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Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 2659

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021014	ATGT	2	8	1098	1105	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021014	AAAG	2	8	2314	2321	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021014	ATTC	2	8	2327	2334	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_021014	TCTG	2	8	6117	6124	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_021014	TTCC	2	8	7451	7458	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_021014	CAGA	2	8	7535	7542	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_021014	TAAA	2	8	11885	11892	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021014	AAGA	2	8	12004	12011	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021014	AAAC	2	8	12792	12799	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_021014	ATGC	2	8	13595	13602	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_021014	TTAA	2	8	14198	14205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021014	ATAA	2	8	14388	14395	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021014	ACAG	2	8	14634	14641	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_021014	AATA	2	8	15601	15608	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021014	CAGA	2	8	17612	17619	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_021014	GGGT	2	8	17770	17777	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021014	CCTG	2	8	18032	18039	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_021014	TGAG	2	8	18104	18111	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021014	TATG	2	8	21110	21117	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021014	AAAG	2	8	22761	22768	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021014	AATA	2	8	32711	32718	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021014	AGGA	2	8	36331	36338	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021014	AAAC	2	8	36658	36665	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_021014	AGGA	2	8	36705	36712	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021014	CAGC	2	8	37237	37244	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_021014	AAGA	2	8	37339	37346	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021014	TTTC	2	8	40806	40813	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_021014	ATAA	2	8	41729	41736	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021014	AGTG	2	8	41873	41880	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021014	GCAG	2	8	43881	43888	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_021014	GCGG	2	8	46064	46071	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
32	NC_021014	GGCA	2	8	46311	46318	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_021014	CATT	2	8	46408	46415	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_021014	GGAG	2	8	46519	46526	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021014	GACT	2	8	46692	46699	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_021014	CAGA	2	8	46811	46818	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_021014	ATGC	2	8	49046	49053	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_021014	AAAT	2	8	54098	54105	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021014	ATGG	2	8	54617	54624	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021014	GCTT	2	8	54678	54685	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_021014	GGCA	2	8	54750	54757	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_021014	TGGA	2	8	55024	55031	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021014	TATT	2	8	55451	55458	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021014	CTGT	2	8	55578	55585	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_021014	TGGA	2	8	55851	55858	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021014	TGGA	2	8	57080	57087	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021014	GAAA	2	8	57367	57374	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021014	ATCA	2	8	57523	57530	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_021014	GAAA	2	8	57790	57797	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021014	ACAG	2	8	59011	59018	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_021014	GACG	2	8	59239	59246	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_021014	TAAA	2	8	60390	60397	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021014	AAGT	2	8	65134	65141	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021014	ATGA	2	8	68308	68315	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021014	ATGG	2	8	69065	69072	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021014	TTCT	2	8	69167	69174	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_021014	TGAT	2	8	69188	69195	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021014	GTAG	2	8	69250	69257	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021014	TGTT	2	8	69442	69449	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021014	ATTG	2	8	69973	69980	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021014	ATGA	2	8	70777	70784	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021014	ATTT	2	8	73572	73579	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021014	AGGA	2	8	74359	74366	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021014	TAGT	2	8	76878	76885	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021014	GTTA	2	8	78953	78960	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021014	AAAG	2	8	83002	83009	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021014	TTAT	2	8	83404	83411	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021014	GATG	2	8	83648	83655	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021014	TGAA	2	8	84661	84668	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021014	TGCA	2	8	87693	87700	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_021014	CGGC	2	8	87795	87802	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_021014	ACAG	2	8	87883	87890	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_021014	AGAC	2	8	88961	88968	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_021014	TTTA	2	8	89024	89031	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021014	TTAC	2	8	95247	95254	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_021014	TAGA	2	8	95410	95417	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021014	CTTT	2	8	98810	98817	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_021014	GCAG	2	8	99480	99487	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_021014	AAAG	2	8	102588	102595	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021014	ATAA	2	8	102787	102794	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021014	TAAA	2	8	106535	106542	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021014	CAAA	2	8	106594	106601	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_021014	ACTG	2	8	110515	110522	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_021014	TCCG	2	8	112770	112777	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_021014	CAGG	2	8	114471	114478	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_021014	AAAC	2	8	117757	117764	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_021014	AAAT	2	8	119739	119746	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021014	TTTC	2	8	124817	124824	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_021014	ACAA	2	8	127027	127034	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_021014	ATAA	2	8	128395	128402	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021014	ATGA	2	8	128915	128922	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021014	TTTG	2	8	128937	128944	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021014	AAGG	2	8	129031	129038	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021014	ATTT	2	8	131807	131814	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021014	AATA	2	8	133997	134004	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021014	CTGC	2	8	135323	135330	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_021014	CTTT	2	8	139229	139236	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_021014	TTAT	2	8	139502	139509	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021014	TGAA	2	8	142988	142995	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021014	ATCA	2	8	143119	143126	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_021014	TCTA	2	8	143200	143207	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_021014	ATCA	2	8	143335	143342	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_021014	TTCT	2	8	147644	147651	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_021014	GGGA	2	8	147787	147794	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021014	GCAG	2	8	150081	150088	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_021014	TAAA	2	8	152879	152886	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021014	CCGT	2	8	159725	159732	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_021014	CTGA	2	8	160419	160426	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_021014	ATCG	2	8	160505	160512	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_021014	CAGT	2	8	161002	161009	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_021014	ATCT	2	8	161010	161017	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_021014	AGTA	2	8	161076	161083	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021014	AGTA	2	8	161171	161178	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021014	TGAT	2	8	161429	161436	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021014	ACAG	2	8	161920	161927	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_021014	GAAA	2	8	162725	162732	