MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. Breinl

Total Repeats: 2487

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020993	CTTT	2	8	402	409	0 %	75 %	0 %	25 %	478693375
2	NC_020993	TTAT	2	8	641	648	25 %	75 %	0 %	0 %	478693375
3	NC_020993	CTAA	2	8	810	817	50 %	25 %	0 %	25 %	478693376
4	NC_020993	CTTG	2	8	1869	1876	0 %	50 %	25 %	25 %	478693379
5	NC_020993	TAAA	2	8	1933	1940	75 %	25 %	0 %	0 %	478693379
6	NC_020993	GAAA	2	8	2764	2771	75 %	0 %	25 %	0 %	478693380
7	NC_020993	TTAA	2	8	2816	2823	50 %	50 %	0 %	0 %	478693380
8	NC_020993	AAAG	2	8	2966	2973	75 %	0 %	25 %	0 %	478693380
9	NC_020993	TGTA	2	8	4167	4174	25 %	50 %	25 %	0 %	478693382
10	NC_020993	AGCA	2	8	4638	4645	50 %	0 %	25 %	25 %	478693383
11	NC_020993	TATG	2	8	5008	5015	25 %	50 %	25 %	0 %	478693383
12	NC_020993	TAAA	2	8	5186	5193	75 %	25 %	0 %	0 %	478693383
13	NC_020993	TTAT	2	8	6505	6512	25 %	75 %	0 %	0 %	478693384
14	NC_020993	TTTA	2	8	6700	6707	25 %	75 %	0 %	0 %	478693384
15	NC_020993	TGAT	2	8	7166	7173	25 %	50 %	25 %	0 %	478693384
16	NC_020993	AATG	2	8	8140	8147	50 %	25 %	25 %	0 %	478693385
17	NC_020993	ATTT	2	8	8718	8725	25 %	75 %	0 %	0 %	478693385
18	NC_020993	AATT	2	8	11045	11052	50 %	50 %	0 %	0 %	478693386
19	NC_020993	GCAT	2	8	11104	11111	25 %	25 %	25 %	25 %	478693386
20	NC_020993	TTTA	2	8	11397	11404	25 %	75 %	0 %	0 %	478693386
21	NC_020993	CATT	2	8	11480	11487	25 %	50 %	0 %	25 %	478693386
22	NC_020993	TCAA	2	8	11647	11654	50 %	25 %	0 %	25 %	478693386
23	NC_020993	TAAA	2	8	11756	11763	75 %	25 %	0 %	0 %	478693386
24	NC_020993	TTTG	2	8	11849	11856	0 %	75 %	25 %	0 %	478693386
25	NC_020993	ACCA	2	8	11861	11868	50 %	0 %	0 %	50 %	478693386
26	NC_020993	TGCA	2	8	11871	11878	25 %	25 %	25 %	25 %	478693386
27	NC_020993	AATG	2	8	12528	12535	50 %	25 %	25 %	0 %	478693387
28	NC_020993	AAAC	2	8	13555	13562	75 %	0 %	0 %	25 %	478693389
29	NC_020993	AATT	2	8	13753	13760	50 %	50 %	0 %	0 %	478693389
30	NC_020993	TTTA	2	8	14109	14116	25 %	75 %	0 %	0 %	478693389
31	NC_020993	ATAA	2	8	14441	14448	75 %	25 %	0 %	0 %	478693389
32	NC_020993	ATTT	2	8	14523	14530	25 %	75 %	0 %	0 %	478693389
33	NC_020993	GTCA	2	8	15398	15405	25 %	25 %	25 %	25 %	478693389
34	NC_020993	TGAG	2	8	15753	15760	25 %	25 %	50 %	0 %	478693389
35	NC_020993	CATA	2	8	15844	15851	50 %	25 %	0 %	25 %	478693389
36	NC_020993	CAAA	2	8	16508	16515	75 %	0 %	0 %	25 %	478693389
37	NC_020993	ATTG	2	8	17620	17627	25 %	50 %	25 %	0 %	478693390
38	NC_020993	ATTT	2	8	18391	18398	25 %	75 %	0 %	0 %	478693391
39	NC_020993	CACT	2	8	18858	18865	25 %	25 %	0 %	50 %	478693391
40	NC_020993	TCTA	2	8	18980	18987	25 %	50 %	0 %	25 %	478693391
41	NC_020993	ATAA	2	8	19083	19090	75 %	25 %	0 %	0 %	478693391
42	NC_020993	TCAA	2	8	19295	19302	50 %	25 %	0 %	25 %	478693391
43	NC_020993	TTGG	2	8	19378	19385	0 %	50 %	50 %	0 %	478693391
44	NC_020993	TTTA	2	8	19447	19454	25 %	75 %	0 %	0 %	478693391
45	NC_020993	ATTT	2	8	19552	19559	25 %	75 %	0 %	0 %	478693391
