MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. Breinl

Total Repeats: 799

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020993	AAAAT	2	10	605	614	80 %	20 %	0 %	0 %	478693375
2	NC_020993	TAATA	2	10	3004	3013	60 %	40 %	0 %	0 %	478693380
3	NC_020993	GCAAT	2	10	3942	3951	40 %	20 %	20 %	20 %	478693381
4	NC_020993	TATCT	2	10	6864	6873	20 %	60 %	0 %	20 %	478693384
5	NC_020993	TTATA	2	10	12479	12488	40 %	60 %	0 %	0 %	478693387
6	NC_020993	TAAAT	2	10	12983	12992	60 %	40 %	0 %	0 %	478693388
7	NC_020993	TAAAA	2	10	13609	13618	80 %	20 %	0 %	0 %	478693389
8	NC_020993	AGAAA	2	10	14299	14308	80 %	0 %	20 %	0 %	478693389
9	NC_020993	GGTTT	2	10	15216	15225	0 %	60 %	40 %	0 %	478693389
10	NC_020993	AGATG	2	10	16312	16321	40 %	20 %	40 %	0 %	478693389
11	NC_020993	TAAAT	2	10	16396	16405	60 %	40 %	0 %	0 %	478693389
12	NC_020993	CTTTT	2	10	27586	27595	0 %	80 %	0 %	20 %	478693398
13	NC_020993	CTTAT	2	10	28841	28850	20 %	60 %	0 %	20 %	478693400
14	NC_020993	TATTT	2	10	29460	29469	20 %	80 %	0 %	0 %	478693401
15	NC_020993	TTATT	2	10	29495	29504	20 %	80 %	0 %	0 %	478693401
16	NC_020993	TATCT	2	10	29634	29643	20 %	60 %	0 %	20 %	478693401
17	NC_020993	TTTAT	2	10	31096	31105	20 %	80 %	0 %	0 %	478693402
18	NC_020993	ATTAT	2	10	34975	34984	40 %	60 %	0 %	0 %	478693405
19	NC_020993	GCATT	2	10	36785	36794	20 %	40 %	20 %	20 %	478693406
20	NC_020993	TGCCA	2	10	38519	38528	20 %	20 %	20 %	40 %	478693407
21	NC_020993	AGGGA	2	10	38592	38601	40 %	0 %	60 %	0 %	478693407
22	NC_020993	AAATT	2	10	40654	40663	60 %	40 %	0 %	0 %	478693408
23	NC_020993	TACTA	2	10	41815	41824	40 %	40 %	0 %	20 %	478693410
24	NC_020993	TATAA	2	10	42419	42428	60 %	40 %	0 %	0 %	478693411
25	NC_020993	TTGAG	2	10	42849	42858	20 %	40 %	40 %	0 %	478693411
26	NC_020993	AGTAT	2	10	43787	43796	40 %	40 %	20 %	0 %	478693412
27	NC_020993	TTAAC	2	10	43991	44000	40 %	40 %	0 %	20 %	478693412
28	NC_020993	ATTTA	2	10	45597	45606	40 %	60 %	0 %	0 %	478693412
29	NC_020993	TTAAT	2	10	49139	49148	40 %	60 %	0 %	0 %	478693414
30	NC_020993	AGATA	2	10	49383	49392	60 %	20 %	20 %	0 %	478693414
31	NC_020993	AGCTC	2	10	50010	50019	20 %	20 %	20 %	40 %	478693415
32	NC_020993	TTAAG	2	10	50081	50090	40 %	40 %	20 %	0 %	478693415
33	NC_020993	ATTAC	2	10	52143	52152	40 %	40 %	0 %	20 %	478693416
34	NC_020993	TACTA	2	10	52772	52781	40 %	40 %	0 %	20 %	478693416
35	NC_020993	ATTAT	2	10	53241	53250	40 %	60 %	0 %	0 %	478693416
36	NC_020993	ATTTA	2	10	53934	53943	40 %	60 %	0 %	0 %	478693417
37	NC_020993	GTATA	2	10	55187	55196	40 %	40 %	20 %	0 %	478693419
38	NC_020993	GTCAA	2	10	55490	55499	40 %	20 %	20 %	20 %	478693419
39	NC_020993	TCTTT	2	10	56411	56420	0 %	80 %	0 %	20 %	478693421
40	NC_020993	AGAAA	2	10	56507	56516	80 %	0 %	20 %	0 %	478693421
41	NC_020993	CTTTG	2	10	58484	58493	0 %	60 %	20 %	20 %	478693422
42	NC_020993	TATAA	2	10	58884	58893	60 %	40 %	0 %	0 %	478693422
43	NC_020993	AGTAA	2	10	62823	62832	60 %	20 %	20 %	0 %	478693425
44	NC_020993	CATTA	2	10	63242	63251	40 %	40 %	0 %	20 %	478693425
