MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum F8 draft genome

Total Repeats: 29576

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021008	TGC	2	6	6156	6161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134918
2	NC_021008	TGA	2	6	6217	6222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134918
3	NC_021008	CGG	2	6	6304	6309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134918
4	NC_021008	CGG	2	6	6313	6318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134918
5	NC_021008	GGC	2	6	6341	6346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134918
6	NC_021008	TCG	2	6	6360	6365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134918
7	NC_021008	TGG	2	6	6367	6372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479134918
8	NC_021008	CTT	2	6	6566	6571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479134919
9	NC_021008	CGC	2	6	6691	6696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479134919
10	NC_021008	GGT	2	6	6752	6757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479134919
11	NC_021008	CAC	2	6	6824	6829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479134919
12	NC_021008	GAA	2	6	6860	6865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479134919
13	NC_021008	CAT	2	6	6881	6886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479134919
14	NC_021008	GTG	2	6	6905	6910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479134919
15	NC_021008	CTC	2	6	6962	6967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479134919
16	NC_021008	CTT	2	6	7001	7006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479134919
17	NC_021008	CTG	3	9	7082	7090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134919
18	NC_021008	GCC	2	6	7142	7147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479134919
19	NC_021008	GAC	2	6	7151	7156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479134919
20	NC_021008	TCT	2	6	7186	7191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479134919
21	NC_021008	CGG	2	6	7199	7204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134919
22	NC_021008	GTG	2	6	7221	7226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479134919
23	NC_021008	TGG	2	6	7246	7251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479134919
24	NC_021008	GCC	2	6	7328	7333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479134919
25	NC_021008	GCG	2	6	7359	7364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134919
26	NC_021008	TGG	2	6	7384	7389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479134919
27	NC_021008	CCG	2	6	7404	7409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479134919
28	NC_021008	TGA	2	6	7414	7419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134919
29	NC_021008	GGA	2	6	7448	7453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479134919
30	NC_021008	CTT	2	6	7493	7498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479134919
31	NC_021008	GAA	2	6	7526	7531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479134919
32	NC_021008	TCT	2	6	7549	7554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479134919
33	NC_021008	ATC	2	6	7692	7697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479134919
34	NC_021008	TGA	2	6	7758	7763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134919
35	NC_021008	TCA	2	6	7863	7868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479134919
36	NC_021008	GAA	2	6	7871	7876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479134919
37	NC_021008	GAA	2	6	7916	7921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479134919
38	NC_021008	TGG	2	6	7999	8004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479134919
39	NC_021008	AGT	2	6	8017	8022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134919
40	NC_021008	TCC	2	6	8028	8033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479134919
41	NC_021008	TTG	2	6	8034	8039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479134919
42	NC_021008	AGT	2	6	8044	8049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134919
43	NC_021008	TCG	2	6	8052	8057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134919
44	NC_021008	GCC	2	6	8141	8146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479134919
45	NC_021008	GCC	2	6	8192	8197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479134919
46	NC_021008	GCC	2	6	8280	8285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479134919
47	NC_021008	GAT	2	6	8297	8302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134919
48	NC_021008	TTG	2	6	8313	8318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479134919
49	NC_021008	TTC	2	6	8334	8339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479134919
50	NC_021008	GCT	2	6	8366	8371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134919
51	NC_021008	GTA	2	6	8372	8377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134919
52	NC_021008	GAT	2	6	8597	8602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134920
53	NC_021008	GAT	2	6	8687	8692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134920
54	NC_021008	GCA	2	6	8715	8720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479134920
55	NC_021008	CGT	2	6	8780	8785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134920
56	NC_021008	TTG	2	6	8949	8954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479134920
57	NC_021008	GTT	2	6	8964	8969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479134920
58	NC_021008	GGC	2	6	9112	9117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134921
59	NC_021008	AGC	2	6	9123	9128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479134921
60	NC_021008	AAC	2	6	9158	9163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479134921
61	NC_021008	GAT	2	6	9261	9266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134921
62	NC_021008	CAT	2	6	9289	9294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479134921
63	NC_021008	CGG	2	6	9316	9321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134921
64	NC_021008	TGA	2	6	9327	9332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134921
65	NC_021008	TCG	2	6	9401	9406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134921
66	NC_021008	CGG	3	9	9456	9464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134921
67	NC_021008	GAA	2	6	9484	9489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479134921
68	NC_021008	CTT	2	6	9547	9552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479134921
69	NC_021008	CTG	2	6	9598	9603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134921
70	NC_021008	TCT	2	6	9744	9749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479134921
71	NC_021008	CAC	2	6	9868	9873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479134921
72	NC_021008	GGC	2	6	9883	9888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134921
73	NC_021008	AGC	2	6	9902	9907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479134921
74	NC_021008	CGG	2	6	9995	10000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134921
75	NC_021008	GAT	2	6	10051	10056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134921
76	NC_021008	GAC	2	6	10108	10113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479134921
77	NC_021008	GCG	2	6	10180	10185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134921
78	NC_021008	TGG	2	6	10221	10226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479134921
