MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034156 draft genome

Total Repeats: 1547

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021006	CCATG	2	10	1759	1768	20 %	20 %	20 %	40 %	480532170
2	NC_021006	AGTCA	2	10	2241	2250	40 %	20 %	20 %	20 %	480532171
3	NC_021006	GTCGA	2	10	4109	4118	20 %	20 %	40 %	20 %	480532173
4	NC_021006	GCCCT	2	10	4132	4141	0 %	20 %	20 %	60 %	480532173
5	NC_021006	TCAGG	2	10	6845	6854	20 %	20 %	40 %	20 %	480532176
6	NC_021006	TGGTT	2	10	8166	8175	0 %	60 %	40 %	0 %	480532178
7	NC_021006	ATCGC	2	10	12724	12733	20 %	20 %	20 %	40 %	480532182
8	NC_021006	AGCAA	2	10	12939	12948	60 %	0 %	20 %	20 %	480532182
9	NC_021006	TCAAA	2	10	12956	12965	60 %	20 %	0 %	20 %	480532182
10	NC_021006	ACTAT	2	10	15470	15479	40 %	40 %	0 %	20 %	480532186
11	NC_021006	AAGAA	2	10	17359	17368	80 %	0 %	20 %	0 %	480532188
12	NC_021006	AAATT	2	10	19033	19042	60 %	40 %	0 %	0 %	480532190
13	NC_021006	CAAGA	2	10	19756	19765	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_021006	TTAAA	2	10	20268	20277	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021006	ACAAA	2	10	25641	25650	80 %	0 %	0 %	20 %	480532198
16	NC_021006	GGTAT	2	10	26644	26653	20 %	40 %	40 %	0 %	480532199
17	NC_021006	AAATC	2	10	27795	27804	60 %	20 %	0 %	20 %	480532199
18	NC_021006	TGGAA	2	10	27819	27828	40 %	20 %	40 %	0 %	480532199
19	NC_021006	AAAAT	2	10	28645	28654	80 %	20 %	0 %	0 %	480532200
20	NC_021006	AACAC	2	10	29192	29201	60 %	0 %	0 %	40 %	480532201
21	NC_021006	GGAGT	2	10	30313	30322	20 %	20 %	60 %	0 %	480532202
22	NC_021006	AGAGT	2	10	31564	31573	40 %	20 %	40 %	0 %	480532203
23	NC_021006	TTGAA	2	10	33694	33703	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021006	AAAGC	2	10	33759	33768	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_021006	TAAAA	2	10	35089	35098	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021006	TATAT	2	10	35146	35155	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021006	AAAAT	2	10	36233	36242	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021006	AAAGG	2	10	36715	36724	60 %	0 %	40 %	0 %	480532208
29	NC_021006	GATAT	2	10	36983	36992	40 %	40 %	20 %	0 %	480532208
30	NC_021006	ATGAT	2	10	38447	38456	40 %	40 %	20 %	0 %	480532210
31	NC_021006	TGTTA	2	10	38790	38799	20 %	60 %	20 %	0 %	480532210
32	NC_021006	AAAGG	2	10	39076	39085	60 %	0 %	40 %	0 %	480532210
33	NC_021006	GGAAG	2	10	39099	39108	40 %	0 %	60 %	0 %	480532210
34	NC_021006	ATTTT	2	10	39811	39820	20 %	80 %	0 %	0 %	480532211
35	NC_021006	TGGAA	2	10	41456	41465	40 %	20 %	40 %	0 %	480532213
36	NC_021006	ATTCA	2	10	41802	41811	40 %	40 %	0 %	20 %	480532213
37	NC_021006	AAATC	2	10	41951	41960	60 %	20 %	0 %	20 %	480532213
38	NC_021006	CGTAT	2	10	43363	43372	20 %	40 %	20 %	20 %	480532215
39	NC_021006	TGAAA	2	10	44416	44425	60 %	20 %	20 %	0 %	480532215
40	NC_021006	GGTAA	2	10	45835	45844	40 %	20 %	40 %	0 %	480532217
41	NC_021006	AATTT	2	10	47289	47298	40 %	60 %	0 %	0 %	480532218
42	NC_021006	TAAAA	2	10	48006	48015	80 %	20 %	0 %	0 %	480532219
43	NC_021006	ATTAA	2	10	48539	48548	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021006	TTTGG	2	10	50145	50154	0 %	60 %	40 %	0 %	480532221
45	NC_021006	ATATT	2	10	52771	52780	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021006	GCATT	2	10	53577	53586	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_021006	AAAAT	2	10	54865	54874	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021006	TAAAA	2	10	55976	55985	80 %	20 %	0 %	0 %	480532225
