MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 6102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021014	TTAT	2	8	3207	3214	25 %	75 %	0 %	0 %	479152298
2	NC_021014	GAAG	2	8	3763	3770	50 %	0 %	50 %	0 %	479152298
3	NC_021014	TGCA	2	8	3951	3958	25 %	25 %	25 %	25 %	479152298
4	NC_021014	GTGA	2	8	4855	4862	25 %	25 %	50 %	0 %	479152299
5	NC_021014	TTTA	2	8	4876	4883	25 %	75 %	0 %	0 %	479152299
6	NC_021014	CCTG	2	8	5228	5235	0 %	25 %	25 %	50 %	479152299
7	NC_021014	ATAG	2	8	5284	5291	50 %	25 %	25 %	0 %	479152299
8	NC_021014	GTCC	2	8	5810	5817	0 %	25 %	25 %	50 %	479152300
9	NC_021014	CCTT	2	8	6410	6417	0 %	50 %	0 %	50 %	479152301
10	NC_021014	TAAG	2	8	6473	6480	50 %	25 %	25 %	0 %	479152301
11	NC_021014	GCAG	2	8	6655	6662	25 %	0 %	50 %	25 %	479152301
12	NC_021014	TCGC	2	8	6730	6737	0 %	25 %	25 %	50 %	479152301
13	NC_021014	AGAA	2	8	6796	6803	75 %	0 %	25 %	0 %	479152301
14	NC_021014	TTTC	2	8	8616	8623	0 %	75 %	0 %	25 %	479152303
15	NC_021014	GCCT	2	8	9137	9144	0 %	25 %	25 %	50 %	479152304
16	NC_021014	GAAG	2	8	10151	10158	50 %	0 %	50 %	0 %	479152305
17	NC_021014	TGGG	2	8	10405	10412	0 %	25 %	75 %	0 %	479152305
18	NC_021014	TATG	2	8	10448	10455	25 %	50 %	25 %	0 %	479152305
19	NC_021014	TGAT	2	8	12044	12051	25 %	50 %	25 %	0 %	479152307
20	NC_021014	GACA	2	8	12824	12831	50 %	0 %	25 %	25 %	479152308
21	NC_021014	AAAG	2	8	13240	13247	75 %	0 %	25 %	0 %	479152308
22	NC_021014	GATC	2	8	13654	13661	25 %	25 %	25 %	25 %	479152309
23	NC_021014	CAGA	2	8	13669	13676	50 %	0 %	25 %	25 %	479152309
24	NC_021014	CAGA	2	8	14974	14981	50 %	0 %	25 %	25 %	479152310
25	NC_021014	CTGA	2	8	15030	15037	25 %	25 %	25 %	25 %	479152310
26	NC_021014	GATC	2	8	16168	16175	25 %	25 %	25 %	25 %	479152311
27	NC_021014	ATTT	2	8	16351	16358	25 %	75 %	0 %	0 %	479152311
28	NC_021014	TGTC	2	8	16602	16609	0 %	50 %	25 %	25 %	479152313
29	NC_021014	TTCC	2	8	16760	16767	0 %	50 %	0 %	50 %	479152313
30	NC_021014	ACGG	2	8	16908	16915	25 %	0 %	50 %	25 %	479152313
31	NC_021014	TCCT	2	8	19140	19147	0 %	50 %	0 %	50 %	479152317
32	NC_021014	CTGG	2	8	19414	19421	0 %	25 %	50 %	25 %	479152317
33	NC_021014	ACAG	2	8	20042	20049	50 %	0 %	25 %	25 %	479152317
34	NC_021014	GGAA	2	8	21409	21416	50 %	0 %	50 %	0 %	479152319
35	NC_021014	GAAT	2	8	22776	22783	50 %	25 %	25 %	0 %	479152322
36	NC_021014	GAAG	2	8	23029	23036	50 %	0 %	50 %	0 %	479152322
37	NC_021014	AGAT	2	8	23263	23270	50 %	25 %	25 %	0 %	479152322
38	NC_021014	ATCC	2	8	23434	23441	25 %	25 %	0 %	50 %	479152323
39	NC_021014	GGAA	2	8	23706	23713	50 %	0 %	50 %	0 %	479152323
40	NC_021014	ATGG	2	8	25598	25605	25 %	25 %	50 %	0 %	479152324
41	NC_021014	AAGA	2	8	25640	25647	75 %	0 %	25 %	0 %	479152324
42	NC_021014	CAGA	2	8	28601	28608	50 %	0 %	25 %	25 %	479152328
43	NC_021014	ATGG	2	8	29355	29362	25 %	25 %	50 %	0 %	479152330
44	NC_021014	TGGA	2	8	29590	29597	25 %	25 %	50 %	0 %	479152330
45	NC_021014	CAGG	2	8	30125	30132	25 %	0 %	50 %	25 %	479152330
46	NC_021014	ATCC	2	8	30768	30775	25 %	25 %	0 %	50 %	479152330
