MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034156 draft genome

Total Repeats: 2638

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021006	CT	3	6	236	241	0 %	50 %	0 %	50 %	480532169
2	NC_021006	TG	3	6	760	765	0 %	50 %	50 %	0 %	480532169
3	NC_021006	AG	3	6	1152	1157	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021006	CT	3	6	1908	1913	0 %	50 %	0 %	50 %	480532170
5	NC_021006	CT	3	6	5698	5703	0 %	50 %	0 %	50 %	480532175
6	NC_021006	TC	3	6	6185	6190	0 %	50 %	0 %	50 %	480532175
7	NC_021006	CT	3	6	6245	6250	0 %	50 %	0 %	50 %	480532175
8	NC_021006	GA	3	6	6807	6812	50 %	0 %	50 %	0 %	480532176
9	NC_021006	CA	3	6	7527	7532	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_021006	CT	3	6	10379	10384	0 %	50 %	0 %	50 %	480532180
11	NC_021006	AT	3	6	10438	10443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021006	TC	3	6	11245	11250	0 %	50 %	0 %	50 %	480532181
13	NC_021006	TA	3	6	13006	13011	50 %	50 %	0 %	0 %	480532182
14	NC_021006	GA	3	6	14988	14993	50 %	0 %	50 %	0 %	480532186
15	NC_021006	TA	4	8	15685	15692	50 %	50 %	0 %	0 %	480532187
16	NC_021006	TC	3	6	17423	17428	0 %	50 %	0 %	50 %	480532188
17	NC_021006	AT	3	6	17525	17530	50 %	50 %	0 %	0 %	480532188
18	NC_021006	AG	5	10	19104	19113	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021006	GA	3	6	19115	19120	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021006	CA	4	8	19214	19221	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_021006	TA	3	6	19581	19586	50 %	50 %	0 %	0 %	480532192
22	NC_021006	TA	3	6	20062	20067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021006	TA	3	6	20283	20288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021006	TA	3	6	21026	21031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021006	CA	3	6	21237	21242	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_021006	AT	3	6	21763	21768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021006	GT	3	6	22142	22147	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021006	AG	3	6	22197	22202	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021006	GA	3	6	22255	22260	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021006	GA	3	6	22820	22825	50 %	0 %	50 %	0 %	480532194
31	NC_021006	TA	3	6	22855	22860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021006	TA	3	6	23561	23566	50 %	50 %	0 %	0 %	480532196
33	NC_021006	GA	3	6	23676	23681	50 %	0 %	50 %	0 %	480532196
34	NC_021006	AG	3	6	24698	24703	50 %	0 %	50 %	0 %	480532197
35	NC_021006	TA	3	6	24758	24763	50 %	50 %	0 %	0 %	480532197
36	NC_021006	GA	4	8	25421	25428	50 %	0 %	50 %	0 %	480532198
37	NC_021006	TA	3	6	26072	26077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021006	GT	3	6	26536	26541	0 %	50 %	50 %	0 %	480532199
39	NC_021006	GA	3	6	27100	27105	50 %	0 %	50 %	0 %	480532199
40	NC_021006	TC	3	6	27945	27950	0 %	50 %	0 %	50 %	480532199
41	NC_021006	TA	3	6	28011	28016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021006	AG	3	6	29552	29557	50 %	0 %	50 %	0 %	480532201
43	NC_021006	AT	3	6	30594	30599	50 %	50 %	0 %	0 %	480532203
44	NC_021006	AT	3	6	30682	30687	50 %	50 %	0 %	0 %	480532203
45	NC_021006	TA	3	6	30889	30894	50 %	50 %	0 %	0 %	480532203
46	NC_021006	AT	3	6	31477	31482	50 %	50 %	0 %	0 %	480532203
47	NC_021006	TA	3	6	31543	31548	50 %	50 %	0 %	0 %	480532203
48	NC_021006	AT	3	6	31774	31779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021006	TA	3	6	31821	31826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021006	CT	3	6	31982	31987	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_021006	GA	3	6	32316	32321	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021006	AT	3	6	32749	32754	50 %	50 %	0 %	0 %	480532205
53	NC_021006	AT	3	6	33182	33187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021006	CA	3	6	33489	33494	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_021006	TA	3	6	35158	35163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021006	TA	3	6	35165	35170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021006	AG	3	6	35314	35319	50 %	0 %	50 %	0 %	480532207
58	NC_021006	GA	3	6	35851	35856	50 %	0 %	50 %	0 %	480532207
59	NC_021006	AT	3	6	36324	36329	50 %	50 %	0 %	0 %	480532208
60	NC_021006	AT	3	6	37039	37044	50 %	50 %	0 %	0 %	480532208
61	NC_021006	GT	3	6	37056	37061	0 %	50 %	50 %	0 %	480532208
62	NC_021006	TA	3	6	37967	37972	50 %	50 %	0 %	0 %	480532209
63	NC_021006	TA	3	6	38091	38096	50 %	50 %	0 %	0 %	480532209
64	NC_021006	AG	3	6	39161	39166	50 %	0 %	50 %	0 %	480532210
65	NC_021006	AC	3	6	39534	39539	50 %	0 %	0 %	50 %	480532211
66	NC_021006	GT	3	6	40214	40219	0 %	50 %	50 %	0 %	480532212
67	NC_021006	TA	3	6	40535	40540	50 %	50 %	0 %	0 %	480532212
68	NC_021006	TA	3	6	41011	41016	50 %	50 %	0 %	0 %	480532212
69	NC_021006	AT	3	6	42085	42090	50 %	50 %	0 %	0 %	480532214
70	NC_021006	AT	3	6	43110	43115	50 %	50 %	0 %	0 %	480532214
71	NC_021006	TA	3	6	43290	43295	50 %	50 %	0 %	0 %	480532215
72	NC_021006	AT	4	8	43521	43528	50 %	50 %	0 %	0 %	480532215
