MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034156 draft genome

Total Repeats: 5903

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021006	TTAT	2	8	28	35	25 %	75 %	0 %	0 %	480532169
2	NC_021006	TGCC	2	8	402	409	0 %	25 %	25 %	50 %	480532169
3	NC_021006	TTGA	2	8	1262	1269	25 %	50 %	25 %	0 %	480532170
4	NC_021006	TTGA	2	8	1700	1707	25 %	50 %	25 %	0 %	480532170
5	NC_021006	ATTC	2	8	1888	1895	25 %	50 %	0 %	25 %	480532170
6	NC_021006	AAGT	2	8	2353	2360	50 %	25 %	25 %	0 %	480532171
7	NC_021006	TGTC	2	8	2557	2564	0 %	50 %	25 %	25 %	480532171
8	NC_021006	CAGT	2	8	2570	2577	25 %	25 %	25 %	25 %	480532171
9	NC_021006	TCAA	2	8	2692	2699	50 %	25 %	0 %	25 %	480532171
10	NC_021006	TAGC	2	8	3209	3216	25 %	25 %	25 %	25 %	480532171
11	NC_021006	TGGC	2	8	3373	3380	0 %	25 %	50 %	25 %	480532171
12	NC_021006	CTGT	2	8	3430	3437	0 %	50 %	25 %	25 %	480532171
13	NC_021006	TAAT	2	8	3533	3540	50 %	50 %	0 %	0 %	480532171
14	NC_021006	AATG	2	8	3605	3612	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021006	AGCT	2	8	3651	3658	25 %	25 %	25 %	25 %	480532172
16	NC_021006	AAGT	2	8	3686	3693	50 %	25 %	25 %	0 %	480532172
17	NC_021006	CTTT	2	8	3786	3793	0 %	75 %	0 %	25 %	480532172
18	NC_021006	GCGT	2	8	3801	3808	0 %	25 %	50 %	25 %	480532172
19	NC_021006	AAAT	2	8	3814	3821	75 %	25 %	0 %	0 %	480532172
20	NC_021006	CAAG	2	8	4789	4796	50 %	0 %	25 %	25 %	480532174
21	NC_021006	CCAA	2	8	5300	5307	50 %	0 %	0 %	50 %	480532174
22	NC_021006	ATCT	2	8	5726	5733	25 %	50 %	0 %	25 %	480532175
23	NC_021006	CAAG	2	8	6348	6355	50 %	0 %	25 %	25 %	480532175
24	NC_021006	CAGC	2	8	6650	6657	25 %	0 %	25 %	50 %	480532176
25	NC_021006	CTAG	2	8	7155	7162	25 %	25 %	25 %	25 %	480532177
26	NC_021006	AAAT	2	8	7704	7711	75 %	25 %	0 %	0 %	480532178
27	NC_021006	TTGA	2	8	7873	7880	25 %	50 %	25 %	0 %	480532178
28	NC_021006	TAAA	2	8	8579	8586	75 %	25 %	0 %	0 %	480532178
29	NC_021006	CCTG	2	8	9217	9224	0 %	25 %	25 %	50 %	480532179
30	NC_021006	TGCT	2	8	9947	9954	0 %	50 %	25 %	25 %	480532180
31	NC_021006	CTTG	2	8	10236	10243	0 %	50 %	25 %	25 %	480532180
32	NC_021006	AGAT	2	8	10432	10439	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021006	GAAA	2	8	10479	10486	75 %	0 %	25 %	0 %	480532181
34	NC_021006	AAAG	2	8	11117	11124	75 %	0 %	25 %	0 %	480532181
35	NC_021006	ATGG	2	8	11466	11473	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021006	CAAG	2	8	11810	11817	50 %	0 %	25 %	25 %	480532182
37	NC_021006	GATT	2	8	12097	12104	25 %	50 %	25 %	0 %	480532182
38	NC_021006	ATTG	2	8	12194	12201	25 %	50 %	25 %	0 %	480532182
39	NC_021006	TGTC	2	8	12232	12239	0 %	50 %	25 %	25 %	480532182
40	NC_021006	CAAC	2	8	12642	12649	50 %	0 %	0 %	50 %	480532182
41	NC_021006	AAGC	2	8	12700	12707	50 %	0 %	25 %	25 %	480532182
42	NC_021006	TGAT	2	8	13309	13316	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021006	CTTG	2	8	13449	13456	0 %	50 %	25 %	25 %	480532183
44	NC_021006	TGAA	2	8	13829	13836	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021006	TAAA	2	8	13857	13864	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021006	AGAA	2	8	14032	14039	75 %	0 %	25 %	0 %	480532184
47	NC_021006	ATCA	2	8	14188	14195	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_021006	TGGT	2	8	14259	14266	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021006	ATGA	2	8	14281	14288	50 %	25 %	25 %	0 %	480532185
