MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994039 draft genome

Total Repeats: 21495

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021005	TCA	2	6	280	285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530349
2	NC_021005	AAC	2	6	349	354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530349
3	NC_021005	ATT	2	6	363	368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530349
4	NC_021005	GTA	2	6	369	374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530349
5	NC_021005	GAA	2	6	456	461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530349
6	NC_021005	GGA	2	6	648	653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480530349
7	NC_021005	TTA	2	6	675	680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530349
8	NC_021005	TTA	2	6	751	756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530349
9	NC_021005	GAT	2	6	837	842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530349
10	NC_021005	GAA	2	6	879	884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530349
11	NC_021005	GAG	2	6	972	977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480530349
12	NC_021005	TGC	2	6	1214	1219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530349
13	NC_021005	ATA	2	6	1402	1407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530349
14	NC_021005	AAT	2	6	1543	1548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530349
15	NC_021005	TAA	2	6	1723	1728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530350
16	NC_021005	TAC	2	6	1753	1758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530350
17	NC_021005	CTT	2	6	1914	1919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530350
18	NC_021005	CTT	2	6	1931	1936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530350
19	NC_021005	CTT	2	6	1941	1946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530350
20	NC_021005	GTA	2	6	1958	1963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530350
21	NC_021005	ATT	2	6	2138	2143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530350
22	NC_021005	TGC	2	6	2158	2163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530350
23	NC_021005	TGA	2	6	2293	2298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530350
24	NC_021005	GAT	2	6	2354	2359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530350
25	NC_021005	ACT	2	6	2489	2494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530350
26	NC_021005	GTT	2	6	2597	2602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530350
27	NC_021005	GAA	2	6	2642	2647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530350
28	NC_021005	CAG	2	6	2787	2792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530350
29	NC_021005	TTG	2	6	2926	2931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530351
30	NC_021005	TGT	2	6	3044	3049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530351
31	NC_021005	ATG	2	6	3051	3056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530351
32	NC_021005	ATT	2	6	3090	3095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530351
33	NC_021005	CAG	2	6	3195	3200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530352
34	NC_021005	GCA	2	6	3269	3274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530352
35	NC_021005	TGG	2	6	3312	3317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530352
36	NC_021005	TGA	3	9	3505	3513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530352
37	NC_021005	TTC	2	6	3690	3695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530352
38	NC_021005	AGA	2	6	3715	3720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530352
39	NC_021005	GAC	2	6	3790	3795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530352
40	NC_021005	AGT	2	6	3904	3909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530352
41	NC_021005	GAA	2	6	3932	3937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530352
42	NC_021005	GAT	2	6	3950	3955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530352
43	NC_021005	AAG	2	6	4071	4076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530352
44	NC_021005	CTC	2	6	4110	4115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480530352
45	NC_021005	AGC	2	6	4117	4122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530352
46	NC_021005	TAT	2	6	4126	4131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530352
47	NC_021005	AAG	2	6	4218	4223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530352
48	NC_021005	GAA	2	6	4238	4243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530352
49	NC_021005	GAA	2	6	4463	4468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530353
50	NC_021005	TTA	2	6	4599	4604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530353
51	NC_021005	GAT	2	6	4647	4652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530353
52	NC_021005	CAG	2	6	4696	4701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530353
53	NC_021005	TAT	2	6	4724	4729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530353
54	NC_021005	GTT	2	6	4800	4805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530353
55	NC_021005	CAT	2	6	4806	4811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530353
56	NC_021005	GAT	2	6	4833	4838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530353
57	NC_021005	ACT	2	6	4885	4890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530353
58	NC_021005	TTA	2	6	4950	4955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530354
59	NC_021005	CTA	2	6	5044	5049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530354
60	NC_021005	AGA	2	6	5081	5086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530354
61	NC_021005	GAT	2	6	5187	5192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530354
62	NC_021005	TGG	2	6	5200	5205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530354
63	NC_021005	GCA	2	6	5304	5309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530354
64	NC_021005	GAA	2	6	5373	5378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530354
65	NC_021005	GAG	2	6	5467	5472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480530354
66	NC_021005	TGA	2	6	5531	5536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530354
