MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034156 draft genome

Total Repeats: 1158

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021006	CCATG	2	10	1759	1768	20 %	20 %	20 %	40 %	480532170
2	NC_021006	AGTCA	2	10	2241	2250	40 %	20 %	20 %	20 %	480532171
3	NC_021006	GTCGA	2	10	4109	4118	20 %	20 %	40 %	20 %	480532173
4	NC_021006	GCCCT	2	10	4132	4141	0 %	20 %	20 %	60 %	480532173
5	NC_021006	TCAGG	2	10	6845	6854	20 %	20 %	40 %	20 %	480532176
6	NC_021006	TGGTT	2	10	8166	8175	0 %	60 %	40 %	0 %	480532178
7	NC_021006	ATCGC	2	10	12724	12733	20 %	20 %	20 %	40 %	480532182
8	NC_021006	AGCAA	2	10	12939	12948	60 %	0 %	20 %	20 %	480532182
9	NC_021006	TCAAA	2	10	12956	12965	60 %	20 %	0 %	20 %	480532182
10	NC_021006	ACTAT	2	10	15470	15479	40 %	40 %	0 %	20 %	480532186
11	NC_021006	AAGAA	2	10	17359	17368	80 %	0 %	20 %	0 %	480532188
12	NC_021006	AAATT	2	10	19033	19042	60 %	40 %	0 %	0 %	480532190
13	NC_021006	ACAAA	2	10	25641	25650	80 %	0 %	0 %	20 %	480532198
14	NC_021006	GGTAT	2	10	26644	26653	20 %	40 %	40 %	0 %	480532199
15	NC_021006	AAATC	2	10	27795	27804	60 %	20 %	0 %	20 %	480532199
16	NC_021006	TGGAA	2	10	27819	27828	40 %	20 %	40 %	0 %	480532199
17	NC_021006	AAAAT	2	10	28645	28654	80 %	20 %	0 %	0 %	480532200
18	NC_021006	AACAC	2	10	29192	29201	60 %	0 %	0 %	40 %	480532201
19	NC_021006	GGAGT	2	10	30313	30322	20 %	20 %	60 %	0 %	480532202
20	NC_021006	AGAGT	2	10	31564	31573	40 %	20 %	40 %	0 %	480532203
21	NC_021006	AAAGG	2	10	36715	36724	60 %	0 %	40 %	0 %	480532208
22	NC_021006	GATAT	2	10	36983	36992	40 %	40 %	20 %	0 %	480532208
23	NC_021006	ATGAT	2	10	38447	38456	40 %	40 %	20 %	0 %	480532210
24	NC_021006	TGTTA	2	10	38790	38799	20 %	60 %	20 %	0 %	480532210
25	NC_021006	AAAGG	2	10	39076	39085	60 %	0 %	40 %	0 %	480532210
26	NC_021006	GGAAG	2	10	39099	39108	40 %	0 %	60 %	0 %	480532210
27	NC_021006	ATTTT	2	10	39811	39820	20 %	80 %	0 %	0 %	480532211
28	NC_021006	TGGAA	2	10	41456	41465	40 %	20 %	40 %	0 %	480532213
29	NC_021006	ATTCA	2	10	41802	41811	40 %	40 %	0 %	20 %	480532213
30	NC_021006	AAATC	2	10	41951	41960	60 %	20 %	0 %	20 %	480532213
31	NC_021006	CGTAT	2	10	43363	43372	20 %	40 %	20 %	20 %	480532215
32	NC_021006	TGAAA	2	10	44416	44425	60 %	20 %	20 %	0 %	480532215
33	NC_021006	GGTAA	2	10	45835	45844	40 %	20 %	40 %	0 %	480532217
34	NC_021006	AATTT	2	10	47289	47298	40 %	60 %	0 %	0 %	480532218
35	NC_021006	TAAAA	2	10	48006	48015	80 %	20 %	0 %	0 %	480532219
36	NC_021006	TTTGG	2	10	50145	50154	0 %	60 %	40 %	0 %	480532221
37	NC_021006	TAAAA	2	10	55976	55985	80 %	20 %	0 %	0 %	480532225
38	NC_021006	TTGAT	2	10	64463	64472	20 %	60 %	20 %	0 %	480532230
39	NC_021006	AGCAG	2	10	68610	68619	40 %	0 %	40 %	20 %	480532233
40	NC_021006	CTTGA	2	10	69321	69330	20 %	40 %	20 %	20 %	480532234
41	NC_021006	AGAGA	2	10	71296	71305	60 %	0 %	40 %	0 %	480532236
42	NC_021006	ATGGT	2	10	73320	73329	20 %	40 %	40 %	0 %	480532240
43	NC_021006	AGACA	2	10	74275	74284	60 %	0 %	20 %	20 %	480532240
44	NC_021006	TGATT	2	10	79080	79089	20 %	60 %	20 %	0 %	480532245
45	NC_021006	TGTCA	2	10	79772	79781	20 %	40 %	20 %	20 %	480532245
46	NC_021006	GAAGA	2	10	81224	81233	60 %	0 %	40 %	0 %	480532246
