MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994039 draft genome

Total Repeats: 5930

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021005	CTAT	2	8	127	134	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_021005	GAAA	2	8	188	195	75 %	0 %	25 %	0 %	480530349
3	NC_021005	AAGA	2	8	229	236	75 %	0 %	25 %	0 %	480530349
4	NC_021005	GGAA	2	8	1423	1430	50 %	0 %	50 %	0 %	480530349
5	NC_021005	TCAT	2	8	1456	1463	25 %	50 %	0 %	25 %	480530349
6	NC_021005	TGAT	2	8	1486	1493	25 %	50 %	25 %	0 %	480530349
7	NC_021005	AATC	2	8	1522	1529	50 %	25 %	0 %	25 %	480530349
8	NC_021005	ATAA	2	8	1688	1695	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021005	ATTT	2	8	1731	1738	25 %	75 %	0 %	0 %	480530350
10	NC_021005	AGCA	2	8	2095	2102	50 %	0 %	25 %	25 %	480530350
11	NC_021005	ACTT	2	8	2699	2706	25 %	50 %	0 %	25 %	480530350
12	NC_021005	GATT	2	8	2707	2714	25 %	50 %	25 %	0 %	480530350
13	NC_021005	TTAG	2	8	3108	3115	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021005	AACT	2	8	3342	3349	50 %	25 %	0 %	25 %	480530352
15	NC_021005	AATT	2	8	3588	3595	50 %	50 %	0 %	0 %	480530352
16	NC_021005	CAAA	2	8	3865	3872	75 %	0 %	0 %	25 %	480530352
17	NC_021005	CTTG	2	8	4033	4040	0 %	50 %	25 %	25 %	480530352
18	NC_021005	ACTT	2	8	4049	4056	25 %	50 %	0 %	25 %	480530352
19	NC_021005	AAAT	2	8	4365	4372	75 %	25 %	0 %	0 %	480530353
20	NC_021005	TTGA	2	8	4446	4453	25 %	50 %	25 %	0 %	480530353
21	NC_021005	ATGA	2	8	4569	4576	50 %	25 %	25 %	0 %	480530353
22	NC_021005	TATC	2	8	5146	5153	25 %	50 %	0 %	25 %	480530354
23	NC_021005	GATT	2	8	5314	5321	25 %	50 %	25 %	0 %	480530354
24	NC_021005	GAAA	2	8	5579	5586	75 %	0 %	25 %	0 %	480530354
25	NC_021005	TTTA	2	8	7622	7629	25 %	75 %	0 %	0 %	480530354
26	NC_021005	GTCG	2	8	7683	7690	0 %	25 %	50 %	25 %	480530354
27	NC_021005	ATCA	2	8	7736	7743	50 %	25 %	0 %	25 %	480530354
28	NC_021005	GAAA	2	8	8205	8212	75 %	0 %	25 %	0 %	480530354
29	NC_021005	AAGA	2	8	8361	8368	75 %	0 %	25 %	0 %	480530354
30	NC_021005	GAAA	2	8	9344	9351	75 %	0 %	25 %	0 %	480530358
31	NC_021005	TATT	2	8	9380	9387	25 %	75 %	0 %	0 %	480530358
32	NC_021005	TAAA	2	8	9511	9518	75 %	25 %	0 %	0 %	480530358
33	NC_021005	ATCA	2	8	9586	9593	50 %	25 %	0 %	25 %	480530358
34	NC_021005	GAAG	2	8	9729	9736	50 %	0 %	50 %	0 %	480530358
35	NC_021005	TTCT	2	8	9848	9855	0 %	75 %	0 %	25 %	480530358
36	NC_021005	ATCA	2	8	9897	9904	50 %	25 %	0 %	25 %	480530358
37	NC_021005	CAGC	2	8	9922	9929	25 %	0 %	25 %	50 %	480530358
38	NC_021005	TTCT	2	8	10444	10451	0 %	75 %	0 %	25 %	480530358
39	NC_021005	CTAT	2	8	10936	10943	25 %	50 %	0 %	25 %	480530359
40	NC_021005	CTTA	2	8	11091	11098	25 %	50 %	0 %	25 %	480530359
41	NC_021005	ATTT	2	8	11490	11497	25 %	75 %	0 %	0 %	480530359
42	NC_021005	AATT	2	8	11523	11530	50 %	50 %	0 %	0 %	480530359
43	NC_021005	TTTA	2	8	11629	11636	25 %	75 %	0 %	0 %	480530359
44	NC_021005	AAAG	2	8	12146	12153	75 %	0 %	25 %	0 %	480530360
45	NC_021005	AGAA	2	8	12342	12349	75 %	0 %	25 %	0 %	480530360
46	NC_021005	TTAA	2	8	12380	12387	50 %	50 %	0 %	0 %	480530361
47	NC_021005	ACCA	2	8	12537	12544	50 %	0 %	0 %	50 %	480530361
48	NC_021005	TGCT	2	8	13062	13069	0 %	50 %	25 %	25 %	480530361
49	NC_021005	GATG	2	8	13306	13313	25 %	25 %	50 %	0 %	480530361
