MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Ruminococcus bromii L2-63 draft genome

Total Repeats: 1149

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021013	CCTTT	2	10	1641	1650	0 %	60 %	0 %	40 %	479150085
2	NC_021013	CTTTT	2	10	5915	5924	0 %	80 %	0 %	20 %	479150089
3	NC_021013	ACGGC	2	10	6129	6138	20 %	0 %	40 %	40 %	479150089
4	NC_021013	ATAAA	2	10	7070	7079	80 %	20 %	0 %	0 %	479150090
5	NC_021013	TGCAT	2	10	7160	7169	20 %	40 %	20 %	20 %	479150090
6	NC_021013	TGAAA	2	10	7398	7407	60 %	20 %	20 %	0 %	479150090
7	NC_021013	GTATC	2	10	7438	7447	20 %	40 %	20 %	20 %	479150090
8	NC_021013	ACGGC	2	10	7559	7568	20 %	0 %	40 %	40 %	479150090
9	NC_021013	ACGGC	2	10	9000	9009	20 %	0 %	40 %	40 %	479150091
10	NC_021013	AAATG	2	10	12184	12193	60 %	20 %	20 %	0 %	479150093
11	NC_021013	TTGTT	2	10	14341	14350	0 %	80 %	20 %	0 %	479150094
12	NC_021013	GCAGG	2	10	14496	14505	20 %	0 %	60 %	20 %	479150094
13	NC_021013	ATTCA	2	10	14507	14516	40 %	40 %	0 %	20 %	479150094
14	NC_021013	AAAGT	2	10	14625	14634	60 %	20 %	20 %	0 %	479150094
15	NC_021013	GAGCA	2	10	15291	15300	40 %	0 %	40 %	20 %	479150094
16	NC_021013	AACGC	2	10	15559	15568	40 %	0 %	20 %	40 %	479150094
17	NC_021013	ACCCG	2	10	19894	19903	20 %	0 %	20 %	60 %	479150097
18	NC_021013	ATGAT	2	10	21876	21885	40 %	40 %	20 %	0 %	479150098
19	NC_021013	TTTTG	2	10	22764	22773	0 %	80 %	20 %	0 %	479150099
20	NC_021013	ATTTT	2	10	30611	30620	20 %	80 %	0 %	0 %	479150103
21	NC_021013	CTTTT	2	10	31416	31425	0 %	80 %	0 %	20 %	479150104
22	NC_021013	ATGTC	2	10	31588	31597	20 %	40 %	20 %	20 %	479150104
23	NC_021013	TTTCT	2	10	34566	34575	0 %	80 %	0 %	20 %	479150107
24	NC_021013	TTGTT	2	10	36642	36651	0 %	80 %	20 %	0 %	479150109
25	NC_021013	AAATG	2	10	37121	37130	60 %	20 %	20 %	0 %	479150110
26	NC_021013	TCATC	2	10	37868	37877	20 %	40 %	0 %	40 %	479150111
27	NC_021013	GGAAA	2	10	38539	38548	60 %	0 %	40 %	0 %	479150111
28	NC_021013	TTTTC	2	10	39085	39094	0 %	80 %	0 %	20 %	479150112
29	NC_021013	CCATT	2	10	39485	39494	20 %	40 %	0 %	40 %	479150112
30	NC_021013	TCTGC	2	10	41585	41594	0 %	40 %	20 %	40 %	479150114
31	NC_021013	TGATG	2	10	42286	42295	20 %	40 %	40 %	0 %	479150115
32	NC_021013	CCACC	2	10	42461	42470	20 %	0 %	0 %	80 %	479150115
33	NC_021013	ATAAA	2	10	43914	43923	80 %	20 %	0 %	0 %	479150117
34	NC_021013	GTTGC	2	10	50653	50662	0 %	40 %	40 %	20 %	479150122
35	NC_021013	TTTTC	2	10	51568	51577	0 %	80 %	0 %	20 %	479150123
36	NC_021013	ATTTA	2	10	55043	55052	40 %	60 %	0 %	0 %	479150128
