MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Roseburia intestinalis XB6B4 draft genome

Total Repeats: 11125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021012	GAAG	2	8	35	42	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021012	AGAA	2	8	568	575	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021012	TTGG	2	8	880	887	0 %	50 %	50 %	0 %	479146201
4	NC_021012	GTAT	2	8	917	924	25 %	50 %	25 %	0 %	479146201
5	NC_021012	CAAT	2	8	953	960	50 %	25 %	0 %	25 %	479146201
6	NC_021012	GTAA	2	8	982	989	50 %	25 %	25 %	0 %	479146201
7	NC_021012	TCAG	2	8	1026	1033	25 %	25 %	25 %	25 %	479146201
8	NC_021012	CAGG	2	8	1126	1133	25 %	0 %	50 %	25 %	479146201
9	NC_021012	ATCA	2	8	2185	2192	50 %	25 %	0 %	25 %	479146201
10	NC_021012	CAGA	2	8	2551	2558	50 %	0 %	25 %	25 %	479146201
11	NC_021012	ATGC	2	8	2601	2608	25 %	25 %	25 %	25 %	479146201
12	NC_021012	GCAG	2	8	2652	2659	25 %	0 %	50 %	25 %	479146201
13	NC_021012	ATTT	2	8	3573	3580	25 %	75 %	0 %	0 %	479146203
14	NC_021012	AGAC	2	8	3821	3828	50 %	0 %	25 %	25 %	479146203
15	NC_021012	AGCA	2	8	3925	3932	50 %	0 %	25 %	25 %	479146203
16	NC_021012	CAGG	2	8	4069	4076	25 %	0 %	50 %	25 %	479146203
17	NC_021012	AAGA	2	8	4305	4312	75 %	0 %	25 %	0 %	479146203
18	NC_021012	TACA	2	8	4389	4396	50 %	25 %	0 %	25 %	479146203
19	NC_021012	CTTT	2	8	4583	4590	0 %	75 %	0 %	25 %	479146204
20	NC_021012	TTTC	2	8	5426	5433	0 %	75 %	0 %	25 %	479146206
21	NC_021012	GACG	2	8	5593	5600	25 %	0 %	50 %	25 %	479146206
22	NC_021012	GGCG	2	8	6632	6639	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
23	NC_021012	GAAA	2	8	6997	7004	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021012	CCTG	2	8	7027	7034	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_021012	CCGT	2	8	7278	7285	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_021012	TCCC	2	8	7425	7432	0 %	25 %	0 %	75 %	479146208
27	NC_021012	ACCG	2	8	7459	7466	25 %	0 %	25 %	50 %	479146208
28	NC_021012	TCTG	2	8	7597	7604	0 %	50 %	25 %	25 %	479146208
29	NC_021012	GATA	2	8	7830	7837	50 %	25 %	25 %	0 %	479146209
30	NC_021012	CAGG	2	8	8436	8443	25 %	0 %	50 %	25 %	479146210
31	NC_021012	GGCA	2	8	8630	8637	25 %	0 %	50 %	25 %	479146210
32	NC_021012	TCCG	2	8	8668	8675	0 %	25 %	25 %	50 %	479146210
33	NC_021012	AAGC	2	8	9042	9049	50 %	0 %	25 %	25 %	479146211
34	NC_021012	GAAA	2	8	9132	9139	75 %	0 %	25 %	0 %	479146211
35	NC_021012	CAGC	2	8	9946	9953	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_021012	TACA	2	8	10541	10548	50 %	25 %	0 %	25 %	479146212
37	NC_021012	GGCT	2	8	10867	10874	0 %	25 %	50 %	25 %	479146213
38	NC_021012	GATT	2	8	10915	10922	25 %	50 %	25 %	0 %	479146213
39	NC_021012	CAGC	2	8	11513	11520	25 %	0 %	25 %	50 %	479146213
40	NC_021012	CAGA	2	8	11549	11556	50 %	0 %	25 %	25 %	479146213
41	NC_021012	CTGA	2	8	11995	12002	25 %	25 %	25 %	25 %	479146214
42	NC_021012	TCCG	2	8	12016	12023	0 %	25 %	25 %	50 %	479146214
43	NC_021012	CGTC	2	8	12300	12307	0 %	25 %	25 %	50 %	479146214
44	NC_021012	GGTC	2	8	12384	12391	0 %	25 %	50 %	25 %	479146214
45	NC_021012	CCAT	2	8	12467	12474	25 %	25 %	0 %	50 %	479146214
46	NC_021012	GCAA	2	8	12800	12807	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_021012	GAAG	2	8	12823	12830	50 %	0 %	50 %	0 %	479146215
48	NC_021012	CCTG	2	8	13806	13813	0 %	25 %	25 %	50 %	479146216
