MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Coprococcus catus GD/7 draft genome

Total Repeats: 40032

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021009	ATC	2	6	109	114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136968
2	NC_021009	CTC	2	6	190	195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479136968
3	NC_021009	CAT	2	6	213	218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136968
4	NC_021009	AAT	2	6	220	225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479136968
5	NC_021009	CGC	2	6	237	242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136968
6	NC_021009	TGG	2	6	522	527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479136968
7	NC_021009	TTG	2	6	775	780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479136969
8	NC_021009	GTT	2	6	789	794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479136969
9	NC_021009	GCA	3	9	811	819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136969
10	NC_021009	GCA	2	6	855	860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136969
11	NC_021009	ATC	2	6	869	874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136969
12	NC_021009	AGC	2	6	890	895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136969
13	NC_021009	CAG	2	6	1030	1035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136969
14	NC_021009	GCC	2	6	1176	1181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136969
15	NC_021009	TAT	2	6	1235	1240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479136969
16	NC_021009	GCA	2	6	1242	1247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136969
17	NC_021009	TTA	2	6	1447	1452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479136969
18	NC_021009	CAG	2	6	1489	1494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136969
19	NC_021009	CTT	2	6	1683	1688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479136969
20	NC_021009	GAT	2	6	1704	1709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479136969
21	NC_021009	CTG	2	6	1720	1725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136969
22	NC_021009	CAG	2	6	2104	2109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136970
23	NC_021009	CAG	2	6	2284	2289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136970
24	NC_021009	GCT	2	6	2328	2333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136970
25	NC_021009	TGA	2	6	2340	2345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479136970
26	NC_021009	ACA	2	6	2374	2379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479136970
27	NC_021009	TAT	4	12	2424	2435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479136970
28	NC_021009	CAG	2	6	2519	2524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136970
29	NC_021009	AGA	2	6	2589	2594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479136970
30	NC_021009	TGA	2	6	2621	2626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479136970
31	NC_021009	CAT	2	6	2650	2655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136970
32	NC_021009	TCA	2	6	2756	2761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136970
33	NC_021009	AGA	3	9	2771	2779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479136970
34	NC_021009	ATT	2	6	2791	2796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479136970
35	NC_021009	ATT	2	6	2905	2910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479136970
36	NC_021009	AAG	2	6	2935	2940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479136970
37	NC_021009	GCA	2	6	3006	3011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136970
38	NC_021009	GTT	2	6	3060	3065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479136970
39	NC_021009	GGT	2	6	3070	3075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479136970
40	NC_021009	CAG	2	6	3079	3084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136970
41	NC_021009	ATT	2	6	3091	3096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479136970
42	NC_021009	CAG	2	6	3184	3189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136970
43	NC_021009	GAA	2	6	3244	3249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479136970
44	NC_021009	CAG	2	6	3309	3314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136970
45	NC_021009	AGA	2	6	3315	3320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479136970
46	NC_021009	AGG	2	6	3365	3370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479136970
47	NC_021009	AAT	2	6	3377	3382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479136970
48	NC_021009	ATC	2	6	3423	3428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136971
49	NC_021009	TGT	2	6	3596	3601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479136971
50	NC_021009	CTT	2	6	3614	3619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479136971
51	NC_021009	GGC	2	6	3725	3730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136971
52	NC_021009	GGT	2	6	3744	3749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479136971
53	NC_021009	GCA	2	6	3765	3770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136971
54	NC_021009	ATT	2	6	3801	3806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479136971
55	NC_021009	CTG	2	6	3877	3882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136971
56	NC_021009	TGA	2	6	3908	3913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479136971
57	NC_021009	GCT	2	6	3915	3920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136971
58	NC_021009	TCG	2	6	3988	3993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136971
59	NC_021009	CAG	2	6	4129	4134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136971
60	NC_021009	GCT	2	6	4172	4177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136971
61	NC_021009	ATC	2	6	4237	4242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136971
62	NC_021009	CAT	2	6	4324	4329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136971
63	NC_021009	GTT	3	9	4353	4361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479136971
64	NC_021009	ATT	2	6	4382	4387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479136971
65	NC_021009	AGG	2	6	4421	4426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479136971
66	NC_021009	ATT	2	6	4532	4537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479136972
