MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rickettsia prowazekii str. Breinl

Total Repeats: 3493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020993	TTTA	2	8	215	222	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020993	CTTT	2	8	402	409	0 %	75 %	0 %	25 %	478693375
3	NC_020993	TTAT	2	8	641	648	25 %	75 %	0 %	0 %	478693375
4	NC_020993	CTAA	2	8	810	817	50 %	25 %	0 %	25 %	478693376
5	NC_020993	TAAT	2	8	1340	1347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020993	AATA	2	8	1712	1719	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020993	CTTG	2	8	1869	1876	0 %	50 %	25 %	25 %	478693379
8	NC_020993	TAAA	2	8	1933	1940	75 %	25 %	0 %	0 %	478693379
9	NC_020993	TAAT	2	8	2485	2492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020993	GAAA	2	8	2764	2771	75 %	0 %	25 %	0 %	478693380
11	NC_020993	TTAA	2	8	2816	2823	50 %	50 %	0 %	0 %	478693380
12	NC_020993	AAAG	2	8	2966	2973	75 %	0 %	25 %	0 %	478693380
13	NC_020993	TATT	2	8	3451	3458	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020993	GTTT	2	8	4074	4081	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020993	TGTA	2	8	4167	4174	25 %	50 %	25 %	0 %	478693382
16	NC_020993	AGCA	2	8	4638	4645	50 %	0 %	25 %	25 %	478693383
17	NC_020993	TATG	2	8	5008	5015	25 %	50 %	25 %	0 %	478693383
18	NC_020993	TAAA	2	8	5186	5193	75 %	25 %	0 %	0 %	478693383
19	NC_020993	ATTT	2	8	5928	5935	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020993	TAAA	2	8	6012	6019	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020993	TTAT	2	8	6505	6512	25 %	75 %	0 %	0 %	478693384
22	NC_020993	TTTA	2	8	6700	6707	25 %	75 %	0 %	0 %	478693384
23	NC_020993	TGAT	2	8	7166	7173	25 %	50 %	25 %	0 %	478693384
24	NC_020993	TTGT	2	8	7723	7730	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020993	AATG	2	8	8140	8147	50 %	25 %	25 %	0 %	478693385
26	NC_020993	ATTT	2	8	8718	8725	25 %	75 %	0 %	0 %	478693385
27	NC_020993	ACTA	2	8	10081	10088	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_020993	TATT	2	8	10570	10577	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020993	ATGT	2	8	10855	10862	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020993	AATT	2	8	11045	11052	50 %	50 %	0 %	0 %	478693386
31	NC_020993	GCAT	2	8	11104	11111	25 %	25 %	25 %	25 %	478693386
32	NC_020993	TTTA	2	8	11397	11404	25 %	75 %	0 %	0 %	478693386
33	NC_020993	CATT	2	8	11480	11487	25 %	50 %	0 %	25 %	478693386
34	NC_020993	TCAA	2	8	11647	11654	50 %	25 %	0 %	25 %	478693386
35	NC_020993	TAAA	2	8	11756	11763	75 %	25 %	0 %	0 %	478693386
36	NC_020993	TTTG	2	8	11849	11856	0 %	75 %	25 %	0 %	478693386
37	NC_020993	ACCA	2	8	11861	11868	50 %	0 %	0 %	50 %	478693386
38	NC_020993	TGCA	2	8	11871	11878	25 %	25 %	25 %	25 %	478693386
39	NC_020993	AATG	2	8	12528	12535	50 %	25 %	25 %	0 %	478693387
40	NC_020993	AAAC	2	8	13555	13562	75 %	0 %	0 %	25 %	478693389
41	NC_020993	AATT	2	8	13753	13760	50 %	50 %	0 %	0 %	478693389
42	NC_020993	TTTA	2	8	14109	14116	25 %	75 %	0 %	0 %	478693389
43	NC_020993	ATAA	2	8	14441	14448	75 %	25 %	0 %	0 %	478693389
44	NC_020993	ATTT	2	8	14523	14530	25 %	75 %	0 %	0 %	478693389
45	NC_020993	GTCA	2	8	15398	15405	25 %	25 %	25 %	25 %	478693389
46	NC_020993	TGAG	2	8	15753	15760	25 %	25 %	50 %	0 %	478693389
47	NC_020993	CATA	2	8	15844	15851	50 %	25 %	0 %	25 %	478693389
