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Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Ruminococcus torques L2-14 draft genome

Total Repeats: 2202

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021015	AAAC	2	8	81	88	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_021015	TAGT	2	8	119	126	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021015	CGAA	2	8	214	221	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_021015	AAAT	2	8	2826	2833	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021015	TATG	2	8	2859	2866	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021015	AAGG	2	8	3077	3084	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021015	GCGT	2	8	3182	3189	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_021015	GCTG	2	8	3529	3536	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_021015	AGTC	2	8	3596	3603	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_021015	CATT	2	8	4015	4022	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_021015	TGTA	2	8	5833	5840	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021015	CTTT	2	8	5887	5894	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_021015	ATTC	2	8	9152	9159	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_021015	TCCA	2	8	9352	9359	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_021015	AATC	2	8	9678	9685	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_021015	CTGT	2	8	9776	9783	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_021015	ATTG	2	8	9858	9865	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021015	ATCA	2	8	10482	10489	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_021015	TTCT	2	8	10491	10498	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_021015	TCTG	2	8	10556	10563	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_021015	TAAT	2	8	15889	15896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021015	TTGA	2	8	20581	20588	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021015	AAAT	2	8	20989	20996	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021015	GAAG	2	8	21611	21618	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021015	TTTG	2	8	22146	22153	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021015	TGGA	2	8	24578	24585	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021015	GACA	2	8	24803	24810	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_021015	GTCG	2	8	25098	25105	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_021015	AGTT	2	8	25753	25760	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021015	CAGG	2	8	27956	27963	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_021015	TGAT	2	8	35426	35433	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021015	CATT	2	8	40103	40110	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_021015	TCGT	2	8	40143	40150	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_021015	AATC	2	8	40186	40193	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_021015	TGTA	2	8	40411	40418	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021015	TATT	2	8	40507	40514	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021015	AAAT	2	8	42058	42065	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021015	TAAA	2	8	46907	46914	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021015	CTTG	2	8	49403	49410	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_021015	TTAC	2	8	51313	51320	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_021015	ATTT	2	8	51352	51359	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021015	GAAA	2	8	51522	51529	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021015	GCCC	2	8	52422	52429	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
44	NC_021015	TTGC	2	8	52704	52711	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_021015	AGGA	2	8	53966	53973	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021015	AGAA	2	8	56445	56452	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021015	GACC	2	8	58717	58724	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_021015	CGGA	2	8	59706	59713	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_021015	AAAG	2	8	60140	60147	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021015	CTGG	2	8	60211	60218	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_021015	GCTG	2	8	60358	60365	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_021015	GCTC	2	8	60384	60391	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_021015	CTAC	2	8	60543	60550	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_021015	CAGG	2	8	60671	60678	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_021015	CAAC	2	8	61104	61111	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_021015	GGTT	2	8	61266	61273	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021015	CAGG	2	8	61763	61770	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_021015	TCTG	2	8	63289	63296	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_021015	GGAA	2	8	65176	65183	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021015	ACTG	2	8	85303	85310	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_021015	TTCA	2	8	85327	85334	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_021015	TTTC	2	8	85473	85480	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_021015	TTCT	2	8	85591	85598	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_021015	TCTA	2	8	85706	85713	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_021015	TGTC	2	8	89122	89129	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_021015	CAAC	2	8	90085	90092	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_021015	ATTG	2	8	90103	90110	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021015	CTTT	2	8	91053	91060	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_021015	ACTG	2	8	91320	91327	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_021015	TCTG	2	8	98174	98181	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_021015	TGAA	2	8	99044	99051	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021015	CTGA	2	8	99526	99533	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_021015	TCAT	2	8	99602	99609	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_021015	ACTG	2	8	99668	99675	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_021015	CATC	2	8	100176	100183	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_021015	TGAT	2	8	100415	100422	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021015	CCTT	2	8	106135	106142	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_021015	TGAT	2	8	106826	106833	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021015	TTTC	2	8	109151	109158	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_021015	ATTC	2	8	109289	109296	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_021015	TCAA	2	8	109534	109541	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_021015	TCAG	2	8	114334	114341	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_021015	TCCT	2	8	114483	114490	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_021015	CCTT	2	8	114519	114526	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_021015	CCTT	2	8	116954	116961	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_021015	TGAC	2	8	117249	117256	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_021015	TGAT	2	8	117342	117349	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021015	CCGT	2	8	117642	117649	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_021015	GAAT	2	8	118061	118068	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021015	ATCC	2	8	125131	125138	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_021015	CACG	2	8	125700	125707	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_021015	CCTT	2	8	127569	127576	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_021015	TTGG	2	8	127722	127729	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021015	TTCC	2	8	129353	129360	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_021015	AACC	2	8	129496	129503	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_021015	TTAT	2	8	130003	130010	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021015	AGGA	2	8	130826	130833	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021015	TGTC	2	8	132029	132036	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_021015	GTGG	2	8	132629	132636	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021015	AATT	2	8	134103	134110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021015	TCTT	2	8	134343	134350	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_021015	