MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum F8 draft genome

Total Repeats: 466

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021008	T	6	6	131	136	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021008	T	7	7	212	218	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021008	G	6	6	2336	2341	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021008	G	6	6	2993	2998	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021008	A	6	6	5598	5603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021008	A	6	6	5840	5845	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021008	T	7	7	5861	5867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021008	T	6	6	11238	11243	0 %	100 %	0 %	0 %	479134921
9	NC_021008	T	6	6	11701	11706	0 %	100 %	0 %	0 %	479134921
10	NC_021008	A	7	7	17066	17072	100 %	0 %	0 %	0 %	479134926
11	NC_021008	A	6	6	17149	17154	100 %	0 %	0 %	0 %	479134926
12	NC_021008	A	6	6	31941	31946	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021008	T	6	6	39303	39308	0 %	100 %	0 %	0 %	479134937
14	NC_021008	T	6	6	42644	42649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021008	T	6	6	55799	55804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021008	T	6	6	56751	56756	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021008	T	6	6	59343	59348	0 %	100 %	0 %	0 %	479134952
18	NC_021008	C	6	6	60385	60390	0 %	0 %	0 %	100 %	479134954
19	NC_021008	A	6	6	80423	80428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021008	C	6	6	81456	81461	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
21	NC_021008	C	6	6	81726	81731	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
22	NC_021008	A	6	6	82246	82251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021008	C	6	6	82330	82335	0 %	0 %	0 %	100 %	479134973
24	NC_021008	T	6	6	97859	97864	0 %	100 %	0 %	0 %	479134983
25	NC_021008	C	6	6	98650	98655	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
26	NC_021008	A	6	6	106792	106797	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021008	C	6	6	106933	106938	0 %	0 %	0 %	100 %	479134992
28	NC_021008	C	6	6	127907	127912	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
29	NC_021008	T	6	6	137928	137933	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021008	T	6	6	142708	142713	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021008	A	6	6	143665	143670	100 %	0 %	0 %	0 %	479135017
32	NC_021008	T	6	6	145465	145470	0 %	100 %	0 %	0 %	479135018
33	NC_021008	T	6	6	150522	150527	0 %	100 %	0 %	0 %	479135021
34	NC_021008	T	6	6	151646	151651	0 %	100 %	0 %	0 %	479135022
35	NC_021008	N	11	11	155805	155815	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021008	T	6	6	163519	163524	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021008	G	6	6	168722	168727	0 %	0 %	100 %	0 %	479135032
38	NC_021008	C	6	6	171338	171343	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
39	NC_021008	T	6	6	180114	180119	0 %	100 %	0 %	0 %	479135039
40	NC_021008	T	6	6	181398	181403	0 %	100 %	0 %	0 %	479135041
41	NC_021008	A	6	6	182411	182416	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021008	G	6	6	186324	186329	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021008	T	6	6	187068	187073	0 %	100 %	0 %	0 %	479135047
44	NC_021008	T	6	6	191611	191616	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021008	A	6	6	201742	201747	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021008	T	8	8	213606	213613	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021008	C	6	6	213660	213665	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
48	NC_021008	T	6	6	218395	218400	0 %	100 %	0 %	0 %	479135070
49	NC_021008	T	6	6	251488	251493	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021008	T	6	6	270461	270466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021008	A	6	6	274963	274968	100 %	0 %	0 %	0 %	479135107
52	NC_021008	A	6	6	278036	278041	100 %	0 %	0 %	0 %	479135110
53	NC_021008	T	6	6	282896	282901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021008	T	6	6	286281	286286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021008	G	6	6	312593	312598	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021008	T	6	6	312861	312866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021008	A	6	6	314462	314467	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021008	T	6	6	329464	329469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021008	T	6	6	329497	329502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021008	C	6	6	331975	331980	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
61	NC_021008	C	6	6	335669	335674	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
62	NC_021008	A	6	6	337636	337641	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021008	T	6	6	342279	342284	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021008	A	6	6	345808	345813	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021008	T	6	6	349186	349191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021008	A	7	7	377040	377046	100 %	0 %	0 %	0 %	479135188
67	NC_021008	T	6	6	377205	377210	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021008	A	6	6	377455	377460	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021008	T	6	6	377877	377882	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021008	T	6	6	386130	386135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021008	C	6	6	386691	386696	0 %	0 %	0 %	100 %	479135191
72	NC_021008	A	6	6	388029	388034	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021008	G	6	6	391651	391656	0 %	0 %	100 %	0 %	479135195