48	NC_020993	CAAA	2	8	16508	16515	75 %	0 %	0 %	25 %	478693389
49	NC_020993	ATTG	2	8	17620	17627	25 %	50 %	25 %	0 %	478693390
50	NC_020993	ATTT	2	8	18391	18398	25 %	75 %	0 %	0 %	478693391
51	NC_020993	CACT	2	8	18858	18865	25 %	25 %	0 %	50 %	478693391
52	NC_020993	TCTA	2	8	18980	18987	25 %	50 %	0 %	25 %	478693391
53	NC_020993	ATAA	2	8	19083	19090	75 %	25 %	0 %	0 %	478693391
54	NC_020993	TCAA	2	8	19295	19302	50 %	25 %	0 %	25 %	478693391
55	NC_020993	TTGG	2	8	19378	19385	0 %	50 %	50 %	0 %	478693391
56	NC_020993	TTTA	2	8	19447	19454	25 %	75 %	0 %	0 %	478693391
57	NC_020993	ATTT	2	8	19552	19559	25 %	75 %	0 %	0 %	478693391
58	NC_020993	AATA	2	8	19630	19637	75 %	25 %	0 %	0 %	478693391
59	NC_020993	CGGA	2	8	19979	19986	25 %	0 %	50 %	25 %	478693392
60	NC_020993	ATTA	2	8	21693	21700	50 %	50 %	0 %	0 %	478693394
61	NC_020993	TTTA	2	8	22424	22431	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020993	AAAT	2	8	23458	23465	75 %	25 %	0 %	0 %	478693395
63	NC_020993	TTAC	2	8	23781	23788	25 %	50 %	0 %	25 %	478693395
64	NC_020993	AAGT	2	8	23887	23894	50 %	25 %	25 %	0 %	478693395
65	NC_020993	AATA	2	8	24143	24150	75 %	25 %	0 %	0 %	478693395
66	NC_020993	AAGG	2	8	24351	24358	50 %	0 %	50 %	0 %	478693395
67	NC_020993	CAAA	2	8	24650	24657	75 %	0 %	0 %	25 %	478693395
68	NC_020993	TAGG	2	8	24990	24997	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020993	ATCA	2	8	25062	25069	50 %	25 %	0 %	25 %	478693396
70	NC_020993	ATTT	2	8	25116	25123	25 %	75 %	0 %	0 %	478693396
71	NC_020993	ATTT	2	8	25517	25524	25 %	75 %	0 %	0 %	478693396
72	NC_020993	GTTT	2	8	25559	25566	0 %	75 %	25 %	0 %	478693396
73	NC_020993	TCAG	2	8	25668	25675	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_020993	TATT	2	8	25805	25812	25 %	75 %	0 %	0 %	478693397
75	NC_020993	ATAG	2	8	26169	26176	50 %	25 %	25 %	0 %	478693397
76	NC_020993	ATTA	2	8	26779	26786	50 %	50 %	0 %	0 %	478693398
77	NC_020993	ATTA	2	8	27262	27269	50 %	50 %	0 %	0 %	478693398
78	NC_020993	GAAT	2	8	27756	27763	50 %	25 %	25 %	0 %	478693398
79	NC_020993	AATG	2	8	27904	27911	50 %	25 %	25 %	0 %	478693398
80	NC_020993	TTCC	2	8	28036	28043	0 %	50 %	0 %	50 %	478693399
81	NC_020993	ATTT	2	8	28493	28500	25 %	75 %	0 %	0 %	478693399
82	NC_020993	TATT	2	8	28863	28870	25 %	75 %	0 %	0 %	478693400
83	NC_020993	TAAA	2	8	29131	29138	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020993	ATGA	2	8	29255	29262	50 %	25 %	25 %	0 %	478693401
85	NC_020993	AAAT	2	8	29545	29552	75 %	25 %	0 %	0 %	478693401
86	NC_020993	TAGT	2	8	30233	30240	25 %	50 %	25 %	0 %	478693402
87	NC_020993	ATTA	2	8	31143	31150	50 %	50 %	0 %	0 %	478693402
88	NC_020993	ACTT	2	8	31623	31630	25 %	50 %	0 %	25 %	478693403
89	NC_020993	TATT	2	8	31655	31662	25 %	75 %	0 %	0 %	478693403
90	NC_020993	TCTT	2	8	31704	31711	0 %	75 %	0 %	25 %	478693403
91	NC_020993	ATAA	2	8	32793	32800	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020993	AATT	2	8	32812	32819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020993	TATG	2	8	33689	33696	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020993	ATTA	2	8	34015	34022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020993	TGTA	2	8	34242	34249	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020993	TATG	2	8	34322	34329	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020993	GGTT	2	8	34359	34366	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020993	AATG	2	8	34685	34692	50 %	25 %	25 %	0 %	478693405