79	NC_021008	CAA	2	6	10237	10242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479134921
80	NC_021008	GGC	2	6	10243	10248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134921
81	NC_021008	GCG	2	6	10310	10315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134921
82	NC_021008	TTG	2	6	10325	10330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479134921
83	NC_021008	GAA	2	6	10414	10419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479134921
84	NC_021008	CTT	3	9	10450	10458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479134921
85	NC_021008	GCA	2	6	10473	10478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479134921
86	NC_021008	GCG	2	6	10517	10522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134921
87	NC_021008	GAT	2	6	10543	10548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134921
88	NC_021008	CTC	2	6	10585	10590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479134921
89	NC_021008	TCT	2	6	10614	10619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479134921
90	NC_021008	CAG	2	6	10735	10740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479134921
91	NC_021008	CTC	2	6	10785	10790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479134921
92	NC_021008	TTC	2	6	10871	10876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479134921
93	NC_021008	GAT	2	6	10888	10893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134921
94	NC_021008	GGT	3	9	10963	10971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479134921
95	NC_021008	ATG	2	6	11030	11035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134921
96	NC_021008	CTT	2	6	11088	11093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479134921
97	NC_021008	GGC	2	6	11164	11169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134921
98	NC_021008	GCC	2	6	11203	11208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479134921
99	NC_021008	GCC	2	6	11213	11218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479134921
100	NC_021008	ATG	2	6	11267	11272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134921
101	NC_021008	CGC	2	6	11355	11360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479134921
102	NC_021008	CCA	2	6	11538	11543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479134921
103	NC_021008	CAC	2	6	11622	11627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479134921
104	NC_021008	GCG	2	6	11658	11663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134921
105	NC_021008	CGT	2	6	11670	11675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134921
106	NC_021008	GTC	2	6	11776	11781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134921
107	NC_021008	GGT	2	6	11835	11840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479134921
108	NC_021008	CGG	2	6	11865	11870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134921
109	NC_021008	GTA	2	6	11878	11883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134921
110	NC_021008	TGG	2	6	11997	12002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479134921
111	NC_021008	CAG	2	6	12004	12009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479134921
112	NC_021008	CTT	2	6	12022	12027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479134921
113	NC_021008	CAG	2	6	12037	12042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479134921
114	NC_021008	GAA	2	6	12094	12099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479134921
115	NC_021008	CGG	2	6	12132	12137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134921
116	NC_021008	CCT	2	6	12147	12152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479134921
117	NC_021008	GAT	2	6	12181	12186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134921
118	NC_021008	GGA	2	6	12202	12207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479134921
119	NC_021008	CCT	2	6	12240	12245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479134921
120	NC_021008	TGA	2	6	12303	12308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134921
121	NC_021008	TCG	2	6	12323	12328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134921
122	NC_021008	ACC	3	9	12361	12369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479134921
123	NC_021008	CGT	2	6	12375	12380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134921
124	NC_021008	GAT	2	6	12463	12468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134921
125	NC_021008	AGC	2	6	12608	12613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479134921
126	NC_021008	GTT	2	6	12646	12651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479134921
127	NC_021008	CCA	2	6	12672	12677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479134921
128	NC_021008	CGT	2	6	12994	12999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134922
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130	NC_021008	CGT	2	6	13027	13032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134922
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160	NC_021008	GGA	2	6	15402	15407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479134926
161	NC_021008	TAC	2	6	15415	15420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479134926
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251	NC_021008	GTG	2	6	22741	22746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479134931
252	NC_021008	TCA	2	6	22786	22791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479134931
253	NC_021008	ATC	2	6	23047	23052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479134931
254	NC_021008	TGC	2	6	23077	23082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134931
255	NC_021008	TCA	2	6	23116	23121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479134931
256	NC_021008	CAC	2	6	23207	23212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479134931
257	NC_021008	TCA	2	6	23315	23320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479134931
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272	NC_021008	TCT	2	6	27809	27814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479134932
273	NC_021008	ATA	2	6	27910	27915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479134932
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280	NC_021008	CAG	2	6	28653	28658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479134932
281	NC_021008	TTC	2	6	28915	28920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479134932
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284	NC_021008	ATA	2	6	29194	29199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479134932
285	NC_021008	CTC	2	6	29200	29205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479134932
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493	NC_021008	CGG	2	6	51842	51847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134946
494	NC_021008	TCA	2	6	51895	51900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479134946
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497	NC_021008	ACG	2	6	52108	52113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479134946
498	NC_021008	CCA	3	9	52114	52122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479134946
499	NC_021008	GGC	2	6	52211	52216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134946
500	NC_021008	ATC	2	6	52246	52251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479134946

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