47	NC_021006	TGATT	2	10	81676	81685	20 %	60 %	20 %	0 %	480532246
48	NC_021006	CAGGA	2	10	83671	83680	40 %	0 %	40 %	20 %	480532247
49	NC_021006	ATCGT	2	10	86947	86956	20 %	40 %	20 %	20 %	480532252
50	NC_021006	TTTCA	2	10	88639	88648	20 %	60 %	0 %	20 %	480532254
51	NC_021006	TCAAT	2	10	88992	89001	40 %	40 %	0 %	20 %	480532254
52	NC_021006	ATTAC	2	10	89460	89469	40 %	40 %	0 %	20 %	480532255
53	NC_021006	CTTTG	2	10	91102	91111	0 %	60 %	20 %	20 %	480532257
54	NC_021006	GAAAG	2	10	98076	98085	60 %	0 %	40 %	0 %	480532263
55	NC_021006	TCGAT	2	10	98686	98695	20 %	40 %	20 %	20 %	480532264
56	NC_021006	ATTTC	2	10	98719	98728	20 %	60 %	0 %	20 %	480532264
57	NC_021006	AATCA	2	10	98892	98901	60 %	20 %	0 %	20 %	480532264
58	NC_021006	AGCCA	2	10	103015	103024	40 %	0 %	20 %	40 %	480532267
59	NC_021006	ATCAG	2	10	103137	103146	40 %	20 %	20 %	20 %	480532267
60	NC_021006	TATGA	2	10	103542	103551	40 %	40 %	20 %	0 %	480532268
61	NC_021006	TGCAG	2	10	104109	104118	20 %	20 %	40 %	20 %	480532269
62	NC_021006	CTATT	2	10	105128	105137	20 %	60 %	0 %	20 %	480532269
63	NC_021006	TTTGG	2	10	106863	106872	0 %	60 %	40 %	0 %	480532270
64	NC_021006	ACAAT	2	10	107992	108001	60 %	20 %	0 %	20 %	480532271
65	NC_021006	AATAT	2	10	108778	108787	60 %	40 %	0 %	0 %	480532271
66	NC_021006	AGTCC	2	10	113006	113015	20 %	20 %	20 %	40 %	480532273
67	NC_021006	AAATG	2	10	114090	114099	60 %	20 %	20 %	0 %	480532274
68	NC_021006	CAAAC	2	10	115566	115575	60 %	0 %	0 %	40 %	480532275
69	NC_021006	ATTCT	2	10	116002	116011	20 %	60 %	0 %	20 %	480532275
70	NC_021006	ACCAA	2	10	116020	116029	60 %	0 %	0 %	40 %	480532275
71	NC_021006	CAATC	2	10	117579	117588	40 %	20 %	0 %	40 %	480532276
72	NC_021006	TAGTT	2	10	117771	117780	20 %	60 %	20 %	0 %	480532276
73	NC_021006	AATCA	2	10	123821	123830	60 %	20 %	0 %	20 %	480532280
74	NC_021006	GAAGC	2	10	124341	124350	40 %	0 %	40 %	20 %	480532280
75	NC_021006	CTACG	2	10	125558	125567	20 %	20 %	20 %	40 %	480532280
76	NC_021006	GAAAC	2	10	128191	128200	60 %	0 %	20 %	20 %	480532281
77	NC_021006	TGTTC	2	10	130014	130023	0 %	60 %	20 %	20 %	480532281
78	NC_021006	GGAAT	2	10	130438	130447	40 %	20 %	40 %	0 %	480532282
79	NC_021006	TAGCT	2	10	132080	132089	20 %	40 %	20 %	20 %	480532283
80	NC_021006	AAGAA	2	10	132530	132539	80 %	0 %	20 %	0 %	480532283
81	NC_021006	AAAAG	2	10	132620	132629	80 %	0 %	20 %	0 %	480532283
82	NC_021006	TCTAG	2	10	136128	136137	20 %	40 %	20 %	20 %	480532283
83	NC_021006	ATGGT	2	10	137161	137170	20 %	40 %	40 %	0 %	480532283
84	NC_021006	ACTAT	2	10	139743	139752	40 %	40 %	0 %	20 %	480532286
85	NC_021006	GTTTT	2	10	139896	139905	0 %	80 %	20 %	0 %	480532286
86	NC_021006	TCCAG	2	10	140148	140157	20 %	20 %	20 %	40 %	480532286
87	NC_021006	GTAAT	2	10	142223	142232	40 %	40 %	20 %	0 %	480532287
88	NC_021006	GTTGG	2	10	145943	145952	0 %	40 %	60 %	0 %	480532290
89	NC_021006	ATGTT	2	10	146610	146619	20 %	60 %	20 %	0 %	480532290
90	NC_021006	CAGAA	2	10	149872	149881	60 %	0 %	20 %	20 %	480532293
91	NC_021006	TGGCT	2	10	152349	152358	0 %	40 %	40 %	20 %	480532295
92	NC_021006	CGCGC	2	10	152386	152395	0 %	0 %	40 %	60 %	480532295
93	NC_021006	TCTTT	2	10	154188	154197	0 %	80 %	0 %	20 %	480532298
