MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 1723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021014	GCCAT	2	10	282	291	20 %	20 %	20 %	40 %	479152296
2	NC_021014	TATGT	2	10	1374	1383	20 %	60 %	20 %	0 %	479152297
3	NC_021014	CAGAA	2	10	4495	4504	60 %	0 %	20 %	20 %	479152299
4	NC_021014	TGATC	2	10	5121	5130	20 %	40 %	20 %	20 %	479152299
5	NC_021014	CAATG	2	10	10949	10958	40 %	20 %	20 %	20 %	479152306
6	NC_021014	ACGTT	2	10	12865	12874	20 %	40 %	20 %	20 %	479152308
7	NC_021014	ACTGG	2	10	16815	16824	20 %	20 %	40 %	20 %	479152313
8	NC_021014	TTTCC	2	10	17237	17246	0 %	60 %	0 %	40 %	479152313
9	NC_021014	AGGTG	2	10	17961	17970	20 %	20 %	60 %	0 %	479152315
10	NC_021014	TCAGG	2	10	24209	24218	20 %	20 %	40 %	20 %	479152323
11	NC_021014	GAAAT	2	10	25814	25823	60 %	20 %	20 %	0 %	479152324
12	NC_021014	ATGGA	2	10	29524	29533	40 %	20 %	40 %	0 %	479152330
13	NC_021014	TTCCG	2	10	29734	29743	0 %	40 %	20 %	40 %	479152330
14	NC_021014	GATGA	2	10	30114	30123	40 %	20 %	40 %	0 %	479152330
15	NC_021014	ATGAT	2	10	30460	30469	40 %	40 %	20 %	0 %	479152330
16	NC_021014	CCATT	2	10	31598	31607	20 %	40 %	0 %	40 %	479152330
17	NC_021014	ATGTC	2	10	31720	31729	20 %	40 %	20 %	20 %	479152330
18	NC_021014	CACGG	2	10	31896	31905	20 %	0 %	40 %	40 %	479152330
19	NC_021014	CGTAT	2	10	32188	32197	20 %	40 %	20 %	20 %	479152330
20	NC_021014	TTATT	2	10	34254	34263	20 %	80 %	0 %	0 %	479152331
21	NC_021014	AAGGA	2	10	34672	34681	60 %	0 %	40 %	0 %	479152331
22	NC_021014	ATTAT	2	10	37757	37766	40 %	60 %	0 %	0 %	479152335
23	NC_021014	AAAAG	2	10	38153	38162	80 %	0 %	20 %	0 %	479152335
24	NC_021014	AAGGT	2	10	40979	40988	40 %	20 %	40 %	0 %	479152338
25	NC_021014	ATTAT	2	10	42161	42170	40 %	60 %	0 %	0 %	479152339
26	NC_021014	TTTAA	2	10	45121	45130	40 %	60 %	0 %	0 %	479152342
27	NC_021014	ATTTC	2	10	48213	48222	20 %	60 %	0 %	20 %	479152344
28	NC_021014	CATAT	2	10	49900	49909	40 %	40 %	0 %	20 %	479152345
29	NC_021014	AGCAG	2	10	51327	51336	40 %	0 %	40 %	20 %	479152346
30	NC_021014	AACGT	2	10	51966	51975	40 %	20 %	20 %	20 %	479152347
31	NC_021014	TAAGG	2	10	60974	60983	40 %	20 %	40 %	0 %	479152354
32	NC_021014	CTTTG	2	10	63463	63472	0 %	60 %	20 %	20 %	479152356
33	NC_021014	TGGAG	2	10	63607	63616	20 %	20 %	60 %	0 %	479152356
34	NC_021014	TGCTC	2	10	63837	63846	0 %	40 %	20 %	40 %	479152356
35	NC_021014	AGATG	2	10	66861	66870	40 %	20 %	40 %	0 %	479152359
36	NC_021014	AAAAT	2	10	67596	67605	80 %	20 %	0 %	0 %	479152359
37	NC_021014	AGGAT	2	10	71930	71939	40 %	20 %	40 %	0 %	479152364
38	NC_021014	ATTTT	2	10	74939	74948	20 %	80 %	0 %	0 %	479152366
39	NC_021014	GAAAA	2	10	78158	78167	80 %	0 %	20 %	0 %	479152371
