MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Ruminococcus torques L2-14 draft genome

Total Repeats: 9493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021015	AAAC	2	8	81	88	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_021015	TAGT	2	8	119	126	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021015	CGAA	2	8	214	221	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_021015	AAAT	2	8	2826	2833	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021015	TATG	2	8	2859	2866	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021015	AAGG	2	8	3077	3084	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021015	GCGT	2	8	3182	3189	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_021015	GCTG	2	8	3529	3536	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_021015	AGTC	2	8	3596	3603	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_021015	CATT	2	8	4015	4022	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_021015	TGTA	2	8	5833	5840	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021015	CTTT	2	8	5887	5894	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_021015	CACG	2	8	6010	6017	25 %	0 %	25 %	50 %	479155736
14	NC_021015	CGAT	2	8	6138	6145	25 %	25 %	25 %	25 %	479155736
15	NC_021015	CCGA	2	8	6320	6327	25 %	0 %	25 %	50 %	479155736
16	NC_021015	AAAT	2	8	6784	6791	75 %	25 %	0 %	0 %	479155737
17	NC_021015	TCAA	2	8	7092	7099	50 %	25 %	0 %	25 %	479155738
18	NC_021015	GACA	2	8	7820	7827	50 %	0 %	25 %	25 %	479155739
19	NC_021015	ATAA	2	8	8515	8522	75 %	25 %	0 %	0 %	479155739
20	NC_021015	CAGC	2	8	8613	8620	25 %	0 %	25 %	50 %	479155739
21	NC_021015	ATAA	2	8	8653	8660	75 %	25 %	0 %	0 %	479155739
22	NC_021015	CAGC	2	8	8875	8882	25 %	0 %	25 %	50 %	479155739
23	NC_021015	ATTC	2	8	9152	9159	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_021015	TCCA	2	8	9352	9359	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_021015	AATC	2	8	9678	9685	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_021015	CTGT	2	8	9776	9783	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_021015	ATTG	2	8	9858	9865	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021015	ATCA	2	8	10482	10489	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_021015	TTCT	2	8	10491	10498	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_021015	TCTG	2	8	10556	10563	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_021015	ATTT	2	8	11670	11677	25 %	75 %	0 %	0 %	479155740
32	NC_021015	GAAA	2	8	12109	12116	75 %	0 %	25 %	0 %	479155740
33	NC_021015	TTAT	2	8	12226	12233	25 %	75 %	0 %	0 %	479155741
34	NC_021015	AGTG	2	8	13712	13719	25 %	25 %	50 %	0 %	479155743
35	NC_021015	ATTT	2	8	14163	14170	25 %	75 %	0 %	0 %	479155744
36	NC_021015	TGAT	2	8	14245	14252	25 %	50 %	25 %	0 %	479155744
37	NC_021015	TCTG	2	8	14580	14587	0 %	50 %	25 %	25 %	479155744
38	NC_021015	GATG	2	8	15096	15103	25 %	25 %	50 %	0 %	479155744
39	NC_021015	TAAT	2	8	15889	15896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021015	AAGA	2	8	15989	15996	75 %	0 %	25 %	0 %	479155745
41	NC_021015	CAGA	2	8	16569	16576	50 %	0 %	25 %	25 %	479155746
42	NC_021015	AAGA	2	8	16598	16605	75 %	0 %	25 %	0 %	479155746
43	NC_021015	CAGA	2	8	16617	16624	50 %	0 %	25 %	25 %	479155746
44	NC_021015	AAAG	2	8	16733	16740	75 %	0 %	25 %	0 %	479155746
45	NC_021015	GATG	2	8	16887	16894	25 %	25 %	50 %	0 %	479155746
46	NC_021015	GACC	2	8	17218	17225	25 %	0 %	25 %	50 %	479155747