49	NC_021006	TGAAT	2	10	57607	57616	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021006	AAAGA	2	10	57826	57835	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021006	ATACA	2	10	59473	59482	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_021006	CAACG	2	10	59589	59598	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
53	NC_021006	TTGAT	2	10	64463	64472	20 %	60 %	20 %	0 %	480532230
54	NC_021006	AGCAG	2	10	68610	68619	40 %	0 %	40 %	20 %	480532233
55	NC_021006	CTTGA	2	10	69321	69330	20 %	40 %	20 %	20 %	480532234
56	NC_021006	AGAGA	2	10	71296	71305	60 %	0 %	40 %	0 %	480532236
57	NC_021006	ATGGT	2	10	73320	73329	20 %	40 %	40 %	0 %	480532240
58	NC_021006	AGACA	2	10	74275	74284	60 %	0 %	20 %	20 %	480532240
59	NC_021006	AAATG	2	10	74852	74861	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021006	AAATT	2	10	74977	74986	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021006	TGATT	2	10	79080	79089	20 %	60 %	20 %	0 %	480532245
62	NC_021006	TGTCA	2	10	79772	79781	20 %	40 %	20 %	20 %	480532245
63	NC_021006	AGTAA	2	10	80052	80061	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021006	GAAGA	2	10	81224	81233	60 %	0 %	40 %	0 %	480532246
65	NC_021006	TGATT	2	10	81676	81685	20 %	60 %	20 %	0 %	480532246
66	NC_021006	CAGGA	2	10	83671	83680	40 %	0 %	40 %	20 %	480532247
67	NC_021006	ATCGT	2	10	86947	86956	20 %	40 %	20 %	20 %	480532252
68	NC_021006	TTTCA	2	10	88639	88648	20 %	60 %	0 %	20 %	480532254
69	NC_021006	TCAAT	2	10	88992	89001	40 %	40 %	0 %	20 %	480532254
70	NC_021006	ATTAC	2	10	89460	89469	40 %	40 %	0 %	20 %	480532255
71	NC_021006	CTTTG	2	10	91102	91111	0 %	60 %	20 %	20 %	480532257
72	NC_021006	AAGCT	2	10	92841	92850	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_021006	GAAAG	2	10	98076	98085	60 %	0 %	40 %	0 %	480532263
74	NC_021006	TCGAT	2	10	98686	98695	20 %	40 %	20 %	20 %	480532264
75	NC_021006	ATTTC	2	10	98719	98728	20 %	60 %	0 %	20 %	480532264
76	NC_021006	AATCA	2	10	98892	98901	60 %	20 %	0 %	20 %	480532264
77	NC_021006	TTTAT	2	10	101171	101180	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021006	AGCCA	2	10	103015	103024	40 %	0 %	20 %	40 %	480532267
79	NC_021006	ATCAG	2	10	103137	103146	40 %	20 %	20 %	20 %	480532267
80	NC_021006	TATGA	2	10	103542	103551	40 %	40 %	20 %	0 %	480532268
81	NC_021006	TGCAG	2	10	104109	104118	20 %	20 %	40 %	20 %	480532269
82	NC_021006	CTATT	2	10	105128	105137	20 %	60 %	0 %	20 %	480532269
83	NC_021006	TTTGG	2	10	106863	106872	0 %	60 %	40 %	0 %	480532270
84	NC_021006	ACAAT	2	10	107992	108001	60 %	20 %	0 %	20 %	480532271
85	NC_021006	AATAT	2	10	108778	108787	60 %	40 %	0 %	0 %	480532271
86	NC_021006	ATTTC	2	10	111971	111980	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_021006	AGTCC	2	10	113006	113015	20 %	20 %	20 %	40 %	480532273
88	NC_021006	AAATG	2	10	114090	114099	60 %	20 %	20 %	0 %	480532274
89	NC_021006	CAAAC	2	10	115566	115575	60 %	0 %	0 %	40 %	480532275
90	NC_021006	ATTCT	2	10	116002	116011	20 %	60 %	0 %	20 %	480532275
91	NC_021006	ACCAA	2	10	116020	116029	60 %	0 %	0 %	40 %	480532275
92	NC_021006	CAATC	2	10	117579	117588	40 %	20 %	0 %	40 %	480532276
93	NC_021006	TAGTT	2	10	117771	117780	20 %	60 %	20 %	0 %	480532276
94	NC_021006	ATTTT	2	10	121799	121808	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021006	ATTTC	2	10	122310	122319	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_021006	AATCA	2	10	123821	123830	60 %	20 %	0 %	20 %	480532280
97	NC_021006	GAAGC	2	10	124341	124350	40 %	0 %	40 %	20 %	480532280