37	NC_021013	AACTG	2	10	56289	56298	40 %	20 %	20 %	20 %	479150129
38	NC_021013	TTGAT	2	10	60339	60348	20 %	60 %	20 %	0 %	479150133
39	NC_021013	TCATT	2	10	62293	62302	20 %	60 %	0 %	20 %	479150134
40	NC_021013	TCATC	2	10	63507	63516	20 %	40 %	0 %	40 %	479150135
41	NC_021013	ATTCC	2	10	67134	67143	20 %	40 %	0 %	40 %	479150137
42	NC_021013	GGAAA	2	10	67198	67207	60 %	0 %	40 %	0 %	479150137
43	NC_021013	CGGTG	2	10	68307	68316	0 %	20 %	60 %	20 %	479150138
44	NC_021013	CTAAT	2	10	68576	68585	40 %	40 %	0 %	20 %	479150138
45	NC_021013	ATGGG	2	10	77305	77314	20 %	20 %	60 %	0 %	479150148
46	NC_021013	GACAC	2	10	80328	80337	40 %	0 %	20 %	40 %	479150150
47	NC_021013	GAAAT	2	10	82023	82032	60 %	20 %	20 %	0 %	479150151
48	NC_021013	CGGCG	2	10	82157	82166	0 %	0 %	60 %	40 %	479150152
49	NC_021013	GAAGT	2	10	82323	82332	40 %	20 %	40 %	0 %	479150152
50	NC_021013	CAAAA	2	10	82447	82456	80 %	0 %	0 %	20 %	479150152
51	NC_021013	AGCCG	2	10	85361	85370	20 %	0 %	40 %	40 %	479150153
52	NC_021013	AGCCG	2	10	89235	89244	20 %	0 %	40 %	40 %	479150156
53	NC_021013	TTGCC	2	10	92948	92957	0 %	40 %	20 %	40 %	479150159
54	NC_021013	GCCCC	2	10	93459	93468	0 %	0 %	20 %	80 %	479150159
55	NC_021013	TTTTG	2	10	96404	96413	0 %	80 %	20 %	0 %	479150161
56	NC_021013	GCTTT	2	10	96622	96631	0 %	60 %	20 %	20 %	479150161
57	NC_021013	TGTCC	2	10	96682	96691	0 %	40 %	20 %	40 %	479150161
58	NC_021013	CGTAA	2	10	97393	97402	40 %	20 %	20 %	20 %	479150162
59	NC_021013	TACAA	2	10	99398	99407	60 %	20 %	0 %	20 %	479150166
60	NC_021013	GCGAA	2	10	100126	100135	40 %	0 %	40 %	20 %	479150167
61	NC_021013	ACCCG	2	10	101956	101965	20 %	0 %	20 %	60 %	479150172
62	NC_021013	ACAGG	2	10	102089	102098	40 %	0 %	40 %	20 %	479150172
63	NC_021013	CTTTT	2	10	106466	106475	0 %	80 %	0 %	20 %	479150174
64	NC_021013	TCGGC	2	10	107385	107394	0 %	20 %	40 %	40 %	479150174
65	NC_021013	AAGAA	2	10	109573	109582	80 %	0 %	20 %	0 %	479150175
66	NC_021013	GGTAT	2	10	109908	109917	20 %	40 %	40 %	0 %	479150176
67	NC_021013	TCATA	2	10	110225	110234	40 %	40 %	0 %	20 %	479150176
68	NC_021013	TCTGT	2	10	110438	110447	0 %	60 %	20 %	20 %	479150176
69	NC_021013	GTCTT	2	10	110459	110468	0 %	60 %	20 %	20 %	479150176
70	NC_021013	ATTTT	2	10	110604	110613	20 %	80 %	0 %	0 %	479150177
71	NC_021013	CCTGC	2	10	112401	112410	0 %	20 %	20 %	60 %	479150180
72	NC_021013	CATTG	2	10	117077	117086	20 %	40 %	20 %	20 %	479150181
73	NC_021013	GTCTG	2	10	117233	117242	0 %	40 %	40 %	20 %	479150181
74	NC_021013	CATTC	2	10	120744	120753	20 %	40 %	0 %	40 %	479150184
