MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Roseburia intestinalis XB6B4 draft genome

Total Repeats: 42009

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021012	CAG	2	6	805	810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146201
2	NC_021012	TTA	2	6	1091	1096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146201
3	NC_021012	GAC	2	6	1353	1358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146201
4	NC_021012	CAG	2	6	1411	1416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146201
5	NC_021012	TAT	2	6	1449	1454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146201
6	NC_021012	ATT	2	6	1483	1488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146201
7	NC_021012	TAA	2	6	1563	1568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479146201
8	NC_021012	CAG	2	6	1579	1584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146201
9	NC_021012	AAG	2	6	1592	1597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146201
10	NC_021012	TGC	2	6	1653	1658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146201
11	NC_021012	GAT	2	6	1702	1707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146201
12	NC_021012	GTT	2	6	1747	1752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479146201
13	NC_021012	TAT	2	6	1767	1772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146201
14	NC_021012	ACA	2	6	1846	1851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479146201
15	NC_021012	ATG	2	6	1871	1876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146201
16	NC_021012	TAA	2	6	1881	1886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479146201
17	NC_021012	TAA	4	12	1914	1925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479146201
18	NC_021012	ATT	2	6	2012	2017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146201
19	NC_021012	TGA	2	6	2040	2045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146201
20	NC_021012	ATG	2	6	2051	2056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146201
21	NC_021012	GAA	2	6	2116	2121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146201
22	NC_021012	CAG	2	6	2133	2138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146201
23	NC_021012	CAA	2	6	2228	2233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479146201
24	NC_021012	ACA	2	6	2236	2241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479146201
25	NC_021012	GAG	2	6	2272	2277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146201
26	NC_021012	AGT	2	6	2571	2576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146201
27	NC_021012	TGA	2	6	2586	2591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146201
28	NC_021012	GCA	2	6	2683	2688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146201
29	NC_021012	ATT	2	6	2707	2712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146201
30	NC_021012	CAG	2	6	2720	2725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146201
31	NC_021012	TGC	2	6	2751	2756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146201
32	NC_021012	ATA	2	6	2810	2815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479146201
33	NC_021012	AAT	2	6	2855	2860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479146201
34	NC_021012	GTG	2	6	3174	3179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146202
35	NC_021012	AAG	2	6	3192	3197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146202
36	NC_021012	AGT	2	6	3218	3223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146202
37	NC_021012	CGT	2	6	3358	3363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146202
38	NC_021012	CTT	2	6	3386	3391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479146202
39	NC_021012	GGA	2	6	3500	3505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146203
40	NC_021012	AAG	2	6	3520	3525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146203
41	NC_021012	CAT	2	6	3561	3566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146203
42	NC_021012	CAT	2	6	3616	3621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146203
43	NC_021012	TCC	2	6	3632	3637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479146203
44	NC_021012	GAA	2	6	3669	3674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146203
45	NC_021012	AAG	2	6	3961	3966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146203
46	NC_021012	TTG	2	6	3971	3976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479146203
47	NC_021012	AGA	2	6	4031	4036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146203
48	NC_021012	GAT	2	6	4156	4161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146203
49	NC_021012	TCA	2	6	4274	4279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146203
50	NC_021012	GGC	2	6	4427	4432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146203
51	NC_021012	AGA	2	6	4436	4441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146203
52	NC_021012	GGC	2	6	4645	4650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146204
53	NC_021012	GCA	2	6	4661	4666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146204
54	NC_021012	CGC	2	6	4685	4690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479146204
55	NC_021012	CGC	2	6	5023	5028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479146205
56	NC_021012	TAG	2	6	5034	5039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146205
57	NC_021012	GCT	2	6	5059	5064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146205
58	NC_021012	TGC	2	6	5070	5075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146205
59	NC_021012	GCT	3	9	5086	5094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146205
60	NC_021012	ACC	2	6	5568	5573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479146206
61	NC_021012	TCA	2	6	5635	5640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146206
62	NC_021012	GCA	2	6	5760	5765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146207
63	NC_021012	GCA	2	6	5832	5837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146207
64	NC_021012	CGG	2	6	7628	7633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146208
65	NC_021012	GGC	2	6	7674	7679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146209
66	NC_021012	CGC	2	6	7736	7741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479146209
67	NC_021012	GTC	2	6	7761	7766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146209
68	NC_021012	CTG	2	6	8059	8064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146210
69	NC_021012	ACT	2	6	8072	8077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146210
70	NC_021012	CGG	2	6	8115	8120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146210
71	NC_021012	AGA	2	6	8195	8200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146210
72	NC_021012	TCG	2	6	8201	8206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146210
73	NC_021012	CCG	2	6	8296	8301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479146210
74	NC_021012	GCT	2	6	8317	8322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146210
75	NC_021012	TCT	2	6	8348	8353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479146210
76	NC_021012	GGA	2	6	8355	8360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146210