67	NC_021009	CAG	2	6	4805	4810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136972
68	NC_021009	ATC	2	6	4846	4851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136972
69	NC_021009	AGC	2	6	4990	4995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136972
70	NC_021009	CGG	2	6	5059	5064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136972
71	NC_021009	CGG	2	6	5068	5073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136972
72	NC_021009	GCA	2	6	5192	5197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136972
73	NC_021009	GCA	2	6	5210	5215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136972
74	NC_021009	TTG	2	6	6350	6355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479136973
75	NC_021009	TGG	2	6	6360	6365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479136973
76	NC_021009	TCT	2	6	6513	6518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479136973
77	NC_021009	AAG	2	6	6583	6588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479136973
78	NC_021009	ATG	2	6	6593	6598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479136973
79	NC_021009	GAT	2	6	6607	6612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479136973
80	NC_021009	GAA	2	6	6694	6699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479136973
81	NC_021009	ACA	2	6	6766	6771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479136973
82	NC_021009	TGA	2	6	6878	6883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479136973
83	NC_021009	TGG	2	6	6935	6940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479136973
84	NC_021009	AGA	3	9	7068	7076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479136973
85	NC_021009	CAT	2	6	7083	7088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136973
86	NC_021009	ATT	2	6	7138	7143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479136973
87	NC_021009	GGC	2	6	7161	7166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136973
88	NC_021009	ATG	2	6	7172	7177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479136973
89	NC_021009	GGA	2	6	7213	7218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479136973
90	NC_021009	CAA	2	6	7334	7339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479136973
91	NC_021009	AAG	2	6	7340	7345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479136973
92	NC_021009	CAG	2	6	7442	7447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136973
93	NC_021009	ATT	2	6	7627	7632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479136974
94	NC_021009	GAT	2	6	7697	7702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479136974
95	NC_021009	TGC	2	6	8441	8446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136975
96	NC_021009	AGA	2	6	8460	8465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479136975
97	NC_021009	GAT	2	6	8581	8586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479136975
98	NC_021009	ACA	2	6	8656	8661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479136975
99	NC_021009	CAT	2	6	8698	8703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136975
100	NC_021009	ATG	2	6	8704	8709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479136975
101	NC_021009	GAT	2	6	8830	8835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479136975
102	NC_021009	TTG	2	6	8849	8854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479136975
103	NC_021009	CTA	2	6	8888	8893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136975
104	NC_021009	GGT	2	6	8965	8970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479136975
105	NC_021009	TAA	3	9	8994	9002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479136975
106	NC_021009	ATG	2	6	9053	9058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479136975
107	NC_021009	TAT	2	6	9102	9107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479136975
108	NC_021009	AAG	2	6	9229	9234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479136975
109	NC_021009	GAA	2	6	9289	9294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479136975
110	NC_021009	AAT	2	6	9301	9306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479136975
111	NC_021009	TTA	2	6	9630	9635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479136975
112	NC_021009	GAT	2	6	9658	9663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479136975
113	NC_021009	TCG	2	6	9771	9776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136975
114	NC_021009	TGG	2	6	9800	9805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479136975
115	NC_021009	TTC	2	6	9815	9820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479136975
116	NC_021009	AAG	2	6	10109	10114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479136975
117	NC_021009	GTA	2	6	10129	10134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479136975
118	NC_021009	TGA	2	6	10143	10148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479136975
119	NC_021009	ACA	2	6	10195	10200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479136975
120	NC_021009	AGA	2	6	10389	10394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479136975
121	NC_021009	TTG	2	6	10544	10549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479136975
122	NC_021009	AGG	2	6	10568	10573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479136975
123	NC_021009	GAG	2	6	10633	10638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479136975
124	NC_021009	ATT	2	6	10695	10700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479136975
125	NC_021009	TAT	2	6	10705	10710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479136975
126	NC_021009	AAT	2	6	10831	10836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479136975
127	NC_021009	ATG	2	6	10912	10917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479136975
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129	NC_021009	TTA	2	6	10949	10954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479136975
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499	NC_021009	GAT	2	6	39076	39081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479137001
500	NC_021009	TCA	2	6	39170	39175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479137001

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