75	NC_021013	AGAGA	2	10	121235	121244	60 %	0 %	40 %	0 %	479150185
76	NC_021013	CCTGT	2	10	121945	121954	0 %	40 %	20 %	40 %	479150185
77	NC_021013	CAAGA	2	10	126857	126866	60 %	0 %	20 %	20 %	479150186
78	NC_021013	TTATG	2	10	130495	130504	20 %	60 %	20 %	0 %	479150188
79	NC_021013	TACAT	2	10	133279	133288	40 %	40 %	0 %	20 %	479150189
80	NC_021013	ATTGA	2	10	133474	133483	40 %	40 %	20 %	0 %	479150189
81	NC_021013	TTCGG	2	10	135236	135245	0 %	40 %	40 %	20 %	479150190
82	NC_021013	TATCA	2	10	135596	135605	40 %	40 %	0 %	20 %	479150190
83	NC_021013	CACAG	2	10	136728	136737	40 %	0 %	20 %	40 %	479150190
84	NC_021013	TGCTG	2	10	141099	141108	0 %	40 %	40 %	20 %	479150192
85	NC_021013	TCTGT	2	10	141122	141131	0 %	60 %	20 %	20 %	479150192
86	NC_021013	TGTAA	2	10	142617	142626	40 %	40 %	20 %	0 %	479150193
87	NC_021013	ATCAC	2	10	142761	142770	40 %	20 %	0 %	40 %	479150193
88	NC_021013	TAAGA	2	10	147872	147881	60 %	20 %	20 %	0 %	479150196
89	NC_021013	TTACC	2	10	148786	148795	20 %	40 %	0 %	40 %	479150196
90	NC_021013	TACCG	2	10	150211	150220	20 %	20 %	20 %	40 %	479150198
91	NC_021013	ATAAC	2	10	155228	155237	60 %	20 %	0 %	20 %	479150202
92	NC_021013	TCAAA	2	10	156579	156588	60 %	20 %	0 %	20 %	479150203
93	NC_021013	AAAAT	2	10	156841	156850	80 %	20 %	0 %	0 %	479150203
94	NC_021013	ATATT	2	10	158549	158558	40 %	60 %	0 %	0 %	479150205
95	NC_021013	TCTTG	2	10	159520	159529	0 %	60 %	20 %	20 %	479150206
96	NC_021013	TTATT	2	10	160520	160529	20 %	80 %	0 %	0 %	479150207
97	NC_021013	GAAAA	2	10	163589	163598	80 %	0 %	20 %	0 %	479150208
98	NC_021013	TATAA	2	10	165675	165684	60 %	40 %	0 %	0 %	479150211
99	NC_021013	CTCTG	2	10	166359	166368	0 %	40 %	20 %	40 %	479150211
100	NC_021013	CTTGT	2	10	167649	167658	0 %	60 %	20 %	20 %	479150212
101	NC_021013	CATTT	2	10	172011	172020	20 %	60 %	0 %	20 %	479150218
102	NC_021013	TAGAT	2	10	176024	176033	40 %	40 %	20 %	0 %	479150220
103	NC_021013	TTCAA	2	10	177261	177270	40 %	40 %	0 %	20 %	479150221
104	NC_021013	CTTTT	2	10	179388	179397	0 %	80 %	0 %	20 %	479150223
105	NC_021013	ACGGA	2	10	180385	180394	40 %	0 %	40 %	20 %	479150224
106	NC_021013	TACCG	2	10	180431	180440	20 %	20 %	20 %	40 %	479150224
107	NC_021013	GCAGA	2	10	183228	183237	40 %	0 %	40 %	20 %	479150228
108	NC_021013	ACAAA	2	10	183882	183891	80 %	0 %	0 %	20 %	479150229
109	NC_021013	TGCTA	2	10	186410	186419	20 %	40 %	20 %	20 %	479150231
110	NC_021013	AATTC	2	10	187993	188002	40 %	40 %	0 %	20 %	479150233
111	NC_021013	TCACA	2	10	189092	189101	40 %	20 %	0 %	40 %	479150234
