MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Ruminococcus bromii L2-63 draft genome

Total Repeats: 1460

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021013	AATA	2	8	120	127	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021013	TAAT	2	8	327	334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021013	AAAT	2	8	1058	1065	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021013	GTCT	2	8	4516	4523	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_021013	TCCC	2	8	9197	9204	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6	NC_021013	AATA	2	8	9484	9491	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021013	GGCG	2	8	9633	9640	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8	NC_021013	ATGT	2	8	11863	11870	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021013	AAAG	2	8	14059	14066	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021013	CAGT	2	8	16246	16253	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_021013	AAAT	2	8	16281	16288	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021013	GTTT	2	8	16341	16348	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021013	TATG	2	8	17423	17430	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021013	ATGA	2	8	17439	17446	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021013	AAAT	2	8	20184	20191	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021013	GAAG	2	8	20294	20301	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021013	TGCC	2	8	23269	23276	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_021013	ATTT	2	8	25849	25856	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021013	CGTT	2	8	26384	26391	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_021013	GAAA	2	8	26788	26795	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021013	GTCC	2	8	26941	26948	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_021013	AAAT	2	8	27519	27526	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021013	TAAA	2	8	28259	28266	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021013	AAGA	2	8	28384	28391	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021013	AGAC	2	8	28456	28463	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_021013	GGCA	2	8	28812	28819	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_021013	GTCC	2	8	29756	29763	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_021013	CTAA	2	8	30019	30026	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_021013	AATA	2	8	30094	30101	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021013	CACT	2	8	31081	31088	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_021013	CAAA	2	8	33640	33647	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_021013	TCGC	2	8	33974	33981	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_021013	AGCA	2	8	34806	34813	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_021013	AAAG	2	8	35034	35041	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021013	TTAT	2	8	45903	45910	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021013	ATGA	2	8	46271	46278	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021013	CATA	2	8	53614	53621	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_021013	CGCA	2	8	53689	53696	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_021013	TCTT	2	8	54218	54225	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_021013	AAAT	2	8	54328	54335	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021013	TCTT	2	8	54629	54636	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_021013	TTCT	2	8	56155	56162	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_021013	TTTG	2	8	62537	62544	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021013	CAAA	2	8	63738	63745	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_021013	CAGG	2	8	64175	64182	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_021013	TTCT	2	8	64252	64259	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_021013	CTTG	2	8	64445	64452	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_021013	GATT	2	8	65057	65064	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021013	CTTG	2	8	65082	65089	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_021013	TCTT	2	8	65273	65280	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_021013	ATAG	2	8	65328	65335	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021013	TTTC	2	8	65386	65393	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_021013	ATTG	2	8	65956	65963	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021013	CAAT	2	8	66054	66061	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_021013	GAAA	2	8	70222	70229	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021013	TCGG	2	8	71318	71325	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_021013	ATAA	2	8	71666	71673	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021013	TCCT	2	8	72547	72554	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_021013	GGCT	2	8	72557	72564	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_021013	AGCG	2	8	72795	72802	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_021013	CCGT	2	8	72923	72930	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_021013	GCTG	2	8	74017	74024	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_021013	AGGA	2	8	74672	74679	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021013	ATTT	2	8	76336	76343	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021013	GAAG	2	8	76554	76561	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021013	CAGA	2	8	78433	78440	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_021013	GGCG	2	8	80507	80514	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
68	NC_021013	CTTG	2	8	81318	81325	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_021013	TCCG	2	8	83391	83398	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_021013	TTGA	2	8	84106	84113	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021013	AAAC	2	8	84287	84294	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_021013	GCGG	2	8	86113	86120	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
73	NC_021013	AAGA	2	8	86144	86151	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021013	AGAA	2	8	86304	86311	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021013	GCGG	2	8	86360	86367	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
76	NC_021013	GCGG	2	8	86582	86589	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
77	NC_021013	GGAC	2	8	87093	87100	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_021013	CCCG	2	8	87304	87311	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
