MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Ruminococcus bromii L2-63 draft genome

Total Repeats: 265

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021013	ATTATA	2	12	13921	13932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021013	TGTTCG	2	12	16377	16388	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_021013	GCTTGT	2	12	26548	26559	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_021013	CAAAAG	2	12	28426	28437	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_021013	GATTCC	2	12	28870	28881	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_021013	TTTAGA	2	12	31192	31203	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021013	GCTAAA	2	12	33131	33142	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_021013	TTTTTC	2	12	45513	45524	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_021013	TGGCAA	2	12	46494	46505	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_021013	GAAAAA	2	12	63824	63835	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021013	ACGCTG	2	12	64600	64611	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_021013	GATAGC	2	12	66132	66143	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_021013	AAACCC	2	12	76627	76638	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_021013	AAAATA	2	12	78408	78419	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021013	GGCGCG	2	12	82920	82931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_021013	AATCCA	2	12	83634	83645	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_021013	CAGCGG	2	12	86770	86781	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_021013	GGACGG	2	12	87622	87633	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_021013	AATAAG	2	12	117500	117511	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021013	GCTTGA	2	12	131250	131261	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_021013	CAAAAA	2	12	131608	131619	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_021013	CGACCT	2	12	137856	137867	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
23	NC_021013	TTTCTG	2	12	163772	163783	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_021013	TATTGC	2	12	176650	176661	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_021013	AAAAGT	2	12	176896	176907	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021013	AGAAAA	2	12	181149	181160	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021013	AAGGCA	2	12	181556	181567	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_021013	GCGTAA	2	12	184142	184153	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_021013	GTTTTT	2	12	200459	200470	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021013	CCTGTA	2	12	201389	201400	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_021013	CAACGG	2	12	208466	208477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_021013	GCTTTC	2	12	211708	211719	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_021013	TGAACT	2	12	217354	217365	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_021013	AAATAA	2	12	228845	228856	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021013	CACAGG	2	12	229156	229167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_021013	TTTATT	2	12	233645	233656	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021013	TTTTAT	2	12	233953	233964	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021013	TTTTTA	2	12	249112	249123	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021013	AAGAGC	2	12	251204	251215	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_021013	ATTGCA	2	12	258792	258803	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_021013	TTTAAA	2	12	264740	264751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021013	CGAAAC	2	12	276120	276131	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_021013	TCAAAA	2	12	284475	284486	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_021013	TTACGC	2	12	324607	324618	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_021013	CGATAA	2	12	330591	330602	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_021013	GTAAAA	2	12	346811	346822	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021013	AGGGCA	2	12	351883	351894	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_021013	TTGAAA	2	12	352220	352231	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021013	ACCGTA	2	12	353130	353141	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_021013	ATTTTT	2	12	365604	365615	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021013	TTATTT	2	12	367848	367859	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021013	GTTTTG	2	12	389445	389456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021013	TAATTT	2	12	392770	392781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021013	CAAATA	2	12	392797	392808	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_021013	TGTTAG	2	12	401455	401466	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021013	TTGCGG	2	12	411391	411402	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_021013	ATTTTT	2	12	421203	421214	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021013	CAGAAT	2	12	434603	434614	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_021013	TGCCGC	2	12	443835	443846	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
60	NC_021013	CCACAC	2	12	444183	444194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_021013	ATTGCA	2	12	453704	453715	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_021013	GCAACG	2	12	464526	464537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_021013	TATCGT	2	12	464860	464871	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_021013	ATGTTT	2	12	478536	478547	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021013	AAATTA	2	12	489430	489441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021013	AAATTA	2	12	502750	502761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021013	AATTGT	2	12	511241	511252	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021013	TACCTG	2	12	532063	532074	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_021013	CATTCT	2	12	534711	534722	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_021013	GCCTGT	2	12	551793	551804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_021013	ACCCAT	2	12	554249	554260	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_021013	CCTTTG	2	12	573817	573828	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_021013	TGAGCG	2	12	574735	574746	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_021013	TGACGG	2	12	576578	576589	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_021013	ACGGTA	2	12	590111	590122	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_021013	TGCCGT	2	12	590193	590204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_021013	TTTATA	2	12	596146	596157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021013	TAAATG	2	12	609389	609400	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021013	TCGGTA	2	12	630993	631004	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_021013	TTCAAT	2	12	631548	631559	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_021013	ATTTTT	2	12	640239	640250	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021013	TTTTGA	2	12	640281	640292	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021013	CAAGAG	2	12	647340	647351	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_021013	CAAAAG	2	12	686892	686903	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_021013	CCTCAA	2	12	690569	690580	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_021013	TCCTGC	2	12	693481	693492	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