45	NC_020993	TGACA	2	10	65244	65253	40 %	20 %	20 %	20 %	478693426
46	NC_020993	TTTGC	2	10	66508	66517	0 %	60 %	20 %	20 %	478693427
47	NC_020993	TAATT	2	10	69223	69232	40 %	60 %	0 %	0 %	478693429
48	NC_020993	TATCA	2	10	69315	69324	40 %	40 %	0 %	20 %	478693429
49	NC_020993	CAATT	2	10	69379	69388	40 %	40 %	0 %	20 %	478693429
50	NC_020993	TTTAC	2	10	71502	71511	20 %	60 %	0 %	20 %	478693430
51	NC_020993	TTTAA	2	10	72798	72807	40 %	60 %	0 %	0 %	478693430
52	NC_020993	TGATT	2	10	73445	73454	20 %	60 %	20 %	0 %	478693430
53	NC_020993	TATAA	2	10	74162	74171	60 %	40 %	0 %	0 %	478693430
54	NC_020993	TTATA	2	10	74638	74647	40 %	60 %	0 %	0 %	478693430
55	NC_020993	ATTTT	2	10	74715	74724	20 %	80 %	0 %	0 %	478693430
56	NC_020993	AATTA	2	10	79508	79517	60 %	40 %	0 %	0 %	478693431
57	NC_020993	TAATT	2	10	82873	82882	40 %	60 %	0 %	0 %	478693433
58	NC_020993	AATAT	2	10	83247	83256	60 %	40 %	0 %	0 %	478693434
59	NC_020993	AGAAT	2	10	83552	83561	60 %	20 %	20 %	0 %	478693434
60	NC_020993	TCCTA	2	10	89223	89232	20 %	40 %	0 %	40 %	478693438
61	NC_020993	CTATA	2	10	90730	90739	40 %	40 %	0 %	20 %	478693441
62	NC_020993	TCCTA	2	10	91102	91111	20 %	40 %	0 %	40 %	478693442
63	NC_020993	TGACA	2	10	91488	91497	40 %	20 %	20 %	20 %	478693442
64	NC_020993	TTATG	2	10	99255	99264	20 %	60 %	20 %	0 %	478693447
65	NC_020993	TCTGC	2	10	99297	99306	0 %	40 %	20 %	40 %	478693447
66	NC_020993	ATTTA	2	10	100039	100048	40 %	60 %	0 %	0 %	478693447
67	NC_020993	TTAAT	2	10	102119	102128	40 %	60 %	0 %	0 %	478693449
68	NC_020993	ATAAA	2	10	103142	103151	80 %	20 %	0 %	0 %	478693449
69	NC_020993	TGGAG	2	10	104157	104166	20 %	20 %	60 %	0 %	478693450
70	NC_020993	GAATA	2	10	104542	104551	60 %	20 %	20 %	0 %	478693450
71	NC_020993	AAAGA	2	10	107958	107967	80 %	0 %	20 %	0 %	478693452
72	NC_020993	TAATA	2	10	108785	108794	60 %	40 %	0 %	0 %	478693453
73	NC_020993	CAACA	2	10	109458	109467	60 %	0 %	0 %	40 %	478693454
74	NC_020993	CTAAG	2	10	112929	112938	40 %	20 %	20 %	20 %	478693457
75	NC_020993	AATGT	2	10	113903	113912	40 %	40 %	20 %	0 %	478693458
76	NC_020993	TGAAA	2	10	114174	114183	60 %	20 %	20 %	0 %	478693458
77	NC_020993	GAAAA	2	10	117800	117809	80 %	0 %	20 %	0 %	478693461
78	NC_020993	ATCAA	2	10	118578	118587	60 %	20 %	0 %	20 %	478693461
79	NC_020993	ATTAT	2	10	121193	121202	40 %	60 %	0 %	0 %	478693463
80	NC_020993	AATAA	2	10	124099	124108	80 %	20 %	0 %	0 %	478693465
81	NC_020993	AGATG	2	10	124947	124956	40 %	20 %	40 %	0 %	478693466
82	NC_020993	GTATT	2	10	124976	124985	20 %	60 %	20 %	0 %	478693466
83	NC_020993	GTAAA	2	10	128716	128725	60 %	20 %	20 %	0 %	478693468
84	NC_020993	ATTTT	2	10	130147	130156	20 %	80 %	0 %	0 %	478693470
85	NC_020993	ATTTT	2	10	130312	130321	20 %	80 %	0 %	0 %	478693470
86	NC_020993	ATTAT	2	10	130459	130468	40 %	60 %	0 %	0 %	478693470
87	NC_020993	ACTTT	2	10	131325	131334	20 %	60 %	0 %	20 %	478693471
88	NC_020993	AGAAA	2	10	136804	136813	80 %	0 %	20 %	0 %	478693474
89	NC_020993	TAATT	2	10	137440	137449	40 %	60 %	0 %	0 %	478693474
90	NC_020993	TATGG	2	10	137510	137519	20 %	40 %	40 %	0 %	478693474