74	NC_021008	N	295	295	392632	392926	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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76	NC_021008	N	1323	1323	397225	398547	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021008	T	6	6	398827	398832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021008	A	6	6	401864	401869	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021008	C	6	6	404818	404823	0 %	0 %	0 %	100 %	479135204
80	NC_021008	A	6	6	410850	410855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021008	T	6	6	414896	414901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021008	C	7	7	425277	425283	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
83	NC_021008	C	6	6	425662	425667	0 %	0 %	0 %	100 %	479135222
84	NC_021008	T	7	7	427756	427762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021008	T	7	7	436026	436032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021008	N	1323	1323	440581	441903	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021008	A	7	7	441926	441932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021008	T	6	6	448400	448405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021008	T	7	7	448555	448561	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021008	A	6	6	450275	450280	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021008	T	7	7	452048	452054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021008	A	6	6	457147	457152	100 %	0 %	0 %	0 %	479135241
93	NC_021008	C	6	6	457549	457554	0 %	0 %	0 %	100 %	479135241
94	NC_021008	T	6	6	461489	461494	0 %	100 %	0 %	0 %	479135245
95	NC_021008	C	6	6	468884	468889	0 %	0 %	0 %	100 %	479135248
96	NC_021008	A	6	6	470361	470366	100 %	0 %	0 %	0 %	479135249
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98	NC_021008	T	6	6	472316	472321	0 %	100 %	0 %	0 %	479135250
99	NC_021008	T	6	6	474302	474307	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021008	T	6	6	474464	474469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021008	G	6	6	483428	483433	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021008	T	6	6	483491	483496	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021008	T	6	6	493298	493303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021008	T	6	6	497633	497638	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021008	A	6	6	497692	497697	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021008	G	6	6	498477	498482	0 %	0 %	100 %	0 %	479135280
107	NC_021008	T	7	7	506664	506670	0 %	100 %	0 %	0 %	479135285
108	NC_021008	A	6	6	509557	509562	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021008	T	6	6	515497	515502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021008	A	7	7	518825	518831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021008	A	6	6	530470	530475	100 %	0 %	0 %	0 %	479135303
112	NC_021008	A	6	6	533398	533403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021008	A	8	8	537047	537054	100 %	0 %	0 %	0 %	479135307
114	NC_021008	T	6	6	537100	537105	0 %	100 %	0 %	0 %	479135307
115	NC_021008	T	6	6	541107	541112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021008	C	9	9	543913	543921	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
117	NC_021008	T	6	6	543926	543931	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021008	N	1869	1869	544603	546471	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021008	C	10	10	547988	547997	0 %	0 %	0 %	100 %	479135310
120	NC_021008	C	6	6	548325	548330	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
121	NC_021008	T	6	6	550089	550094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021008	T	7	7	552749	552755	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021008	A	6	6	557072	557077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021008	G	6	6	557162	557167	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021008	N	309	309	566466	566774	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021008	T	6	6	570589	570594	0 %	100 %	0 %	0 %	479135315
127	NC_021008	T	6	6	573362	573367	0 %	100 %	0 %	0 %	479135317
128	NC_021008	C	8	8	576610	576617	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
129	NC_021008	G	6	6	580590	580595	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021008	T	6	6	583505	583510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021008	T	7	7	585899	585905	0 %	100 %	0 %	0 %	479135329
132	NC_021008	A	6	6	589296	589301	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021008	C	6	6	596715	596720	0 %	0 %	0 %	100 %	479135338
134	NC_021008	A	6	6	604531	604536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021008	A	6	6	604562	604567	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021008	A	6	6	616517	616522	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021008	A	6	6	627456	627461	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021008	C	7	7	627552	627558	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
139	NC_021008	A	6	6	629044	629049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021008	A	6	6	634592	634597	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021008	T	6	6	637494	637499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021008	T	6	6	642315	642320	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021008	T	6	6	643824	643829	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021008	N	245	245	655413	655657	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021008	A	6	6	656104	656109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021008	A	6	6	662960	662965	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021008	A	7	7	663599	663605	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021008	A	6	6	664123	664128	100 %	0 %	0 %	0 %	479135386
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.