 %	479156043
276	NC_021015	CAATG	2	10	351228	351237	40 %	20 %	20 %	20 %	479156044
277	NC_021015	TTCTG	2	10	351533	351542	0 %	60 %	20 %	20 %	479156044
278	NC_021015	GAATA	2	10	351892	351901	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
279	NC_021015	AGATC	2	10	352269	352278	40 %	20 %	20 %	20 %	479156045
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282	NC_021015	GAGAA	2	10	354660	354669	60 %	0 %	40 %	0 %	479156046
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285	NC_021015	GCAGA	2	10	357509	357518	40 %	0 %	40 %	20 %	479156047
286	NC_021015	GACAC	2	10	359751	359760	40 %	0 %	20 %	40 %	479156050
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290	NC_021015	GAAAA	2	10	363609	363618	80 %	0 %	20 %	0 %	479156054
291	NC_021015	AAGAT	2	10	364479	364488	60 %	20 %	20 %	0 %	479156055
292	NC_021015	TATGC	2	10	364493	364502	20 %	40 %	20 %	20 %	479156055
293	NC_021015	ACCGA	2	10	365257	365266	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
294	NC_021015	GACAA	2	10	365497	365506	60 %	0 %	20 %	20 %	479156056
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401	NC_021015	TCGTA	2	10	487743	487752	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
402	NC_021015	TCAAA	2	10	489229	489238	60 %	20 %	0 %	20 %	479156164
403	NC_021015	CCTTT	2	10	489320	489329	0 %	60 %	0 %	40 %	479156164
404	NC_021015	TTCAG	2	10	489486	489495	20 %	40 %	20 %	20 %	479156164
405	NC_021015	AAATA	2	10	490035	490044	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
406	NC_021015	GGTAT	2	10	492275	492284	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
407	NC_021015	CATGA	2	10	492731	492740	40 %	20 %	20 %	20 %	479156170
408	NC_021015	TCTAA	2	10	493489	493498	40 %	40 %	0 %	20 %	479156172
409	NC_021015	TTGGT	2	10	493529	493538	0 %	60 %	40 %	0 %	479156172
410	NC_021015	ATTCC	2	10	494426	494435	20 %	40 %	0 %	40 %	479156173
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413	NC_021015	TGTCC	2	10	499758	499767	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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429	NC_021015	GCCTT	2	10	515443	515452	0 %	40 %	20 %	40 %	479156192
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431	NC_021015	TTCCT	2	10	518651	518660	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
432	NC_021015	CTTTT	2	10	519105	519114	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
433	NC_021015	AGTGA	2	10	520746	520755	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
434	NC_021015	TGAAA	2	10	520787	520796	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
435	NC_021015	CCTGT	2	10	521308	521317	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
436	NC_021015	TTAAA	2	10	524669	524678	60 %	40 %	0 %	0 %	479156203
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438	NC_021015	CGCAT	2	10	525637	525646	20 %	20 %	20 %	40 %	479156204
439	NC_021015	TCATT	2	10	528896	528905	20 %	60 %	0 %	20 %	479156207
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441	NC_021015	TTTCC	2	10	529801	529810	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
442	NC_021015	ATCTC	2	10	530804	530813	20 %	40 %	0 %	40 %	479156208
443	NC_021015	ATCTC	2	10	531119	531128	20 %	40 %	0 %	40 %	479156208
444	NC_021015	CTTCA	2	10	532398	532407	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
445	NC_021015	TGATT	2	10	533788	533797	20 %	60 %	20 %	0 %	479156209
446	NC_021015	GCCAT	2	10	534940	534949	20 %	20 %	20 %	40 %	479156210
447	NC_021015	GCTTT	2	10	535393	535402	0 %	60 %	20 %	20 %	479156210
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451	NC_021015	TAAAC	2	10	542622	542631	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
452	NC_021015	TATTT	2	10	542685	542694	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
453	NC_021015	TGCCT	2	10	542833	542842	0 %	40 %	20 %	40 %	479156218
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461	NC_021015	AATTC	2	10	550473	550482	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
462	NC_021015	TCTTA	2	10	552377	552386	20 %	60 %	0 %	20 %	479156227
463	NC_021015	CTTTC	2	10	554451	554460	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
464	NC_021015	TTCTT	2	10	556230	556239	0 %	80 %	0 %	20 %	479156232
465	NC_021015	ATTAA	2	10	557710	557719	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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