67	NC_021005	AGA	2	6	5714	5719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530354
68	NC_021005	TGA	2	6	5840	5845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530354
69	NC_021005	TGA	2	6	5857	5862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530354
70	NC_021005	AGA	2	6	5906	5911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530354
71	NC_021005	AGA	2	6	6101	6106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530354
72	NC_021005	ATT	2	6	6138	6143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530354
73	NC_021005	GGA	2	6	6179	6184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480530354
74	NC_021005	CGT	2	6	6348	6353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530354
75	NC_021005	ACA	2	6	6362	6367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530354
76	NC_021005	TGT	2	6	6422	6427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530354
77	NC_021005	CAT	2	6	6429	6434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530354
78	NC_021005	TGA	2	6	6671	6676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530354
79	NC_021005	TGA	4	12	6731	6742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530354
80	NC_021005	TGA	2	6	6755	6760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530354
81	NC_021005	GAT	2	6	6783	6788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530354
82	NC_021005	GTA	2	6	6796	6801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530354
83	NC_021005	CGA	2	6	6946	6951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530354
84	NC_021005	TGT	2	6	7127	7132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530354
85	NC_021005	TGA	2	6	7150	7155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530354
86	NC_021005	TGA	2	6	7160	7165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530354
87	NC_021005	GAA	2	6	7211	7216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530354
88	NC_021005	CCG	2	6	7311	7316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	480530354
89	NC_021005	ACA	2	6	7423	7428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530354
90	NC_021005	GAC	2	6	7574	7579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530354
91	NC_021005	TAT	2	6	7583	7588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530354
92	NC_021005	TTA	2	6	7908	7913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530354
93	NC_021005	GTA	2	6	8136	8141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530354
94	NC_021005	ATA	2	6	8215	8220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530354
95	NC_021005	ATT	2	6	8272	8277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530354
96	NC_021005	TTA	2	6	8409	8414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530354
97	NC_021005	GAA	2	6	8433	8438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530354
98	NC_021005	CGT	2	6	8550	8555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530355
99	NC_021005	TGC	2	6	8671	8676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530355
100	NC_021005	GCA	2	6	8721	8726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530355
101	NC_021005	AGA	2	6	8759	8764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530355
102	NC_021005	AAT	2	6	8791	8796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530356
103	NC_021005	CGT	2	6	8821	8826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530356
104	NC_021005	TGA	2	6	8834	8839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530356
105	NC_021005	TAT	2	6	8894	8899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530356
106	NC_021005	TGA	2	6	8997	9002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530356
107	NC_021005	TGC	2	6	9051	9056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530356
108	NC_021005	TAT	2	6	9079	9084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530356
109	NC_021005	TTA	2	6	9149	9154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530357
110	NC_021005	GAA	2	6	9197	9202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530357
111	NC_021005	ATT	2	6	9220	9225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530357
112	NC_021005	AAG	2	6	9234	9239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530357
113	NC_021005	ATT	2	6	9270	9275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530358
114	NC_021005	TTG	2	6	9276	9281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530358
115	NC_021005	AGT	2	6	9329	9334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530358
116	NC_021005	TTA	2	6	9353	9358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530358
117	NC_021005	TAG	2	6	9451	9456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530358
118	NC_021005	ATC	2	6	9547	9552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530358
119	NC_021005	CAA	2	6	9604	9609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530358
120	NC_021005	AAG	2	6	9667	9672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530358
121	NC_021005	ATC	2	6	9677	9682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530358
122	NC_021005	GAA	2	6	9789	9794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530358
123	NC_021005	ACT	2	6	9876	9881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530358
124	NC_021005	AAG	2	6	9886	9891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530358
125	NC_021005	TAT	2	6	9951	9956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530358
126	NC_021005	ATA	2	6	10081	10086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530358
127	NC_021005	GAT	2	6	10221	10226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530358
128	NC_021005	TCT	2	6	10251	10256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530358
129	NC_021005	AAG	2	6	10553	10558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530359
130	NC_021005	TGG	2	6	10600	10605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530359
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252	NC_021005	AGT	2	6	26269	26274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530367
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500	NC_021005	GTT	2	6	46180	46185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530403

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