50	NC_021006	CAAA	2	8	14334	14341	75 %	0 %	0 %	25 %	480532185
51	NC_021006	TGGA	2	8	14840	14847	25 %	25 %	50 %	0 %	480532186
52	NC_021006	AAAT	2	8	15380	15387	75 %	25 %	0 %	0 %	480532186
53	NC_021006	ATGC	2	8	15506	15513	25 %	25 %	25 %	25 %	480532186
54	NC_021006	TCTT	2	8	15841	15848	0 %	75 %	0 %	25 %	480532187
55	NC_021006	TATT	2	8	16149	16156	25 %	75 %	0 %	0 %	480532187
56	NC_021006	TTAT	2	8	16331	16338	25 %	75 %	0 %	0 %	480532187
57	NC_021006	TTAT	2	8	16485	16492	25 %	75 %	0 %	0 %	480532187
58	NC_021006	GCTG	2	8	16750	16757	0 %	25 %	50 %	25 %	480532188
59	NC_021006	AGTA	2	8	17139	17146	50 %	25 %	25 %	0 %	480532188
60	NC_021006	TTGG	2	8	17386	17393	0 %	50 %	50 %	0 %	480532188
61	NC_021006	TACT	2	8	17497	17504	25 %	50 %	0 %	25 %	480532188
62	NC_021006	AATT	2	8	17729	17736	50 %	50 %	0 %	0 %	480532189
63	NC_021006	CTAA	2	8	18396	18403	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_021006	ATGA	2	8	18469	18476	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021006	AAAG	2	8	18535	18542	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021006	AAGC	2	8	18880	18887	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_021006	AGAT	2	8	19094	19101	50 %	25 %	25 %	0 %	480532190
68	NC_021006	ATAA	2	8	19231	19238	75 %	25 %	0 %	0 %	480532191
69	NC_021006	TAAA	2	8	19343	19350	75 %	25 %	0 %	0 %	480532191
70	NC_021006	AAGA	2	8	19615	19622	75 %	0 %	25 %	0 %	480532192
71	NC_021006	AAAG	2	8	19849	19856	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021006	TAAG	2	8	19864	19871	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021006	AGGG	2	8	19883	19890	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021006	TTAA	2	8	20019	20026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021006	TTCT	2	8	20604	20611	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_021006	GGAA	2	8	20781	20788	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021006	TTTG	2	8	20982	20989	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021006	AAGA	2	8	21003	21010	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021006	AGTA	2	8	21456	21463	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021006	GTAT	2	8	21668	21675	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021006	ATGA	2	8	21805	21812	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021006	AGTA	2	8	22168	22175	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021006	ATCA	2	8	24067	24074	50 %	25 %	0 %	25 %	480532196
84	NC_021006	GAAA	2	8	24094	24101	75 %	0 %	25 %	0 %	480532196
85	NC_021006	AAAT	2	8	24163	24170	75 %	25 %	0 %	0 %	480532196
86	NC_021006	CAAT	2	8	24710	24717	50 %	25 %	0 %	25 %	480532197
87	NC_021006	ATCT	2	8	24783	24790	25 %	50 %	0 %	25 %	480532197
88	NC_021006	ATCA	2	8	25493	25500	50 %	25 %	0 %	25 %	480532198
89	NC_021006	ACCT	2	8	26004	26011	25 %	25 %	0 %	50 %	480532198
90	NC_021006	TGAA	2	8	26207	26214	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021006	AGAA	2	8	27888	27895	75 %	0 %	25 %	0 %	480532199
92	NC_021006	AGCA	2	8	27907	27914	50 %	0 %	25 %	25 %	480532199
93	NC_021006	TAAT	2	8	28276	28283	50 %	50 %	0 %	0 %	480532200
94	NC_021006	TTTA	2	8	28463	28470	25 %	75 %	0 %	0 %	480532200
95	NC_021006	CTGA	2	8	28572	28579	25 %	25 %	25 %	25 %	480532200