73	NC_021006	TA	3	6	44405	44410	50 %	50 %	0 %	0 %	480532215
74	NC_021006	TA	3	6	45157	45162	50 %	50 %	0 %	0 %	480532216
75	NC_021006	TA	3	6	45174	45179	50 %	50 %	0 %	0 %	480532216
76	NC_021006	AT	3	6	45398	45403	50 %	50 %	0 %	0 %	480532216
77	NC_021006	TA	3	6	45480	45485	50 %	50 %	0 %	0 %	480532216
78	NC_021006	AT	3	6	45722	45727	50 %	50 %	0 %	0 %	480532217
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80	NC_021006	AT	4	8	45875	45882	50 %	50 %	0 %	0 %	480532217
81	NC_021006	AT	3	6	46104	46109	50 %	50 %	0 %	0 %	480532217
82	NC_021006	AT	4	8	46249	46256	50 %	50 %	0 %	0 %	480532217
83	NC_021006	AT	3	6	46332	46337	50 %	50 %	0 %	0 %	480532217
84	NC_021006	TA	3	6	46437	46442	50 %	50 %	0 %	0 %	480532217
85	NC_021006	TA	3	6	47596	47601	50 %	50 %	0 %	0 %	480532219
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87	NC_021006	TA	3	6	48610	48615	50 %	50 %	0 %	0 %	480532220
88	NC_021006	AT	3	6	48856	48861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021006	AT	3	6	48893	48898	50 %	50 %	0 %	0 %	480532221
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91	NC_021006	AG	3	6	49115	49120	50 %	0 %	50 %	0 %	480532221
92	NC_021006	AT	3	6	49326	49331	50 %	50 %	0 %	0 %	480532221
93	NC_021006	TA	3	6	49549	49554	50 %	50 %	0 %	0 %	480532221
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95	NC_021006	AT	3	6	52450	52455	50 %	50 %	0 %	0 %	480532223
96	NC_021006	TA	3	6	54206	54211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021006	TA	4	8	54559	54566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021006	AT	3	6	55435	55440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021006	AT	3	6	55630	55635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021006	AG	3	6	55864	55869	50 %	0 %	50 %	0 %	480532225
101	NC_021006	TC	3	6	55989	55994	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_021006	TC	3	6	56541	56546	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_021006	TG	3	6	57445	57450	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021006	GT	3	6	58127	58132	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021006	AT	3	6	58524	58529	50 %	50 %	0 %	0 %	480532226
106	NC_021006	TG	3	6	59021	59026	0 %	50 %	50 %	0 %	480532227
107	NC_021006	GT	3	6	59401	59406	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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109	NC_021006	TG	3	6	62412	62417	0 %	50 %	50 %	0 %	480532229
110	NC_021006	AG	3	6	64008	64013	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021006	CA	3	6	64187	64192	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_021006	TA	3	6	67049	67054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021006	TC	3	6	67638	67643	0 %	50 %	0 %	50 %	480532233
114	NC_021006	CT	3	6	68723	68728	0 %	50 %	0 %	50 %	480532233
115	NC_021006	CT	3	6	69178	69183	0 %	50 %	0 %	50 %	480532234
116	NC_021006	GA	3	6	70319	70324	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021006	TC	3	6	70365	70370	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_021006	AG	3	6	71383	71388	50 %	0 %	50 %	0 %	480532236
119	NC_021006	GA	3	6	72771	72776	50 %	0 %	50 %	0 %	480532237
120	NC_021006	GA	3	6	73058	73063	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021006	TA	3	6	75196	75201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021006	GA	3	6	75466	75471	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021006	CT	3	6	76478	76483	0 %	50 %	0 %	50 %	480532242
124	NC_021006	AT	4	8	76602	76609	50 %	50 %	0 %	0 %	480532242
125	NC_021006	AG	3	6	77904	77909	50 %	0 %	50 %	0 %	480532244
126	NC_021006	AG	5	10	77973	77982	50 %	0 %	50 %	0 %	480532244
127	NC_021006	GA	4	8	78309	78316	50 %	0 %	50 %	0 %	480532244
128	NC_021006	GA	3	6	78417	78422	50 %	0 %	50 %	0 %	480532244
129	NC_021006	CT	3	6	78670	78675	0 %	50 %	0 %	50 %	480532244
130	NC_021006	AT	3	6	78860	78865	50 %	50 %	0 %	0 %	480532244
131	NC_021006	CT	3	6	79215	79220	0 %	50 %	0 %	50 %	480532245
132	NC_021006	TA	3	6	80041	80046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021006	AT	3	6	80812	80817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021006	GA	3	6	80902	80907	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021006	TG	4	8	81501	81508	0 %	50 %	50 %	0 %	480532246
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139	NC_021006	GA	3	6	84450	84455	50 %	0 %	50 %	0 %	480532248
140	NC_021006	AG	5	10	85538	85547	50 %	0 %	50 %	0 %	480532249
141	NC_021006	AT	3	6	88385	88390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021006	AT	3	6	89140	89145	50 %	50 %	0 %	0 %	480532255
143	NC_021006	TC	3	6	89609	89614	0 %	50 %	0 %	50 %	480532255
144	NC_021006	TG	3	6	93770	93775	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021006	TC	3	6	94440	94445	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_021006	GA	3	6	96013	96018	50 %	0 %	50 %	0 %	480532261
147	NC_021006	GT	3	6	96091	96096	0 %	50 %	50 %	0 %	480532261
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