MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 8761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021014	ATGT	2	8	1098	1105	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021014	AAAG	2	8	2314	2321	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021014	ATTC	2	8	2327	2334	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_021014	TTAT	2	8	3207	3214	25 %	75 %	0 %	0 %	479152298
5	NC_021014	GAAG	2	8	3763	3770	50 %	0 %	50 %	0 %	479152298
6	NC_021014	TGCA	2	8	3951	3958	25 %	25 %	25 %	25 %	479152298
7	NC_021014	GTGA	2	8	4855	4862	25 %	25 %	50 %	0 %	479152299
8	NC_021014	TTTA	2	8	4876	4883	25 %	75 %	0 %	0 %	479152299
9	NC_021014	CCTG	2	8	5228	5235	0 %	25 %	25 %	50 %	479152299
10	NC_021014	ATAG	2	8	5284	5291	50 %	25 %	25 %	0 %	479152299
11	NC_021014	GTCC	2	8	5810	5817	0 %	25 %	25 %	50 %	479152300
12	NC_021014	TCTG	2	8	6117	6124	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_021014	CCTT	2	8	6410	6417	0 %	50 %	0 %	50 %	479152301
14	NC_021014	TAAG	2	8	6473	6480	50 %	25 %	25 %	0 %	479152301
15	NC_021014	GCAG	2	8	6655	6662	25 %	0 %	50 %	25 %	479152301
16	NC_021014	TCGC	2	8	6730	6737	0 %	25 %	25 %	50 %	479152301
17	NC_021014	AGAA	2	8	6796	6803	75 %	0 %	25 %	0 %	479152301
18	NC_021014	TTCC	2	8	7451	7458	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_021014	CAGA	2	8	7535	7542	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_021014	TTTC	2	8	8616	8623	0 %	75 %	0 %	25 %	479152303
21	NC_021014	GCCT	2	8	9137	9144	0 %	25 %	25 %	50 %	479152304
22	NC_021014	GAAG	2	8	10151	10158	50 %	0 %	50 %	0 %	479152305
23	NC_021014	TGGG	2	8	10405	10412	0 %	25 %	75 %	0 %	479152305
24	NC_021014	TATG	2	8	10448	10455	25 %	50 %	25 %	0 %	479152305
25	NC_021014	TAAA	2	8	11885	11892	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021014	AAGA	2	8	12004	12011	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021014	TGAT	2	8	12044	12051	25 %	50 %	25 %	0 %	479152307
28	NC_021014	AAAC	2	8	12792	12799	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_021014	GACA	2	8	12824	12831	50 %	0 %	25 %	25 %	479152308
30	NC_021014	AAAG	2	8	13240	13247	75 %	0 %	25 %	0 %	479152308
31	NC_021014	ATGC	2	8	13595	13602	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_021014	GATC	2	8	13654	13661	25 %	25 %	25 %	25 %	479152309
33	NC_021014	CAGA	2	8	13669	13676	50 %	0 %	25 %	25 %	479152309
34	NC_021014	TTAA	2	8	14198	14205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021014	ATAA	2	8	14388	14395	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021014	ACAG	2	8	14634	14641	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_021014	CAGA	2	8	14974	14981	50 %	0 %	25 %	25 %	479152310
38	NC_021014	CTGA	2	8	15030	15037	25 %	25 %	25 %	25 %	479152310
39	NC_021014	AATA	2	8	15601	15608	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021014	GATC	2	8	16168	16175	25 %	25 %	25 %	25 %	479152311
41	NC_021014	ATTT	2	8	16351	16358	25 %	75 %	0 %	0 %	479152311
42	NC_021014	TGTC	2	8	16602	16609	0 %	50 %	25 %	25 %	479152313
43	NC_021014	TTCC	2	8	16760	16767	0 %	50 %	0 %	50 %	479152313
44	NC_021014	ACGG	2	8	16908	16915	25 %	0 %	50 %	25 %	479152313
45	NC_021014	CAGA	2	8	17612	17619	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_021014	GGGT	2	8	17770	17777	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021014	CCTG	2	8	18032	18039	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_021014	TGAG	2	8	18104	18111	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021014	TCCT	2	8	19140	19147	0 %	50 %	0 %	50 %	479152317
