MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Rickettsia prowazekii str. Breinl

Total Repeats: 1188

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020993	AAAAT	2	10	605	614	80 %	20 %	0 %	0 %	478693375
2	NC_020993	TTAAT	2	10	870	879	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020993	TAATA	2	10	3004	3013	60 %	40 %	0 %	0 %	478693380
4	NC_020993	GCAAT	2	10	3942	3951	40 %	20 %	20 %	20 %	478693381
5	NC_020993	ACTAT	2	10	5557	5566	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_020993	CTCTT	2	10	5568	5577	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
7	NC_020993	TATCT	2	10	6864	6873	20 %	60 %	0 %	20 %	478693384
8	NC_020993	GCTTA	2	10	7737	7746	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_020993	AAATA	2	10	7824	7833	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020993	GATTT	2	10	10490	10499	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020993	TTATA	2	10	12479	12488	40 %	60 %	0 %	0 %	478693387
12	NC_020993	TAAAT	2	10	12983	12992	60 %	40 %	0 %	0 %	478693388
13	NC_020993	TAAAA	2	10	13609	13618	80 %	20 %	0 %	0 %	478693389
14	NC_020993	AGAAA	2	10	14299	14308	80 %	0 %	20 %	0 %	478693389
15	NC_020993	GGTTT	2	10	15216	15225	0 %	60 %	40 %	0 %	478693389
16	NC_020993	AGATG	2	10	16312	16321	40 %	20 %	40 %	0 %	478693389
17	NC_020993	TAAAT	2	10	16396	16405	60 %	40 %	0 %	0 %	478693389
18	NC_020993	TTTAA	2	10	19783	19792	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020993	TTAAT	2	10	21810	21819	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020993	AGCTT	2	10	21913	21922	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_020993	ATATT	2	10	22499	22508	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020993	CTTTT	2	10	27586	27595	0 %	80 %	0 %	20 %	478693398
23	NC_020993	CTTAT	2	10	28841	28850	20 %	60 %	0 %	20 %	478693400
24	NC_020993	TATTT	2	10	29460	29469	20 %	80 %	0 %	0 %	478693401
25	NC_020993	TTATT	2	10	29495	29504	20 %	80 %	0 %	0 %	478693401
26	NC_020993	TATCT	2	10	29634	29643	20 %	60 %	0 %	20 %	478693401
27	NC_020993	TTCAT	2	10	29784	29793	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_020993	TAGGT	2	10	29846	29855	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020993	TTTAT	2	10	31096	31105	20 %	80 %	0 %	0 %	478693402
30	NC_020993	ATTTG	2	10	32242	32251	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020993	TTCTA	2	10	33485	33494	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_020993	TTATT	2	10	33986	33995	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020993	TATAA	2	10	34055	34064	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020993	ATTAT	2	10	34975	34984	40 %	60 %	0 %	0 %	478693405
35	NC_020993	TACTC	2	10	36102	36111	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
36	NC_020993	GCATT	2	10	36785	36794	20 %	40 %	20 %	20 %	478693406
37	NC_020993	TGCCA	2	10	38519	38528	20 %	20 %	20 %	40 %	478693407
38	NC_020993	AGGGA	2	10	38592	38601	40 %	0 %	60 %	0 %	478693407
39	NC_020993	AAATT	2	10	40654	40663	60 %	40 %	0 %	0 %	478693408
40	NC_020993	TTAAT	2	10	41108	41117	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020993	TACTA	2	10	41815	41824	40 %	40 %	0 %	20 %	478693410
42	NC_020993	GTAAT	2	10	42091	42100	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020993	TATAA	2	10	42419	42428	60 %	40 %	0 %	0 %	478693411
44	NC_020993	TTGAG	2	10	42849	42858	20 %	40 %	40 %	0 %	478693411
45	NC_020993	AGTAT	2	10	43787	43796	40 %	40 %	20 %	0 %	478693412
46	NC_020993	TTAAC	2	10	43991	44000	40 %	40 %	0 %	20 %	478693412