98	NC_021006	CTACG	2	10	125558	125567	20 %	20 %	20 %	40 %	480532280
99	NC_021006	GAAAC	2	10	128191	128200	60 %	0 %	20 %	20 %	480532281
100	NC_021006	TGTTC	2	10	130014	130023	0 %	60 %	20 %	20 %	480532281
101	NC_021006	GGAAT	2	10	130438	130447	40 %	20 %	40 %	0 %	480532282
102	NC_021006	TAATA	2	10	131692	131701	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021006	TAGCT	2	10	132080	132089	20 %	40 %	20 %	20 %	480532283
104	NC_021006	AAGAA	2	10	132530	132539	80 %	0 %	20 %	0 %	480532283
105	NC_021006	AAAAG	2	10	132620	132629	80 %	0 %	20 %	0 %	480532283
106	NC_021006	TCTAG	2	10	136128	136137	20 %	40 %	20 %	20 %	480532283
107	NC_021006	ATGGT	2	10	137161	137170	20 %	40 %	40 %	0 %	480532283
108	NC_021006	TAGTT	2	10	137780	137789	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021006	ATATA	2	10	137918	137927	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021006	TAAAA	2	10	138004	138013	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021006	ACTAT	2	10	139743	139752	40 %	40 %	0 %	20 %	480532286
112	NC_021006	GTTTT	2	10	139896	139905	0 %	80 %	20 %	0 %	480532286
113	NC_021006	TCCAG	2	10	140148	140157	20 %	20 %	20 %	40 %	480532286
114	NC_021006	TATGT	2	10	141256	141265	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021006	TGAAA	2	10	141486	141495	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021006	AATCA	2	10	141522	141531	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_021006	TGTTT	2	10	141685	141694	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021006	GTAAT	2	10	142223	142232	40 %	40 %	20 %	0 %	480532287
119	NC_021006	CTTTA	2	10	143952	143961	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_021006	GTTGG	2	10	145943	145952	0 %	40 %	60 %	0 %	480532290
121	NC_021006	ATGTT	2	10	146610	146619	20 %	60 %	20 %	0 %	480532290
122	NC_021006	CTTAT	2	10	147003	147012	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_021006	CAGAA	2	10	149872	149881	60 %	0 %	20 %	20 %	480532293
124	NC_021006	TGGCT	2	10	152349	152358	0 %	40 %	40 %	20 %	480532295
125	NC_021006	CGCGC	2	10	152386	152395	0 %	0 %	40 %	60 %	480532295
126	NC_021006	TCTTT	2	10	154188	154197	0 %	80 %	0 %	20 %	480532298
127	NC_021006	TAAAA	2	10	155055	155064	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021006	AAGTA	2	10	155358	155367	60 %	20 %	20 %	0 %	480532299
129	NC_021006	AGTCA	2	10	159951	159960	40 %	20 %	20 %	20 %	480532301
130	NC_021006	ATTTT	2	10	161014	161023	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021006	CTTTC	2	10	162151	162160	0 %	60 %	0 %	40 %	480532304
132	NC_021006	CATAA	2	10	163588	163597	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_021006	GATTT	2	10	165272	165281	20 %	60 %	20 %	0 %	480532306
134	NC_021006	TATAA	2	10	166108	166117	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021006	AATCC	2	10	166561	166570	40 %	20 %	0 %	40 %	480532307
136	NC_021006	TTTGA	2	10	166618	166627	20 %	60 %	20 %	0 %	480532307
137	NC_021006	GAGAG	2	10	167643	167652	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021006	TTGAT	2	10	169200	169209	20 %	60 %	20 %	0 %	480532308
139	NC_021006	GAGAA	2	10	169389	169398	60 %	0 %	40 %	0 %	480532308
140	NC_021006	CTTTC	2	10	169475	169484	0 %	60 %	0 %	40 %	480532308
141	NC_021006	AATGA	2	10	170217	170226	60 %	20 %	20 %	0 %	480532310
142	NC_021006	ATTTT	2	10	175625	175634	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021006	TTGGA	2	10	176746	176755	20 %	40 %	40 %	0 %	480532316