49	NC_021012	GCAG	2	8	14479	14486	25 %	0 %	50 %	25 %	479146216
50	NC_021012	TCCA	2	8	14518	14525	25 %	25 %	0 %	50 %	479146216
51	NC_021012	GATG	2	8	14787	14794	25 %	25 %	50 %	0 %	479146216
52	NC_021012	CGGA	2	8	15131	15138	25 %	0 %	50 %	25 %	479146216
53	NC_021012	GCAG	2	8	15184	15191	25 %	0 %	50 %	25 %	479146216
54	NC_021012	TGAT	2	8	15361	15368	25 %	50 %	25 %	0 %	479146217
55	NC_021012	CTGG	2	8	15779	15786	0 %	25 %	50 %	25 %	479146218
56	NC_021012	TCAA	2	8	15930	15937	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_021012	ATTT	2	8	15945	15952	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021012	GAAA	2	8	16389	16396	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021012	TTTC	2	8	16564	16571	0 %	75 %	0 %	25 %	479146219
60	NC_021012	ACGG	2	8	16702	16709	25 %	0 %	50 %	25 %	479146219
61	NC_021012	ATCA	2	8	16732	16739	50 %	25 %	0 %	25 %	479146219
62	NC_021012	CCCG	2	8	17247	17254	0 %	0 %	25 %	75 %	479146219
63	NC_021012	TACC	2	8	17475	17482	25 %	25 %	0 %	50 %	479146219
64	NC_021012	ATCA	2	8	19128	19135	50 %	25 %	0 %	25 %	479146220
65	NC_021012	GCTG	2	8	19664	19671	0 %	25 %	50 %	25 %	479146220
66	NC_021012	CCTG	2	8	19697	19704	0 %	25 %	25 %	50 %	479146220
67	NC_021012	CTGT	2	8	20037	20044	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_021012	ACAG	2	8	20056	20063	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_021012	ATGA	2	8	20845	20852	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021012	GGAG	2	8	21435	21442	25 %	0 %	75 %	0 %	479146221
71	NC_021012	GACA	2	8	21572	21579	50 %	0 %	25 %	25 %	479146221
72	NC_021012	AGAA	2	8	21635	21642	75 %	0 %	25 %	0 %	479146221
73	NC_021012	ATGT	2	8	21796	21803	25 %	50 %	25 %	0 %	479146221
74	NC_021012	GCAG	2	8	21858	21865	25 %	0 %	50 %	25 %	479146221
75	NC_021012	GGAT	2	8	22105	22112	25 %	25 %	50 %	0 %	479146221
76	NC_021012	AATG	2	8	22414	22421	50 %	25 %	25 %	0 %	479146221
77	NC_021012	ATTT	2	8	23344	23351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021012	CTGA	2	8	23461	23468	25 %	25 %	25 %	25 %	479146222
79	NC_021012	TCAG	2	8	24066	24073	25 %	25 %	25 %	25 %	479146222
80	NC_021012	TTTG	2	8	24584	24591	0 %	75 %	25 %	0 %	479146223
81	NC_021012	GGAA	2	8	24699	24706	50 %	0 %	50 %	0 %	479146223
82	NC_021012	GGAT	2	8	25271	25278	25 %	25 %	50 %	0 %	479146223
83	NC_021012	TGCC	2	8	25324	25331	0 %	25 %	25 %	50 %	479146223
84	NC_021012	ATGT	2	8	27163	27170	25 %	50 %	25 %	0 %	479146226
85	NC_021012	CAGC	2	8	28158	28165	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_021012	CGGA	2	8	28632	28639	25 %	0 %	50 %	25 %	479146227
87	NC_021012	CAGG	2	8	29449	29456	25 %	0 %	50 %	25 %	479146229
88	NC_021012	GAAA	2	8	29619	29626	75 %	0 %	25 %	0 %	479146229
89	NC_021012	GCTG	2	8	30335	30342	0 %	25 %	50 %	25 %	479146230
90	NC_021012	TGGA	2	8	30437	30444	25 %	25 %	50 %	0 %	479146230
91	NC_021012	TGCT	2	8	30676	30683	0 %	50 %	25 %	25 %	479146230
92	NC_021012	AATG	2	8	30804	30811	50 %	25 %	25 %	0 %	479146231
93	NC_021012	ATGA	2	8	31090	31097	50 %	25 %	25 %	0 %	479146232
94	NC_021012	GATC	2	8	31206	31213	25 %	25 %	25 %	25 %	479146232
95	NC_021012	TTTC	2	8	31231	31238	0 %	75 %	0 %	25 %	479146232
96	NC_021012	CAGG	2	8	31657	31664	25 %	0 %	50 %	25 %	479146232
97	NC_021012	GGAA	2	8	31840	31847	50 %	0 %	50 %	0 %	479146233
98	NC_021012	GGAT	2	8	31863	31870	25 %	25 %	50 %	0 %	479146233
