MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Ruminococcus bromii L2-63 draft genome

Total Repeats: 7188

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021013	AGT	2	6	7	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021013	ACT	2	6	19	24	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021013	ATT	2	6	196	201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021013	AGG	2	6	321	326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021013	AAT	2	6	1099	1104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021013	TAA	2	6	1270	1275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021013	ATT	2	6	1304	1309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021013	AAC	2	6	2370	2375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_021013	CCT	2	6	6328	6333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_021013	AAT	2	6	9256	9261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021013	AAT	2	6	9318	9323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021013	GCG	2	6	9439	9444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_021013	TGT	2	6	9505	9510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021013	AAT	2	6	9513	9518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021013	CGC	2	6	9564	9569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_021013	ATA	2	6	9592	9597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021013	TCA	2	6	9626	9631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_021013	ATT	2	6	11776	11781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021013	ATA	3	9	13847	13855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021013	AAG	2	6	13864	13869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021013	GGC	2	6	14016	14021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_021013	TAA	2	6	14043	14048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021013	CTG	2	6	16259	16264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_021013	GAT	2	6	16308	16313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021013	GAT	2	6	16395	16400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021013	GAT	2	6	16530	16535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021013	ACA	3	9	16599	16607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_021013	ACC	2	6	16660	16665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_021013	ACA	2	6	16716	16721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_021013	ATG	2	6	16750	16755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021013	GCC	2	6	16764	16769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_021013	AGA	2	6	16838	16843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021013	AAC	2	6	16851	16856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_021013	ATG	2	6	16903	16908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021013	CAA	2	6	16997	17002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_021013	AAC	2	6	17033	17038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_021013	GCG	2	6	17077	17082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_021013	AAT	2	6	17127	17132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021013	ATT	2	6	17146	17151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021013	GAT	2	6	17334	17339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021013	TGC	2	6	17360	17365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_021013	TTG	3	9	17392	17400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021013	TGA	2	6	17588	17593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021013	CAG	2	6	17609	17614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_021013	ATA	2	6	19374	19379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021013	ATA	2	6	20175	20180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021013	AAT	2	6	20203	20208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021013	TAA	2	6	20287	20292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021013	CAA	2	6	22265	22270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_021013	TCC	2	6	23217	23222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_021013	CAG	2	6	25031	25036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_021013	GTT	2	6	25062	25067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021013	CAA	2	6	25150	25155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_021013	TTG	2	6	25213	25218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021013	TAA	3	9	25240	25248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021013	GGA	2	6	25404	25409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021013	TGT	2	6	26311	26316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021013	AAT	2	6	26351	26356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021013	TTA	2	6	26392	26397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021013	TTG	2	6	26427	26432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021013	TTG	2	6	26472	26477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021013	TAA	2	6	26529	26534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021013	GAA	2	6	26824	26829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021013	CAA	2	6	26973	26978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_021013	GCT	2	6	27003	27008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_021013	ACA	2	6	27071	27076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_021013	TTG	2	6	27098	27103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021013	GCG	2	6	27233	27238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_021013	CTC	2	6	27292	27297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_021013	ACC	2	6	27314	27319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_021013	ATC	2	6	27382	27387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_021013	CAA	2	6	27420	27425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_021013	TTG	2	6	27566	27571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021013	TTG	2	6	27656	27661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021013	ACA	2	6	27761	27766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_021013	TCA	2	6	27818	27823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_021013	CGG	2	6	27825	27830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_021013	AAC	2	6	27846	27851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_021013	GCA	2	6	27942	27947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_021013	TGA	2	6	27975	27980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021013	CTC	2	6	28147	28152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_021013	ACC	2	6	28166	28171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_021013	CAT	2	6	28178	28183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_021013	GAA	2	6	28189	28194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021013	ATT	2	6	28328	28333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021013	GAA	2	6	28444	28449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021013	GAA	2	6	28504	28509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021013	GAG	2	6	28540	28545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021013	CAG	2	6	28606	28611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_021013	GAG	2	6	28612	28617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021013	GAA	2	6	28633	28638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021013	GAG	2	6	28675	28680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021013	TTG	2	6	28711	28716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021013	TAA	2	6	28719	28724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021013	ATA	2	6	28729	28734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021013	