MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum F8 draft genome

Total Repeats: 39696

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021008	GTG	3	9	1	9	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021008	TAC	2	6	35	40	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021008	GTG	2	6	90	95	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021008	TGA	2	6	116	121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021008	GGC	2	6	253	258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_021008	TGG	2	6	303	308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021008	GGT	2	6	378	383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021008	TCT	2	6	413	418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_021008	CGG	2	6	466	471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_021008	GCA	2	6	564	569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_021008	CGC	2	6	611	616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_021008	CAG	2	6	712	717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_021008	ATT	2	6	753	758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021008	TCG	2	6	783	788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_021008	GAA	2	6	904	909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021008	GAG	2	6	951	956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021008	GCG	2	6	1134	1139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_021008	GAA	2	6	1168	1173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021008	GGT	2	6	1241	1246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021008	GTC	3	9	1252	1260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_021008	CCG	2	6	1353	1358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_021008	GGA	2	6	1369	1374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021008	ATC	2	6	1393	1398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_021008	GCA	2	6	1619	1624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_021008	CCT	2	6	1734	1739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_021008	GGC	2	6	1805	1810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_021008	CGT	2	6	1831	1836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_021008	GGT	2	6	1872	1877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021008	CGT	2	6	1941	1946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_021008	GTG	2	6	1990	1995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021008	TGA	2	6	2113	2118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021008	GTC	2	6	2122	2127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_021008	GTG	2	6	2167	2172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021008	TGG	2	6	2194	2199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021008	GCC	2	6	2257	2262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_021008	AGT	2	6	2392	2397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021008	GAT	2	6	2412	2417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021008	GAT	2	6	2919	2924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021008	GGA	2	6	2963	2968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021008	CGG	2	6	3186	3191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_021008	TCG	3	9	3202	3210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_021008	CGT	2	6	3230	3235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_021008	AGG	2	6	3292	3297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021008	AGC	2	6	3308	3313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_021008	CAC	2	6	3386	3391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_021008	GCC	2	6	3647	3652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_021008	GTA	2	6	3741	3746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021008	GGT	2	6	3788	3793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021008	GAT	2	6	3857	3862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021008	GCC	2	6	3929	3934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_021008	TGG	2	6	3953	3958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021008	CGG	2	6	4237	4242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_021008	GAC	2	6	4689	4694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_021008	TCG	2	6	4846	4851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_021008	CGT	2	6	4926	4931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_021008	GAG	2	6	4973	4978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021008	TCC	2	6	5270	5275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_021008	GCC	2	6	5360	5365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_021008	AGA	2	6	5401	5406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021008	GCG	2	6	5410	5415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_021008	CGC	3	9	5515	5523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_021008	ACG	2	6	5622	5627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_021008	CAA	2	6	5736	5741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_021008	TGC	2	6	6156	6161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134918
65	NC_021008	TGA	2	6	6217	6222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134918
66	NC_021008	CGG	2	6	6304	6309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134918
67	NC_021008	CGG	2	6	6313	6318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134918
68	NC_021008	GGC	2	6	6341	6346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134918
69	NC_021008	TCG	2	6	6360	6365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134918
70	NC_021008	TGG	2	6	6367	6372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479134918
71	NC_021008	CTC	2	6	6445	6450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_021008	CTT	2	6	6566	6571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479134919
73	NC_021008	CGC	2	6	6691	6696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479134919
74	NC_021008	GGT	2	6	6752	6757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479134919
75	NC_021008	CAC	2	6	6824	6829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479134919
76	NC_021008	GAA	2	6	6860	6865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479134919
77	NC_021008	CAT	2	6	6881	6886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479134919
78	NC_021008	GTG	2	6	6905	6910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479134919
79	NC_021008	CTC	2	6	6962	6967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479134919
80	NC_021008	CTT	2	6	7001	7006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479134919
81	NC_021008	CTG	3	9	7082	7090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134919
82	NC_021008	GCC	2	6	7142	7147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479134919
83	NC_021008	GAC	2	6	7151	7156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479134919
84	NC_021008	TCT	2	6	7186	7191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479134919
85	NC_021008	CGG	2	6	7199	7204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134919
