MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Coprococcus catus GD/7 draft genome

Total Repeats: 298

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021009	TTTCTA	2	12	5895	5906	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_021009	TTTTAT	2	12	40184	40195	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021009	TTTGTC	2	12	44807	44818	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_021009	ATCCCA	2	12	122003	122014	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_021009	AAATTG	2	12	125062	125073	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021009	TCCTAT	2	12	133415	133426	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_021009	AAAGAA	2	12	134835	134846	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021009	GGAAAA	2	12	142310	142321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021009	TCTTTT	2	12	152075	152086	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_021009	ACAAAA	2	12	160263	160274	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_021009	GAAAAA	2	12	167407	167418	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021009	TGAAGA	2	12	168178	168189	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021009	GATTGC	2	12	176878	176889	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_021009	AAGACA	2	12	215518	215529	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_021009	AAAAAT	2	12	266031	266042	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021009	TATAAA	2	12	268149	268160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021009	TAAGGA	2	12	268229	268240	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021009	ATGGCA	2	12	271723	271734	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_021009	GATTTT	2	12	272083	272094	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021009	ACCTAT	2	12	272242	272253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_021009	GATTGA	2	12	283200	283211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021009	CTTTTT	2	12	287718	287729	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_021009	ATAAAA	2	12	296385	296396	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021009	TGCCGG	2	12	306975	306986	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_021009	GTCATT	2	12	307052	307063	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_021009	CTGAAT	2	12	332548	332559	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_021009	AAAAGA	2	12	354314	354325	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021009	GGATAC	2	12	393679	393690	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_021009	GATAAA	2	12	398853	398864	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021009	GAAAAA	2	12	421200	421211	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021009	GAAATG	2	12	430876	430887	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021009	GGAATT	2	12	464908	464919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021009	TCAAAA	2	12	488354	488365	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_021009	AAATGA	2	12	489578	489589	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021009	TTTTTA	2	12	497109	497120	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021009	AAGCAA	2	12	500263	500274	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_021009	ATTTCA	2	12	503673	503684	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_021009	AGGCAA	2	12	523781	523792	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_021009	TTTTAT	2	12	534996	535007	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021009	AAATCT	2	12	564539	564550	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_021009	ATTATA	2	12	587974	587985	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021009	GATACA	2	12	594404	594415	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_021009	AAAACA	2	12	606638	606649	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_021009	CATTTT	2	12	607830	607841	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_021009	TGTAAG	2	12	622430	622441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021009	AGAATG	2	12	637165	637176	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021009	GCTATT	2	12	637880	637891	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_021009	GCGTTG	2	12	685238	685249	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_021009	GAGAAA	2	12	686030	686041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021009	TAAAAA	2	12	701836	701847	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021009	TTTTGC	2	12	712217	712228	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_021009	AGAGAA	2	12	714493	714504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021009	AGACAG	2	12	721828	721839	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_021009	AAGAAA	2	12	732539	732550	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021009	AAAAAT	2	12	734938	734949	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021009	CAGACA	2	12	736166	736177	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_021009	AATAAA	2	12	738652	738663	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021009	GTCTTT	2	12	743894	743905	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_021009	AAACAG	2	12	756123	756134	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_021009	TAATAT	2	12	764147	764158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021009	AAAATA	2	12	793025	793036	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021009	TTGAGA	2	12	813980	813991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021009	ATAATG	2	12	816705	816716	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021009	AAACAA	2	12	822648	822659	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_021009	GATTTG	2	12	843076	843087	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021009	ATAAAA	2	12	854637	854648	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021009	TTATTT	2	12	854686	854697	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021009	TTTAAG	2	12	860153	860164	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021009	GACATG	2	12	871563	871574	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_021009	CAAGAA	2	12	874069	874080	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_021009	TGAATG	2	12	893545	893556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021009	TGATAA	2	12	893966	893977	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021009	AGAAAC	2	12	895347	895358	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_021009	ATAAAA	2	12	905607	905618	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021009	CCGATG	2	12	925522	925533	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_021009	CCGATT	2	12	926476	926487	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_021009	TAAAAA	2	12	935229	935240	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021009	TAATGT	2	12	955472	955483	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021009	AAAGTA	2	12	956742	956753	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021009	ACAGCA	2	12	