99	NC_021012	TTTA	2	8	31882	31889	25 %	75 %	0 %	0 %	479146233
100	NC_021012	GATG	2	8	32518	32525	25 %	25 %	50 %	0 %	479146233
101	NC_021012	ACCG	2	8	33118	33125	25 %	0 %	25 %	50 %	479146234
102	NC_021012	TTTC	2	8	33231	33238	0 %	75 %	0 %	25 %	479146234
103	NC_021012	GACC	2	8	33474	33481	25 %	0 %	25 %	50 %	479146234
104	NC_021012	CCGT	2	8	33721	33728	0 %	25 %	25 %	50 %	479146234
105	NC_021012	AGAC	2	8	33844	33851	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_021012	TTAC	2	8	34004	34011	25 %	50 %	0 %	25 %	479146235
107	NC_021012	TGCA	2	8	35429	35436	25 %	25 %	25 %	25 %	479146236
108	NC_021012	GAGG	2	8	35630	35637	25 %	0 %	75 %	0 %	479146236
109	NC_021012	TTCA	2	8	35723	35730	25 %	50 %	0 %	25 %	479146236
110	NC_021012	GACA	2	8	36684	36691	50 %	0 %	25 %	25 %	479146237
111	NC_021012	AGGT	2	8	37785	37792	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021012	GGCG	2	8	37975	37982	0 %	0 %	75 %	25 %	479146238
113	NC_021012	AATG	2	8	38275	38282	50 %	25 %	25 %	0 %	479146238
114	NC_021012	CTTT	2	8	38592	38599	0 %	75 %	0 %	25 %	479146238
115	NC_021012	GGGA	2	8	38945	38952	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021012	AAAG	2	8	38981	38988	75 %	0 %	25 %	0 %	479146239
117	NC_021012	GTTT	2	8	39208	39215	0 %	75 %	25 %	0 %	479146239
118	NC_021012	CAGG	2	8	40047	40054	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_021012	TCAA	2	8	40113	40120	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_021012	GAGT	2	8	40512	40519	25 %	25 %	50 %	0 %	479146240
121	NC_021012	AAAG	2	8	40954	40961	75 %	0 %	25 %	0 %	479146240
122	NC_021012	GGCA	2	8	41145	41152	25 %	0 %	50 %	25 %	479146241
123	NC_021012	TTAT	2	8	41354	41361	25 %	75 %	0 %	0 %	479146241
124	NC_021012	ATGG	2	8	41846	41853	25 %	25 %	50 %	0 %	479146241
125	NC_021012	TAAA	2	8	42132	42139	75 %	25 %	0 %	0 %	479146241
126	NC_021012	TTTA	2	8	42364	42371	25 %	75 %	0 %	0 %	479146242
127	NC_021012	GATG	2	8	43616	43623	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021012	CAGA	2	8	44150	44157	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_021012	TCTT	2	8	44305	44312	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_021012	GCAT	2	8	45157	45164	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_021012	ATCC	2	8	45288	45295	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_021012	ATCT	2	8	45596	45603	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_021012	AATG	2	8	45795	45802	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021012	TACA	2	8	46282	46289	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_021012	AAAG	2	8	46417	46424	75 %	0 %	25 %	0 %	479146243
136	NC_021012	CAGC	2	8	46455	46462	25 %	0 %	25 %	50 %	479146243
137	NC_021012	TCAG	2	8	46561	46568	25 %	25 %	25 %	25 %	479146243
138	NC_021012	ATGG	2	8	47216	47223	25 %	25 %	50 %	0 %	479146243
139	NC_021012	ATGG	2	8	47303	47310	25 %	25 %	50 %	0 %	479146243
140	NC_021012	ACAG	2	8	47421	47428	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_021012	ACAA	2	8	47431	47438	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_021012	ATAA	2	8	47513	47520	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021012	ATCA	2	8	48499	48506	50 %	25 %	0 %	25 %	479146245
144	NC_021012	ATCT	2	8	48781	48788	25 %	50 %	0 %	25 %	479146245
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