MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994039 draft genome

Total Repeats: 26014

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021005	TAA	2	6	34	39	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021005	AAT	2	6	43	48	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021005	TTC	2	6	49	54	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_021005	ATT	2	6	96	101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021005	AGG	2	6	172	177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021005	TCA	2	6	280	285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530349
7	NC_021005	AAC	2	6	349	354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530349
8	NC_021005	ATT	2	6	363	368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530349
9	NC_021005	GTA	2	6	369	374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530349
10	NC_021005	GAA	2	6	456	461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530349
11	NC_021005	GGA	2	6	648	653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480530349
12	NC_021005	TTA	2	6	675	680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530349
13	NC_021005	TTA	2	6	751	756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530349
14	NC_021005	GAT	2	6	837	842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530349
15	NC_021005	GAA	2	6	879	884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530349
16	NC_021005	GAG	2	6	972	977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480530349
17	NC_021005	TGC	2	6	1214	1219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530349
18	NC_021005	ATA	2	6	1402	1407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530349
19	NC_021005	AAT	2	6	1543	1548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530349
20	NC_021005	TAT	2	6	1657	1662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021005	TAT	2	6	1666	1671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021005	TAA	2	6	1723	1728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530350
23	NC_021005	TAC	2	6	1753	1758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530350
24	NC_021005	CTT	2	6	1914	1919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530350
25	NC_021005	CTT	2	6	1931	1936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530350
26	NC_021005	CTT	2	6	1941	1946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530350
27	NC_021005	GTA	2	6	1958	1963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530350
28	NC_021005	ATT	2	6	2138	2143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530350
29	NC_021005	TGC	2	6	2158	2163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530350
30	NC_021005	TGA	2	6	2293	2298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530350
31	NC_021005	GAT	2	6	2354	2359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530350
32	NC_021005	ACT	2	6	2489	2494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530350
33	NC_021005	GTT	2	6	2597	2602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530350
34	NC_021005	GAA	2	6	2642	2647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530350
35	NC_021005	CAG	2	6	2787	2792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530350
36	NC_021005	AGT	2	6	2901	2906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021005	TTG	2	6	2926	2931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530351
38	NC_021005	TGT	2	6	3044	3049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530351
39	NC_021005	ATG	2	6	3051	3056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530351
40	NC_021005	ATT	2	6	3090	3095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530351
41	NC_021005	CAG	2	6	3195	3200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530352
42	NC_021005	GCA	2	6	3269	3274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530352
43	NC_021005	TGG	2	6	3312	3317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530352
44	NC_021005	TGA	3	9	3505	3513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530352
45	NC_021005	TTC	2	6	3690	3695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530352
46	NC_021005	AGA	2	6	3715	3720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530352
47	NC_021005	GAC	2	6	3790	3795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530352
48	NC_021005	AGT	2	6	3904	3909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530352
49	NC_021005	GAA	2	6	3932	3937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530352
50	NC_021005	GAT	2	6	3950	3955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530352
51	NC_021005	AAG	2	6	4071	4076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530352
52	NC_021005	CTC	2	6	4110	4115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480530352
53	NC_021005	AGC	2	6	4117	4122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530352
54	NC_021005	TAT	2	6	4126	4131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530352
55	NC_021005	AAG	2	6	4218	4223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530352
56	NC_021005	GAA	2	6	4238	4243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530352
57	NC_021005	TAA	2	6	4305	4310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021005	GAA	2	6	4463	4468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530353
59	NC_021005	TTA	2	6	4599	4604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530353
60	NC_021005	GAT	2	6	4647	4652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530353
61	NC_021005	CAG	2	6	4696	4701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530353
62	NC_021005	TAT	2	6	4724	4729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530353
63	NC_021005	GTT	2	6	4800	4805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530353
64	NC_021005	CAT	2	6	4806	4811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530353
65	NC_021005	GAT	2	6	4833	4838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530353
66	NC_021005	ACT	2	6	4885	4890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530353
67	NC_021005	TTA	2	6	4950	4955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530354
68	NC_021005	CTA	2	6	5044	5049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530354
69	NC_021005	AGA	2	6	5081	5086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530354
70	NC_021005	GAT	2	6	5187	5192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530354
71	NC_021005	TGG	2	6	5200	5205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530354
72	NC_021005	GCA	2	6	5304	5309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530354