TGT	2	6	28747	28752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021013	CAG	2	6	28754	28759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_021013	GAG	2	6	29017	29022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021013	CAA	2	6	29054	29059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_021013	AGT	2	6	29103	29108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021013	GAG	2	6	29219	29224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021013	CAA	2	6	29256	29261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_021013	TTG	2	6	29474	29479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021013	GAT	2	6	29531	29536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021013	ATA	2	6	29537	29542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021013	ATG	2	6	29626	29631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021013	AGC	2	6	29720	29725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_021013	CAG	2	6	29737	29742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_021013	TCT	2	6	29897	29902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_021013	CCA	2	6	29904	29909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_021013	CAG	2	6	29962	29967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_021013	GCA	2	6	30210	30215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_021013	CTG	2	6	30235	30240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_021013	ATT	2	6	30278	30283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021013	GTT	2	6	30320	30325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021013	TGG	2	6	30364	30369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021013	ACC	2	6	32915	32920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_021013	GCC	2	6	33173	33178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_021013	GAA	2	6	33666	33671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021013	TAT	2	6	33672	33677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021013	ACC	2	6	33697	33702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_021013	CAG	2	6	33781	33786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_021013	GCC	2	6	33833	33838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_021013	CAC	2	6	33961	33966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_021013	TCA	2	6	34025	34030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_021013	CAA	2	6	34699	34704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_021013	CTG	2	6	34865	34870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_021013	AGC	2	6	34880	34885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_021013	ATG	2	6	34886	34891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021013	GCC	2	6	34976	34981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_021013	TAG	2	6	36696	36701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021013	TGT	2	6	36726	36731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021013	TAC	2	6	36735	36740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_021013	TAG	2	6	36750	36755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021013	TGA	2	6	37411	37416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021013	TCT	2	6	37500	37505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_021013	CCT	2	6	39501	39506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_021013	GGT	2	6	39730	39735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021013	CCT	2	6	41916	41921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_021013	CCT	2	6	43144	43149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_021013	CCT	2	6	45493	45498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_021013	TGC	2	6	45499	45504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_021013	GTC	2	6	45570	45575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_021013	ATA	2	6	45617	45622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021013	GAA	2	6	45799	45804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021013	CGC	2	6	45823	45828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_021013	CAT	2	6	45946	45951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_021013	ACA	2	6	45959	45964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_021013	CCG	3	9	46044	46052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
150	NC_021013	GAA	2	6	46076	46081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_021013	TAA	2	6	46287	46292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_021013	CTG	2	6	46387	46392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_021013	CAT	2	6	46459	46464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_021013	CAA	2	6	46581	46586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_021013	GCC	2	6	46660	46665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
156	NC_021013	CCT	2	6	46822	46827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
157	NC_021013	TGT	2	6	46868	46873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
158	NC_021013	ATA	2	6	46874	46879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_021013	GCT	2	6	47652	47657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_021013	TCC	2	6	48028	48033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
161	NC_021013	GTC	2	6	53606	53611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_021013	CGC	2	6	53737	53742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
163	NC_021013	ATC	3	9	53750	53758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_021013	CAT	2	6	53872	53877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_021013	ACA	2	6	54018	54023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
166	NC_021013	ATC	2	6	54058	54063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
167	NC_021013	GGC	2	6	54319	54324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
168	NC_021013	TGC	2	6	54414	54419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
169	NC_021013	GCA	2	6	54437	54442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
170	NC_021013	GGC	2	6	54602	54607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
171	NC_021013	GGC	2	6	54647	54652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
172	NC_021013	TGA	2	6	54720	54725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
173	NC_021013	GCC	2	6	54745	54750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
174	NC_021013	ACC	2	6	54762	54767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
175	NC_021013	ATT	2	6	56096	56101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_021013	CAA	2	6	56133	56138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
177	NC_021013	TAT	2	6	57417	57422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_021013	GCC	2	6	57494	57499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
179	NC_021013	TAT	2	6	57871	57876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
180	NC_021013	AAG	2	6	59814	59819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_021013	CCT	2	6	61238	61243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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190	NC_021013	TCA	2	6	63952	63957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
191	NC_021013	TTC	2	6	63974	63979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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275	NC_021013	CCG	2	6	80777	80782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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452	NC_021013	GGA	2	6	166435	166440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
453	NC_021013	GGA	2	6	168165	168170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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