MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma fermentans PG18 DNA

Total Repeats: 83

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021002	TCATTT	2	12	109	120	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_021002	AAAATT	2	12	6615	6626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021002	ATTTTT	2	12	20485	20496	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021002	TGCAAG	2	12	45869	45880	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_021002	ATAATT	2	12	53519	53530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021002	TTAATA	2	12	53531	53542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021002	CTCCAG	2	12	76891	76902	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
8	NC_021002	CTTTTA	2	12	103101	103112	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_021002	AAATAG	2	12	107806	107817	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021002	TAAAAT	2	12	116450	116461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021002	TGGCTT	2	12	120216	120227	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_021002	ATGTAT	2	12	120317	120328	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021002	AAAGGA	2	12	124556	124567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021002	AAATTT	2	12	170195	170206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021002	TAAAAA	2	12	179151	179162	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021002	ATCTTT	2	12	185647	185658	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_021002	TAAAAT	2	12	204018	204029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021002	AATTTT	2	12	234522	234533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021002	ATTAAT	2	12	234807	234818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021002	CAATCA	2	12	253795	253806	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_021002	GTATTG	2	12	253975	253986	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021002	AAAAAT	2	12	282723	282734	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021002	ATAAAT	2	12	282830	282841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021002	TTTAGT	2	12	284568	284579	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021002	TGTTTT	2	12	291562	291573	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021002	AATATA	2	12	291766	291777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021002	TATTAA	2	12	302739	302750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021002	ATTTTA	2	12	307313	307324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021002	ATATTT	2	12	319915	319926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021002	TAAAAA	2	12	320072	320083	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021002	ACATTA	2	12	335321	335332	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_021002	AAAATT	2	12	350504	350515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021002	ATTTAA	2	12	356644	356655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021002	AATATT	2	12	357617	357628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021002	TTTTAT	2	12	369049	369060	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021002	AATTTT	2	12	374622	374633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021002	TTTTAT	2	12	404202	404213	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021002	TAATTT	2	12	434371	434382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021002	ACTTTT	2	12	435750	435761	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_021002	TTAATA	2	12	447620	447631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021002	ATTTTT	2	12	460893	460904	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021002	AAAATA	2	12	467163	467174	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021002	AAAAAT	2	12	471603	471614	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021002	TGTTTT	2	12	472875	472886	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021002	GAATTA	2	12	485927	485938	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021002	AAAAAT	2	12	500235	500246	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021002	ATTTTT	2	12	507818	507829	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021002	ATATAA	2	12	513381	513392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021002	AATATT	3	18	525769	525786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021002	ATTTTT	2	12	526766	526777	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021002	CTTTAA	2	12	546338	546349	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_021002	AAAATT	2	12	547115	547126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021002	TTAATA	2	12	568304	568315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021002	ATTTTT	2	12	668961	668972	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021002	TTATTG	2	12	694802	694813	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021002	ATAAAA	2	12	695134	695145	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021002	TTAAAA	2	12	705292	705303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021002	AAATTT	2	12	714521	714532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021002	TTTAAT	2	12	736304	736315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021002	ATTTTT	2	12	741017	741028	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021002	TTTAAT	2	12	743033	743044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021002	TTAATT	2	12	750326	750337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021002	AATGAA	2	12	762984	762995	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021002	TAAAAA	2	12	766678	766689	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021002	ATTTTT	2	12	793749	793760	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021002	TAAATA	2	12	801672	801683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021002	AAGTTA	2	12	802158	802169	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021002	TAAAAA	2	12	828284	828295	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021002	ATATTA	2	12	843635	843646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021002	GTTTTT	2	12	853681	853692	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021002	ATATTT	2	12	864329	864340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021002	ATATAA	2	12	880510	880521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021002	ATTTTT	2	12	891234	891245	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021002	CTCCAG	2	12	902225	902236	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
75	NC_021002	TTTTTA	2	12	924356	924367	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021002	CCAACT	2	12	929274	929285	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_021002	ATTTCT	2	12	936337	936348	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_021002	TAAAAT	2	12	971224	971235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021002	TTCTTA	2	12	971373	971384	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_021002	TATTAA	2	12	982582	982593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021002	ATTTTA	2	12	995495	995506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021002	AATATT	2	12	1000808	1000819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021002	AAAAGA	2	12	1001164	1001175	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.