MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Roseburia intestinalis XB6B4 draft genome

Total Repeats: 11460

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021012	GAA	2	6	24	29	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021012	ATC	2	6	91	96	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021012	GAA	2	6	133	138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021012	CGT	2	6	210	215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_021012	GAT	2	6	345	350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021012	CGG	2	6	393	398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_021012	ATC	2	6	486	491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_021012	TGT	2	6	552	557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021012	ATT	2	6	662	667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021012	GCA	2	6	679	684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_021012	GAT	2	6	2990	2995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021012	GTA	2	6	4719	4724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021012	GGC	2	6	4755	4760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_021012	CCT	2	6	5154	5159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_021012	GTT	2	6	5177	5182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021012	GCG	2	6	5191	5196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_021012	CAG	2	6	5211	5216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_021012	CGG	2	6	5998	6003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_021012	TCA	2	6	6265	6270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_021012	GTT	2	6	6366	6371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021012	GTT	2	6	6396	6401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021012	GTT	2	6	6432	6437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021012	GCC	2	6	6439	6444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_021012	TCT	2	6	6500	6505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_021012	ATC	2	6	6519	6524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_021012	CAG	2	6	6533	6538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_021012	CGG	2	6	6568	6573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_021012	TGC	2	6	6584	6589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_021012	AAG	2	6	6762	6767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021012	TGC	2	6	6821	6826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_021012	CGC	2	6	6887	6892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_021012	ATC	2	6	6907	6912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_021012	TCC	2	6	6976	6981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_021012	CGG	2	6	7143	7148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_021012	GCC	2	6	7165	7170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_021012	GCG	2	6	7219	7224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_021012	CAG	3	9	7257	7265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_021012	GCC	2	6	7351	7356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_021012	CTT	2	6	7407	7412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_021012	TCC	2	6	7908	7913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_021012	AGG	2	6	8020	8025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021012	AGC	2	6	8912	8917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_021012	GCC	2	6	8926	8931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_021012	CCG	3	9	9014	9022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_021012	GGA	2	6	9186	9191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021012	CTT	2	6	9272	9277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_021012	CAC	2	6	9282	9287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_021012	TGC	2	6	9394	9399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_021012	CTG	2	6	9477	9482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_021012	GCT	2	6	9650	9655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_021012	GCA	2	6	9676	9681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_021012	GAA	2	6	9720	9725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021012	AGC	2	6	9817	9822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_021012	GCT	2	6	10001	10006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_021012	GCC	2	6	10073	10078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_021012	CTG	2	6	12720	12725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_021012	GGA	2	6	13241	13246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021012	TTA	2	6	15969	15974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021012	GAA	2	6	16023	16028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021012	GGC	2	6	16124	16129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_021012	CGG	2	6	16142	16147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_021012	CTA	2	6	16151	16156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_021012	CCA	2	6	16165	16170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_021012	ATG	2	6	16269	16274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021012	ATC	2	6	16276	16281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_021012	AAT	2	6	16404	16409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021012	GAG	2	6	16477	16482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021012	AGA	2	6	16495	16500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021012	AGG	2	6	16508	16513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021012	AGT	2	6	20260	20265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021012	CAA	2	6	20373	20378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_021012	GCG	2	6	20424	20429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_021012	GAG	2	6	20773	20778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021012	ATC	2	6	20785	20790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_021012	AGT	2	6	20923	20928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021012	TCA	2	6	23297	23302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_021012	GTT	2	6	23401	23406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021012	TCC	2	6	25520	25525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_021012	ACC	2	6	25588	25593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_021012	ACA	2	6	25638	25643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_021012	CTA	2	6	25680	25685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_021012	CTT	2	6	25797	25802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_021012	TGT	2	6	25814	25819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021012	AGA	2	6	26039	26044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021012	AAC	2	6	26045	26050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_021012	CGG	2	6	26073	26078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_021012	ATA	2	6	28116	28121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021012	AAT	2	6	28125	28130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021012	TAA	2	6	28192	28197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021012	GAT	2	6	29985	29990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021012	GAA	2	6	30005	30010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021012	ACA	2	6	30031	30036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_021012	TGA	2	6	30074	30079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021012	GCA	2	6	32587	32592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_021012	AGT	2	6	32601	32606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021012	GGC	2	6	39870	39875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_021012	CAA	2	6	40145	40150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_021012	GTA	2	6	43690	43695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021012	GCA	2	6	43770	43775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_021012	TGA	2	6	43826	43831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021012	ACA	2	6	43974	43979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_021012	ACT	2	6	44020	44025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_021012	AAG	2	6	44055	44060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021012	GGA	2	6	44180	44185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021012	GGA	2	6	44262	44267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021012	GCG	2	6	44437	44442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_021012	ATT	2	6	44579	44584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021012	AGG	2	6	44588	44593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021012	GTT	2	6	44674	44679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021012	GCA	2	6	44723	