MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Ruminococcus torques L2-14 draft genome

Total Repeats: 46845

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021015	ACA	3	9	27	35	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_021015	AGA	2	6	57	62	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021015	ACA	2	6	93	98	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_021015	GAA	2	6	108	113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021015	GGC	2	6	189	194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_021015	GGT	2	6	382	387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021015	TGG	2	6	418	423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021015	CGA	2	6	442	447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_021015	GCA	2	6	516	521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_021015	CGC	2	6	563	568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_021015	CAG	2	6	605	610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_021015	GAA	2	6	612	617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021015	AAG	2	6	635	640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021015	CAG	2	6	659	664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_021015	AGG	2	6	849	854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021015	GGC	2	6	870	875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_021015	ACT	2	6	962	967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_021015	GCA	2	6	977	982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_021015	GCA	2	6	998	1003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_021015	AGT	2	6	1013	1018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021015	GAA	2	6	1113	1118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021015	GGT	2	6	1187	1192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021015	GTC	2	6	1201	1206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_021015	TAG	2	6	1262	1267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021015	GGA	2	6	1314	1319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021015	ATC	2	6	1338	1343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_021015	AGG	2	6	1593	1598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021015	CCT	2	6	1675	1680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_021015	GAA	2	6	1688	1693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021015	AAC	2	6	2789	2794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_021015	GAA	2	6	2810	2815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021015	TGG	2	6	2927	2932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021015	GAG	2	6	2988	2993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021015	GGA	2	6	3116	3121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021015	ACA	2	6	3129	3134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_021015	GCG	2	6	3151	3156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_021015	ACC	2	6	3352	3357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_021015	TAC	2	6	3371	3376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_021015	GGA	2	6	3666	3671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021015	GAT	2	6	3867	3872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021015	GGT	2	6	3904	3909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021015	AGC	2	6	4009	4014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_021015	AAG	2	6	4176	4181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021015	GAG	2	6	4552	4557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021015	CGG	2	6	4797	4802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_021015	CAA	2	6	4891	4896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_021015	ACC	2	6	5068	5073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_021015	CAG	2	6	5096	5101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_021015	GGT	2	6	5291	5296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021015	CGT	2	6	5486	5491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_021015	GAG	2	6	5535	5540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021015	TGT	2	6	5588	5593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021015	GAC	2	6	5714	5719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_021015	GAT	3	9	5812	5820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021015	AAC	2	6	5941	5946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_021015	TCC	2	6	5999	6004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155736
57	NC_021015	ACA	2	6	6121	6126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479155736
58	NC_021015	TCC	3	9	6211	6219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155736
59	NC_021015	CTG	2	6	6273	6278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155736
60	NC_021015	CTG	2	6	6300	6305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155736
61	NC_021015	TTA	2	6	6386	6391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479155736
62	NC_021015	CAT	2	6	6493	6498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155736
63	NC_021015	CCT	2	6	6503	6508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155736
64	NC_021015	CAC	2	6	6517	6522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479155736
65	NC_021015	GAT	2	6	6613	6618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155736
66	NC_021015	TTC	2	6	6651	6656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_021015	AGT	2	6	6689	6694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021015	AAT	2	6	6733	6738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479155737
69	NC_021015	TCT	2	6	6778	6783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155737
70	NC_021015	TCC	2	6	6809	6814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155737
71	NC_021015	CAA	2	6	6822	6827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479155737
72	NC_021015	TTA	2	6	6999	7004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021015	GCT	2	6	7021	7026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_021015	GGA	2	6	7045	7050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021015	GGT	2	6	7224	7229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479155738
76	NC_021015	ATG	2	6	7261	7266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155738
77	NC_021015	CAG	2	6	7410	7415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155738
78	NC_021015	AGT	2	6	7574	7579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155738
79	NC_021015	GAA	3	9	7632	7640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155738
80	NC_021015	AAT	2	6	7648	7653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479155738
81	NC_021015	TTC	2	6	7745	7750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155739