ATCA	2	8	135777	135784	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_021015	TGCT	2	8	137404	137411	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_021015	CAAA	2	8	138049	138056	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_021015	GATC	2	8	138872	138879	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_021015	TTTC	2	8	147496	147503	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_021015	CTTC	2	8	150967	150974	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_021015	TAAA	2	8	151018	151025	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021015	TATT	2	8	158078	158085	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021015	CATT	2	8	160175	160182	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_021015	ATTT	2	8	160322	160329	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021015	TAAA	2	8	160608	160615	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021015	GTAT	2	8	160854	160861	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021015	ATAG	2	8	161203	161210	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021015	AATC	2	8	161729	161736	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_021015	ATTT	2	8	161789	161796	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021015	TCTG	2	8	161845	161852	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_021015	TCTA	2	8	163854	163861	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_021015	GGGT	2	8	165088	165095	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021015	ATTT	2	8	167172	167179	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021015	ATAA	2	8	168269	168276	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021015	TAAT	2	8	168794	168801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021015	TCGC	2	8	171099	171106	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
124	NC_021015	CTTT	2	8	171536	171543	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_021015	ATTG	2	8	171608	171615	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021015	CTTG	2	8	171701	171708	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_021015	AGTA	2	8	172109	172116	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021015	CTTT	2	8	173043	173050	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_021015	CTGT	2	8	175833	175840	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_021015	ATTA	2	8	177540	177547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021015	TTGA	2	8	177632	177639	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021015	AAAT	2	8	178140	178147	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021015	TTTC	2	8	178289	178296	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_021015	TTTC	2	8	190290	190297	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_021015	CGGT	2	8	190526	190533	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
136	NC_021015	ACTT	2	8	191442	191449	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_021015	ATTG	2	8	191763	191770	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021015	TTTC	2	8	191820	191827	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_021015	ACTG	2	8	191970	191977	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_021015	TGTT	2	8	192164	192171	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021015	CTGT	2	8	192409	192416	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_021015	TCTG	2	8	192926	192933	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_021015	ACCA	2	8	193076	193083	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_021015	CTCC	2	8	193499	193506	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
145	NC_021015	TTCC	2	8	193673	193680	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_021015	CTGC	2	8	194081	194088	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
147	NC_021015	ATCC	2	8	196423	196430	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_021015	TCCT	2	8	196431	196438	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_021015	AGGC	2	8	197036	197043	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_021015	ATGT	2	8	197071	197078	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_021015	TTTA	2	8	201694	201701	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_021015	GTTT	2	8	204597	204604	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
153	NC_021015	GTTT	2	8	204790	204797	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
154	NC_021015	CTTT	2	8	208666	208673	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
155	NC_021015	AAAG	2	8	209869	209876	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
156	NC_021015	GCTT	2	8	211536	211543	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
157	NC_021015	CTTT	2	8	211668	211675	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
158	NC_021015	AGTA	2	8	214238	214245	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
159	NC_021015	TTCA	2	8	220259	220266	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
160	NC_021015	TTCT	2	8	220294	220301	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
161	NC_021015	TCTG	2	8	220423	220430	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
162	NC_021015	TTTC	3	12	220432	220443	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
163	NC_021015	TTTC	2	8	220447	220454	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
164	NC_021015	TTTC	2	8	221061	221068	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
165	NC_021015	ATTT	2	8	224636	224643	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_021015	TGTT	2	8	234070	234077	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
172	NC_021015	GTTA	2	8	241052	241059	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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174	NC_021015	TGAG	2	8	241634	241641	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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178	NC_021015	TACA	2	8	242757	242764	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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181	NC_021015	AAAG	2	8	243499	243506	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
182	NC_021015	CTTG	2	8	245332	245339	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
183	NC_021015	TGGA	2	8	245623	245630	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
184	NC_021015	TCAG	2	8	248142	248149	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
185	NC_021015	GAAA	2	8	250424	250431	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
186	NC_021015	TTTA	2	8	252427	252434	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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189	NC_021015	CTGT	2	8	254179	254186	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
190	NC_021015	GAAA	2	8	254397	254404	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
191	NC_021015	ACGA	2	8	254476	254483	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
192	NC_021015	AGAA	2	8	254516	254523	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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197	NC_021015	TTCC	2	8	255569	255576	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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221	NC_021015	TTCG	2	8	293970	293977	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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261	NC_021015	GGTC	2	8	385916	385923	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
262	NC_021015	CAAT	2	8	386170	386177	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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282	NC_021015	GGAT	2	8	426999	427006	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_021015	ATTA	2	8	441177	441184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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297	NC_021015	ACAG	2	8	458344	458351	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
298	NC_021015	AGAA	2	8	460800	460807	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
299	NC_021015	CCTG	2	8	461088	461095	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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452	NC_021015	TTTC	2	8	704806	704813	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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499	NC_021015	ATTT	2	8	761369	761376	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
500	NC_021015	TATT	2	8	763626	763633	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

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