112	NC_021013	TTTCA	2	10	189626	189635	20 %	60 %	0 %	20 %	479150235
113	NC_021013	GAAAA	2	10	192997	193006	80 %	0 %	20 %	0 %	479150238
114	NC_021013	TCAGA	2	10	196161	196170	40 %	20 %	20 %	20 %	479150239
115	NC_021013	AACAG	2	10	196656	196665	60 %	0 %	20 %	20 %	479150239
116	NC_021013	ATTAA	2	10	196684	196693	60 %	40 %	0 %	0 %	479150239
117	NC_021013	ATGTT	2	10	207381	207390	20 %	60 %	20 %	0 %	479150247
118	NC_021013	GTTCC	2	10	210798	210807	0 %	40 %	20 %	40 %	479150248
119	NC_021013	TAAAC	2	10	211597	211606	60 %	20 %	0 %	20 %	479150248
120	NC_021013	ATTTT	2	10	214844	214853	20 %	80 %	0 %	0 %	479150250
121	NC_021013	GGTTT	2	10	214871	214880	0 %	60 %	40 %	0 %	479150250
122	NC_021013	TTGCT	2	10	218868	218877	0 %	60 %	20 %	20 %	479150253
123	NC_021013	CATTA	2	10	220619	220628	40 %	40 %	0 %	20 %	479150256
124	NC_021013	CTTAT	2	10	221347	221356	20 %	60 %	0 %	20 %	479150256
125	NC_021013	CGATT	2	10	221843	221852	20 %	40 %	20 %	20 %	479150256
126	NC_021013	TATCA	2	10	223423	223432	40 %	40 %	0 %	20 %	479150257
127	NC_021013	TTATG	2	10	223784	223793	20 %	60 %	20 %	0 %	479150257
128	NC_021013	AAAAC	2	10	226031	226040	80 %	0 %	0 %	20 %	479150259
129	NC_021013	ACCGA	2	10	226064	226073	40 %	0 %	20 %	40 %	479150259
130	NC_021013	TTACC	2	10	227812	227821	20 %	40 %	0 %	40 %	479150260
131	NC_021013	ACCTT	2	10	230400	230409	20 %	40 %	0 %	40 %	479150262
132	NC_021013	AAAAG	2	10	231228	231237	80 %	0 %	20 %	0 %	479150263
133	NC_021013	TGCGG	2	10	233334	233343	0 %	20 %	60 %	20 %	479150264
134	NC_021013	TGAAA	2	10	236548	236557	60 %	20 %	20 %	0 %	479150268
135	NC_021013	TCGGT	2	10	237872	237881	0 %	40 %	40 %	20 %	479150269
136	NC_021013	ACAGC	2	10	240045	240054	40 %	0 %	20 %	40 %	479150271
137	NC_021013	AAAAT	2	10	241311	241320	80 %	20 %	0 %	0 %	479150273
138	NC_021013	AAAAC	2	10	241958	241967	80 %	0 %	0 %	20 %	479150274
139	NC_021013	CAGGG	2	10	246451	246460	20 %	0 %	60 %	20 %	479150278
140	NC_021013	CTTTA	2	10	246669	246678	20 %	60 %	0 %	20 %	479150278
141	NC_021013	ATTTG	2	10	247811	247820	20 %	60 %	20 %	0 %	479150280
142	NC_021013	GCCTT	2	10	248247	248256	0 %	40 %	20 %	40 %	479150280
143	NC_021013	GTTTT	2	10	248935	248944	0 %	80 %	20 %	0 %	479150280
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148	NC_021013	GATTT	2	10	258232	258241	20 %	60 %	20 %	0 %	479150294
149	NC_021013	GGCAA	2	10	260282	260291	40 %	0 %	40 %	20 %	479150296
150	NC_021013	GGTTC	2	10	261863	261872	0 %	40 %	40 %	20 %	479150296