79	NC_021013	TGCT	2	8	97514	97521	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_021013	TTCA	2	8	97997	98004	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_021013	CTTT	2	8	98028	98035	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_021013	TTTA	2	8	99771	99778	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021013	CTTT	2	8	110494	110501	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_021013	CTGC	2	8	116174	116181	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_021013	CGTC	2	8	116559	116566	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_021013	ATCA	2	8	119355	119362	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_021013	AAAC	2	8	119379	119386	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_021013	ATTT	2	8	126117	126124	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021013	TTAA	2	8	130089	130096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021013	AATC	2	8	130833	130840	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_021013	ATGA	2	8	131783	131790	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021013	CAAG	2	8	132334	132341	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_021013	ACTG	2	8	132379	132386	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_021013	AGCC	2	8	138103	138110	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_021013	TTGA	2	8	140485	140492	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021013	AGAT	3	12	142024	142035	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021013	GTTC	2	8	144289	144296	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_021013	AGAA	2	8	145678	145685	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021013	TAAT	2	8	146286	146293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021013	AAAT	2	8	149152	149159	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021013	ATTA	2	8	153089	153096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021013	ATTT	2	8	154096	154103	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021013	TCGT	2	8	157744	157751	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_021013	AAAT	2	8	163160	163167	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021013	TTGG	2	8	163217	163224	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021013	CTGT	2	8	168604	168611	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_021013	ATAA	2	8	168642	168649	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021013	GCAA	2	8	172460	172467	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_021013	CACT	2	8	173495	173502	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_021013	AAGA	2	8	173983	173990	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021013	GAAA	2	8	174075	174082	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021013	TCGG	2	8	175221	175228	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_021013	TATT	2	8	175369	175376	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021013	TATT	3	12	176561	176572	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021013	TGTA	2	8	176699	176706	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021013	ATAA	2	8	177459	177466	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021013	CGGG	2	8	181623	181630	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
118	NC_021013	GAGG	2	8	181757	181764	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021013	GGGA	2	8	182843	182850	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021013	CCTG	2	8	184162	184169	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_021013	ACGG	2	8	184223	184230	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_021013	AATT	2	8	184847	184854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021013	CTAT	2	8	185533	185540	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_021013	TAAA	2	8	187227	187234	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021013	TACA	2	8	190553	190560	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_021013	ATTG	2	8	194856	194863	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021013	TAAA	2	8	194900	194907	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021013	AGAA	2	8	198761	198768	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021013	TCAT	2	8	198909	198916	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_021013	TCAA	2	8	199166	199173	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_021013	CAAC	2	8	199272	199279	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_021013	GCAA	2	8	199785	199792	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_021013	TGTT	2	8	200724	200731	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021013	ATTT	2	8	202793	202800	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021013	TTTA	2	8	202821	202828	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021013	AAAG	2	8	204812	204819	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021013	ATCT	2	8	205054	205061	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_021013	TTAT	2	8	205427	205434	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021013	ATGT	2	8	205501	205508	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021013	CAAT	2	8	205580	205587	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_021013	AAAT	2	8	209589	209596	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021013	GTAT	2	8	209798	209805	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021013	ACCC	2	8	211929	211936	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
144	NC_021013	TTGA	2	8	211983	211990	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021013	ATTT	2	8	212585	212592	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021013	TGAA	2	8	217230	217237	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021013	TGTT	2	8	217284	217291	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021013	TTGT	2	8	217398	217405	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021013	TGAA	2	8	217417	217424	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_021013	AAAT	2	8	217971	217978	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_021013	AAAT	2	8	218127	218134	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_021013	TTGT	2	8	219308	219315	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
153	NC_021013	ATTT	2	8	222708	222715	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_021013	AAAG	2	8	228492	228499	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_021013	ATTT	2	8	241173	241180	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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