50	NC_021005	TTGG	2	8	13415	13422	0 %	50 %	50 %	0 %	480530361
51	NC_021005	TGAA	2	8	13557	13564	50 %	25 %	25 %	0 %	480530361
52	NC_021005	AAGA	2	8	13655	13662	75 %	0 %	25 %	0 %	480530361
53	NC_021005	TCTA	2	8	13831	13838	25 %	50 %	0 %	25 %	480530361
54	NC_021005	TGGC	2	8	13860	13867	0 %	25 %	50 %	25 %	480530361
55	NC_021005	AACA	2	8	14064	14071	75 %	0 %	0 %	25 %	480530361
56	NC_021005	GTTC	2	8	14093	14100	0 %	50 %	25 %	25 %	480530361
57	NC_021005	ATGA	2	8	14300	14307	50 %	25 %	25 %	0 %	480530361
58	NC_021005	GAGG	2	8	14730	14737	25 %	0 %	75 %	0 %	480530362
59	NC_021005	AAAC	2	8	14789	14796	75 %	0 %	0 %	25 %	480530362
60	NC_021005	GCTT	2	8	15415	15422	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_021005	CCTG	2	8	15463	15470	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_021005	GTGA	2	8	15743	15750	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021005	AGCG	2	8	15914	15921	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_021005	AGCC	2	8	16795	16802	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_021005	GTAA	2	8	17217	17224	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021005	GCGA	2	8	17373	17380	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_021005	ATTC	2	8	18239	18246	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_021005	CTAA	2	8	18593	18600	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_021005	GTCT	2	8	18618	18625	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_021005	TAGG	2	8	19249	19256	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021005	CTTT	2	8	20764	20771	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_021005	ATGT	2	8	22200	22207	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021005	GATA	2	8	22841	22848	50 %	25 %	25 %	0 %	480530364
74	NC_021005	CAAG	2	8	23005	23012	50 %	0 %	25 %	25 %	480530364
75	NC_021005	GGTT	2	8	23160	23167	0 %	50 %	50 %	0 %	480530364
76	NC_021005	CTTT	2	8	23217	23224	0 %	75 %	0 %	25 %	480530364
77	NC_021005	CTAT	2	8	23344	23351	25 %	50 %	0 %	25 %	480530364
78	NC_021005	TTGG	2	8	23448	23455	0 %	50 %	50 %	0 %	480530364
79	NC_021005	AACA	2	8	23494	23501	75 %	0 %	0 %	25 %	480530364
80	NC_021005	TTCA	2	8	23965	23972	25 %	50 %	0 %	25 %	480530365
81	NC_021005	GATA	2	8	25415	25422	50 %	25 %	25 %	0 %	480530366
82	NC_021005	AATC	2	8	25557	25564	50 %	25 %	0 %	25 %	480530366
83	NC_021005	GATT	2	8	25901	25908	25 %	50 %	25 %	0 %	480530366
84	NC_021005	AACA	2	8	25964	25971	75 %	0 %	0 %	25 %	480530366
85	NC_021005	AGCC	2	8	27613	27620	25 %	0 %	25 %	50 %	480530371
86	NC_021005	TTGA	2	8	27721	27728	25 %	50 %	25 %	0 %	480530372
87	NC_021005	ATGA	2	8	28104	28111	50 %	25 %	25 %	0 %	480530373
88	NC_021005	AATC	2	8	28139	28146	50 %	25 %	0 %	25 %	480530373
89	NC_021005	AAAT	2	8	28247	28254	75 %	25 %	0 %	0 %	480530373
90	NC_021005	TTTG	2	8	28304	28311	0 %	75 %	25 %	0 %	480530374
91	NC_021005	TCAT	2	8	28387	28394	25 %	50 %	0 %	25 %	480530374
92	NC_021005	TATC	2	8	28511	28518	25 %	50 %	0 %	25 %	480530374
93	NC_021005	GATT	2	8	29299	29306	25 %	50 %	25 %	0 %	480530375
94	NC_021005	GATG	2	8	29570	29577	25 %	25 %	50 %	0 %	480530376
95	NC_021005	TTGA	2	8	30151	30158	25 %	50 %	25 %	0 %	480530378