44728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_021012	TGG	2	6	44783	44788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021012	ATC	2	6	44860	44865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_021012	ATG	2	6	44900	44905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021012	GCA	2	6	45147	45152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_021012	GAA	2	6	45196	45201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021012	AAG	2	6	45260	45265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021012	TGC	2	6	45351	45356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_021012	GTT	2	6	45373	45378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021012	TGA	2	6	45405	45410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021012	ATA	2	6	45416	45421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021012	ATT	2	6	45460	45465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021012	GAG	2	6	45631	45636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021012	CAG	2	6	45638	45643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_021012	AGC	2	6	45668	45673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_021012	TCT	2	6	45693	45698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_021012	TCA	2	6	45818	45823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_021012	ATC	2	6	45871	45876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_021012	CTG	2	6	45885	45890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_021012	ACA	2	6	46042	46047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_021012	GCA	2	6	46063	46068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_021012	ATT	2	6	46166	46171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021012	CAG	2	6	46234	46239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_021012	ATT	2	6	46275	46280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021012	CAG	2	6	46365	46370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_021012	TTA	2	6	47457	47462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021012	AGT	2	6	48419	48424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021012	AAG	2	6	48450	48455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021012	GAG	2	6	54891	54896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021012	TTA	2	6	58242	58247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021012	ATG	2	6	58281	58286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021012	AGT	2	6	58371	58376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021012	TGG	2	6	58416	58421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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173	NC_021012	TAT	2	6	63677	63682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_021012	GCT	2	6	99420	99425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
282	NC_021012	TGT	2	6	99489	99494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
283	NC_021012	TGG	2	6	99498	99503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
284	NC_021012	TTC	2	6	99509	99514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
285	NC_021012	CTG	2	6	99535	99540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
286	NC_021012	TTA	2	6	99546	99551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
287	NC_021012	ATT	2	6	99604	99609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_021012	GAA	2	6	99676	99681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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292	NC_021012	TTG	2	6	99773	99778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
293	NC_021012	TGC	2	6	99852	99857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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312	NC_021012	AAG	2	6	111737	111742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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410	NC_021012	CAT	2	6	166979	166984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
411	NC_021012	CTC	2	6	166997	167002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
412	NC_021012	AGC	2	6	167052	167057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
413	NC_021012	GCA	2	6	167064	167069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
414	NC_021012	CAG	2	6	167102	167107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
415	NC_021012	TCC	3	9	167208	167216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
416	NC_021012	ATC	2	6	167270	167275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
417	NC_021012	CCT	2	6	167705	167710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
418	NC_021012	TAC	2	6	167732	167737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
419	NC_021012	CAG	2	6	167755	167760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
420	NC_021012	ATT	2	6	167764	167769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
421	NC_021012	TTC	2	6	167815	167820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
422	NC_021012	CCT	2	6	167877	167882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
423	NC_021012	AAT	2	6	168087	168092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
424	NC_021012	TTC	3	9	168109	168117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
425	NC_021012	CTC	2	6	168196	168201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
426	NC_021012	CAT	2	6	168214	168219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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429	NC_021012	CAG	2	6	169979	169984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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432	NC_021012	CCT	2	6	170050	170055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
433	NC_021012	TGA	2	6	170092	170097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
434	NC_021012	AAT	2	6	170116	170121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
435	NC_021012	CGG	2	6	170183	170188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
436	NC_021012	TAA	2	6	170207	170212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
437	NC_021012	CCT	2	6	170368	170373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
438	NC_021012	CCG	2	6	170614	170619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
439	NC_021012	ATC	2	6	170703	170708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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441	NC_021012	CAT	2	6	170789	170794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
442	NC_021012	CTT	2	6	170920	170925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
443	NC_021012	AAT	2	6	170965	170970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
444	NC_021012	CGG	2	6	171103	171108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
445	NC_021012	TGC	2	6	176793	176798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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447	NC_021012	AGG	2	6	179378	179383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
448	NC_021012	CTC	2	6	181536	181541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
449	NC_021012	GTT	2	6	181557	181562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
450	NC_021012	ATT	2	6	182143	182148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
451	NC_021012	GCG	2	6	182348	182353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
452	NC_021012	CAA	2	6	182466	182471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
453	NC_021012	TAC	2	6	182526	182531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
454	NC_021012	ACC	2	6	183949	183954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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456	NC_021012	CAT	2	6	184005	184010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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459	NC_021012	CTC	2	6	184889	184894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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463	NC_021012	CTG	2	6	185135	185140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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465	NC_021012	AGC	2	6	185192	185197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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472	NC_021012	CTT	2	6	185789	185794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
473	NC_021012	TCT	2	6	185796	185801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
474	NC_021012	CCT	2	6	185855	185860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
475	NC_021012	CCT	2	6	186488	186493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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499	NC_021012	ACC	2	6	192711	192716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
500	NC_021012	GAT	2	6	192720	192725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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