47	NC_021015	GGAT	2	8	17816	17823	25 %	25 %	50 %	0 %	479155747
48	NC_021015	TGGA	2	8	18068	18075	25 %	25 %	50 %	0 %	479155747
49	NC_021015	GCCA	2	8	18755	18762	25 %	0 %	25 %	50 %	479155748
50	NC_021015	GACA	2	8	19077	19084	50 %	0 %	25 %	25 %	479155748
51	NC_021015	AAAT	2	8	19145	19152	75 %	25 %	0 %	0 %	479155748
52	NC_021015	GAAG	2	8	19344	19351	50 %	0 %	50 %	0 %	479155748
53	NC_021015	GGCT	2	8	19734	19741	0 %	25 %	50 %	25 %	479155748
54	NC_021015	TTTC	2	8	19750	19757	0 %	75 %	0 %	25 %	479155748
55	NC_021015	CGAA	2	8	19987	19994	50 %	0 %	25 %	25 %	479155748
56	NC_021015	TTGA	2	8	20581	20588	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021015	AAAT	2	8	20989	20996	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021015	GAAG	2	8	21611	21618	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021015	AAGA	2	8	22089	22096	75 %	0 %	25 %	0 %	479155750
60	NC_021015	TTTG	2	8	22146	22153	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021015	GTTT	2	8	22821	22828	0 %	75 %	25 %	0 %	479155751
62	NC_021015	TCAG	2	8	23592	23599	25 %	25 %	25 %	25 %	479155751
63	NC_021015	TGGA	2	8	24578	24585	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021015	GACA	2	8	24803	24810	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_021015	GTCG	2	8	25098	25105	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_021015	AGTT	2	8	25753	25760	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021015	ATTT	2	8	25812	25819	25 %	75 %	0 %	0 %	479155753
68	NC_021015	AAGA	2	8	25967	25974	75 %	0 %	25 %	0 %	479155753
69	NC_021015	TGCC	2	8	26918	26925	0 %	25 %	25 %	50 %	479155754
70	NC_021015	TGAG	2	8	26974	26981	25 %	25 %	50 %	0 %	479155754
71	NC_021015	TAAG	2	8	27009	27016	50 %	25 %	25 %	0 %	479155754
72	NC_021015	ATGG	2	8	27085	27092	25 %	25 %	50 %	0 %	479155754
73	NC_021015	GATC	2	8	27714	27721	25 %	25 %	25 %	25 %	479155754
74	NC_021015	CAGG	2	8	27956	27963	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_021015	ATTT	2	8	28707	28714	25 %	75 %	0 %	0 %	479155755
76	NC_021015	TGCA	2	8	29079	29086	25 %	25 %	25 %	25 %	479155755
77	NC_021015	TGCG	2	8	29129	29136	0 %	25 %	50 %	25 %	479155755
78	NC_021015	GGAA	2	8	29148	29155	50 %	0 %	50 %	0 %	479155755
79	NC_021015	ATGA	2	8	29813	29820	50 %	25 %	25 %	0 %	479155756
80	NC_021015	TCCA	2	8	30237	30244	25 %	25 %	0 %	50 %	479155756
81	NC_021015	AGAA	2	8	31051	31058	75 %	0 %	25 %	0 %	479155757
82	NC_021015	GGAA	2	8	31067	31074	50 %	0 %	50 %	0 %	479155757
83	NC_021015	AGGA	2	8	31109	31116	50 %	0 %	50 %	0 %	479155757
84	NC_021015	ATGG	2	8	31478	31485	25 %	25 %	50 %	0 %	479155758
85	NC_021015	CTTC	2	8	32046	32053	0 %	50 %	0 %	50 %	479155758
86	NC_021015	GATG	2	8	32401	32408	25 %	25 %	50 %	0 %	479155759
87	NC_021015	GGAA	2	8	32533	32540	50 %	0 %	50 %	0 %	479155759
88	NC_021015	TGAT	2	8	32586	32593	25 %	50 %	25 %	0 %	479155759
89	NC_021015	TGAG	2	8	32715	32722	25 %	25 %	50 %	0 %	479155759
90	NC_021015	AGAA	2	8	33071	33078	75 %	0 %	25 %	0 %	479155760
91	NC_021015	ATCA	2	8	33397	33404	50 %	25 %	0 %	25 %	479155760
92	NC_021015	CAGA	2	8	33913	33920	50 %	0 %	25 %	25 %	479155761
93	NC_021015	TGAT	2	8	35426	35433	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021015	GATT	2	8	36075	36082	25 %	50 %	25 %	0 %	479155765
95	NC_021015	CAGT	2	8	37449	37456	25 %	25 %	25 %	25 %	479155765
96	NC_021015	GCAG	2	8	38025	38032	25 %	0 %	50 %	25 %	479155767
97	NC_021015	GAAA	2	8	38196	38203	75 %	0 %	25 %	0 %	479155767
