MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Ruminococcus bromii L2-63 draft genome

Total Repeats: 28456

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021013	AGT	2	6	7	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021013	ACT	2	6	19	24	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021013	ATT	2	6	196	201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021013	AGG	2	6	321	326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021013	TAA	2	6	367	372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150084
6	NC_021013	TAT	2	6	383	388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150084
7	NC_021013	AAT	2	6	420	425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150084
8	NC_021013	TGA	2	6	533	538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150084
9	NC_021013	GAT	2	6	579	584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150084
10	NC_021013	ATG	2	6	760	765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150084
11	NC_021013	GAT	2	6	855	860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150084
12	NC_021013	ACA	2	6	996	1001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150084
13	NC_021013	AAT	2	6	1099	1104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021013	TAA	2	6	1270	1275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021013	ATT	2	6	1304	1309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021013	GCG	2	6	1424	1429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479150085
17	NC_021013	GAA	2	6	1571	1576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150085
18	NC_021013	TTG	2	6	1752	1757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150085
19	NC_021013	TGT	2	6	1933	1938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150085
20	NC_021013	TGA	2	6	1948	1953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150085
21	NC_021013	TGA	2	6	2128	2133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150085
22	NC_021013	TTG	2	6	2273	2278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150085
23	NC_021013	AAC	2	6	2370	2375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_021013	ACA	2	6	2384	2389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150086
25	NC_021013	CGG	2	6	2454	2459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479150086
26	NC_021013	TTC	2	6	2543	2548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150086
27	NC_021013	CGG	2	6	2634	2639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479150086
28	NC_021013	TCA	2	6	2646	2651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150086
29	NC_021013	AGA	3	9	2679	2687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150086
30	NC_021013	TGT	2	6	2913	2918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150086
31	NC_021013	TGA	2	6	2985	2990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150086
32	NC_021013	ATA	3	9	3315	3323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150087
33	NC_021013	CAA	2	6	3440	3445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150087
34	NC_021013	AAC	2	6	3601	3606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150087
35	NC_021013	ATT	2	6	3610	3615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150087
36	NC_021013	CCA	2	6	3812	3817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479150087
37	NC_021013	TAA	2	6	3818	3823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150087
38	NC_021013	AAT	2	6	3831	3836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150087
39	NC_021013	AAG	2	6	3909	3914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150087
40	NC_021013	TGA	2	6	3970	3975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150087
41	NC_021013	CAT	2	6	4074	4079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150087
42	NC_021013	ATT	2	6	4108	4113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150087
43	NC_021013	TTG	2	6	4196	4201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150087
44	NC_021013	CAA	2	6	4225	4230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150087
45	NC_021013	AAT	2	6	4298	4303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150087
46	NC_021013	CAT	2	6	4437	4442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150087
47	NC_021013	TCC	2	6	4591	4596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479150088
48	NC_021013	GGT	2	6	4634	4639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479150088
49	NC_021013	TTC	2	6	4665	4670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150088
50	NC_021013	TCT	2	6	4693	4698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150088
51	NC_021013	GAA	2	6	4709	4714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150088
52	NC_021013	TAA	2	6	4775	4780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150088
53	NC_021013	TAA	2	6	5188	5193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150089
54	NC_021013	GAA	2	6	5315	5320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150089
55	NC_021013	TCA	2	6	5424	5429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150089
56	NC_021013	ATT	2	6	5438	5443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150089
57	NC_021013	ATG	2	6	5516	5521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150089
58	NC_021013	CAA	2	6	5647	5652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150089
59	NC_021013	CAC	2	6	5687	5692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479150089
60	NC_021013	TGA	2	6	5763	5768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150089
61	NC_021013	AAG	2	6	5821	5826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150089
62	NC_021013	ATG	2	6	5888	5893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150089
63	NC_021013	ATC	2	6	5936	5941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150089
64	NC_021013	TAT	2	6	6108	6113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150089
65	NC_021013	TTC	2	6	6160	6165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150089
66	NC_021013	CTT	3	9	6183	6191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150089
67	NC_021013	TAG	2	6	6212	6217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150089
68	NC_021013	CCT	2	6	6328	6333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_021013	ACT	2	6	6364	6369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150090
70	NC_021013	TTC	2	6	6411	6416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150090
71	NC_021013	GTT	2	6	6550	6555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150090
72	NC_021013	TCT	2	6	6566	6571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150090
73	NC_021013	AAT	2	6	6668	6673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150090
74	NC_021013	ATC	2	6	6705	6710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150090
75	NC_021013	ATA	2	6	6789	6794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150090
76	NC_021013	CCA	2	6	6863	6868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479150090
77	NC_021013	AAT	2	6	6887	6892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150090
78	NC_021013	TGT	2	6	6893	6898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150090
79	NC_021013	GTT	3	9	6928	6936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150090
80	NC_021013	AAG	2	6	6964	6969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150090
81	NC_021013	TTA	2	6	7015	7020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150090
82	NC_021013	CAA	2	6	7053	7058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150090
83	NC_021013	ATA	2	6	7090	7095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150090
84	NC_021013	GAA	2	6	7100	7105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150090
85	NC_021013	CAG	2	6	7214	7219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479150090
86	NC_021013	ATA	2	6	7232	7237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150090
87	NC_021013	ATT	2	6	7321	7326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150090
88	NC_021013	ATT	2	6	7341	7346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150090
89	NC_021013	ATA	2	6	7358	7363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150090
90	NC_021013	ACA	2	6	7372	7377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150090
91	NC_021013	AAT	2	6	7512	7517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150090
92	NC_021013	TTC	2	6	7590	7595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150090
93	NC_021013	TCT	2	6	7615	7620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150090
94	NC_021013	TAG	2	6	7642	7647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150090
95	NC_021013	ATT	2	6	7819	7824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150091
96	NC_021013	GTA	2	6	7912	7917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150091
97	NC_021013	AAT	2	6	7946	7951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150091
98	NC_021013	TCT	2	6	8144	8149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150091