94	NC_021006	AAGTA	2	10	155358	155367	60 %	20 %	20 %	0 %	480532299
95	NC_021006	AGTCA	2	10	159951	159960	40 %	20 %	20 %	20 %	480532301
96	NC_021006	CTTTC	2	10	162151	162160	0 %	60 %	0 %	40 %	480532304
97	NC_021006	GATTT	2	10	165272	165281	20 %	60 %	20 %	0 %	480532306
98	NC_021006	AATCC	2	10	166561	166570	40 %	20 %	0 %	40 %	480532307
99	NC_021006	TTTGA	2	10	166618	166627	20 %	60 %	20 %	0 %	480532307
100	NC_021006	TTGAT	2	10	169200	169209	20 %	60 %	20 %	0 %	480532308
101	NC_021006	GAGAA	2	10	169389	169398	60 %	0 %	40 %	0 %	480532308
102	NC_021006	CTTTC	2	10	169475	169484	0 %	60 %	0 %	40 %	480532308
103	NC_021006	AATGA	2	10	170217	170226	60 %	20 %	20 %	0 %	480532310
104	NC_021006	TTGGA	2	10	176746	176755	20 %	40 %	40 %	0 %	480532316
105	NC_021006	CTTTT	2	10	181344	181353	0 %	80 %	0 %	20 %	480532320
106	NC_021006	CCAAG	2	10	181409	181418	40 %	0 %	20 %	40 %	480532320
107	NC_021006	GAATA	2	10	182847	182856	60 %	20 %	20 %	0 %	480532321
108	NC_021006	TTTTG	2	10	183148	183157	0 %	80 %	20 %	0 %	480532322
109	NC_021006	ACTCA	2	10	185578	185587	40 %	20 %	0 %	40 %	480532325
110	NC_021006	CTTCA	2	10	194186	194195	20 %	40 %	0 %	40 %	480532331
111	NC_021006	CCATA	2	10	197248	197257	40 %	20 %	0 %	40 %	480532335
112	NC_021006	AATCA	2	10	198372	198381	60 %	20 %	0 %	20 %	480532336
113	NC_021006	CCTAA	2	10	203163	203172	40 %	20 %	0 %	40 %	480532340
114	NC_021006	GGAAT	2	10	203429	203438	40 %	20 %	40 %	0 %	480532340
115	NC_021006	TCCTA	2	10	205755	205764	20 %	40 %	0 %	40 %	480532344
116	NC_021006	TTTTC	2	10	206132	206141	0 %	80 %	0 %	20 %	480532345
117	NC_021006	ACCAG	2	10	206481	206490	40 %	0 %	20 %	40 %	480532345
118	NC_021006	TAGAA	2	10	206670	206679	60 %	20 %	20 %	0 %	480532346
119	NC_021006	TTGAT	2	10	207132	207141	20 %	60 %	20 %	0 %	480532346
120	NC_021006	ACCTG	2	10	208965	208974	20 %	20 %	20 %	40 %	480532348
121	NC_021006	TGAAA	2	10	211563	211572	60 %	20 %	20 %	0 %	480532350
122	NC_021006	GACTA	2	10	213006	213015	40 %	20 %	20 %	20 %	480532350
123	NC_021006	CCCTT	2	10	213999	214008	0 %	40 %	0 %	60 %	480532352
124	NC_021006	GATTA	2	10	215463	215472	40 %	40 %	20 %	0 %	480532353
125	NC_021006	AACCA	2	10	217349	217358	60 %	0 %	0 %	40 %	480532354
126	NC_021006	CCCGA	2	10	218232	218241	20 %	0 %	20 %	60 %	480532355
127	NC_021006	TAACT	2	10	218394	218403	40 %	40 %	0 %	20 %	480532356
128	NC_021006	GCAAG	2	10	218624	218633	40 %	0 %	40 %	20 %	480532356
129	NC_021006	CATCT	2	10	219792	219801	20 %	40 %	0 %	40 %	480532356
130	NC_021006	TTGAT	2	10	221299	221308	20 %	60 %	20 %	0 %	480532356
131	NC_021006	TTTCT	2	10	221378	221387	0 %	80 %	0 %	20 %	480532356
132	NC_021006	CCTTG	2	10	221471	221480	0 %	40 %	20 %	40 %	480532356
133	NC_021006	CTGCT	2	10	221945	221954	0 %	40 %	20 %	40 %	480532357
134	NC_021006	ATATA	2	10	228858	228867	60 %	40 %	0 %	0 %	480532362
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259	NC_021006	TTGAT	2	10	445560	445569	20 %	60 %	20 %	0 %	480532553
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262	NC_021006	TCCAG	2	10	448594	448603	20 %	20 %	20 %	40 %	480532558
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