40	NC_021014	TGGAA	2	10	81175	81184	40 %	20 %	40 %	0 %	479152373
41	NC_021014	AAAAG	2	10	82007	82016	80 %	0 %	20 %	0 %	479152373
42	NC_021014	GTTCC	2	10	82366	82375	0 %	40 %	20 %	40 %	479152374
43	NC_021014	TGGAG	2	10	85135	85144	20 %	20 %	60 %	0 %	479152376
44	NC_021014	TACAT	2	10	87302	87311	40 %	40 %	0 %	20 %	479152378
45	NC_021014	GCAGA	2	10	89656	89665	40 %	0 %	40 %	20 %	479152379
46	NC_021014	GGACT	2	10	90418	90427	20 %	20 %	40 %	20 %	479152379
47	NC_021014	ATCGG	2	10	91887	91896	20 %	20 %	40 %	20 %	479152380
48	NC_021014	AGGTG	2	10	92401	92410	20 %	20 %	60 %	0 %	479152380
49	NC_021014	ACGGA	2	10	93020	93029	40 %	0 %	40 %	20 %	479152381
50	NC_021014	ATTCT	2	10	100806	100815	20 %	60 %	0 %	20 %	479152387
51	NC_021014	CTGTA	2	10	101855	101864	20 %	40 %	20 %	20 %	479152389
52	NC_021014	GAAGA	2	10	105612	105621	60 %	0 %	40 %	0 %	479152392
53	NC_021014	CAAAA	2	10	106190	106199	80 %	0 %	0 %	20 %	479152392
54	NC_021014	GAGCA	2	10	108067	108076	40 %	0 %	40 %	20 %	479152394
55	NC_021014	CAATG	2	10	108171	108180	40 %	20 %	20 %	20 %	479152394
56	NC_021014	GAAGA	2	10	110029	110038	60 %	0 %	40 %	0 %	479152395
57	NC_021014	ATTTT	2	10	114643	114652	20 %	80 %	0 %	0 %	479152399
58	NC_021014	GGAAT	2	10	116210	116219	40 %	20 %	40 %	0 %	479152399
59	NC_021014	GCTTT	2	10	118388	118397	0 %	60 %	20 %	20 %	479152401
60	NC_021014	AAAGG	2	10	118464	118473	60 %	0 %	40 %	0 %	479152401
61	NC_021014	TAAAG	2	10	120817	120826	60 %	20 %	20 %	0 %	479152403
62	NC_021014	TGGAA	2	10	122956	122965	40 %	20 %	40 %	0 %	479152405
63	NC_021014	CCATT	2	10	125755	125764	20 %	40 %	0 %	40 %	479152407
64	NC_021014	AGATG	2	10	130391	130400	40 %	20 %	40 %	0 %	479152410
65	NC_021014	CTGAT	2	10	130802	130811	20 %	40 %	20 %	20 %	479152411
66	NC_021014	ATGGA	2	10	131554	131563	40 %	20 %	40 %	0 %	479152412
67	NC_021014	CTCTT	2	10	132668	132677	0 %	60 %	0 %	40 %	479152413
68	NC_021014	TGAAC	2	10	133600	133609	40 %	20 %	20 %	20 %	479152413
69	NC_021014	ATGGA	2	10	134158	134167	40 %	20 %	40 %	0 %	479152414
70	NC_021014	TATGG	2	10	136510	136519	20 %	40 %	40 %	0 %	479152415
71	NC_021014	GTTAT	2	10	142312	142321	20 %	60 %	20 %	0 %	479152420
72	NC_021014	ATGTG	2	10	144511	144520	20 %	40 %	40 %	0 %	479152421
73	NC_021014	ATGAA	2	10	144861	144870	60 %	20 %	20 %	0 %	479152422
74	NC_021014	TGTGC	2	10	144928	144937	0 %	40 %	40 %	20 %	479152422
75	NC_021014	CAGAT	2	10	148291	148300	40 %	20 %	20 %	20 %	479152425
76	NC_021014	AGATG	2	10	148328	148337	40 %	20 %	40 %	0 %	479152425
77	NC_021014	GCTGA	2	10	148866	148875	20 %	20 %	40 %	20 %	479152425
78	NC_021014	GGGGC	2	10	149118	149127	0 %	0 %	80 %	20 %	479152425