47	NC_021014	AAGG	2	8	31194	31201	50 %	0 %	50 %	0 %	479152330
48	NC_021014	ATCT	2	8	31992	31999	25 %	50 %	0 %	25 %	479152330
49	NC_021014	CGAT	2	8	32422	32429	25 %	25 %	25 %	25 %	479152330
50	NC_021014	GATG	2	8	32615	32622	25 %	25 %	50 %	0 %	479152330
51	NC_021014	GGAT	2	8	33558	33565	25 %	25 %	50 %	0 %	479152331
52	NC_021014	GATC	2	8	33792	33799	25 %	25 %	25 %	25 %	479152331
53	NC_021014	CGGA	2	8	33824	33831	25 %	0 %	50 %	25 %	479152331
54	NC_021014	GGGA	2	8	34884	34891	25 %	0 %	75 %	0 %	479152332
55	NC_021014	CGAT	2	8	35117	35124	25 %	25 %	25 %	25 %	479152332
56	NC_021014	GTTT	2	8	35283	35290	0 %	75 %	25 %	0 %	479152332
57	NC_021014	CTGA	2	8	35799	35806	25 %	25 %	25 %	25 %	479152333
58	NC_021014	TTTG	2	8	36108	36115	0 %	75 %	25 %	0 %	479152334
59	NC_021014	ACGG	2	8	37834	37841	25 %	0 %	50 %	25 %	479152335
60	NC_021014	ATCT	2	8	38852	38859	25 %	50 %	0 %	25 %	479152336
61	NC_021014	CATT	2	8	39174	39181	25 %	50 %	0 %	25 %	479152336
62	NC_021014	CAGA	2	8	39610	39617	50 %	0 %	25 %	25 %	479152337
63	NC_021014	GATT	2	8	40690	40697	25 %	50 %	25 %	0 %	479152337
64	NC_021014	CAAG	2	8	40901	40908	50 %	0 %	25 %	25 %	479152338
65	NC_021014	CGAT	2	8	41174	41181	25 %	25 %	25 %	25 %	479152338
66	NC_021014	GATG	2	8	42147	42154	25 %	25 %	50 %	0 %	479152339
67	NC_021014	TAAA	2	8	42310	42317	75 %	25 %	0 %	0 %	479152340
68	NC_021014	GAAG	2	8	43175	43182	50 %	0 %	50 %	0 %	479152340
69	NC_021014	AGGT	2	8	43669	43676	25 %	25 %	50 %	0 %	479152340
70	NC_021014	ACAG	2	8	44026	44033	50 %	0 %	25 %	25 %	479152341
71	NC_021014	TGTT	2	8	44190	44197	0 %	75 %	25 %	0 %	479152341
72	NC_021014	GGTA	2	8	44946	44953	25 %	25 %	50 %	0 %	479152342
73	NC_021014	AAGG	2	8	45040	45047	50 %	0 %	50 %	0 %	479152342
74	NC_021014	ATCT	2	8	45459	45466	25 %	50 %	0 %	25 %	479152342
75	NC_021014	GAAA	2	8	47135	47142	75 %	0 %	25 %	0 %	479152343
76	NC_021014	GGAA	2	8	47264	47271	50 %	0 %	50 %	0 %	479152343
77	NC_021014	ATCC	2	8	47290	47297	25 %	25 %	0 %	50 %	479152343
78	NC_021014	CAGA	2	8	47376	47383	50 %	0 %	25 %	25 %	479152343
79	NC_021014	GACA	2	8	47403	47410	50 %	0 %	25 %	25 %	479152343
80	NC_021014	AATA	2	8	47811	47818	75 %	25 %	0 %	0 %	479152343
81	NC_021014	TGGC	2	8	47995	48002	0 %	25 %	50 %	25 %	479152344
82	NC_021014	GGAC	2	8	48574	48581	25 %	0 %	50 %	25 %	479152344
83	NC_021014	TGCC	2	8	49979	49986	0 %	25 %	25 %	50 %	479152345
84	NC_021014	GGTT	2	8	50107	50114	0 %	50 %	50 %	0 %	479152345
85	NC_021014	AAAG	2	8	50619	50626	75 %	0 %	25 %	0 %	479152346
86	NC_021014	TAAA	2	8	50684	50691	75 %	25 %	0 %	0 %	479152346
87	NC_021014	AGAT	2	8	51694	51701	50 %	25 %	25 %	0 %	479152347
88	NC_021014	TGGA	2	8	51838	51845	25 %	25 %	50 %	0 %	479152347
89	NC_021014	CAGC	2	8	52383	52390	25 %	0 %	25 %	50 %	479152347
90	NC_021014	CCGG	2	8	53208	53215	0 %	0 %	50 %	50 %	479152348
91	NC_021014	GAAA	2	8	53686	53693	75 %	0 %	25 %	0 %	479152348
92	NC_021014	TGAA	2	8	53908	53915	50 %	25 %	25 %	0 %	479152348
93	NC_021014	CAGG	2	8	54030	54037	25 %	0 %	50 %	25 %	479152348
94	NC_021014	GATC	2	8	56398	56405	25 %	25 %	25 %	25 %	479152350