96	NC_021006	GAAA	2	8	29393	29400	75 %	0 %	25 %	0 %	480532201
97	NC_021006	TGGA	2	8	29572	29579	25 %	25 %	50 %	0 %	480532201
98	NC_021006	AGAA	2	8	29781	29788	75 %	0 %	25 %	0 %	480532202
99	NC_021006	TGTA	2	8	30883	30890	25 %	50 %	25 %	0 %	480532203
100	NC_021006	GGAT	2	8	31442	31449	25 %	25 %	50 %	0 %	480532203
101	NC_021006	AGGA	2	8	31721	31728	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021006	ATTG	2	8	32695	32702	25 %	50 %	25 %	0 %	480532205
103	NC_021006	TCAA	2	8	32709	32716	50 %	25 %	0 %	25 %	480532205
104	NC_021006	TGAA	2	8	32835	32842	50 %	25 %	25 %	0 %	480532206
105	NC_021006	AGTT	2	8	32946	32953	25 %	50 %	25 %	0 %	480532206
106	NC_021006	ATCA	2	8	32981	32988	50 %	25 %	0 %	25 %	480532206
107	NC_021006	TTAA	2	8	33065	33072	50 %	50 %	0 %	0 %	480532206
108	NC_021006	GATT	2	8	33782	33789	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021006	AACA	2	8	34626	34633	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_021006	CTTT	2	8	35108	35115	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_021006	TTAT	2	8	35171	35178	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021006	TATT	2	8	35179	35186	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021006	TAAA	2	8	35451	35458	75 %	25 %	0 %	0 %	480532207
114	NC_021006	GGTA	2	8	35863	35870	25 %	25 %	50 %	0 %	480532207
115	NC_021006	TAAT	2	8	36305	36312	50 %	50 %	0 %	0 %	480532208
116	NC_021006	ACAG	2	8	37071	37078	50 %	0 %	25 %	25 %	480532208
117	NC_021006	AGAA	2	8	37242	37249	75 %	0 %	25 %	0 %	480532208
118	NC_021006	TTGA	2	8	38174	38181	25 %	50 %	25 %	0 %	480532209
119	NC_021006	AATT	2	8	38597	38604	50 %	50 %	0 %	0 %	480532210
120	NC_021006	TTTA	2	8	38629	38636	25 %	75 %	0 %	0 %	480532210
121	NC_021006	TAAA	2	8	38756	38763	75 %	25 %	0 %	0 %	480532210
122	NC_021006	AGAA	2	8	38764	38771	75 %	0 %	25 %	0 %	480532210
123	NC_021006	TCAT	2	8	39117	39124	25 %	50 %	0 %	25 %	480532210
124	NC_021006	ATAA	2	8	39639	39646	75 %	25 %	0 %	0 %	480532211
125	NC_021006	AGTC	2	8	39698	39705	25 %	25 %	25 %	25 %	480532211
126	NC_021006	AGTA	2	8	39821	39828	50 %	25 %	25 %	0 %	480532211
127	NC_021006	ATTG	2	8	39840	39847	25 %	50 %	25 %	0 %	480532211
128	NC_021006	CTTA	2	8	40019	40026	25 %	50 %	0 %	25 %	480532211
129	NC_021006	AATG	2	8	40191	40198	50 %	25 %	25 %	0 %	480532212
130	NC_021006	AATT	2	8	40257	40264	50 %	50 %	0 %	0 %	480532212
131	NC_021006	GAAG	2	8	40468	40475	50 %	0 %	50 %	0 %	480532212
132	NC_021006	CATA	2	8	40909	40916	50 %	25 %	0 %	25 %	480532212
133	NC_021006	TAAT	2	8	41448	41455	50 %	50 %	0 %	0 %	480532213
134	NC_021006	AGGA	2	8	41466	41473	50 %	0 %	50 %	0 %	480532213
135	NC_021006	GGAA	2	8	41548	41555	50 %	0 %	50 %	0 %	480532213
136	NC_021006	AAGA	2	8	41723	41730	75 %	0 %	25 %	0 %	480532213
137	NC_021006	TAAA	2	8	41853	41860	75 %	25 %	0 %	0 %	480532213
138	NC_021006	AATA	2	8	42069	42076	75 %	25 %	0 %	0 %	480532213
139	NC_021006	ATTT	2	8	42353	42360	25 %	75 %	0 %	0 %	480532214
140	NC_021006	TAAT	2	8	42815	42822	50 %	50 %	0 %	0 %	480532214
141	NC_021006	AGTG	2	8	42832	42839	25 %	25 %	50 %	0 %	480532214
142	NC_021006	AAAT	2	8	42897	42904	75 %	25 %	0 %	0 %	480532214
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144	NC_021006	GAAG	2	8	43469	43476	50 %	0 %	50 %	0 %	480532215
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