50	NC_021014	CTGG	2	8	19414	19421	0 %	25 %	50 %	25 %	479152317
51	NC_021014	ACAG	2	8	20042	20049	50 %	0 %	25 %	25 %	479152317
52	NC_021014	TATG	2	8	21110	21117	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021014	GGAA	2	8	21409	21416	50 %	0 %	50 %	0 %	479152319
54	NC_021014	AAAG	2	8	22761	22768	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021014	GAAT	2	8	22776	22783	50 %	25 %	25 %	0 %	479152322
56	NC_021014	GAAG	2	8	23029	23036	50 %	0 %	50 %	0 %	479152322
57	NC_021014	AGAT	2	8	23263	23270	50 %	25 %	25 %	0 %	479152322
58	NC_021014	ATCC	2	8	23434	23441	25 %	25 %	0 %	50 %	479152323
59	NC_021014	GGAA	2	8	23706	23713	50 %	0 %	50 %	0 %	479152323
60	NC_021014	ATGG	2	8	25598	25605	25 %	25 %	50 %	0 %	479152324
61	NC_021014	AAGA	2	8	25640	25647	75 %	0 %	25 %	0 %	479152324
62	NC_021014	CAGA	2	8	28601	28608	50 %	0 %	25 %	25 %	479152328
63	NC_021014	ATGG	2	8	29355	29362	25 %	25 %	50 %	0 %	479152330
64	NC_021014	TGGA	2	8	29590	29597	25 %	25 %	50 %	0 %	479152330
65	NC_021014	CAGG	2	8	30125	30132	25 %	0 %	50 %	25 %	479152330
66	NC_021014	ATCC	2	8	30768	30775	25 %	25 %	0 %	50 %	479152330
67	NC_021014	AAGG	2	8	31194	31201	50 %	0 %	50 %	0 %	479152330
68	NC_021014	ATCT	2	8	31992	31999	25 %	50 %	0 %	25 %	479152330
69	NC_021014	CGAT	2	8	32422	32429	25 %	25 %	25 %	25 %	479152330
70	NC_021014	GATG	2	8	32615	32622	25 %	25 %	50 %	0 %	479152330
71	NC_021014	AATA	2	8	32711	32718	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021014	GGAT	2	8	33558	33565	25 %	25 %	50 %	0 %	479152331
73	NC_021014	GATC	2	8	33792	33799	25 %	25 %	25 %	25 %	479152331
74	NC_021014	CGGA	2	8	33824	33831	25 %	0 %	50 %	25 %	479152331
75	NC_021014	GGGA	2	8	34884	34891	25 %	0 %	75 %	0 %	479152332
76	NC_021014	CGAT	2	8	35117	35124	25 %	25 %	25 %	25 %	479152332
77	NC_021014	GTTT	2	8	35283	35290	0 %	75 %	25 %	0 %	479152332
78	NC_021014	CTGA	2	8	35799	35806	25 %	25 %	25 %	25 %	479152333
79	NC_021014	TTTG	2	8	36108	36115	0 %	75 %	25 %	0 %	479152334
80	NC_021014	AGGA	2	8	36331	36338	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021014	AAAC	2	8	36658	36665	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_021014	AGGA	2	8	36705	36712	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021014	CAGC	2	8	37237	37244	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_021014	AAGA	2	8	37339	37346	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021014	ACGG	2	8	37834	37841	25 %	0 %	50 %	25 %	479152335
86	NC_021014	ATCT	2	8	38852	38859	25 %	50 %	0 %	25 %	479152336
87	NC_021014	CATT	2	8	39174	39181	25 %	50 %	0 %	25 %	479152336
88	NC_021014	CAGA	2	8	39610	39617	50 %	0 %	25 %	25 %	479152337
89	NC_021014	GATT	2	8	40690	40697	25 %	50 %	25 %	0 %	479152337
90	NC_021014	TTTC	2	8	40806	40813	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_021014	CAAG	2	8	40901	40908	50 %	0 %	25 %	25 %	479152338
92	NC_021014	CGAT	2	8	41174	41181	25 %	25 %	25 %	25 %	479152338
93	NC_021014	ATAA	2	8	41729	41736	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021014	AGTG	2	8	41873	41880	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021014	GATG	2	8	42147	42154	25 %	25 %	50 %	0 %	479152339
96	NC_021014	TAAA	2	8	42310	42317	75 %	25 %	0 %	0 %	479152340
97	NC_021014	GAAG	2	8	43175	43182	50 %	0 %	50 %	0 %	479152340
98	NC_021014	AGGT	2	8	43669	43676	25 %	25 %	50 %	0 %	479152340