95	NC_021014	AGAT	2	8	56653	56660	50 %	25 %	25 %	0 %	479152351
96	NC_021014	AGCA	2	8	59805	59812	50 %	0 %	25 %	25 %	479152352
97	NC_021014	TGAA	2	8	59998	60005	50 %	25 %	25 %	0 %	479152353
98	NC_021014	TGCG	2	8	60234	60241	0 %	25 %	50 %	25 %	479152353
99	NC_021014	TTTC	2	8	61288	61295	0 %	75 %	0 %	25 %	479152354
100	NC_021014	GCTG	2	8	61738	61745	0 %	25 %	50 %	25 %	479152354
101	NC_021014	ACGG	2	8	62743	62750	25 %	0 %	50 %	25 %	479152356
102	NC_021014	GCTG	2	8	62848	62855	0 %	25 %	50 %	25 %	479152356
103	NC_021014	AGGA	2	8	63782	63789	50 %	0 %	50 %	0 %	479152356
104	NC_021014	CAGA	2	8	64706	64713	50 %	0 %	25 %	25 %	479152356
105	NC_021014	AAAG	2	8	65196	65203	75 %	0 %	25 %	0 %	479152357
106	NC_021014	ATCT	2	8	65335	65342	25 %	50 %	0 %	25 %	479152358
107	NC_021014	ATGA	2	8	65908	65915	50 %	25 %	25 %	0 %	479152358
108	NC_021014	GTCT	2	8	66874	66881	0 %	50 %	25 %	25 %	479152359
109	NC_021014	TGAA	2	8	68025	68032	50 %	25 %	25 %	0 %	479152360
110	NC_021014	TAAC	2	8	71340	71347	50 %	25 %	0 %	25 %	479152362
111	NC_021014	AATA	2	8	71428	71435	75 %	25 %	0 %	0 %	479152362
112	NC_021014	ATTC	2	8	71454	71461	25 %	50 %	0 %	25 %	479152362
113	NC_021014	CTTG	2	8	72299	72306	0 %	50 %	25 %	25 %	479152365
114	NC_021014	AAAT	2	8	74841	74848	75 %	25 %	0 %	0 %	479152366
115	NC_021014	TACT	2	8	74889	74896	25 %	50 %	0 %	25 %	479152366
116	NC_021014	TTGC	2	8	75085	75092	0 %	50 %	25 %	25 %	479152367
117	NC_021014	ATGA	2	8	77004	77011	50 %	25 %	25 %	0 %	479152369
118	NC_021014	ACAA	2	8	77068	77075	75 %	0 %	0 %	25 %	479152369
119	NC_021014	TTCG	2	8	77183	77190	0 %	50 %	25 %	25 %	479152369
120	NC_021014	ATCT	2	8	77362	77369	25 %	50 %	0 %	25 %	479152370
121	NC_021014	AAAT	2	8	78081	78088	75 %	25 %	0 %	0 %	479152371
122	NC_021014	CTTT	2	8	78091	78098	0 %	75 %	0 %	25 %	479152371
123	NC_021014	GTTG	2	8	78240	78247	0 %	50 %	50 %	0 %	479152371
124	NC_021014	GGTA	2	8	79739	79746	25 %	25 %	50 %	0 %	479152373
125	NC_021014	CAGA	2	8	80006	80013	50 %	0 %	25 %	25 %	479152373
126	NC_021014	AAAG	2	8	80232	80239	75 %	0 %	25 %	0 %	479152373
127	NC_021014	AATG	2	8	81353	81360	50 %	25 %	25 %	0 %	479152373
128	NC_021014	ATCA	2	8	81615	81622	50 %	25 %	0 %	25 %	479152373
129	NC_021014	CTGT	2	8	81637	81644	0 %	50 %	25 %	25 %	479152373
130	NC_021014	GATG	2	8	82222	82229	25 %	25 %	50 %	0 %	479152374
131	NC_021014	CAGA	2	8	82243	82250	50 %	0 %	25 %	25 %	479152374
132	NC_021014	GCTG	2	8	82830	82837	0 %	25 %	50 %	25 %	479152374
133	NC_021014	GTCC	2	8	83039	83046	0 %	25 %	25 %	50 %	479152375
134	NC_021014	CTGG	2	8	89841	89848	0 %	25 %	50 %	25 %	479152379
135	NC_021014	ATGG	2	8	89922	89929	25 %	25 %	50 %	0 %	479152379
136	NC_021014	GAAA	2	8	90165	90172	75 %	0 %	25 %	0 %	479152379
137	NC_021014	ACAG	2	8	90319	90326	50 %	0 %	25 %	25 %	479152379
138	NC_021014	GCAG	2	8	90651	90658	25 %	0 %	50 %	25 %	479152379
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140	NC_021014	ATGA	2	8	92522	92529	50 %	25 %	25 %	0 %	479152380
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