46	NC_020993	AATA	2	8	19630	19637	75 %	25 %	0 %	0 %	478693391
47	NC_020993	CGGA	2	8	19979	19986	25 %	0 %	50 %	25 %	478693392
48	NC_020993	ATTA	2	8	21693	21700	50 %	50 %	0 %	0 %	478693394
49	NC_020993	AAAT	2	8	23458	23465	75 %	25 %	0 %	0 %	478693395
50	NC_020993	TTAC	2	8	23781	23788	25 %	50 %	0 %	25 %	478693395
51	NC_020993	AAGT	2	8	23887	23894	50 %	25 %	25 %	0 %	478693395
52	NC_020993	AATA	2	8	24143	24150	75 %	25 %	0 %	0 %	478693395
53	NC_020993	AAGG	2	8	24351	24358	50 %	0 %	50 %	0 %	478693395
54	NC_020993	CAAA	2	8	24650	24657	75 %	0 %	0 %	25 %	478693395
55	NC_020993	ATCA	2	8	25062	25069	50 %	25 %	0 %	25 %	478693396
56	NC_020993	ATTT	2	8	25116	25123	25 %	75 %	0 %	0 %	478693396
57	NC_020993	ATTT	2	8	25517	25524	25 %	75 %	0 %	0 %	478693396
58	NC_020993	GTTT	2	8	25559	25566	0 %	75 %	25 %	0 %	478693396
59	NC_020993	TATT	2	8	25805	25812	25 %	75 %	0 %	0 %	478693397
60	NC_020993	ATAG	2	8	26169	26176	50 %	25 %	25 %	0 %	478693397
61	NC_020993	ATTA	2	8	26779	26786	50 %	50 %	0 %	0 %	478693398
62	NC_020993	ATTA	2	8	27262	27269	50 %	50 %	0 %	0 %	478693398
63	NC_020993	GAAT	2	8	27756	27763	50 %	25 %	25 %	0 %	478693398
64	NC_020993	AATG	2	8	27904	27911	50 %	25 %	25 %	0 %	478693398
65	NC_020993	TTCC	2	8	28036	28043	0 %	50 %	0 %	50 %	478693399
66	NC_020993	ATTT	2	8	28493	28500	25 %	75 %	0 %	0 %	478693399
67	NC_020993	TATT	2	8	28863	28870	25 %	75 %	0 %	0 %	478693400
68	NC_020993	ATGA	2	8	29255	29262	50 %	25 %	25 %	0 %	478693401
69	NC_020993	AAAT	2	8	29545	29552	75 %	25 %	0 %	0 %	478693401
70	NC_020993	TAGT	2	8	30233	30240	25 %	50 %	25 %	0 %	478693402
71	NC_020993	ATTA	2	8	31143	31150	50 %	50 %	0 %	0 %	478693402
72	NC_020993	ACTT	2	8	31623	31630	25 %	50 %	0 %	25 %	478693403
73	NC_020993	TATT	2	8	31655	31662	25 %	75 %	0 %	0 %	478693403
74	NC_020993	TCTT	2	8	31704	31711	0 %	75 %	0 %	25 %	478693403
75	NC_020993	AATG	2	8	34685	34692	50 %	25 %	25 %	0 %	478693405
76	NC_020993	CATG	2	8	34836	34843	25 %	25 %	25 %	25 %	478693405
77	NC_020993	CTAC	2	8	34996	35003	25 %	25 %	0 %	50 %	478693405
78	NC_020993	ATTC	2	8	35219	35226	25 %	50 %	0 %	25 %	478693405
79	NC_020993	CTAC	2	8	35305	35312	25 %	25 %	0 %	50 %	478693405
80	NC_020993	ATTG	2	8	36315	36322	25 %	50 %	25 %	0 %	478693406
81	NC_020993	TAAA	2	8	37470	37477	75 %	25 %	0 %	0 %	478693407
82	NC_020993	CAAA	2	8	38294	38301	75 %	0 %	0 %	25 %	478693407
83	NC_020993	ATTA	2	8	38698	38705	50 %	50 %	0 %	0 %	478693407
84	NC_020993	TAAA	2	8	38853	38860	75 %	25 %	0 %	0 %	478693407
85	NC_020993	TTTA	2	8	38919	38926	25 %	75 %	0 %	0 %	478693407
86	NC_020993	ATAC	2	8	38976	38983	50 %	25 %	0 %	25 %	478693407
87	NC_020993	TAAT	2	8	39033	39040	50 %	50 %	0 %	0 %	478693407
88	NC_020993	ATTA	2	8	39792	39799	50 %	50 %	0 %	0 %	478693408
89	NC_020993	TAAT	2	8	40007	40014	50 %	50 %	0 %	0 %	478693408
90	NC_020993	ATAA	2	8	40024	40031	75 %	25 %	0 %	0 %	478693408
91	NC_020993	GGAT	2	8	40212	40219	25 %	25 %	50 %	0 %	478693408
92	NC_020993	GATT	2	8	40554	40561	25 %	50 %	25 %	0 %	478693408