144	NC_021006	CTTTT	2	10	181344	181353	0 %	80 %	0 %	20 %	480532320
145	NC_021006	CCAAG	2	10	181409	181418	40 %	0 %	20 %	40 %	480532320
146	NC_021006	GAATA	2	10	182847	182856	60 %	20 %	20 %	0 %	480532321
147	NC_021006	TTTTG	2	10	183148	183157	0 %	80 %	20 %	0 %	480532322
148	NC_021006	ACTCA	2	10	185578	185587	40 %	20 %	0 %	40 %	480532325
149	NC_021006	TTTGG	2	10	188228	188237	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
150	NC_021006	CTTCA	2	10	194186	194195	20 %	40 %	0 %	40 %	480532331
151	NC_021006	ATTTT	2	10	195144	195153	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_021006	CCATA	2	10	197248	197257	40 %	20 %	0 %	40 %	480532335
153	NC_021006	AATCA	2	10	198372	198381	60 %	20 %	0 %	20 %	480532336
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155	NC_021006	GGAAT	2	10	203429	203438	40 %	20 %	40 %	0 %	480532340
156	NC_021006	TCCTA	2	10	205755	205764	20 %	40 %	0 %	40 %	480532344
157	NC_021006	TTTTC	2	10	206132	206141	0 %	80 %	0 %	20 %	480532345
158	NC_021006	ACCAG	2	10	206481	206490	40 %	0 %	20 %	40 %	480532345
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161	NC_021006	ACCTG	2	10	208965	208974	20 %	20 %	20 %	40 %	480532348
162	NC_021006	TGAAA	2	10	211563	211572	60 %	20 %	20 %	0 %	480532350
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165	NC_021006	GATTA	2	10	215463	215472	40 %	40 %	20 %	0 %	480532353
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171	NC_021006	TTGAT	2	10	221299	221308	20 %	60 %	20 %	0 %	480532356
172	NC_021006	TTTCT	2	10	221378	221387	0 %	80 %	0 %	20 %	480532356
173	NC_021006	CCTTG	2	10	221471	221480	0 %	40 %	20 %	40 %	480532356
174	NC_021006	CTGCT	2	10	221945	221954	0 %	40 %	20 %	40 %	480532357
175	NC_021006	CATAT	2	10	227500	227509	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
176	NC_021006	ATATA	2	10	228858	228867	60 %	40 %	0 %	0 %	480532362
177	NC_021006	GGCTA	2	10	230492	230501	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
178	NC_021006	AAAGG	2	10	232966	232975	60 %	0 %	40 %	0 %	480532365
179	NC_021006	CTTTT	2	10	235576	235585	0 %	80 %	0 %	20 %	480532367
180	NC_021006	AGCTG	2	10	236789	236798	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
181	NC_021006	ATTTT	2	10	236858	236867	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_021006	CTCTA	2	10	237320	237329	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
183	NC_021006	TAAAA	2	10	238018	238027	80 %	20 %	0 %	0 %	480532368
184	NC_021006	TTCAG	2	10	249588	249597	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
185	NC_021006	GCCTT	2	10	250820	250829	0 %	40 %	20 %	40 %	480532378
186	NC_021006	TCCAA	2	10	251634	251643	40 %	20 %	0 %	40 %	480532379
187	NC_021006	AAAAG	2	10	252398	252407	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
188	NC_021006	GTTTT	2	10	253876	253885	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
189	NC_021006	CTATA	2	10	253892	253901	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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191	NC_021006	CTTTT	2	10	255423	255432	0 %	80 %	0 %	20 %	480532384
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195	NC_021006	ATTTT	2	10	257277	257286	20 %	80 %	0 %	0 %	480532386
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199	NC_021006	CATTC	2	10	259280	259289	20 %	40 %	0 %	40 %	480532388
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204	NC_021006	AACCA	2	10	265439	265448	60 %	0 %	0 %	40 %	480532395