87	NC_021013	ATAAAC	2	12	696762	696773	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_021013	GTTTTG	2	12	697629	697640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021013	AAACAA	2	12	699971	699982	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_021013	ACAAAA	2	12	704338	704349	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_021013	GTTTAA	2	12	707105	707116	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021013	TCGTTG	2	12	711403	711414	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_021013	CGCCCT	2	12	711464	711475	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_021013	CGTCTG	2	12	711539	711550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_021013	TCATAG	2	12	726396	726407	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_021013	ATTTTG	2	12	738169	738180	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021013	TCAGAT	2	12	738407	738418	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_021013	TTTTTA	2	12	740546	740557	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021013	GAATTA	2	12	744302	744313	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021013	CAAAAT	2	12	751827	751838	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_021013	TCAACA	2	12	752123	752134	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_021013	CTTACG	2	12	753857	753868	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_021013	ACAATA	2	12	755099	755110	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_021013	GGTTTC	2	12	757841	757852	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_021013	AAATTA	2	12	757926	757937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021013	TATTTT	2	12	772031	772042	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021013	TCTTAC	2	12	776762	776773	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_021013	CCGCAA	2	12	777145	777156	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
109	NC_021013	AAGTTC	2	12	781397	781408	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_021013	TATGTT	2	12	782144	782155	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021013	TTTTGC	2	12	783042	783053	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_021013	TGCAAA	2	12	814709	814720	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_021013	CTGTAA	2	12	817940	817951	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_021013	AGCAAA	2	12	823181	823192	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_021013	TGAAAA	2	12	834398	834409	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021013	TTTGAA	2	12	837771	837782	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021013	TTATAA	2	12	840191	840202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021013	AAAAAG	2	12	862255	862266	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021013	TCGGTA	2	12	874012	874023	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_021013	TTTCTG	2	12	882918	882929	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_021013	TGACGG	2	12	884665	884676	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_021013	ACGGTG	2	12	884769	884780	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_021013	CAAGCA	2	12	890075	890086	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_021013	CACGCT	2	12	890543	890554	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
125	NC_021013	ATTTAT	2	12	892772	892783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021013	GGACAG	2	12	901758	901769	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_021013	ATATGT	2	12	918145	918156	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021013	TTAAAA	2	12	932307	932318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021013	AAAAAG	2	12	940822	940833	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021013	AATTTT	2	12	943262	943273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021013	ATATCA	2	12	943634	943645	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_021013	GTAGCA	2	12	960608	960619	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_021013	GTTATA	2	12	970796	970807	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021013	TTTTCT	2	12	987012	987023	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_021013	CAGCGG	2	12	993007	993018	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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137	NC_021013	CGCTGA	2	12	999414	999425	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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139	NC_021013	TGCCGA	2	12	1009019	1009030	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_021013	ATTTTG	2	12	1013424	1013435	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021013	GAGTAG	2	12	1027690	1027701	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021013	ATTTTA	2	12	1033512	1033523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021013	TTGACT	2	12	1040368	1040379	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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149	NC_021013	AAAAAG	2	12	1106617	1106628	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_021013	CAAAGG	2	12	1149384	1149395	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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157	NC_021013	GCAGGT	2	12	1184035	1184046	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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160	NC_021013	TACATT	2	12	1254132	1254143	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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242	NC_021013	TTGCGT	2	12	1919214	1919225	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
243	NC_021013	CAGTCC	2	12	1948718	1948729	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
244	NC_021013	TAAAAG	2	12	1955630	1955641	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
245	NC_021013	ATTGCA	2	12	1994721	1994732	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
246	NC_021013	TTTTTG	2	12	2032671	2032682	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
247	NC_021013	GACGAG	2	12	2046268	2046279	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
248	NC_021013	TATTTT	2	12	2051653	2051664	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
249	NC_021013	ATTGCA	2	12	2069423	2069434	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
250	NC_021013	GACGCA	2	12	2069722	2069733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
251	NC_021013	ATTATC	2	12	2070767	2070778	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
252	NC_021013	GGTTTC	2	12	2076418	2076429	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
253	NC_021013	TCACGG	2	12	2079794	2079805	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
254	NC_021013	CTCCAT	2	12	2105764	2105775	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
255	NC_021013	GCTTAT	2	12	2135265	2135276	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
256	NC_021013	CGCACC	2	12	2156489	2156500	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
257	NC_021013	CCCGTC	2	12	2157977	2157988	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
258	NC_021013	AGATTG	2	12	2171926	2171937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
259	NC_021013	GTACCC	2	12	2175141	2175152	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
260	NC_021013	TGAGTT	2	12	2199993	2200004	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
261	NC_021013	TTTCAT	2	12	2209716	2209727	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
262	NC_021013	TAACTG	2	12	2210126	2210137	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
263	NC_021013	ACCTTT	2	12	2210936	2210947	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
264	NC_021013	ATTTCT	2	12	2237099	2237110	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
265	NC_021013	TTCAGG	2	12	2241112	2241123	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.