99	NC_021014	GCAG	2	8	43881	43888	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_021014	ACAG	2	8	44026	44033	50 %	0 %	25 %	25 %	479152341
101	NC_021014	TGTT	2	8	44190	44197	0 %	75 %	25 %	0 %	479152341
102	NC_021014	GGTA	2	8	44946	44953	25 %	25 %	50 %	0 %	479152342
103	NC_021014	AAGG	2	8	45040	45047	50 %	0 %	50 %	0 %	479152342
104	NC_021014	ATCT	2	8	45459	45466	25 %	50 %	0 %	25 %	479152342
105	NC_021014	GCGG	2	8	46064	46071	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
106	NC_021014	GGCA	2	8	46311	46318	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_021014	CATT	2	8	46408	46415	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_021014	GGAG	2	8	46519	46526	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021014	GACT	2	8	46692	46699	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_021014	CAGA	2	8	46811	46818	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_021014	GAAA	2	8	47135	47142	75 %	0 %	25 %	0 %	479152343
112	NC_021014	GGAA	2	8	47264	47271	50 %	0 %	50 %	0 %	479152343
113	NC_021014	ATCC	2	8	47290	47297	25 %	25 %	0 %	50 %	479152343
114	NC_021014	CAGA	2	8	47376	47383	50 %	0 %	25 %	25 %	479152343
115	NC_021014	GACA	2	8	47403	47410	50 %	0 %	25 %	25 %	479152343
116	NC_021014	AATA	2	8	47811	47818	75 %	25 %	0 %	0 %	479152343
117	NC_021014	TGGC	2	8	47995	48002	0 %	25 %	50 %	25 %	479152344
118	NC_021014	GGAC	2	8	48574	48581	25 %	0 %	50 %	25 %	479152344
119	NC_021014	ATGC	2	8	49046	49053	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_021014	TGCC	2	8	49979	49986	0 %	25 %	25 %	50 %	479152345
121	NC_021014	GGTT	2	8	50107	50114	0 %	50 %	50 %	0 %	479152345
122	NC_021014	AAAG	2	8	50619	50626	75 %	0 %	25 %	0 %	479152346
123	NC_021014	TAAA	2	8	50684	50691	75 %	25 %	0 %	0 %	479152346
124	NC_021014	AGAT	2	8	51694	51701	50 %	25 %	25 %	0 %	479152347
125	NC_021014	TGGA	2	8	51838	51845	25 %	25 %	50 %	0 %	479152347
126	NC_021014	CAGC	2	8	52383	52390	25 %	0 %	25 %	50 %	479152347
127	NC_021014	CCGG	2	8	53208	53215	0 %	0 %	50 %	50 %	479152348
128	NC_021014	GAAA	2	8	53686	53693	75 %	0 %	25 %	0 %	479152348
129	NC_021014	TGAA	2	8	53908	53915	50 %	25 %	25 %	0 %	479152348
130	NC_021014	CAGG	2	8	54030	54037	25 %	0 %	50 %	25 %	479152348
131	NC_021014	AAAT	2	8	54098	54105	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021014	ATGG	2	8	54617	54624	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021014	GCTT	2	8	54678	54685	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_021014	GGCA	2	8	54750	54757	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_021014	TGGA	2	8	55024	55031	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021014	TATT	2	8	55451	55458	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021014	CTGT	2	8	55578	55585	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_021014	TGGA	2	8	55851	55858	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021014	GATC	2	8	56398	56405	25 %	25 %	25 %	25 %	479152350
140	NC_021014	AGAT	2	8	56653	56660	50 %	25 %	25 %	0 %	479152351
141	NC_021014	TGGA	2	8	57080	57087	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021014	GAAA	2	8	57367	57374	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021014	ATCA	2	8	57523	57530	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_021014	GAAA	2	8	57790	57797	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021014	ACAG	2	8	59011	59018	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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