MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum F8 draft genome

Total Repeats: 1687

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021008	TCCT	2	8	144	151	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_021008	GACC	2	8	338	345	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_021008	GAGT	2	8	670	677	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021008	CGGG	2	8	836	843	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5	NC_021008	GGTG	2	8	1860	1867	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021008	GCCG	2	8	1955	1962	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_021008	TTGC	2	8	2177	2184	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_021008	ACCG	2	8	2303	2310	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_021008	GCGA	2	8	2399	2406	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_021008	GCCG	2	8	2496	2503	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_021008	GCCG	2	8	3776	3783	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_021008	GATG	2	8	6495	6502	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021008	AAAC	2	8	12819	12826	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_021008	AACT	2	8	17930	17937	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_021008	GAGC	2	8	18717	18724	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_021008	ATTC	2	8	19083	19090	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_021008	GGCA	2	8	24202	24209	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_021008	TCGT	2	8	25097	25104	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_021008	GCTC	2	8	25421	25428	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_021008	ACCA	2	8	25982	25989	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_021008	CGAA	2	8	26060	26067	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_021008	ACCA	2	8	26588	26595	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_021008	AGCA	2	8	26831	26838	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_021008	TGAT	2	8	26986	26993	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021008	ATCA	2	8	27236	27243	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_021008	CTCG	2	8	27265	27272	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_021008	TCAG	2	8	29888	29895	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_021008	GCTG	2	8	29903	29910	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_021008	GCTC	2	8	29937	29944	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_021008	CAAT	2	8	31882	31889	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_021008	CACG	2	8	32405	32412	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_021008	CGCC	2	8	32485	32492	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
33	NC_021008	GCCG	2	8	33435	33442	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_021008	GCTG	2	8	37214	37221	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_021008	GGTC	2	8	37446	37453	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_021008	GCGG	2	8	39856	39863	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
37	NC_021008	GGTG	2	8	40788	40795	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021008	CCAC	2	8	41001	41008	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
39	NC_021008	AATC	2	8	45847	45854	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_021008	TCGC	2	8	47632	47639	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_021008	TGCG	2	8	49336	49343	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_021008	AACC	2	8	52836	52843	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_021008	CCTC	2	8	55779	55786	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
44	NC_021008	GAGG	2	8	55791	55798	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021008	TTTG	2	8	58374	58381	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021008	GGTG	2	8	62821	62828	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021008	GCCC	2	8	64932	64939	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
48	NC_021008	CCGC	2	8	65222	65229	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
49	NC_021008	ATTG	2	8	67500	67507	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021008	CATA	2	8	71062	71069	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_021008	CAAC	2	8	71422	71429	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_021008	AGCC	2	8	71829	71836	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_021008	CCAT	2	8	71874	71881	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_021008	CGTG	2	8	72422	72429	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_021008	CGGC	2	8	74426	74433	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_021008	GATG	2	8	79355	79362	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021008	CGAT	2	8	81777	81784	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_021008	ACGC	2	8	81786	81793	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_021008	CTTT	2	8	82079	82086	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_021008	GCGG	2	8	82173	82180	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
61	NC_021008	TCCT	2	8	86870	86877	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_021008	GCCG	2	8	90037	90044	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_021008	GGGA	2	8	90071	90078	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021008	CCTT	2	8	95940	95947	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_021008	CGGT	2	8	97945	97952	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_021008	TGAG	2	8	101228	101235	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021008	GCCG	2	8	103074	103081	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_021008	CGAA	2	8	104166	104173	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_021008	CCTG	2	8	110559	110566	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_021008	CGGC	2	8	115806	115813	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_021008	CCGG	2	8	121870	121877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_021008	ATGT	2	8	121901	121908	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021008	CCGT	2	8	121966	121973	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_021008	CCTT	2	8	126872	126879	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_021008	ATGC	2	8	127033	127040	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_021008	GCCG	2	8	134079	134086	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_021008	AAAC	2	8	134137	134144	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_021008	TGCT	2	8	134375	134382	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_021008	CGCA	2	8	136168	136175	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_021008	GAAA	2	8	137801	137808	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021008	CGGC	2	8	138014	138021	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_021008	TGCG	2	8	138253	138260	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_021008	GACA	2	8	138702	138709	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_021008	TTTG	2	8	138924	138931	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021008	GGAA	2	8	141627	141634	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021008	CAAA	2	8	148556	148563	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_021008	GCGG	2	8	151301	151308	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
88	NC_021008	AGCG	2	8	155556	155563	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_021008	CACC	2	8	155819	155826	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
90	NC_021008	TACG	2	8	160750	160757	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_021008	CACG	2	8	161017	161024	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_021008	GGCG	2	8	161770	161777	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
93	NC_021008	GCGG	2	8	162058	162065	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
94	NC_021008	GGTG	2	8	162487	162494	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021008	AGGC	2	8	162998	163005	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_021008	CGTC	2	8	163110	163117	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_021008	GACC	2	8	163467	163474	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_021008	CTGA	2	8	165285	165292	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_021008	GGCT	2	8	165519	165526	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_021008	TCGG	2	8	165640	165647	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_021008	ACCG	2	8	166091	166098	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_021008	TTGT	2	8	166121	166128	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021008	ACGT	2	8	166736	166743	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_021008	TCAG	2	8	172891	172898	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_021008	GCTA	2	8	172943	172950	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_021008	TCCT	2	8	175581	175588	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_021008	ACGC	2	8	176717	176724	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_021008	CCTT	2	8	178394	178401	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_021008	ATGG	2	8	180465	180472	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021008	ATAC	2	8	182049	182056	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_021008	CGCC	2	8	184225	184232	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