96	NC_021005	GGAA	2	8	30195	30202	50 %	0 %	50 %	0 %	480530378
97	NC_021005	AGGC	2	8	30363	30370	25 %	0 %	50 %	25 %	480530378
98	NC_021005	TGAT	2	8	30492	30499	25 %	50 %	25 %	0 %	480530379
99	NC_021005	ACGG	2	8	30854	30861	25 %	0 %	50 %	25 %	480530379
100	NC_021005	AAGA	2	8	31196	31203	75 %	0 %	25 %	0 %	480530379
101	NC_021005	ACCA	2	8	31304	31311	50 %	0 %	0 %	50 %	480530380
102	NC_021005	TGAA	2	8	31549	31556	50 %	25 %	25 %	0 %	480530381
103	NC_021005	AGCT	2	8	31681	31688	25 %	25 %	25 %	25 %	480530381
104	NC_021005	ACAA	2	8	32121	32128	75 %	0 %	0 %	25 %	480530381
105	NC_021005	GTTG	2	8	33620	33627	0 %	50 %	50 %	0 %	480530385
106	NC_021005	TGAT	2	8	33830	33837	25 %	50 %	25 %	0 %	480530386
107	NC_021005	AACA	2	8	33869	33876	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_021005	AAGA	2	8	34790	34797	75 %	0 %	25 %	0 %	480530388
109	NC_021005	GAGC	2	8	34880	34887	25 %	0 %	50 %	25 %	480530388
110	NC_021005	AGCA	2	8	35061	35068	50 %	0 %	25 %	25 %	480530388
111	NC_021005	AATC	2	8	35729	35736	50 %	25 %	0 %	25 %	480530389
112	NC_021005	CAAA	2	8	35887	35894	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_021005	GATG	2	8	36448	36455	25 %	25 %	50 %	0 %	480530391
114	NC_021005	TATC	2	8	36531	36538	25 %	50 %	0 %	25 %	480530391
115	NC_021005	TGCT	2	8	36648	36655	0 %	50 %	25 %	25 %	480530391
116	NC_021005	CAAG	2	8	36757	36764	50 %	0 %	25 %	25 %	480530391
117	NC_021005	TTCT	2	8	36880	36887	0 %	75 %	0 %	25 %	480530391
118	NC_021005	AATC	2	8	37157	37164	50 %	25 %	0 %	25 %	480530391
119	NC_021005	ATGA	2	8	37277	37284	50 %	25 %	25 %	0 %	480530391
120	NC_021005	GGTT	2	8	37610	37617	0 %	50 %	50 %	0 %	480530391
121	NC_021005	ATGA	2	8	38061	38068	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021005	GTCA	2	8	38217	38224	25 %	25 %	25 %	25 %	480530392
123	NC_021005	ACTT	2	8	39237	39244	25 %	50 %	0 %	25 %	480530393
124	NC_021005	TTTA	2	8	39665	39672	25 %	75 %	0 %	0 %	480530394
125	NC_021005	AAGA	2	8	40026	40033	75 %	0 %	25 %	0 %	480530394
126	NC_021005	TTAC	2	8	40390	40397	25 %	50 %	0 %	25 %	480530395
127	NC_021005	AACC	2	8	40623	40630	50 %	0 %	0 %	50 %	480530395
128	NC_021005	AAAC	2	8	40733	40740	75 %	0 %	0 %	25 %	480530395
129	NC_021005	ATCT	2	8	41379	41386	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_021005	CAGG	2	8	41914	41921	25 %	0 %	50 %	25 %	480530398
131	NC_021005	GCAA	2	8	41993	42000	50 %	0 %	25 %	25 %	480530398
132	NC_021005	ACCT	2	8	42498	42505	25 %	25 %	0 %	50 %	480530400
133	NC_021005	TCTA	2	8	42723	42730	25 %	50 %	0 %	25 %	480530400
134	NC_021005	CAAC	2	8	43181	43188	50 %	0 %	0 %	50 %	480530401
135	NC_021005	TGGT	2	8	43354	43361	0 %	50 %	50 %	0 %	480530402
136	NC_021005	ATCA	2	8	43462	43469	50 %	25 %	0 %	25 %	480530402
137	NC_021005	ATGA	2	8	43473	43480	50 %	25 %	25 %	0 %	480530402
138	NC_021005	TTGC	2	8	44473	44480	0 %	50 %	25 %	25 %	480530403
139	NC_021005	CTAA	2	8	44641	44648	50 %	25 %	0 %	25 %	480530403
140	NC_021005	TTCA	2	8	44841	44848	25 %	50 %	0 %	25 %	480530403
141	NC_021005	GTAA	2	8	44938	44945	50 %	25 %	25 %	0 %	480530403
142	NC_021005	CAAG	2	8	45289	45296	50 %	0 %	25 %	25 %	480530403
143	NC_021005	AAAT	2	8	45579	45586	75 %	25 %	0 %	0 %	480530403
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