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152	NC_021013	GCGGT	2	10	267322	267331	0 %	20 %	60 %	20 %	479150301
153	NC_021013	GGCAG	2	10	267565	267574	20 %	0 %	60 %	20 %	479150301
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156	NC_021013	TTCGG	2	10	274108	274117	0 %	40 %	40 %	20 %	479150312
157	NC_021013	CAGTG	2	10	282631	282640	20 %	20 %	40 %	20 %	479150317
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161	NC_021013	AAAAT	2	10	289460	289469	80 %	20 %	0 %	0 %	479150323
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164	NC_021013	TTATG	2	10	292423	292432	20 %	60 %	20 %	0 %	479150325
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169	NC_021013	GGAAC	2	10	309145	309154	40 %	0 %	40 %	20 %	479150334
170	NC_021013	TACCT	2	10	309443	309452	20 %	40 %	0 %	40 %	479150334
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173	NC_021013	CTTTT	2	10	316311	316320	0 %	80 %	0 %	20 %	479150343
174	NC_021013	TGCAA	2	10	316697	316706	40 %	20 %	20 %	20 %	479150343
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187	NC_021013	GTGAT	2	10	343041	343050	20 %	40 %	40 %	0 %	479150369
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231	NC_021013	TACTC	2	10	454568	454577	20 %	40 %	0 %	40 %	479150444
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245	NC_021013	TGAAT	2	10	494315	494324	40 %	40 %	20 %	0 %	479150472
246	NC_021013	CCTTA	2	10	496075	496084	20 %	40 %	0 %	40 %	479150473
247	NC_021013	TTTAC	2	10	498097	498106	20 %	60 %	0 %	20 %	479150476
248	NC_021013	TGTTT	2	10	499272	499281	0 %	80 %	20 %	0 %	479150476
249	NC_021013	ATTAC	2	10	500572	500581	40 %	40 %	0 %	20 %	479150477
250	NC_021013	CATTT	2	10	502339	502348	20 %	60 %	0 %	20 %	479150478
251	NC_021013	TTGTT	2	10	504295	504304	0 %	80 %	20 %	0 %	479150479
252	NC_021013	AACTC	2	10	506453	506462	40 %	20 %	0 %	40 %	479150480
253	NC_021013	CCGAA	2	10	508206	508215	40 %	0 %	20 %	40 %	479150482
254	NC_021013	AACGG	2	10	508376	508385	40 %	0 %	40 %	20 %	479150482
255	NC_021013	CCATA	2	10	514005	514014	40 %	20 %	0 %	40 %	479150487
256	NC_021013	AAAAT	2	10	520794	520803	80 %	20 %	0 %	0 %	479150491
257	NC_021013	GTCGG	2	10	521801	521810	0 %	20 %	60 %	20 %	479150492
258	NC_021013	GTAAA	2	10	522573	522582	60 %	20 %	20 %	0 %	479150492
259	NC_021013	ACTGT	2	10	523608	523617	20 %	40 %	20 %	20 %	479150492
260	NC_021013	CAACC	2	10	524376	524385	40 %	0 %	0 %	60 %	479150492
261	NC_021013	TCTTT	2	10	525633	525642	0 %	80 %	0 %	20 %	479150492
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