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021014	TGGA	2	8	162879	162886	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021014	TACC	2	8	162998	163005	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_021014	AAGG	2	8	163305	163312	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021014	GAAA	2	8	163852	163859	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021014	AGGA	2	8	166459	166466	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021014	AAGG	2	8	167579	167586	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021014	GGCA	2	8	168706	168713	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_021014	GATC	2	8	168772	168779	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_021014	ATGT	2	8	168792	168799	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021014	TCTG	2	8	169121	169128	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_021014	GCAG	2	8	171428	171435	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_021014	CAGG	2	8	173216	173223	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_021014	ATCC	2	8	173319	173326	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_021014	GGTC	2	8	173495	173502	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_021014	AGTC	2	8	173522	173529	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_021014	GTGG	2	8	173560	173567	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021014	GCAG	2	8	175055	175062	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_021014	ATAA	2	8	175967	175974	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021014	AGGG	2	8	175989	175996	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021014	GTTT	2	8	177573	177580	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021014	ATAA	2	8	177628	177635	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021014	AACG	2	8	183695	183702	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_021014	TGAA	2	8	185435	185442	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021014	AAGA	2	8	195147	195154	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021014	ATTG	2	8	195252	195259	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021014	GGGA	2	8	201283	201290	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021014	CAAA	2	8	205844	205851	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_021014	CAAT	2	8	208060	208067	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_021014	GATT	2	8	210425	210432	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021014	AAAG	2	8	211351	211358	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021014	TGAT	2	8	213557	213564	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021014	CAGG	2	8	213637	213644	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
149	NC_021014	ATTT	2	8	216786	216793	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_021014	TTAA	2	8	217038	217045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_021014	TTTG	2	8	217055	217062	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_021014	TGGA	2	8	217320	217327	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_021014	TGAA	2	8	217441	217448	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
154	NC_021014	AATT	2	8	220642	220649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_021014	TTAC	2	8	220834	220841	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
156	NC_021014	TTTA	2	8	225228	225235	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_021014	AGGA	2	8	225857	225864	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
158	NC_021014	AAGA	2	8	226010	226017	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
159	NC_021014	GGAA	2	8	226113	226120	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
160	NC_021014	TTTA	2	8	226649	226656	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_021014	GACA	2	8	226705	226712	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
162	NC_021014	CATC	2	8	226718	226725	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
163	NC_021014	GAAG	2	8	227338	227345	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
164	NC_021014	GATG	2	8	227789	227796	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
165	NC_021014	AGAT	2	8	227867	227874	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
166	NC_021014	CGGG	2	8	229443	229450	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
167	NC_021014	GATG	2	8	229741	229748	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
168	NC_021014	TGGA	2	8	229757	229764	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
169	NC_021014	TGCC	2	8	230092	230099	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
170	NC_021014	CAGG	2	8	231527	231534	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
171	NC_021014	CTTG	2	8	235838	235845	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
172	NC_021014	AATG	2	8	235940	235947	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
173	NC_021014	TATT	2	8	236009	236016	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_021014	ACAA	2	8	236089	236096	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
175	NC_021014	ATGT	2	8	239345	239352	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
176	NC_021014	CATT	2	8	240360	240367	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
177	NC_021014	TTTA	2	8	240437	240444	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_021014	TGCC	2	8	240450	240457	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
179	NC_021014	CATT	2	8	240516	240523	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
180	NC_021014	ACAG	2	8	243876	243883	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
181	NC_021014	GGCA	2	8	243930	243937	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
182	NC_021014	ATTT	2	8	244035	244042	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_021014	CGGA	2	8	247301	247308	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
184	NC_021014	ACAG	2	8	247519	247526	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
185	NC_021014	GAAA	2	8	252216	252223	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
186	NC_021014	GCTG	2	8	252228	252235	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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188	NC_021014	TTTC	2	8	252659	252666	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
189	NC_021014	TGAC	2	8	258884	258891	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
190	NC_021014	AGGA	2	8	258982	258989	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
191	NC_021014	ATAC	2	8	259466	259473	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
192	NC_021014	AGGC	2	8	263151	263158	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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194	NC_021014	GAAA	2	8	273981	273988	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
195	NC_021014	ACAG	2	8	274653	274660	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
196	NC_021014	GATT	2	8	274683	274690	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
197	NC_021014	TCTG	2	8	275022	275029	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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199	NC_021014	TTTG	2	8	278476	278483	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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201	NC_021014	TGGG	2	8	278648	278655	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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203	NC_021014	GAAG	2	8	283852	283859	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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222	NC_021014	CTGG	2	8	318638	318645	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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225	NC_021014	ATGG	2	8	319393	319400	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
226	NC_021014	GGAA	2	8	319930	319937	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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231	NC_021014	TTTC	2	8	324531	324538	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
232	NC_021014	TGGA	2	8	325497	325504	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
233	NC_021014	AAGA	2	8	325610	325617	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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235	NC_021014	GAAA	2	8	326064	326071	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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240	NC_021014	ATGG	2	8	327385	327392	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
241	NC_021014	AAAT	2	8	327776	327783	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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256	NC_021014	AAAG	2	8	352264	352271	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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264	NC_021014	AATG	2	8	359329	359336	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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451	NC_021014	GCAA	2	8	652578	652585	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
452	NC_021014	AATT	2	8	652726	652733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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486	NC_021014	GACA	2	8	702767	702774	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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488	NC_021014	GGAA	2	8	703352	703359	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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499	NC_021014	GTCA	2	8	718734	718741	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
500	NC_021014	ATGG	2	8	721806	721813	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding

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