79	NC_021014	GGATG	2	10	149809	149818	20 %	20 %	60 %	0 %	479152426
80	NC_021014	TTGCT	3	15	150919	150933	0 %	60 %	20 %	20 %	479152427
81	NC_021014	ATGAA	2	10	152903	152912	60 %	20 %	20 %	0 %	479152430
82	NC_021014	CTTTT	2	10	155472	155481	0 %	80 %	0 %	20 %	479152434
83	NC_021014	AAGAA	2	10	156438	156447	80 %	0 %	20 %	0 %	479152436
84	NC_021014	ACTAT	2	10	156653	156662	40 %	40 %	0 %	20 %	479152436
85	NC_021014	ATATT	2	10	156731	156740	40 %	60 %	0 %	0 %	479152436
86	NC_021014	AAGAG	2	10	157988	157997	60 %	0 %	40 %	0 %	479152438
87	NC_021014	CGACA	2	10	158101	158110	40 %	0 %	20 %	40 %	479152439
88	NC_021014	ATACC	2	10	165382	165391	40 %	20 %	0 %	40 %	479152443
89	NC_021014	GTGCT	2	10	167260	167269	0 %	40 %	40 %	20 %	479152445
90	NC_021014	GCTGA	2	10	168070	168079	20 %	20 %	40 %	20 %	479152446
91	NC_021014	CTGGA	2	10	169904	169913	20 %	20 %	40 %	20 %	479152447
92	NC_021014	GGTAT	2	10	176620	176629	20 %	40 %	40 %	0 %	479152453
93	NC_021014	TGATC	2	10	176937	176946	20 %	40 %	20 %	20 %	479152453
94	NC_021014	ATGGA	2	10	183308	183317	40 %	20 %	40 %	0 %	479152459
95	NC_021014	CAGCG	2	10	185491	185500	20 %	0 %	40 %	40 %	479152462
96	NC_021014	ATGGA	2	10	186201	186210	40 %	20 %	40 %	0 %	479152462
97	NC_021014	CCAGC	2	10	187327	187336	20 %	0 %	20 %	60 %	479152464
98	NC_021014	CTTTA	2	10	191076	191085	20 %	60 %	0 %	20 %	479152468
99	NC_021014	TTATG	2	10	192046	192055	20 %	60 %	20 %	0 %	479152470
100	NC_021014	GAGAT	2	10	195863	195872	40 %	20 %	40 %	0 %	479152472
101	NC_021014	GTAAT	2	10	197149	197158	40 %	40 %	20 %	0 %	479152473
102	NC_021014	CATGC	2	10	197598	197607	20 %	20 %	20 %	40 %	479152473
103	NC_021014	TACTA	2	10	197778	197787	40 %	40 %	0 %	20 %	479152473
104	NC_021014	ACAGG	2	10	202557	202566	40 %	0 %	40 %	20 %	479152480
105	NC_021014	TACTT	2	10	204631	204640	20 %	60 %	0 %	20 %	479152482
106	NC_021014	GTGGA	2	10	204951	204960	20 %	20 %	60 %	0 %	479152482
107	NC_021014	AAAAG	2	10	205402	205411	80 %	0 %	20 %	0 %	479152483
108	NC_021014	ATCTG	2	10	208544	208553	20 %	40 %	20 %	20 %	479152488
109	NC_021014	GCAGA	2	10	209484	209493	40 %	0 %	40 %	20 %	479152489
110	NC_021014	AATAT	2	10	214967	214976	60 %	40 %	0 %	0 %	479152497
111	NC_021014	TTTCC	2	10	216079	216088	0 %	60 %	0 %	40 %	479152497
112	NC_021014	AAAAG	2	10	218247	218256	80 %	0 %	20 %	0 %	479152499
113	NC_021014	AATTA	2	10	218354	218363	60 %	40 %	0 %	0 %	479152499
114	NC_021014	ATGAA	2	10	221620	221629	60 %	20 %	20 %	0 %	479152503
115	NC_021014	ACTTA	2	10	223171	223180	40 %	40 %	0 %	20 %	479152504
116	NC_021014	ACAGC	2	10	228026	228035	40 %	0 %	20 %	40 %	479152507
117	NC_021014	CCGTA	2	10	231034	231043	20 %	20 %	20 %	40 %	479152508