47	NC_020993	ATTTA	2	10	45597	45606	40 %	60 %	0 %	0 %	478693412
48	NC_020993	TATAT	2	10	47683	47692	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020993	AAATG	2	10	47814	47823	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020993	TTATA	2	10	47918	47927	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020993	TATAT	2	10	48557	48566	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020993	GAAAA	2	10	48585	48594	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020993	TTAAT	2	10	49139	49148	40 %	60 %	0 %	0 %	478693414
54	NC_020993	AGATA	2	10	49383	49392	60 %	20 %	20 %	0 %	478693414
55	NC_020993	AGCTC	2	10	50010	50019	20 %	20 %	20 %	40 %	478693415
56	NC_020993	TTAAG	2	10	50081	50090	40 %	40 %	20 %	0 %	478693415
57	NC_020993	ATTAC	2	10	52143	52152	40 %	40 %	0 %	20 %	478693416
58	NC_020993	TACTA	2	10	52772	52781	40 %	40 %	0 %	20 %	478693416
59	NC_020993	ATTAT	2	10	53241	53250	40 %	60 %	0 %	0 %	478693416
60	NC_020993	ATTTT	2	10	53371	53380	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020993	TTATC	2	10	53753	53762	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_020993	ATTTA	2	10	53934	53943	40 %	60 %	0 %	0 %	478693417
63	NC_020993	GTATA	2	10	55187	55196	40 %	40 %	20 %	0 %	478693419
64	NC_020993	GTCAA	2	10	55490	55499	40 %	20 %	20 %	20 %	478693419
65	NC_020993	ATGAC	2	10	56268	56277	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_020993	TCTTT	2	10	56411	56420	0 %	80 %	0 %	20 %	478693421
67	NC_020993	AGAAA	2	10	56507	56516	80 %	0 %	20 %	0 %	478693421
68	NC_020993	ATTTA	2	10	57996	58005	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020993	TGTAA	2	10	58276	58285	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020993	CTTTG	2	10	58484	58493	0 %	60 %	20 %	20 %	478693422
71	NC_020993	TATAA	2	10	58884	58893	60 %	40 %	0 %	0 %	478693422
72	NC_020993	ACTTT	2	10	60826	60835	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_020993	AGTAA	2	10	62823	62832	60 %	20 %	20 %	0 %	478693425
74	NC_020993	CATTA	2	10	63242	63251	40 %	40 %	0 %	20 %	478693425
75	NC_020993	TGACA	2	10	65244	65253	40 %	20 %	20 %	20 %	478693426
76	NC_020993	ATTTG	2	10	65431	65440	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020993	TTTGC	2	10	66508	66517	0 %	60 %	20 %	20 %	478693427
78	NC_020993	TAAAT	2	10	67269	67278	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020993	TAATT	2	10	69223	69232	40 %	60 %	0 %	0 %	478693429
80	NC_020993	TATCA	2	10	69315	69324	40 %	40 %	0 %	20 %	478693429
81	NC_020993	CAATT	2	10	69379	69388	40 %	40 %	0 %	20 %	478693429
82	NC_020993	ATAGA	2	10	70788	70797	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020993	TTAAA	2	10	70948	70957	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020993	TTTAC	2	10	71502	71511	20 %	60 %	0 %	20 %	478693430
85	NC_020993	TTTAA	2	10	72798	72807	40 %	60 %	0 %	0 %	478693430
86	NC_020993	TGATT	2	10	73445	73454	20 %	60 %	20 %	0 %	478693430
87	NC_020993	TATAA	2	10	74162	74171	60 %	40 %	0 %	0 %	478693430
88	NC_020993	TTATA	2	10	74638	74647	40 %	60 %	0 %	0 %	478693430
89	NC_020993	ATTTT	2	10	74715	74724	20 %	80 %	0 %	0 %	478693430
90	NC_020993	TTTGA	2	10	77378	77387	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020993	AGCAT	2	10	77883	77892	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_020993	TAATT	2	10	78050	78059	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020993	TTCAA	2	10	78662	78671	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_020993	AATTA	2	10	79508	79517	60 %	40 %	0 %	0 %	478693431