86	NC_021008	GTG	2	6	7221	7226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479134919
87	NC_021008	TGG	2	6	7246	7251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479134919
88	NC_021008	GCC	2	6	7328	7333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479134919
89	NC_021008	GCG	2	6	7359	7364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134919
90	NC_021008	TGG	2	6	7384	7389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479134919
91	NC_021008	CCG	2	6	7404	7409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479134919
92	NC_021008	TGA	2	6	7414	7419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134919
93	NC_021008	GGA	2	6	7448	7453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479134919
94	NC_021008	CTT	2	6	7493	7498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479134919
95	NC_021008	GAA	2	6	7526	7531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479134919
96	NC_021008	TCT	2	6	7549	7554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479134919
97	NC_021008	ATC	2	6	7692	7697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479134919
98	NC_021008	TGA	2	6	7758	7763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134919
99	NC_021008	TCA	2	6	7863	7868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479134919
100	NC_021008	GAA	2	6	7871	7876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479134919
101	NC_021008	GAA	2	6	7916	7921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479134919
102	NC_021008	TGG	2	6	7999	8004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479134919
103	NC_021008	AGT	2	6	8017	8022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134919
104	NC_021008	TCC	2	6	8028	8033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479134919
105	NC_021008	TTG	2	6	8034	8039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479134919
106	NC_021008	AGT	2	6	8044	8049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134919
107	NC_021008	TCG	2	6	8052	8057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134919
108	NC_021008	GCC	2	6	8141	8146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479134919
109	NC_021008	GCC	2	6	8192	8197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479134919
110	NC_021008	GCC	2	6	8280	8285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479134919
111	NC_021008	GAT	2	6	8297	8302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134919
112	NC_021008	TTG	2	6	8313	8318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479134919
113	NC_021008	TTC	2	6	8334	8339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479134919
114	NC_021008	GCT	2	6	8366	8371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134919
115	NC_021008	GTA	2	6	8372	8377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134919
116	NC_021008	CCT	2	6	8387	8392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_021008	TCA	2	6	8411	8416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_021008	CTT	2	6	8420	8425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_021008	CAT	2	6	8433	8438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_021008	ATT	2	6	8444	8449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021008	GAT	2	6	8597	8602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134920
122	NC_021008	GAT	2	6	8687	8692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134920
123	NC_021008	GCA	2	6	8715	8720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479134920
124	NC_021008	CGT	2	6	8780	8785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134920
125	NC_021008	TTG	2	6	8949	8954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479134920
126	NC_021008	GTT	2	6	8964	8969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479134920
127	NC_021008	AGT	2	6	9006	9011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021008	TGG	2	6	9025	9030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021008	TGA	2	6	9050	9055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021008	GGC	2	6	9112	9117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134921
131	NC_021008	AGC	2	6	9123	9128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479134921
132	NC_021008	AAC	2	6	9158	9163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479134921
133	NC_021008	GAT	2	6	9261	9266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134921
134	NC_021008	CAT	2	6	9289	9294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479134921
135	NC_021008	CGG	2	6	9316	9321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134921
136	NC_021008	TGA	2	6	9327	9332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134921
137	NC_021008	TCG	2	6	9401	9406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134921
138	NC_021008	CGG	3	9	9456	9464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134921
139	NC_021008	GAA	2	6	9484	9489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479134921
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141	NC_021008	CTG	2	6	9598	9603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134921
142	NC_021008	TCT	2	6	9744	9749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479134921
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146	NC_021008	CGG	2	6	9995	10000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134921
147	NC_021008	GAT	2	6	10051	10056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134921
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153	NC_021008	GCG	2	6	10310	10315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134921
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159	NC_021008	GAT	2	6	10543	10548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134921
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261	NC_021008	CTT	2	6	16710	16715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479134926
262	NC_021008	GAC	2	6	16801	16806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479134926
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265	NC_021008	AAG	2	6	17176	17181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
266	NC_021008	TGT	2	6	17272	17277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
267	NC_021008	CAA	2	6	17425	17430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
268	NC_021008	TTC	2	6	17465	17470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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270	NC_021008	CTG	2	6	17580	17585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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282	NC_021008	TTC	2	6	18696	18701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
283	NC_021008	ACT	2	6	18706	18711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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288	NC_021008	CAG	2	6	19294	19299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
289	NC_021008	CAT	2	6	19380	19385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479134930
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291	NC_021008	ATG	2	6	19526	19531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134930
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