112	NC_021008	TGCG	2	8	184320	184327	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_021008	AGAA	2	8	184630	184637	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021008	GCCT	2	8	187459	187466	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
115	NC_021008	AAGG	2	8	187472	187479	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021008	GATG	2	8	187538	187545	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021008	ACGC	2	8	187850	187857	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_021008	GACT	2	8	188332	188339	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_021008	GCCA	2	8	192236	192243	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_021008	AGGA	2	8	192718	192725	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021008	CTGG	2	8	193046	193053	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_021008	AGCG	2	8	193743	193750	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_021008	TCGT	2	8	194067	194074	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_021008	CGGG	2	8	195258	195265	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
125	NC_021008	CCGA	2	8	199926	199933	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
126	NC_021008	TCAG	2	8	201689	201696	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_021008	GGCT	2	8	207519	207526	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_021008	GCCG	2	8	207565	207572	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_021008	GCAC	2	8	207731	207738	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_021008	CCGG	2	8	208328	208335	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_021008	TGGG	2	8	208340	208347	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021008	TGCG	2	8	209319	209326	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_021008	GAAC	2	8	209825	209832	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_021008	CCCG	2	8	211582	211589	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
135	NC_021008	ATCC	2	8	215617	215624	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_021008	TCAC	2	8	215669	215676	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_021008	TAGT	2	8	216274	216281	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021008	GGAA	2	8	216711	216718	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021008	GCAT	2	8	217917	217924	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_021008	CAAA	2	8	219073	219080	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_021008	TCAG	2	8	219209	219216	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_021008	AATC	2	8	219217	219224	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_021008	AGCG	2	8	224211	224218	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_021008	ACAT	2	8	224348	224355	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_021008	GGAT	2	8	224541	224548	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021008	GAAC	2	8	224949	224956	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_021008	AGAT	2	8	225070	225077	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021008	CCTT	2	8	225697	225704	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_021008	CAGC	2	8	225878	225885	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
150	NC_021008	GGCG	2	8	226790	226797	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
151	NC_021008	ACGG	2	8	227333	227340	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
152	NC_021008	TCAC	2	8	227443	227450	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_021008	AGCG	2	8	227730	227737	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
154	NC_021008	TCGG	2	8	228163	228170	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
155	NC_021008	ATTC	2	8	228803	228810	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
156	NC_021008	ACTG	2	8	229119	229126	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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159	NC_021008	GCCG	2	8	236921	236928	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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170	NC_021008	TACT	2	8	256775	256782	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
171	NC_021008	GCCG	2	8	258912	258919	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
172	NC_021008	TACG	2	8	273678	273685	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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179	NC_021008	TCGG	2	8	281072	281079	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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196	NC_021008	ACCG	2	8	296563	296570	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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448	NC_021008	GCTA	2	8	571734	571741	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
449	NC_021008	CCGT	2	8	571865	571872	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
450	NC_021008	CAGC	2	8	572344	572351	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
451	NC_021008	CTGA	2	8	572425	572432	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
452	NC_021008	CGGC	2	8	572456	572463	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
453	NC_021008	TTCC	2	8	576604	576611	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
454	NC_021008	CGGC	2	8	576697	576704	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
455	NC_021008	CGAA	2	8	577147	577154	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
456	NC_021008	GCGA	2	8	577200	577207	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
457	NC_021008	TACG	2	8	577247	577254	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
458	NC_021008	TGTT	2	8	577494	577501	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
459	NC_021008	TGAT	2	8	578065	578072	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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461	NC_021008	GCAT	2	8	580391	580398	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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465	NC_021008	TACC	2	8	587439	587446	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
466	NC_021008	ACGT	2	8	587565	587572	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
467	NC_021008	GGTG	2	8	591591	591598	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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469	NC_021008	TTAT	3	12	592601	592612	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
470	NC_021008	GGAT	2	8	596970	596977	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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472	NC_021008	GCGT	2	8	600283	600290	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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475	NC_021008	CGAA	2	8	615293	615300	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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477	NC_021008	CAGC	2	8	616932	616939	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
478	NC_021008	CCAC	2	8	617505	617512	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
479	NC_021008	AGGC	2	8	617769	617776	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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481	NC_021008	GGGC	2	8	618566	618573	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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483	NC_021008	TGAA	2	8	618760	618767	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
484	NC_021008	GGAC	2	8	618864	618871	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
485	NC_021008	CGGC	2	8	619643	619650	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
486	NC_021008	GTCG	2	8	621696	621703	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
487	NC_021008	AAGC	2	8	624720	624727	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
488	NC_021008	GGTC	2	8	626274	626281	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
489	NC_021008	CGTG	2	8	626657	626664	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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495	NC_021008	ACCA	2	8	637635	637642	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
496	NC_021008	TGCG	2	8	641420	641427	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
497	NC_021008	ACCG	2	8	642197	642204	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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500	NC_021008	TCAG	2	8	647709	647716	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

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