91	NC_020993	GAAAA	2	10	140279	140288	80 %	0 %	20 %	0 %	478693476
92	NC_020993	ATTTT	2	10	141763	141772	20 %	80 %	0 %	0 %	478693477
93	NC_020993	TAATT	2	10	141962	141971	40 %	60 %	0 %	0 %	478693477
94	NC_020993	CAAAA	2	10	142663	142672	80 %	0 %	0 %	20 %	478693477
95	NC_020993	ATTAC	2	10	143785	143794	40 %	40 %	0 %	20 %	478693479
96	NC_020993	ATTTA	2	10	145687	145696	40 %	60 %	0 %	0 %	478693481
97	NC_020993	TACCG	2	10	146221	146230	20 %	20 %	20 %	40 %	478693482
98	NC_020993	TTATC	2	10	146292	146301	20 %	60 %	0 %	20 %	478693482
99	NC_020993	TACTT	2	10	147649	147658	20 %	60 %	0 %	20 %	478693482
100	NC_020993	CTTGC	2	10	148032	148041	0 %	40 %	20 %	40 %	478693482
101	NC_020993	CATTA	2	10	149772	149781	40 %	40 %	0 %	20 %	478693485
102	NC_020993	TATTT	2	10	149793	149802	20 %	80 %	0 %	0 %	478693485
103	NC_020993	CTTTG	2	10	149994	150003	0 %	60 %	20 %	20 %	478693485
104	NC_020993	TTGCA	2	10	150329	150338	20 %	40 %	20 %	20 %	478693485
105	NC_020993	CAAAA	2	10	150471	150480	80 %	0 %	0 %	20 %	478693485
106	NC_020993	ATTTT	2	10	150836	150845	20 %	80 %	0 %	0 %	478693485
107	NC_020993	AAGAA	2	10	151674	151683	80 %	0 %	20 %	0 %	478693486
108	NC_020993	TATAA	2	10	152809	152818	60 %	40 %	0 %	0 %	478693486
109	NC_020993	CAAAA	2	10	153185	153194	80 %	0 %	0 %	20 %	478693486
110	NC_020993	TAATT	2	10	154164	154173	40 %	60 %	0 %	0 %	478693486
111	NC_020993	TCATA	2	10	157998	158007	40 %	40 %	0 %	20 %	478693489
112	NC_020993	AGTAT	2	10	162840	162849	40 %	40 %	20 %	0 %	478693492
113	NC_020993	AATAT	2	10	166643	166652	60 %	40 %	0 %	0 %	478693496
114	NC_020993	TAGCT	2	10	170947	170956	20 %	40 %	20 %	20 %	478693501
115	NC_020993	AATTA	2	10	171142	171151	60 %	40 %	0 %	0 %	478693501
116	NC_020993	AATAT	2	10	171280	171289	60 %	40 %	0 %	0 %	478693502
117	NC_020993	ATAAA	2	10	171595	171604	80 %	20 %	0 %	0 %	478693502
118	NC_020993	CTGCT	2	10	173696	173705	0 %	40 %	20 %	40 %	478693503
119	NC_020993	TAACT	2	10	173804	173813	40 %	40 %	0 %	20 %	478693503
120	NC_020993	AATTA	2	10	174574	174583	60 %	40 %	0 %	0 %	478693504
121	NC_020993	GTTTT	2	10	176794	176803	0 %	80 %	20 %	0 %	478693505
122	NC_020993	AATTA	2	10	177233	177242	60 %	40 %	0 %	0 %	478693505
123	NC_020993	ACTAT	2	10	177330	177339	40 %	40 %	0 %	20 %	478693505
124	NC_020993	ATTTA	2	10	177356	177365	40 %	60 %	0 %	0 %	478693505
125	NC_020993	CTTTC	2	10	177553	177562	0 %	60 %	0 %	40 %	478693505
126	NC_020993	GAAAA	2	10	177933	177942	80 %	0 %	20 %	0 %	478693506
127	NC_020993	TTAAT	2	10	178545	178554	40 %	60 %	0 %	0 %	478693506
128	NC_020993	TAAAT	2	10	178819	178828	60 %	40 %	0 %	0 %	478693506
129	NC_020993	TAATG	2	10	179743	179752	40 %	40 %	20 %	0 %	478693508
130	NC_020993	ATACT	2	10	180051	180060	40 %	40 %	0 %	20 %	478693508
131	NC_020993	AAAAC	2	10	181567	181576	80 %	0 %	0 %	20 %	478693509
132	NC_020993	AATAC	2	10	181828	181837	60 %	20 %	0 %	20 %	478693509
133	NC_020993	ATTTT	2	10	181928	181937	20 %	80 %	0 %	0 %	478693509
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