95	NC_020993	ATGCA	2	10	81568	81577	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_020993	TAATT	2	10	82873	82882	40 %	60 %	0 %	0 %	478693433
97	NC_020993	AATAT	2	10	83247	83256	60 %	40 %	0 %	0 %	478693434
98	NC_020993	AGAAT	2	10	83552	83561	60 %	20 %	20 %	0 %	478693434
99	NC_020993	TTATG	2	10	84632	84641	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020993	AGTTG	2	10	84651	84660	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020993	TCCTA	2	10	89223	89232	20 %	40 %	0 %	40 %	478693438
102	NC_020993	CTATA	2	10	90730	90739	40 %	40 %	0 %	20 %	478693441
103	NC_020993	TCCTA	2	10	91102	91111	20 %	40 %	0 %	40 %	478693442
104	NC_020993	TGACA	2	10	91488	91497	40 %	20 %	20 %	20 %	478693442
105	NC_020993	CAAAA	2	10	92185	92194	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_020993	TTTAA	2	10	93356	93365	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020993	TATTG	2	10	94611	94620	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020993	ATATT	2	10	94744	94753	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020993	TTATG	2	10	99255	99264	20 %	60 %	20 %	0 %	478693447
110	NC_020993	TCTGC	2	10	99297	99306	0 %	40 %	20 %	40 %	478693447
111	NC_020993	ATTTA	2	10	100039	100048	40 %	60 %	0 %	0 %	478693447
112	NC_020993	CTTTA	2	10	101856	101865	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_020993	TTAAT	2	10	102119	102128	40 %	60 %	0 %	0 %	478693449
114	NC_020993	ATAAA	2	10	103142	103151	80 %	20 %	0 %	0 %	478693449
115	NC_020993	TGGAG	2	10	104157	104166	20 %	20 %	60 %	0 %	478693450
116	NC_020993	GAATA	2	10	104542	104551	60 %	20 %	20 %	0 %	478693450
117	NC_020993	AATTA	2	10	105168	105177	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020993	AAAGA	2	10	107958	107967	80 %	0 %	20 %	0 %	478693452
119	NC_020993	TAATA	2	10	108785	108794	60 %	40 %	0 %	0 %	478693453
120	NC_020993	CAACA	2	10	109458	109467	60 %	0 %	0 %	40 %	478693454
121	NC_020993	TAAAT	2	10	111970	111979	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020993	CTAAG	2	10	112929	112938	40 %	20 %	20 %	20 %	478693457
123	NC_020993	TATAA	2	10	113148	113157	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020993	AATGT	2	10	113903	113912	40 %	40 %	20 %	0 %	478693458
125	NC_020993	TGAAA	2	10	114174	114183	60 %	20 %	20 %	0 %	478693458
126	NC_020993	GAAAA	2	10	117800	117809	80 %	0 %	20 %	0 %	478693461
127	NC_020993	ATCAA	2	10	118578	118587	60 %	20 %	0 %	20 %	478693461
128	NC_020993	ATTAT	2	10	121193	121202	40 %	60 %	0 %	0 %	478693463
129	NC_020993	TTATA	2	10	122821	122830	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020993	AATAA	2	10	124099	124108	80 %	20 %	0 %	0 %	478693465
131	NC_020993	TTATT	2	10	124126	124135	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020993	AGATG	2	10	124947	124956	40 %	20 %	40 %	0 %	478693466
133	NC_020993	GTATT	2	10	124976	124985	20 %	60 %	20 %	0 %	478693466
134	NC_020993	TTCTA	2	10	126081	126090	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_020993	TATAA	2	10	127354	127363	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020993	GTAAA	2	10	128716	128725	60 %	20 %	20 %	0 %	478693468
137	NC_020993	ATTTT	2	10	130147	130156	20 %	80 %	0 %	0 %	478693470
138	NC_020993	ATTTT	2	10	130312	130321	20 %	80 %	0 %	0 %	478693470
139	NC_020993	ATTAT	2	10	130459	130468	40 %	60 %	0 %	0 %	478693470
140	NC_020993	ACTTT	2	10	131325	131334	20 %	60 %	0 %	20 %	478693471
141	NC_020993	AAAAG	2	10	131903	131912	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020993	GTCAA	2	10	133004	133013	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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