77	NC_021012	GCC	2	6	8395	8400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479146210
78	NC_021012	GCT	2	6	8409	8414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146210
79	NC_021012	ATC	2	6	8461	8466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146210
80	NC_021012	GGA	2	6	8475	8480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146210
81	NC_021012	CCA	2	6	8489	8494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479146210
82	NC_021012	CGC	2	6	8690	8695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479146210
83	NC_021012	GGC	2	6	9085	9090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146211
84	NC_021012	GCC	2	6	9094	9099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479146211
85	NC_021012	GGC	2	6	9111	9116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146211
86	NC_021012	CTG	2	6	9118	9123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146211
87	NC_021012	CTG	2	6	10247	10252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146212
88	NC_021012	CGA	2	6	10305	10310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146212
89	NC_021012	CCG	2	6	10395	10400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479146212
90	NC_021012	TGG	2	6	10416	10421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146212
91	NC_021012	ACG	2	6	10425	10430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146212
92	NC_021012	CTG	2	6	10568	10573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146212
93	NC_021012	CCG	2	6	10674	10679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479146213
94	NC_021012	GGA	2	6	10736	10741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146213
95	NC_021012	CAG	2	6	10889	10894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146213
96	NC_021012	GCC	2	6	11019	11024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479146213
97	NC_021012	CTT	2	6	11107	11112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479146213
98	NC_021012	GCG	2	6	11121	11126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146213
99	NC_021012	TGC	4	12	11202	11213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146213
100	NC_021012	AGC	2	6	11220	11225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146213
101	NC_021012	CTG	2	6	11234	11239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146213
102	NC_021012	AGA	2	6	11274	11279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146213
103	NC_021012	GAA	2	6	11291	11296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146213
104	NC_021012	GCA	2	6	11416	11421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146213
105	NC_021012	TCC	2	6	11467	11472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479146213
106	NC_021012	ATA	2	6	11492	11497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479146213
107	NC_021012	GGC	2	6	11504	11509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146213
108	NC_021012	GCG	2	6	11598	11603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146213
109	NC_021012	CGG	2	6	11782	11787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146213
110	NC_021012	AGC	2	6	11793	11798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146213
111	NC_021012	AGC	2	6	11802	11807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146213
112	NC_021012	GCT	2	6	11839	11844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146213
113	NC_021012	AGC	2	6	11874	11879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146213
114	NC_021012	CAC	2	6	11891	11896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479146213
115	NC_021012	GCA	2	6	11917	11922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146213
116	NC_021012	GGC	2	6	12034	12039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146214
117	NC_021012	CGT	2	6	12169	12174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146214
118	NC_021012	AGC	2	6	12293	12298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146214
119	NC_021012	CAG	2	6	12409	12414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146214
120	NC_021012	CTT	2	6	12439	12444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479146214
121	NC_021012	GCC	2	6	12446	12451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479146214
122	NC_021012	CGC	2	6	12534	12539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479146214
123	NC_021012	CAG	2	6	12604	12609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146214
124	NC_021012	ATC	2	6	12628	12633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146214
125	NC_021012	GCG	2	6	13040	13045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146215
126	NC_021012	GAT	2	6	13078	13083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146215
127	NC_021012	ATT	2	6	13134	13139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146215
128	NC_021012	TGA	2	6	13143	13148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146215
129	NC_021012	GAA	2	6	13160	13165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146215
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132	NC_021012	GGA	2	6	13641	13646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146216
133	NC_021012	ACG	2	6	13651	13656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146216
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144	NC_021012	GCG	2	6	14213	14218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146216
145	NC_021012	ACC	2	6	14230	14235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479146216
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147	NC_021012	GCG	2	6	14255	14260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146216
148	NC_021012	GCT	2	6	14261	14266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146216
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247	NC_021012	GTT	2	6	25148	25153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479146223
248	NC_021012	TCA	2	6	25243	25248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146223
249	NC_021012	CCG	3	9	25296	25304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479146223
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251	NC_021012	GAA	2	6	26099	26104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146225
252	NC_021012	ATC	2	6	26117	26122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146225
253	NC_021012	ATG	2	6	26135	26140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146225
254	NC_021012	TCA	2	6	26277	26282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146225
255	NC_021012	TGA	2	6	26298	26303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146225
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497	NC_021012	TGC	2	6	48563	48568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146245
498	NC_021012	GCA	2	6	48583	48588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146245
499	NC_021012	TGG	2	6	48617	48622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146245
500	NC_021012	GAT	2	6	48711	48716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146245

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