82	NC_021015	ATA	2	6	7771	7776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479155739
83	NC_021015	TGC	2	6	7807	7812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155739
84	NC_021015	CGC	2	6	7879	7884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479155739
85	NC_021015	CTC	2	6	7896	7901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155739
86	NC_021015	ATC	2	6	8084	8089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155739
87	NC_021015	TGC	2	6	8242	8247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155739
88	NC_021015	AAT	2	6	8302	8307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479155739
89	NC_021015	CTT	2	6	8425	8430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155739
90	NC_021015	CTG	2	6	8454	8459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155739
91	NC_021015	GCC	2	6	8509	8514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479155739
92	NC_021015	CTG	2	6	8553	8558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155739
93	NC_021015	TCA	2	6	8706	8711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155739
94	NC_021015	ACT	2	6	8860	8865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155739
95	NC_021015	TGT	2	6	8973	8978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479155739
96	NC_021015	CTG	2	6	8983	8988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155739
97	NC_021015	GTC	2	6	9050	9055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155739
98	NC_021015	TTG	2	6	9081	9086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479155739
99	NC_021015	ATT	2	6	9106	9111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021015	TCC	2	6	9112	9117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_021015	CAT	2	6	9189	9194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_021015	TCT	2	6	9295	9300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_021015	AGA	2	6	9462	9467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021015	AGA	2	6	9664	9669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021015	TAC	2	6	9695	9700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_021015	TGG	2	6	9795	9800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021015	ATG	2	6	9873	9878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021015	TTC	2	6	10006	10011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_021015	CCA	2	6	10063	10068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_021015	CTT	2	6	10124	10129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_021015	CTT	2	6	10176	10181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_021015	CAG	2	6	10197	10202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_021015	AAG	2	6	10209	10214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021015	CTT	2	6	10290	10295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_021015	TAA	2	6	10707	10712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479155740
116	NC_021015	CTG	2	6	10751	10756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155740
117	NC_021015	TTC	2	6	10787	10792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155740
118	NC_021015	GGA	2	6	10811	10816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479155740
119	NC_021015	ATG	2	6	10869	10874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155740
120	NC_021015	ATG	2	6	10884	10889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155740
121	NC_021015	ATT	2	6	10922	10927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479155740
122	NC_021015	ATG	2	6	10961	10966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155740
123	NC_021015	AGA	2	6	11182	11187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155740
124	NC_021015	GCA	2	6	11222	11227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155740
125	NC_021015	GAA	2	6	11258	11263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155740
126	NC_021015	TGA	2	6	11392	11397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155740
127	NC_021015	GCG	2	6	11403	11408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479155740
128	NC_021015	TGA	2	6	11476	11481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155740
129	NC_021015	TGT	2	6	11523	11528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479155740
130	NC_021015	AGA	2	6	11683	11688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155740
131	NC_021015	CAT	2	6	11701	11706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155740
132	NC_021015	ATA	2	6	11814	11819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479155740
133	NC_021015	TTG	2	6	11858	11863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479155740
134	NC_021015	ATT	2	6	11876	11881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479155740
135	NC_021015	ATT	2	6	11895	11900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479155740
136	NC_021015	TCG	2	6	11943	11948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155740
137	NC_021015	TAA	2	6	12004	12009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479155740
138	NC_021015	GAA	2	6	12017	12022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155740
139	NC_021015	ATC	2	6	12048	12053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155740
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142	NC_021015	GTT	2	6	12545	12550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479155741
143	NC_021015	ATG	2	6	12633	12638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155741
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148	NC_021015	TTC	2	6	13000	13005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_021015	AAT	2	6	13031	13036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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179	NC_021015	TGT	2	6	15788	15793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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260	NC_021015	TAA	2	6	22159	22164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
261	NC_021015	ATA	2	6	22175	22180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
262	NC_021015	GCT	2	6	22222	22227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
263	NC_021015	TTA	2	6	22235	22240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
264	NC_021015	TCG	2	6	22287	22292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
265	NC_021015	CAA	2	6	22508	22513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479155751
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301	NC_021015	ATT	2	6	25299	25304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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381	NC_021015	TAG	2	6	30333	30338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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