73	NC_021005	GAA	2	6	5373	5378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530354
74	NC_021005	GAG	2	6	5467	5472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480530354
75	NC_021005	TGA	2	6	5531	5536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530354
76	NC_021005	AGA	2	6	5714	5719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530354
77	NC_021005	TGA	2	6	5840	5845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530354
78	NC_021005	TGA	2	6	5857	5862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530354
79	NC_021005	AGA	2	6	5906	5911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530354
80	NC_021005	AGA	2	6	6101	6106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530354
81	NC_021005	ATT	2	6	6138	6143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530354
82	NC_021005	GGA	2	6	6179	6184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480530354
83	NC_021005	CGT	2	6	6348	6353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530354
84	NC_021005	ACA	2	6	6362	6367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530354
85	NC_021005	TGT	2	6	6422	6427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530354
86	NC_021005	CAT	2	6	6429	6434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530354
87	NC_021005	TGA	2	6	6671	6676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530354
88	NC_021005	TGA	4	12	6731	6742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530354
89	NC_021005	TGA	2	6	6755	6760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530354
90	NC_021005	GAT	2	6	6783	6788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530354
91	NC_021005	GTA	2	6	6796	6801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530354
92	NC_021005	CGA	2	6	6946	6951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530354
93	NC_021005	TGT	2	6	7127	7132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530354
94	NC_021005	TGA	2	6	7150	7155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530354
95	NC_021005	TGA	2	6	7160	7165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530354
96	NC_021005	GAA	2	6	7211	7216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530354
97	NC_021005	CCG	2	6	7311	7316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	480530354
98	NC_021005	ACA	2	6	7423	7428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530354
99	NC_021005	GAC	2	6	7574	7579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530354
100	NC_021005	TAT	2	6	7583	7588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530354
101	NC_021005	TTA	2	6	7908	7913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530354
102	NC_021005	GTA	2	6	8136	8141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530354
103	NC_021005	ATA	2	6	8215	8220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530354
104	NC_021005	ATT	2	6	8272	8277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530354
105	NC_021005	TTA	2	6	8409	8414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530354
106	NC_021005	GAA	2	6	8433	8438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530354
107	NC_021005	TCT	2	6	8457	8462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_021005	AAT	2	6	8485	8490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021005	TAA	2	6	8500	8505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021005	CGT	2	6	8550	8555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530355
111	NC_021005	TGC	2	6	8671	8676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530355
112	NC_021005	GCA	2	6	8721	8726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530355
113	NC_021005	AGA	2	6	8759	8764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530355
114	NC_021005	AAT	2	6	8791	8796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530356
115	NC_021005	CGT	2	6	8821	8826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530356
116	NC_021005	TGA	2	6	8834	8839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530356
117	NC_021005	TAT	2	6	8894	8899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530356
118	NC_021005	TGA	2	6	8997	9002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530356
119	NC_021005	TGC	2	6	9051	9056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530356
120	NC_021005	TAT	2	6	9079	9084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530356
121	NC_021005	TTA	2	6	9149	9154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530357
122	NC_021005	GAA	2	6	9197	9202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530357
123	NC_021005	ATT	2	6	9220	9225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530357
124	NC_021005	AAG	2	6	9234	9239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530357
125	NC_021005	ATT	2	6	9270	9275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530358
126	NC_021005	TTG	2	6	9276	9281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530358
127	NC_021005	AGT	2	6	9329	9334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530358
128	NC_021005	TTA	2	6	9353	9358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530358
129	NC_021005	TAG	2	6	9451	9456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530358
130	NC_021005	ATC	2	6	9547	9552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530358
131	NC_021005	CAA	2	6	9604	9609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530358
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260	NC_021005	GGT	2	6	19527	19532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
261	NC_021005	TCG	2	6	19642	19647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
262	NC_021005	CGT	2	6	19722	19727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
263	NC_021005	AGT	2	6	20180	20185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
264	NC_021005	GTA	2	6	20247	20252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
265	NC_021005	ATG	2	6	20270	20275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
266	NC_021005	TAA	3	9	20341	20349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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268	NC_021005	TAT	2	6	20467	20472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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273	NC_021005	GTG	2	6	20963	20968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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279	NC_021005	TGA	2	6	21418	21423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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