98	NC_021015	ATCA	2	8	38310	38317	50 %	25 %	0 %	25 %	479155767
99	NC_021015	GCGT	2	8	38496	38503	0 %	25 %	50 %	25 %	479155767
100	NC_021015	AAGA	2	8	38964	38971	75 %	0 %	25 %	0 %	479155767
101	NC_021015	TATC	2	8	39162	39169	25 %	50 %	0 %	25 %	479155767
102	NC_021015	CATT	2	8	40103	40110	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_021015	TCGT	2	8	40143	40150	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_021015	AATC	2	8	40186	40193	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_021015	TGTA	2	8	40411	40418	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021015	TATT	2	8	40507	40514	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021015	GAAA	2	8	40791	40798	75 %	0 %	25 %	0 %	479155770
108	NC_021015	GCAG	2	8	40984	40991	25 %	0 %	50 %	25 %	479155770
109	NC_021015	GAAG	2	8	41530	41537	50 %	0 %	50 %	0 %	479155770
110	NC_021015	ACGA	2	8	41759	41766	50 %	0 %	25 %	25 %	479155770
111	NC_021015	TGGA	2	8	41883	41890	25 %	25 %	50 %	0 %	479155770
112	NC_021015	ATGA	2	8	42014	42021	50 %	25 %	25 %	0 %	479155770
113	NC_021015	AAAT	2	8	42058	42065	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021015	GGAC	2	8	44656	44663	25 %	0 %	50 %	25 %	479155773
115	NC_021015	TACG	2	8	44789	44796	25 %	25 %	25 %	25 %	479155773
116	NC_021015	CTTT	2	8	44900	44907	0 %	75 %	0 %	25 %	479155773
117	NC_021015	CAGA	2	8	45744	45751	50 %	0 %	25 %	25 %	479155773
118	NC_021015	TTCA	2	8	45909	45916	25 %	50 %	0 %	25 %	479155773
119	NC_021015	CGGC	2	8	45921	45928	0 %	0 %	50 %	50 %	479155773
120	NC_021015	TGAG	2	8	46544	46551	25 %	25 %	50 %	0 %	479155773
121	NC_021015	GGTC	2	8	46679	46686	0 %	25 %	50 %	25 %	479155773
122	NC_021015	ATTT	2	8	46795	46802	25 %	75 %	0 %	0 %	479155773
123	NC_021015	TAAA	2	8	46907	46914	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021015	TCAG	2	8	47310	47317	25 %	25 %	25 %	25 %	479155774
125	NC_021015	TGGA	2	8	47921	47928	25 %	25 %	50 %	0 %	479155774
126	NC_021015	CTTG	2	8	49403	49410	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_021015	GGAA	2	8	49658	49665	50 %	0 %	50 %	0 %	479155776
128	NC_021015	GTCT	2	8	50244	50251	0 %	50 %	25 %	25 %	479155776
129	NC_021015	TGTA	2	8	50848	50855	25 %	50 %	25 %	0 %	479155776
130	NC_021015	TTAC	2	8	51313	51320	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_021015	ATTT	2	8	51352	51359	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021015	GAAA	2	8	51522	51529	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021015	GCCC	2	8	52422	52429	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
134	NC_021015	TTGC	2	8	52704	52711	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_021015	AGGA	2	8	53966	53973	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021015	GCTT	2	8	54129	54136	0 %	50 %	25 %	25 %	479155779
137	NC_021015	GCAG	2	8	54209	54216	25 %	0 %	50 %	25 %	479155779
138	NC_021015	TGTC	2	8	54488	54495	0 %	50 %	25 %	25 %	479155779
139	NC_021015	ATGA	2	8	55989	55996	50 %	25 %	25 %	0 %	479155782
140	NC_021015	AAAG	2	8	56000	56007	75 %	0 %	25 %	0 %	479155782
141	NC_021015	AGAA	2	8	56445	56452	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021015	CCGT	2	8	56906	56913	0 %	25 %	25 %	50 %	479155783
143	NC_021015	TTTC	2	8	57118	57125	0 %	75 %	0 %	25 %	479155784
144	NC_021015	GAAA	2	8	58302	58309	75 %	0 %	25 %	0 %	479155785
145	NC_021015	GACC	2	8	58717	58724	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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