99	NC_020993	CATG	2	8	34836	34843	25 %	25 %	25 %	25 %	478693405
100	NC_020993	CTAC	2	8	34996	35003	25 %	25 %	0 %	50 %	478693405
101	NC_020993	ATTC	2	8	35219	35226	25 %	50 %	0 %	25 %	478693405
102	NC_020993	CTAC	2	8	35305	35312	25 %	25 %	0 %	50 %	478693405
103	NC_020993	AGTT	2	8	35795	35802	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020993	ATTG	2	8	36315	36322	25 %	50 %	25 %	0 %	478693406
105	NC_020993	TAAA	2	8	37470	37477	75 %	25 %	0 %	0 %	478693407
106	NC_020993	CAAA	2	8	38294	38301	75 %	0 %	0 %	25 %	478693407
107	NC_020993	ATTA	2	8	38698	38705	50 %	50 %	0 %	0 %	478693407
108	NC_020993	TAAA	2	8	38853	38860	75 %	25 %	0 %	0 %	478693407
109	NC_020993	TTTA	2	8	38919	38926	25 %	75 %	0 %	0 %	478693407
110	NC_020993	ATAC	2	8	38976	38983	50 %	25 %	0 %	25 %	478693407
111	NC_020993	TAAT	2	8	39033	39040	50 %	50 %	0 %	0 %	478693407
112	NC_020993	ATAA	2	8	39702	39709	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020993	CAAT	2	8	39759	39766	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_020993	ATTA	2	8	39792	39799	50 %	50 %	0 %	0 %	478693408
115	NC_020993	TAAT	2	8	40007	40014	50 %	50 %	0 %	0 %	478693408
116	NC_020993	ATAA	2	8	40024	40031	75 %	25 %	0 %	0 %	478693408
117	NC_020993	GGAT	2	8	40212	40219	25 %	25 %	50 %	0 %	478693408
118	NC_020993	GATT	2	8	40554	40561	25 %	50 %	25 %	0 %	478693408
119	NC_020993	AAAC	2	8	41712	41719	75 %	0 %	0 %	25 %	478693410
120	NC_020993	TCAT	2	8	42019	42026	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_020993	TAAA	2	8	42135	42142	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020993	TAAA	2	8	43095	43102	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020993	TAAA	2	8	44582	44589	75 %	25 %	0 %	0 %	478693412
124	NC_020993	AGGT	2	8	44658	44665	25 %	25 %	50 %	0 %	478693412
125	NC_020993	GATA	2	8	44880	44887	50 %	25 %	25 %	0 %	478693412
126	NC_020993	AATG	2	8	45135	45142	50 %	25 %	25 %	0 %	478693412
127	NC_020993	TAAA	2	8	45350	45357	75 %	25 %	0 %	0 %	478693412
128	NC_020993	ACTA	2	8	45477	45484	50 %	25 %	0 %	25 %	478693412
129	NC_020993	ATCA	2	8	45937	45944	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_020993	ATTT	2	8	47614	47621	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020993	TTGT	2	8	47866	47873	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020993	AAAG	2	8	48297	48304	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020993	TAAT	2	8	48338	48345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020993	ATTA	2	8	48406	48413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020993	TAAC	2	8	48489	48496	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_020993	GAAT	2	8	48808	48815	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020993	TTAG	2	8	49126	49133	25 %	50 %	25 %	0 %	478693414
138	NC_020993	GATA	2	8	49743	49750	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020993	AAGT	2	8	49779	49786	50 %	25 %	25 %	0 %	478693415
140	NC_020993	TTAT	2	8	49859	49866	25 %	75 %	0 %	0 %	478693415
141	NC_020993	CTTG	2	8	50264	50271	0 %	50 %	25 %	25 %	478693415
142	NC_020993	ATAA	2	8	50314	50321	75 %	25 %	0 %	0 %	478693415
143	NC_020993	ATCT	2	8	50393	50400	25 %	50 %	0 %	25 %	478693415
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