956994	957005	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_021009	TGGTTC	2	12	960528	960539	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_021009	AAATGA	2	12	970468	970479	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021009	AGAATG	2	12	977784	977795	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021009	ATGCCA	2	12	995763	995774	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_021009	ATTTTA	2	12	1012695	1012706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021009	GTAGCT	2	12	1017040	1017051	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_021009	CAAAAA	2	12	1033298	1033309	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_021009	GAATCT	2	12	1042053	1042064	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_021009	CAGTGC	2	12	1069174	1069185	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_021009	CTTTTC	2	12	1071830	1071841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_021009	GAAAAA	2	12	1088243	1088254	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021009	GGAAAA	2	12	1105275	1105286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021009	GTTGGC	2	12	1119411	1119422	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_021009	TGGATC	2	12	1119493	1119504	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_021009	GTTTTT	2	12	1124426	1124437	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021009	ATTTTT	2	12	1176334	1176345	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021009	TTTCAG	2	12	1181287	1181298	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_021009	GAATTT	2	12	1225072	1225083	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021009	GTTATG	2	12	1230382	1230393	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021009	CTGAAG	2	12	1232508	1232519	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_021009	TGAAAA	2	12	1257732	1257743	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021009	GAAACA	2	12	1272798	1272809	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_021009	GTTTAC	2	12	1274036	1274047	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_021009	AAAGAC	2	12	1289064	1289075	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_021009	AATGCT	2	12	1293701	1293712	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_021009	CGGCTT	2	12	1295855	1295866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_021009	ATAAAG	2	12	1298711	1298722	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021009	CAAATT	2	12	1317778	1317789	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_021009	AAAAGG	2	12	1340665	1340676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021009	AAAAAT	2	12	1390530	1390541	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021009	GCCTTT	2	12	1402576	1402587	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_021009	GCCGGT	2	12	1402742	1402753	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_021009	ATAAAA	2	12	1408296	1408307	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021009	AGTTGA	2	12	1415375	1415386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021009	TTGTAA	2	12	1426319	1426330	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021009	CCTTCG	2	12	1426441	1426452	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
117	NC_021009	AATACA	2	12	1458114	1458125	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_021009	TTGTTT	2	12	1461643	1461654	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021009	TATTTG	2	12	1466867	1466878	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021009	AGAAAA	2	12	1469605	1469616	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021009	AGCCAG	2	12	1470452	1470463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_021009	TCCTGC	2	12	1471868	1471879	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
123	NC_021009	AAAACC	2	12	1471910	1471921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_021009	TTCAAA	2	12	1477931	1477942	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_021009	TACCTG	2	12	1480215	1480226	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_021009	CCGTCA	2	12	1480408	1480419	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
127	NC_021009	CTGTTC	2	12	1488264	1488275	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_021009	ACCCAT	2	12	1488990	1489001	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_021009	CCCGGA	2	12	1489966	1489977	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
130	NC_021009	CCTTTC	2	12	1500467	1500478	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_021009	TATATC	2	12	1502306	1502317	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_021009	TCTTTT	2	12	1529328	1529339	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_021009	TTATTG	2	12	1565746	1565757	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021009	GAAGGC	2	12	1570685	1570696	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_021009	TGGGTG	2	12	1579466	1579477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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138	NC_021009	AGCTGC	2	12	1599497	1599508	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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142	NC_021009	CGGCAG	2	12	1708925	1708936	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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156	NC_021009	TGCCGA	2	12	1858791	1858802	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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242	NC_021009	ATAAAA	2	12	2833392	2833403	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
243	NC_021009	GCATGA	2	12	2870357	2870368	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
244	NC_021009	AGACAG	2	12	2870494	2870505	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
245	NC_021009	CGGATG	2	12	2894881	2894892	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
246	NC_021009	CTGGTG	2	12	2916046	2916057	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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248	NC_021009	ACTGAC	2	12	2945239	2945250	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
249	NC_021009	GGAAGT	2	12	2958657	2958668	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
250	NC_021009	TAAATG	2	12	2963720	2963731	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
251	NC_021009	TAATGT	2	12	2964012	2964023	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
252	NC_021009	ATGCAG	2	12	2965209	2965220	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
253	NC_021009	AAAGTA	2	12	2965274	2965285	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
254	NC_021009	GCAAAA	2	12	2966960	2966971	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
255	NC_021009	GTCAAT	2	12	2971577	2971588	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
256	NC_021009	AGAATC	2	12	2972748	2972759	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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263	NC_021009	CAAAAA	2	12	3023469	3023480	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.