99	NC_021013	ATA	2	6	8194	8199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150091
100	NC_021013	ATA	2	6	8230	8235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150091
101	NC_021013	TCT	2	6	8270	8275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150091
102	NC_021013	TTA	2	6	8343	8348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150091
103	NC_021013	ATC	2	6	8350	8355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150091
104	NC_021013	AAG	2	6	8367	8372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150091
105	NC_021013	AAC	2	6	8386	8391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150091
106	NC_021013	AAT	2	6	8428	8433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150091
107	NC_021013	CTT	2	6	8452	8457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150091
108	NC_021013	ATA	2	6	8513	8518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150091
109	NC_021013	TGA	2	6	8692	8697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150091
110	NC_021013	AAT	2	6	8773	8778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150091
111	NC_021013	ATT	2	6	8801	8806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150091
112	NC_021013	AGA	2	6	8922	8927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150091
113	NC_021013	TAT	2	6	8935	8940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150091
114	NC_021013	ATT	2	6	8977	8982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150091
115	NC_021013	TTC	2	6	9031	9036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150091
116	NC_021013	TCT	2	6	9056	9061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150091
117	NC_021013	ATA	2	6	9082	9087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150091
118	NC_021013	TTC	2	6	9185	9190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150091
119	NC_021013	AAT	2	6	9256	9261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021013	AAT	2	6	9318	9323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021013	GCG	2	6	9439	9444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_021013	TGT	2	6	9505	9510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021013	AAT	2	6	9513	9518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021013	CGC	2	6	9564	9569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_021013	ATA	2	6	9592	9597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021013	TCA	2	6	9626	9631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_021013	TGT	2	6	9861	9866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150092
128	NC_021013	CCG	2	6	9968	9973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150092
129	NC_021013	CCG	2	6	10006	10011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150092
130	NC_021013	GTA	2	6	10164	10169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150092
131	NC_021013	TCA	2	6	10357	10362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150092
132	NC_021013	TTG	3	9	10456	10464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150092
133	NC_021013	GAA	2	6	10611	10616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150092
134	NC_021013	CTT	2	6	10635	10640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150092
135	NC_021013	CAA	2	6	10781	10786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150092
136	NC_021013	GTT	2	6	10950	10955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150092
137	NC_021013	GTG	2	6	11040	11045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479150092
138	NC_021013	CAT	2	6	11046	11051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150092
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141	NC_021013	AAT	2	6	11184	11189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150092
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152	NC_021013	ATT	2	6	11776	11781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_021013	CTT	2	6	12046	12051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150093
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178	NC_021013	ATA	3	9	13847	13855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_021013	AAG	2	6	13864	13869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
180	NC_021013	GGC	2	6	14016	14021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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182	NC_021013	AAG	2	6	14111	14116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150094
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258	NC_021013	CAA	2	6	19550	19555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150097
259	NC_021013	TAA	2	6	19604	19609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150097
260	NC_021013	CAA	2	6	19643	19648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150097
261	NC_021013	TGA	2	6	19785	19790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150097
262	NC_021013	GAT	2	6	19867	19872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150097
263	NC_021013	TTA	2	6	19913	19918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150097
264	NC_021013	ACA	2	6	19991	19996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150097
265	NC_021013	GAT	2	6	20035	20040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150097
266	NC_021013	TAA	2	6	20101	20106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150097
267	NC_021013	ATA	2	6	20175	20180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
268	NC_021013	AAT	2	6	20203	20208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
269	NC_021013	TAA	2	6	20287	20292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
270	NC_021013	TGT	2	6	20353	20358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150098
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272	NC_021013	CAA	2	6	20491	20496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150098
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274	NC_021013	TAT	2	6	20708	20713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150098
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281	NC_021013	ATT	2	6	21011	21016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150098
282	NC_021013	GGC	2	6	21289	21294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479150098
283	NC_021013	ATT	2	6	21378	21383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150098
284	NC_021013	GGA	2	6	21484	21489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479150098
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287	NC_021013	TTC	2	6	21696	21701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150098
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291	NC_021013	GAT	2	6	21914	21919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150098
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293	NC_021013	ACA	2	6	22187	22192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150098
294	NC_021013	CAA	2	6	22265	22270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
295	NC_021013	ATA	2	6	22416	22421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150099
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301	NC_021013	TAT	2	6	22964	22969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150099
302	NC_021013	TTC	2	6	22977	22982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150099
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307	NC_021013	TCC	2	6	23217	23222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
308	NC_021013	TGT	2	6	23390	23395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150100
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336	NC_021013	TAA	3	9	25240	25248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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376	NC_021013	GAA	2	6	28189	28194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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379	NC_021013	GAA	2	6	28504	28509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
380	NC_021013	GAG	2	6	28540	28545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
381	NC_021013	CAG	2	6	28606	28611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
382	NC_021013	GAG	2	6	28612	28617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
383	NC_021013	GAA	2	6	28633	28638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
384	NC_021013	GAG	2	6	28675	28680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
385	NC_021013	TTG	2	6	28711	28716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
386	NC_021013	TAA	2	6	28719	28724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
387	NC_021013	ATA	2	6	28729	28734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
388	NC_021013	TGT	2	6	28747	28752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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390	NC_021013	GAG	2	6	29017	29022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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