MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Non-Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum F8 draft genome

Total Repeats: 316

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021008	T	6	6	131	136	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021008	T	7	7	212	218	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021008	G	6	6	2336	2341	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021008	G	6	6	2993	2998	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021008	A	6	6	5598	5603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021008	A	6	6	5840	5845	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021008	T	7	7	5861	5867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021008	A	6	6	31941	31946	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021008	T	6	6	42644	42649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021008	T	6	6	55799	55804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021008	T	6	6	56751	56756	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021008	A	6	6	80423	80428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021008	C	6	6	81456	81461	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14	NC_021008	C	6	6	81726	81731	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15	NC_021008	A	6	6	82246	82251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021008	C	6	6	98650	98655	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
17	NC_021008	A	6	6	106792	106797	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021008	C	6	6	127907	127912	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
19	NC_021008	T	6	6	137928	137933	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021008	T	6	6	142708	142713	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021008	N	11	11	155805	155815	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021008	T	6	6	163519	163524	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021008	C	6	6	171338	171343	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
24	NC_021008	A	6	6	182411	182416	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021008	G	6	6	186324	186329	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021008	T	6	6	191611	191616	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021008	A	6	6	201742	201747	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021008	T	8	8	213606	213613	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021008	C	6	6	213660	213665	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
30	NC_021008	T	6	6	251488	251493	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021008	T	6	6	270461	270466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021008	T	6	6	282896	282901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021008	T	6	6	286281	286286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021008	G	6	6	312593	312598	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021008	T	6	6	312861	312866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021008	A	6	6	314462	314467	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021008	T	6	6	329464	329469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021008	T	6	6	329497	329502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021008	C	6	6	331975	331980	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
40	NC_021008	C	6	6	335669	335674	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
41	NC_021008	A	6	6	337636	337641	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021008	T	6	6	342279	342284	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021008	A	6	6	345808	345813	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021008	T	6	6	349186	349191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021008	T	6	6	377205	377210	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021008	A	6	6	377455	377460	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021008	T	6	6	377877	377882	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021008	T	6	6	386130	386135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021008	A	6	6	388029	388034	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021008	N	295	295	392632	392926	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021008	N	1323	1323	397225	398547	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021008	T	6	6	398827	398832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021008	A	6	6	401864	401869	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021008	A	6	6	410850	410855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021008	T	6	6	414896	414901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021008	C	7	7	425277	425283	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
57	NC_021008	T	7	7	427756	427762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021008	T	7	7	436026	436032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021008	N	1323	1323	440581	441903	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021008	A	7	7	441926	441932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021008	T	6	6	448400	448405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021008	T	7	7	448555	448561	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021008	A	6	6	450275	450280	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021008	T	7	7	452048	452054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021008	T	6	6	474302	474307	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021008	T	6	6	474464	474469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021008	G	6	6	483428	483433	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021008	T	6	6	483491	483496	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021008	T	6	6	493298	493303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021008	T	6	6	497633	497638	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021008	A	6	6	497692	497697	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021008	A	6	6	509557	509562	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021008	T	6	6	515497	515502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021008	A	7	7	518825	518831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021008	A	6	6	533398	533403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021008	T	6	6	541107	541112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021008	C	9	9	543913	543921	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
78	NC_021008	T	6	6	543926	543931	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021008	N	1869	1869	544603	546471	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021008	C	6	6	548325	548330	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
81	NC_021008	T	6	6	550089	550094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021008	T	7	7	552749	552755	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021008	A	6	6	557072	557077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021008	G	6	6	557162	557167	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021008	N	309	309	566466	566774	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021008	C	8	8	576610	576617	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
87	NC_021008	G	6	6	580590	580595	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021008	T	6	6	583505	583510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021008	A	6	6	589296	589301	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021008	A	6	6	604531	604536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021008	A	6	6	604562	604567	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021008	A	6	6	616517	616522	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021008	A	6	6	627456	627461	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021008	C	7	7	627552	627558	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
95	NC_021008	A	6	6	629044	629049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021008	A	6	6	634592	634597	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021008	T	6	6	637494	637499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021008	T	6	6	642315	642320	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021008	T	6	6	643824	643829	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021008	N	245	245	655413	655657	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021008	A	6	6	656104	656109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021008	A	6	6	662960	662965	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021008	A	7	7	663599	663605	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021008	T	6	6	670012	670017	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021008	A	6	6	670612	670617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021008	C	6	6	690500	690505	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
107	NC_021008	T	7	7	701863	701869	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021008	N	291	291	706109	706399	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021008	C	6	6	727848	727853	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
110	NC_021008	T	6	6	745507	745512	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021008	A	7	7	763929	763935	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021008	C	6	6	767389	767394	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
113	NC_021008	A	9	9	773327	773335	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021008	G	9	9	781376	781384	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021008	G	6	6	781405	781410	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021008	T	6	6	782599	782604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021008	A	6	6	793155	793160	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021008	A	6	6	802342	802347	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021008	T	6	6	802442	802447	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021008	A	6	6	836575	836580	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021008	G	8	8	857338	857345	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021008	T	6	6	861553	861558	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021008	A	7	7	875596	875602	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021008	A	7	7	876720	876726	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021008	A	6	6	905366	905371	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021008	T	6	6	911498	911503	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021008	N	284	284	936454	936737	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021008	A	8	8	942743	942750	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021008	T	6	6	944343	944348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021008	T	6	6	955461	955466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021008	A	6	6	1001675	1001680	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021008	A	7	7	1016063	1016069	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021008	A	6	6	1017802	1017807	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021008	N	1582	1582	1018747	1020328	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021008	A	6	6	1023342	1023347	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021008	N	310	310	1047126	1047435	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021008	T	6	6	1047573	1047578	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021008	A	6	6	1047786	1047791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021008	C	6	6	1049777	1049782	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
140	NC_021008	N	237	237	1052290	1052526	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021008	A	6	6	1059776	1059781	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021008	N	320	320	1060604	1060923	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021008	T	9	9	1064655	1064663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021008	G	6	6	1081157	1081162	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021008	T	10	10	1099510	1099519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021008	T	6	6	1116671	1116676	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021008	A	6	6	1135351	1135356	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021008	A	6	6	1142410	1142415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021008	T	6	6	1155606	1155611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_021008	T	6	6	1162541	1162546	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_021008	G	6	6	1170095	1170100	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
152	NC_021008	G	6	6	1170113	1170118	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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301	NC_021008	T	7	7	2284924	2284930	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
302	NC_021008	T	6	6	2287701	2287706	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
303	NC_021008	N	958	958	2294651	2295608	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
304	NC_021008	T	6	6	2296147	2296152	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
305	NC_021008	A	6	6	2311767	2311772	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
306	NC_021008	A	8	8	2316041	2316048	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
307	NC_021008	G	8	8	2316060	2316067	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
308	NC_021008	C	10	10	2316091	2316100	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
309	NC_021008	G	7	7	2316120	2316126	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
310	NC_021008	G	6	6	2316160	2316165	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
311	NC_021008	A	7	7	2321944	2321950	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
312	NC_021008	A	6	6	2331076	2331081	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
313	NC_021008	T	6	6	2332491	2332496	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
314	NC_021008	G	12	12	2332782	2332793	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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316	NC_021008	A	6	6	2370891	2370896	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.