MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Coprococcus catus GD/7 draft genome

Total Repeats: 701

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021009	TAAAA	2	10	8021	8030	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021009	AGTAT	2	10	8184	8193	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021009	AAGTG	2	10	13389	13398	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021009	CATTT	2	10	14140	14149	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_021009	TATAA	2	10	36260	36269	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021009	TTTTG	2	10	43044	43053	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021009	AAAAT	2	10	60258	60267	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021009	GAAAA	2	10	60350	60359	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021009	TAAAA	2	10	66237	66246	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021009	TTTTA	2	10	69823	69832	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021009	AAAAT	2	10	128808	128817	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021009	TTTGA	2	10	143599	143608	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021009	ATAGC	2	10	144086	144095	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_021009	GTATA	2	10	144158	144167	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021009	TAAAG	2	10	144321	144330	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021009	TACTT	2	10	144681	144690	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_021009	TTATT	2	10	146432	146441	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021009	GTGAT	2	10	167784	167793	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021009	GAAAA	2	10	174239	174248	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021009	CGGCA	2	10	175126	175135	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_021009	ATTTC	2	10	176742	176751	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_021009	GATGG	2	10	177372	177381	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021009	TTTGT	2	10	182412	182421	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021009	CTGGG	2	10	188341	188350	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
25	NC_021009	GAAGA	2	10	188458	188467	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021009	TTTTG	2	10	189968	189977	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021009	AAAAT	2	10	193406	193415	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021009	TTGAT	2	10	193588	193597	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021009	ACAGA	2	10	207593	207602	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_021009	GAATA	2	10	215136	215145	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021009	TAAAG	2	10	216732	216741	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021009	CTTTT	2	10	232450	232459	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_021009	TTTTG	2	10	235470	235479	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021009	GCGCA	2	10	235864	235873	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
35	NC_021009	AACGG	2	10	239168	239177	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_021009	ATTGA	2	10	244980	244989	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021009	GAAAT	2	10	251835	251844	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021009	GTTCA	2	10	257924	257933	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_021009	GAAAA	2	10	264009	264018	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021009	GAATA	2	10	265970	265979	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021009	TGAAA	2	10	269340	269349	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021009	AATAT	2	10	270680	270689	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021009	AAGAA	2	10	274120	274129	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021009	TTTTA	2	10	283422	283431	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021009	CTTCG	2	10	286470	286479	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
46	NC_021009	TATTC	2	10	286932	286941	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_021009	TGTAT	2	10	287804	287813	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021009	ATGGT	2	10	288274	288283	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021009	GAACA	2	10	288654	288663	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_021009	TTATA	2	10	291477	291486	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021009	GTGAT	2	10	305703	305712	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021009	ATCCC	2	10	305734	305743	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
53	NC_021009	TATAC	2	10	321467	321476	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_021009	ATTTT	2	10	334704	334713	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021009	TATAC	2	10	343171	343180	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_021009	CTGAA	2	10	349885	349894	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_021009	CTGTA	2	10	350041	350050	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_021009	TCTTT	2	10	354362	354371	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_021009	CTGAC	2	10	355109	355118	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
60	NC_021009	TGAAA	2	10	375485	375494	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021009	TATAA	2	10	383891	383900	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021009	AGGTT	2	10	385080	385089	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021009	CTATA	2	10	391333	391342	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_021009	AGTTT	2	10	393561	393570	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021009	CATAT	2	10	396937	396946	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_021009	GAATA	2	10	407718	407727	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021009	TATAA	2	10	416148	416157	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021009	TTTTG	2	10	417715	417724	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021009	GATAA	2	10	420243	420252	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021009	ATAAG	2	10	433972	433981	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021009	GCTTT	2	10	438443	438452	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_021009	CAACA	2	10	452308	452317	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
73	NC_021009	GTGAT	2	10	457987	457996	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021009	GTTTT	2	10	458197	458206	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021009	GGTTT	2	10	465198	465207	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021009	TAGTT	2	10	465723	465732	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021009	GGAAT	2	10	472166	472175	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021009	GGAAT	2	10	489130	489139	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021009	TAAAG	2	10	490310	490319	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021009	TGAAT	2	10	492967	492976	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021009	ATAAA	2	10	496935	496944	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021009	TGAGT	2	10	496993	497002	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021009	ATCTT	2	10	499651	499660	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_021009	ATTCT	2	10	499791	499800	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_021009	TACGG	2	10	504058	504067	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
86	NC_021009	CTTTC	2	10	504829	504838	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
87	NC_021009	CTCCC	2	10	505780	505789	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
88	NC_021009	TCTTT	2	10	506381	506390	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_021009	AATGT	2	10	520752	520761	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021009	AAAAT	2	10	521576	521585	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021009	TAATA	2	10	521717	521726	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021009	TAGAT	2	10	521730	521739	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021009	AAATG	2	10	527257	527266	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021009	AAAAG	2	10	534648	534657	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021009	CATGA	2	10	535533	535542	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_021009	AGAAA	2	10	541954	541963	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021009	TAGTT	2	10	548373	548382	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021009	AGAAA	2	10	558284	558293	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021009	GAAAA	2	10	558384	558393	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021009	GCTGC	2	10	559329	559338	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