205	NC_021006	AATGA	2	10	267006	267015	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
206	NC_021006	ACAAT	2	10	267709	267718	60 %	20 %	0 %	20 %	480532399
207	NC_021006	TTTTC	2	10	269482	269491	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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209	NC_021006	TTCAA	2	10	269939	269948	40 %	40 %	0 %	20 %	480532401
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211	NC_021006	GGCAA	2	10	271307	271316	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
212	NC_021006	GTTAT	2	10	272135	272144	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
213	NC_021006	GACTC	2	10	273566	273575	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
214	NC_021006	AAAAT	2	10	273842	273851	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
215	NC_021006	ATACC	2	10	279634	279643	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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246	NC_021006	AATAA	2	10	311150	311159	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
247	NC_021006	AAAAC	2	10	312782	312791	80 %	0 %	0 %	20 %	480532439
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249	NC_021006	GGGCT	2	10	314065	314074	0 %	20 %	60 %	20 %	480532440
250	NC_021006	CTTGA	2	10	315496	315505	20 %	40 %	20 %	20 %	480532441
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253	NC_021006	ATGGT	2	10	317426	317435	20 %	40 %	40 %	0 %	480532441
254	NC_021006	GGCAA	2	10	318793	318802	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
255	NC_021006	TAGAA	2	10	318870	318879	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
256	NC_021006	CCATA	2	10	320873	320882	40 %	20 %	0 %	40 %	480532446
257	NC_021006	ATGAC	2	10	321034	321043	40 %	20 %	20 %	20 %	480532446
258	NC_021006	CTAAA	2	10	321476	321485	60 %	20 %	0 %	20 %	480532446
259	NC_021006	CGATA	2	10	323008	323017	40 %	20 %	20 %	20 %	480532448
260	NC_021006	GACAA	2	10	323193	323202	60 %	0 %	20 %	20 %	480532448
261	NC_021006	CTGTG	2	10	324179	324188	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
262	NC_021006	GTATT	2	10	325313	325322	20 %	60 %	20 %	0 %	480532449
263	NC_021006	AAATT	2	10	326129	326138	60 %	40 %	0 %	0 %	480532450
264	NC_021006	CGTAC	2	10	328320	328329	20 %	20 %	20 %	40 %	480532452
265	NC_021006	AGCCA	2	10	332351	332360	40 %	0 %	20 %	40 %	480532457
266	NC_021006	CCATT	2	10	333805	333814	20 %	40 %	0 %	40 %	480532458
267	NC_021006	CCCCT	2	10	334211	334220	0 %	20 %	0 %	80 %	480532458
268	NC_021006	AGTTG	2	10	334236	334245	20 %	40 %	40 %	0 %	480532458
269	NC_021006	TAAAC	2	10	334341	334350	60 %	20 %	0 %	20 %	480532458
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271	NC_021006	TTCTT	2	10	335882	335891	0 %	80 %	0 %	20 %	480532461
272	NC_021006	CTTTC	2	10	336206	336215	0 %	60 %	0 %	40 %	480532462
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288	NC_021006	GTTTA	2	10	352824	352833	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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389	NC_021006	GTTGA	2	10	495625	495634	20 %	40 %	40 %	0 %	480532603
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392	NC_021006	CTTTC	2	10	498244	498253	0 %	60 %	0 %	40 %	480532606
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401	NC_021006	TCACT	2	10	510439	510448	20 %	40 %	0 %	40 %	480532620
402	NC_021006	CCATT	2	10	515009	515018	20 %	40 %	0 %	40 %	480532623
403	NC_021006	ATCCC	2	10	515427	515436	20 %	20 %	0 %	60 %	480532623
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