118	NC_021014	CTGAG	2	10	233455	233464	20 %	20 %	40 %	20 %	479152513
119	NC_021014	ACATA	2	10	235451	235460	60 %	20 %	0 %	20 %	479152519
120	NC_021014	TGCGG	2	10	237607	237616	0 %	20 %	60 %	20 %	479152520
121	NC_021014	ATGCC	2	10	237657	237666	20 %	20 %	20 %	40 %	479152520
122	NC_021014	TGGAA	2	10	238151	238160	40 %	20 %	40 %	0 %	479152520
123	NC_021014	TGGAA	2	10	238415	238424	40 %	20 %	40 %	0 %	479152520
124	NC_021014	GCGAA	2	10	242832	242841	40 %	0 %	40 %	20 %	479152523
125	NC_021014	AACAG	2	10	243435	243444	60 %	0 %	20 %	20 %	479152523
126	NC_021014	GGAAC	2	10	246340	246349	40 %	0 %	40 %	20 %	479152525
127	NC_021014	AAAGA	2	10	250993	251002	80 %	0 %	20 %	0 %	479152528
128	NC_021014	ATGCC	2	10	253822	253831	20 %	20 %	20 %	40 %	479152531
129	NC_021014	TTCTG	2	10	255481	255490	0 %	60 %	20 %	20 %	479152532
130	NC_021014	GGCTG	2	10	256868	256877	0 %	20 %	60 %	20 %	479152533
131	NC_021014	CGGAT	2	10	257454	257463	20 %	20 %	40 %	20 %	479152534
132	NC_021014	GAAGA	2	10	257472	257481	60 %	0 %	40 %	0 %	479152534
133	NC_021014	TATGC	2	10	257562	257571	20 %	40 %	20 %	20 %	479152534
134	NC_021014	TTTGG	2	10	257644	257653	0 %	60 %	40 %	0 %	479152534
135	NC_021014	AGCGG	2	10	258729	258738	20 %	0 %	60 %	20 %	479152534
136	NC_021014	ATGAT	2	10	259747	259756	40 %	40 %	20 %	0 %	479152536
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141	NC_021014	TTTGG	2	10	279546	279555	0 %	60 %	40 %	0 %	479152554
142	NC_021014	AAAGG	2	10	279686	279695	60 %	0 %	40 %	0 %	479152554
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156	NC_021014	CTGTA	2	10	299700	299709	20 %	40 %	20 %	20 %	479152578
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176	NC_021014	CTGCC	2	10	344902	344911	0 %	20 %	20 %	60 %	479152604
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250	NC_021014	ATCAT	2	10	498236	498245	40 %	40 %	0 %	20 %	479152753
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253	NC_021014	CAAGG	2	10	509084	509093	40 %	0 %	40 %	20 %	479152762
254	NC_021014	TGCAC	2	10	509706	509715	20 %	20 %	20 %	40 %	479152763
255	NC_021014	CAGAA	2	10	511899	511908	60 %	0 %	20 %	20 %	479152767
256	NC_021014	AAGAA	2	10	514389	514398	80 %	0 %	20 %	0 %	479152772
257	NC_021014	GGATC	2	10	515300	515309	20 %	20 %	40 %	20 %	479152774
258	NC_021014	CAGAA	2	10	521753	521762	60 %	0 %	20 %	20 %	479152780
259	NC_021014	GGAAC	2	10	521780	521789	40 %	0 %	40 %	20 %	479152780
260	NC_021014	TGCCA	2	10	525895	525904	20 %	20 %	20 %	40 %	479152784
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262	NC_021014	ATGGA	2	10	537194	537203	40 %	20 %	40 %	0 %	479152793
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