93	NC_020993	AAAC	2	8	41712	41719	75 %	0 %	0 %	25 %	478693410
94	NC_020993	TAAA	2	8	44582	44589	75 %	25 %	0 %	0 %	478693412
95	NC_020993	AGGT	2	8	44658	44665	25 %	25 %	50 %	0 %	478693412
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98	NC_020993	TAAA	2	8	45350	45357	75 %	25 %	0 %	0 %	478693412
99	NC_020993	ACTA	2	8	45477	45484	50 %	25 %	0 %	25 %	478693412
100	NC_020993	TTAG	2	8	49126	49133	25 %	50 %	25 %	0 %	478693414
101	NC_020993	AAGT	2	8	49779	49786	50 %	25 %	25 %	0 %	478693415
102	NC_020993	TTAT	2	8	49859	49866	25 %	75 %	0 %	0 %	478693415
103	NC_020993	CTTG	2	8	50264	50271	0 %	50 %	25 %	25 %	478693415
104	NC_020993	ATAA	2	8	50314	50321	75 %	25 %	0 %	0 %	478693415
105	NC_020993	ATCT	2	8	50393	50400	25 %	50 %	0 %	25 %	478693415
106	NC_020993	AATT	2	8	50721	50728	50 %	50 %	0 %	0 %	478693415
107	NC_020993	AAAT	2	8	51251	51258	75 %	25 %	0 %	0 %	478693415
108	NC_020993	AAAT	2	8	51922	51929	75 %	25 %	0 %	0 %	478693416
109	NC_020993	ATTA	2	8	52520	52527	50 %	50 %	0 %	0 %	478693416
110	NC_020993	TTTA	2	8	52661	52668	25 %	75 %	0 %	0 %	478693416
111	NC_020993	ATTG	2	8	52737	52744	25 %	50 %	25 %	0 %	478693416
112	NC_020993	AATG	2	8	54192	54199	50 %	25 %	25 %	0 %	478693418
113	NC_020993	TCTA	2	8	54204	54211	25 %	50 %	0 %	25 %	478693418
114	NC_020993	AGCT	2	8	55168	55175	25 %	25 %	25 %	25 %	478693419
115	NC_020993	AAAG	2	8	55313	55320	75 %	0 %	25 %	0 %	478693419
116	NC_020993	AAAT	2	8	55448	55455	75 %	25 %	0 %	0 %	478693419
117	NC_020993	ATTA	2	8	56653	56660	50 %	50 %	0 %	0 %	478693421
118	NC_020993	GTAG	2	8	56822	56829	25 %	25 %	50 %	0 %	478693421
119	NC_020993	ATGA	2	8	57206	57213	50 %	25 %	25 %	0 %	478693421
120	NC_020993	AACT	2	8	57462	57469	50 %	25 %	0 %	25 %	478693421
121	NC_020993	AAAG	2	8	57866	57873	75 %	0 %	25 %	0 %	478693421
122	NC_020993	AAAT	2	8	58534	58541	75 %	25 %	0 %	0 %	478693422
123	NC_020993	TATT	3	12	58576	58587	25 %	75 %	0 %	0 %	478693422
124	NC_020993	TTTA	2	8	58781	58788	25 %	75 %	0 %	0 %	478693422
125	NC_020993	TAAA	2	8	58940	58947	75 %	25 %	0 %	0 %	478693422
126	NC_020993	TTTA	2	8	59039	59046	25 %	75 %	0 %	0 %	478693423
127	NC_020993	GTTA	2	8	59850	59857	25 %	50 %	25 %	0 %	478693423
128	NC_020993	TATG	2	8	60066	60073	25 %	50 %	25 %	0 %	478693423
129	NC_020993	TAGT	2	8	61320	61327	25 %	50 %	25 %	0 %	478693424
130	NC_020993	ATAA	2	8	61793	61800	75 %	25 %	0 %	0 %	478693424
131	NC_020993	AGTA	2	8	62258	62265	50 %	25 %	25 %	0 %	478693425
132	NC_020993	TAGT	2	8	62811	62818	25 %	50 %	25 %	0 %	478693425
133	NC_020993	TTGA	2	8	63400	63407	25 %	50 %	25 %	0 %	478693425
134	NC_020993	AGTC	2	8	63562	63569	25 %	25 %	25 %	25 %	478693425
135	NC_020993	GTAA	2	8	63744	63751	50 %	25 %	25 %	0 %	478693425
136	NC_020993	TGAT	2	8	63808	63815	25 %	50 %	25 %	0 %	478693425
137	NC_020993	GATA	2	8	63979	63986	50 %	25 %	25 %	0 %	478693426
138	NC_020993	TTTC	2	8	64306	64313	0 %	75 %	0 %	25 %	478693426
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