101	NC_021009	ATTTC	2	10	564663	564672	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_021009	GGATA	2	10	576778	576787	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021009	AAGGA	2	10	576825	576834	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021009	CCATT	2	10	588547	588556	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
105	NC_021009	GGTGA	2	10	595169	595178	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021009	ATTGA	2	10	600161	600170	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021009	TCATT	2	10	608494	608503	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_021009	TTGAA	2	10	619463	619472	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021009	GCTGA	2	10	624966	624975	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
110	NC_021009	ATGTA	2	10	625531	625540	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021009	GACAG	2	10	625547	625556	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
112	NC_021009	GTGCA	2	10	628294	628303	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
113	NC_021009	CAGAG	2	10	628538	628547	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
114	NC_021009	ATTAA	2	10	629373	629382	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021009	CCGCA	2	10	633322	633331	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
116	NC_021009	TCAAA	2	10	642696	642705	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_021009	ATTCA	2	10	645201	645210	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_021009	CACCG	2	10	646016	646025	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
119	NC_021009	TAAGA	2	10	654555	654564	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021009	TATAG	2	10	657039	657048	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021009	TTTAA	2	10	661688	661697	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021009	TGCCA	2	10	668399	668408	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
123	NC_021009	TTTTC	2	10	684578	684587	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_021009	GATAT	2	10	684645	684654	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021009	CATCC	2	10	685587	685596	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
126	NC_021009	CAGAG	2	10	685640	685649	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
127	NC_021009	AAAGA	2	10	704718	704727	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021009	CTTTT	2	10	713857	713866	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_021009	GATTT	2	10	714119	714128	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021009	ATGGA	2	10	714715	714724	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021009	GTCAG	2	10	719414	719423	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
132	NC_021009	CAATG	2	10	736255	736264	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_021009	AGAGT	2	10	747602	747611	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021009	AAATG	2	10	754468	754477	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021009	AGAAA	2	10	762897	762906	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021009	AAAGA	2	10	766084	766093	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021009	TCCAT	2	10	785426	785435	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
138	NC_021009	GTTCG	2	10	785708	785717	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
139	NC_021009	GTTAT	2	10	785718	785727	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021009	GATAT	2	10	787074	787083	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021009	GGAAT	2	10	787456	787465	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021009	TACTT	2	10	810315	810324	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_021009	GTTGT	2	10	814553	814562	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021009	TTTTG	2	10	821077	821086	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021009	AAATG	2	10	822683	822692	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021009	GGCTT	2	10	830059	830068	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
147	NC_021009	TTTTA	2	10	830519	830528	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021009	TAGGA	2	10	859258	859267	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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196	NC_021009	GATTT	2	10	1021309	1021318	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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428	NC_021009	TTACT	2	10	2278058	2278067	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
429	NC_021009	TATAT	2	10	2280157	2280166	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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431	NC_021009	ATTGT	2	10	2281554	2281563	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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441	NC_021009	GATCA	2	10	2325140	2325149	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
442	NC_021009	TACCA	2	10	2325779	2325788	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
443	NC_021009	TTCAG	2	10	2325925	2325934	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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446	NC_021009	CTTTT	2	10	2339109	2339118	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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451	NC_021009	AAGTA	2	10	2346435	2346444	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
452	NC_021009	CTGTT	2	10	2354366	2354375	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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460	NC_021009	ATAAA	2	10	2386770	2386779	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
461	NC_021009	GTCCG	2	10	2390080	2390089	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
462	NC_021009	TGATC	2	10	2396195	2396204	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
463	NC_021009	ATGAA	2	10	2398309	2398318	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
464	NC_021009	ATTCT	2	10	2399323	2399332	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
465	NC_021009	CACTT	2	10	2400628	2400637	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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467	NC_021009	ATCCG	2	10	2404598	2404607	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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470	NC_021009	TTTCA	2	10	2422161	2422170	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
471	NC_021009	CTTTT	2	10	2424357	2424366	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
472	NC_021009	TTCTT	2	10	2436686	2436695	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
473	NC_021009	TCATA	2	10	2436742	2436751	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
474	NC_021009	GTAAT	2	10	2442147	2442156	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
475	NC_021009	AAAAG	2	10	2444451	2444460	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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477	NC_021009	GATCC	2	10	2446017	2446026	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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479	NC_021009	ATCTC	2	10	2453922	2453931	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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482	NC_021009	GTCAC	2	10	2456135	2456144	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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489	NC_021009	ATTCA	2	10	2496275	2496284	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
490	NC_021009	ATCTG	2	10	2496546	2496555	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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492	NC_021009	TCAAT	2	10	2508969	2508978	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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500	NC_021009	GGCTG	2	10	2563055	2563064	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding

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